Het microbioom van sputum, urine en ontlasting bij gezonde personen en patiënten met chronische obstructieve longziekte (COPD) (COPD)
Studie Overzicht
Toestand
Toestand
Conditie
Conditie
Interventie / Behandeling
Interventie / Behandeling
Gedetailleerde beschrijving
Studietype
Studietype
Inschrijving (Verwacht)
Inschrijving
Contacten en locaties
Studie Locaties
-
-
Songpa
-
Seoul, Songpa, Korea, republiek van, 05505
- Werving
- Asan Medical Center, University of Ulsan College of Medicine
-
Contact:
- Sei Won Lee, MD PhD
- Telefoonnummer: +82-2-3010-3990
- E-mail: iseiwon@gmail.com
-
-
Deelname Criteria
Geschiktheidscriteria
Geschiktheidscriteria
Leeftijden die in aanmerking komen voor studie
- Kind
- Volwassen
- Oudere volwassene
Accepteert gezonde vrijwilligers
Geslachten die in aanmerking komen voor studie
Bemonsteringsmethode
Studie Bevolking
COPD-groep
- Hetzelfde als hierboven
Gezonde rokers
- Deelnemers met een rookgeschiedenis
- Deelnemers met normale spirometrieresultaten
Beschrijving
Inclusiecriteria:
- Patiënten met een rookgeschiedenis van ten minste 10 pakjaren
- Patiënten met aanhoudende beperking van de luchtstroom die niet volledig reversibel was (bijv. post-bronchusverwijdend geforceerd expiratoir volume in 1 seconde/geforceerde vitale capaciteit (FEV1/FVC) <0,7)
Uitsluitingscriteria:
- Patiënten met een gelijktijdig bestaande ziekte die de onderzoeksresultaten zou kunnen verstoren (bijv. maligniteit, congestief hartfalen, cerebrovasculaire aandoeningen, chronisch nierfalen, diabetes met ernstige complicaties of ongecontroleerde hypertensie)
- Patiënten met een andere luchtwegaandoening dan obstructieve longziekte (bijv. Eerdere longresectie, door tuberculose vernietigde long en bronchiëctasie)
- Patiënten met recente (8 weken voorafgaand aan screening) exacerbatie of andere aandoeningen van de luchtwegen
Studie plan
Hoe is de studie opgezet?
Ontwerpdetails
- Observatiemodellen: Ander
- Tijdsperspectieven: Dwarsdoorsnede
Aantal groepen / cohorten
Cohorten en interventies
Groep / CohortGroep / Cohort |
Interventie / BehandelingInterventie / Behandeling |
|---|---|
|
Gezonde roker
Gezonde roker met normale spirometriewaarde
|
Monsters worden verkregen van deelnemers.
Verdere tussenkomst is niet nodig.
De verkregen monsters worden verder geanalyseerd.
|
|
COPD
Patiënten met een rookgeschiedenis van ten minste 10 pakjaar Patiënten met aanhoudende beperking van de luchtstroom die niet volledig reversibel was (bijv.
post-bronchusverwijdend geforceerd expiratoir volume in 1 seconde/geforceerde vitale capaciteit (FEV1/FVC) <0,7)
|
Monsters worden verkregen van deelnemers.
Verdere tussenkomst is niet nodig.
De verkregen monsters worden verder geanalyseerd.
|
Wat meet het onderzoek?
Primaire uitkomstmaten
Primaire uitkomstmaten
Uitkomstmaat |
Maatregel Beschrijving |
Tijdsspanne |
|---|---|---|
|
Alfa-diversiteit gemeten door kwantitatieve analyse van de operationele taxonomische eenheid (OTU).
Tijdsspanne: Gemiddeld 1 maand
|
DNA wordt geëxtraheerd uit elk monster van elke patiënt met behulp van een DNA-isolatiekit.
De 16S universele primers worden gebruikt voor amplificatie van 16S ribosomale ribonucleïnezuur (rRNA) genen met een polymerase kettingreactie (PCR) systeem.
Na amplicatie wordt sequencing uitgevoerd met behulp van de GREENGENES-database, waarna een metagenomische analyse werd uitgevoerd door de MD Healthcare Corporation met behulp van MDx-Pro-software (Ver.1,
Seoul, Zuid-Korea).
