Le microbiome des expectorations, de l'urine et des matières fécales chez les personnes en bonne santé et les patients atteints de maladie pulmonaire obstructive chronique (MPOC) (COPD)
Aperçu de l'étude
Statut
Statut
Les conditions
Les conditions
Intervention / Traitement
Intervention / Traitement
Description détaillée
Type d'étude
Type d'étude
Inscription (Anticipé)
Inscription
Contacts et emplacements
Lieux d'étude
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Songpa
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Seoul, Songpa, Corée, République de, 05505
- Recrutement
- Asan Medical Center, University of Ulsan College of Medicine
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Contact:
- Sei Won Lee, MD PhD
- Numéro de téléphone: +82-2-3010-3990
- E-mail: iseiwon@gmail.com
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Critères de participation
Critère d'éligibilité
Critère d'éligibilité
Âges éligibles pour étudier
- Enfant
- Adulte
- Adulte plus âgé
Accepte les volontaires sains
Sexes éligibles pour l'étude
Méthode d'échantillonnage
Population étudiée
Groupe MPOC
- Comme ci-dessus
Fumeurs en bonne santé
- Participants ayant des antécédents de tabagisme
- Participants avec des résultats de spirométrie normaux
La description
Critère d'intégration:
- Patients ayant des antécédents de tabagisme d'au moins 10 paquets-année
- Les patients présentant une limitation persistante du débit d'air qui n'était pas entièrement réversible (par ex. volume expiratoire forcé post-bronchodilatateur en 1 seconde/capacité vitale forcée (FEV1/FVC) <0,7)
Critère d'exclusion:
- Patients atteints d'une maladie concomitante susceptible d'interférer avec les résultats de l'étude (par exemple, tumeur maligne, insuffisance cardiaque congestive, troubles cérébrovasculaires, insuffisance rénale chronique, diabète avec complications graves ou hypertension non contrôlée)
- Patients atteints d'une maladie respiratoire autre qu'une maladie pulmonaire obstructive (par exemple, une résection pulmonaire antérieure, un poumon détruit par la tuberculose et une bronchectasie)
- Patients présentant une exacerbation récente (8 semaines avant le dépistage) ou une autre maladie respiratoire
Plan d'étude
Comment l'étude est-elle conçue ?
Détails de conception
- Modèles d'observation: Autre
- Perspectives temporelles: Transversale
Nombre de groupes / cohortes
Cohortes et interventions
Groupe / CohorteGroupe / Cohorte |
Intervention / TraitementIntervention / Traitement |
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Fumeur en bonne santé
Fumeur en bonne santé avec une valeur de spirométrie normale
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Des échantillons sont obtenus auprès des participants.
Aucune autre intervention n'est nécessaire.
Les échantillons obtenus seront ensuite analysés.
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MPOC
Patients ayant des antécédents de tabagisme d'au moins 10 paquets-année Patients présentant une limitation persistante du débit d'air qui n'était pas entièrement réversible (par ex.
volume expiratoire forcé post-bronchodilatateur en 1 seconde/capacité vitale forcée (FEV1/FVC) <0,7)
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Des échantillons sont obtenus auprès des participants.
Aucune autre intervention n'est nécessaire.
Les échantillons obtenus seront ensuite analysés.
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Que mesure l'étude ?
Principaux critères de jugement
Principaux critères de jugement
Mesure des résultats |
Description de la mesure |
Délai |
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Diversité alpha mesurée par analyse quantitative de l'unité taxonomique opérationnelle (OTU)
Délai: 1 mois en moyenne
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L'ADN est extrait de chaque échantillon de chaque patient à l'aide d'un kit d'isolement d'ADN.
Les amorces universelles 16S sont utilisées pour l'amplification des gènes d'acide ribonucléique ribosomal (ARNr) 16S avec un système de réaction en chaîne par polymérase (PCR).