Taxonomische toewijzing van deze sequenties wordt uitgevoerd met een operationele taxonomische eenheid (OTU) cutoff van 3%.
|
Gemiddeld 1 maand
|
|
Microbioomsamenstelling door metagenomische analyse
Tijdsspanne: Gemiddeld 1 maand
|
De samenstelling van het microbioom wordt gepresenteerd als een staafdiagram.
|
Gemiddeld 1 maand
|
Secundaire uitkomstmaten
Secundaire uitkomstmaten
Uitkomstmaat |
Maatregel Beschrijving |
Tijdsspanne |
|---|---|---|
|
Biodiversiteit beschreven door de Shannon-diversiteitsindex en de Simpson-index
Tijdsspanne: Gemiddeld 1 maand
|
De Shannon-index en de Simpson-index worden berekend met behulp van metagenomische gegevens.
|
Gemiddeld 1 maand
|
|
Biodiversiteit beschreven door Principal Component Analysis (PCA)
Tijdsspanne: Gemiddeld 1 maand
|
PCA wordt uitgevoerd voor alle 16S rRNA-genaflezingen geclusterd met een overeenkomst van 97%.
|
Gemiddeld 1 maand
|
Medewerkers en onderzoekers
Sponsor
Sponsor
Publicaties en nuttige links
Algemene publicaties
- Kim HJ, Kim YS, Kim KH, Choi JP, Kim YK, Yun S, Sharma L, Dela Cruz CS, Lee JS, Oh YM, Lee SD, Lee SW. The microbiome of the lung and its extracellular vesicles in nonsmokers, healthy smokers and COPD patients. Exp Mol Med. 2017 Apr 14;49(4):e316. doi: 10.1038/emm.2017.7.
- Marsland BJ, Trompette A, Gollwitzer ES. The Gut-Lung Axis in Respiratory Disease. Ann Am Thorac Soc. 2015 Nov;12 Suppl 2:S150-6. doi: 10.1513/AnnalsATS.201503-133AW.
- Pragman AA, Kim HB, Reilly CS, Wendt C, Isaacson RE. The lung microbiome in moderate and severe chronic obstructive pulmonary disease. PLoS One. 2012;7(10):e47305. doi: 10.1371/journal.pone.0047305. Epub 2012 Oct 11.
- Erb-Downward JR, Thompson DL, Han MK, Freeman CM, McCloskey L, Schmidt LA, Young VB, Toews GB, Curtis JL, Sundaram B, Martinez FJ, Huffnagle GB. Analysis of the lung microbiome in the "healthy" smoker and in COPD. PLoS One. 2011 Feb 22;6(2):e16384. doi: 10.1371/journal.pone.0016384.
Studie record data
Bestudeer belangrijke data
Studie start (Verwacht)
Studie start
Primaire voltooiing (Verwacht)
Primaire voltooiing
Studie voltooiing (Verwacht)
Studie voltooiing
Studieregistratiedata
Eerst ingediend
Eerst ingediend
Eerst ingediend dat voldeed aan de QC-criteria
Eerst ingediend dat voldeed aan de QC-criteria
Eerst geplaatst (Werkelijk)
Eerst geplaatst
Updates van studierecords
Laatste update geplaatst (Werkelijk)
Laatste update geplaatst
Laatste update ingediend die voldeed aan QC-criteria
Laatste update ingediend die voldeed aan QC-criteria
Laatst geverifieerd
Laatst geverifieerd
Meer informatie
Termen gerelateerd aan deze studie
Trefwoorden
Aanvullende relevante MeSH-voorwaarden
Andere studie-ID-nummers
Andere studie-ID-nummers
- 2018-0980 (Andere identificatie: M D Anderson Cancer Center)
Plan Individuele Deelnemersgegevens (IPD)
Bent u van plan om gegevens van individuele deelnemers (IPD) te delen?
Informatie over medicijnen en apparaten, studiedocumenten
Bestudeert een door de Amerikaanse FDA gereguleerd geneesmiddel
Bestudeert een door de Amerikaanse FDA gereguleerd apparaatproduct
Deze informatie is zonder wijzigingen rechtstreeks van de website clinicaltrials.gov gehaald. Als u verzoeken heeft om uw onderzoeksgegevens te wijzigen, te verwijderen of bij te werken, neem dan contact op met register@clinicaltrials.gov. Zodra er een wijziging wordt doorgevoerd op clinicaltrials.gov, wordt deze ook automatisch bijgewerkt op onze website .