Après l'amplification, le séquençage est effectué à l'aide de la base de données GREENGENES, après quoi une analyse métagénomique a été réalisée par la société MD Healthcare à l'aide du logiciel MDx-Pro (Ver.1,
Séoul, Corée du Sud).
L'attribution taxonomique de ces séquences est effectuée avec un seuil d'unité taxonomique opérationnelle (OTU) de 3 %.
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1 mois en moyenne
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Composition du microbiome par analyse métagénomique
Délai: 1 mois en moyenne
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La composition du microbiome est présentée sous forme de graphique à barres.
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1 mois en moyenne
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Mesures de résultats secondaires
Mesures de résultats secondaires
Mesure des résultats |
Description de la mesure |
Délai |
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Biodiversité décrite par l'indice de diversité de Shannon et l'indice de Simpson
Délai: 1 mois en moyenne
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L'indice de Shannon et l'indice de Simpson sont calculés en utilisant des données métagénomiques.
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1 mois en moyenne
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Biodiversité décrite par Analyse en Composantes Principales (ACP)
Délai: 1 mois en moyenne
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L'ACP est réalisée pour toutes les lectures de gènes d'ARNr 16S regroupées à une similarité de 97 %.
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1 mois en moyenne
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Collaborateurs et enquêteurs
Parrainer
Parrainer
Publications et liens utiles
Publications générales
- Kim HJ, Kim YS, Kim KH, Choi JP, Kim YK, Yun S, Sharma L, Dela Cruz CS, Lee JS, Oh YM, Lee SD, Lee SW. The microbiome of the lung and its extracellular vesicles in nonsmokers, healthy smokers and COPD patients. Exp Mol Med. 2017 Apr 14;49(4):e316. doi: 10.1038/emm.2017.7.
- Marsland BJ, Trompette A, Gollwitzer ES. The Gut-Lung Axis in Respiratory Disease. Ann Am Thorac Soc. 2015 Nov;12 Suppl 2:S150-6. doi: 10.1513/AnnalsATS.201503-133AW.
- Pragman AA, Kim HB, Reilly CS, Wendt C, Isaacson RE. The lung microbiome in moderate and severe chronic obstructive pulmonary disease. PLoS One. 2012;7(10):e47305. doi: 10.1371/journal.pone.0047305. Epub 2012 Oct 11.
- Erb-Downward JR, Thompson DL, Han MK, Freeman CM, McCloskey L, Schmidt LA, Young VB, Toews GB, Curtis JL, Sundaram B, Martinez FJ, Huffnagle GB. Analysis of the lung microbiome in the "healthy" smoker and in COPD. PLoS One. 2011 Feb 22;6(2):e16384. doi: 10.1371/journal.pone.0016384.
Dates d'enregistrement des études
Dates principales de l'étude
Début de l'étude (Anticipé)
Début de l'étude
Achèvement primaire (Anticipé)
Achèvement primaire
Achèvement de l'étude (Anticipé)
Achèvement de l'étude
Dates d'inscription aux études
Première soumission
Première soumission
Première soumission répondant aux critères de contrôle qualité
Première soumission répondant aux critères de contrôle qualité
Première publication (Réel)
Première publication
Mises à jour des dossiers d'étude
Dernière mise à jour publiée (Réel)
Dernière mise à jour publiée
Dernière mise à jour soumise répondant aux critères de contrôle qualité
Dernière mise à jour soumise répondant aux critères de contrôle qualité
Dernière vérification
Dernière vérification
Plus d'information
Termes liés à cette étude
Mots clés
Termes MeSH pertinents supplémentaires
Autres numéros d'identification d'étude
Autres numéros d'identification d'étude
- 2018-0980 (Autre identifiant: M D Anderson Cancer Center)
Plan pour les données individuelles des participants (IPD)
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Informations sur les médicaments et les dispositifs, documents d'étude
Étudie un produit pharmaceutique réglementé par la FDA américaine
Étudie un produit d'appareil réglementé par la FDA américaine
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