Il microbioma dell'espettorato, delle urine e delle feci nelle persone sane e nei pazienti con broncopneumopatia cronica ostruttiva (BPCO) (COPD)
Panoramica dello studio
Stato
Stato
Condizioni
Condizioni
Intervento / Trattamento
Intervento / Trattamento
Descrizione dettagliata
Tipo di studio
Tipo di studio
Iscrizione (Anticipato)
Iscrizione
Contatti e Sedi
Luoghi di studio
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Songpa
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Seoul, Songpa, Corea, Repubblica di, 05505
- Reclutamento
- Asan Medical Center, University of Ulsan College of Medicine
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Contatto:
- Sei Won Lee, MD PhD
- Numero di telefono: +82-2-3010-3990
- Email: iseiwon@gmail.com
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Criteri di partecipazione
Criteri di ammissibilità
Criteri di ammissibilità
Età idonea allo studio
- Bambino
- Adulto
- Adulto più anziano
Accetta volontari sani
Sessi ammissibili allo studio
Metodo di campionamento
Popolazione di studio
gruppo BPCO
- Come sopra
Fumatori sani
- Partecipanti con storia di fumo
- Partecipanti con risultati spirometrici normali
Descrizione
Criterio di inclusione:
- Pazienti con una storia di fumo di almeno 10 pacchetti-anno
- Pazienti con limitazione persistente del flusso aereo non completamente reversibile (ad es. volume espiratorio forzato post-broncodilatatore in 1 secondo/capacità vitale forzata (FEV1/FVC) <0,7)
Criteri di esclusione:
- Pazienti con malattie coesistenti che potrebbero interferire con i risultati dello studio (ad es. tumore maligno, insufficienza cardiaca congestizia, disturbi cerebrovascolari, insufficienza renale cronica, diabete con gravi complicanze o ipertensione incontrollata)
- Pazienti con malattie respiratorie diverse dalla malattia polmonare ostruttiva (ad esempio, precedente resezione polmonare, polmone distrutto dalla tubercolosi e bronchiectasie)
- Pazienti con esacerbazioni recenti (8 settimane prima dello screening) o altre malattie respiratorie
Piano di studio
Come è strutturato lo studio?
Dettagli di progettazione
- Modelli osservazionali: Altro
- Prospettive temporali: Trasversale
Numero di gruppi/coorti
Coorti e interventi
Gruppo / CoorteGruppo / Coorte |
Intervento / TrattamentoIntervento / Trattamento |
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Fumatore sano
Fumatore sano con valore spirometrico normale
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I campioni sono ottenuti dai partecipanti.
Non è necessario alcun ulteriore intervento.
I campioni ottenuti saranno ulteriormente analizzati.
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BPCO
Pazienti con una storia di fumo di almeno 10 pacchetti-anno Pazienti con persistente limitazione al flusso aereo non completamente reversibile (ad es.
volume espiratorio forzato post-broncodilatatore in 1 secondo/capacità vitale forzata (FEV1/FVC) <0,7)
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I campioni sono ottenuti dai partecipanti.
Non è necessario alcun ulteriore intervento.
I campioni ottenuti saranno ulteriormente analizzati.
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Cosa sta misurando lo studio?
Misure di risultato primarie
Misure di risultato primarie
Misura del risultato |
Misura Descrizione |
Lasso di tempo |
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Diversità alfa misurata dall'analisi quantitativa dell'unità tassonomica operativa (OTU).
Lasso di tempo: Una media di 1 mese
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Il DNA viene estratto da ciascun campione di ciascun paziente utilizzando un kit di isolamento del DNA.
I primer universali 16S vengono utilizzati per l'amplificazione dei geni dell'acido ribonucleico ribosomiale 16S (rRNA) con il sistema di reazione a catena della polimerasi (PCR).
Dopo l'amplificazione, il sequenziamento viene eseguito utilizzando il database GREENGENES, dopo di che è stata eseguita un'analisi metagenomica dalla società MD Healthcare utilizzando il software MDx-Pro (Ver.1,
Seul, Corea del Sud).
L'assegnazione tassonomica di queste sequenze viene effettuata con un limite di unità tassonomica operativa (OTU) del 3%.
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Una media di 1 mese
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Composizione del microbioma mediante analisi metagenomica
Lasso di tempo: Una media di 1 mese
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La composizione del microbioma è presentata come grafico a barre.
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Una media di 1 mese
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Misure di risultato secondarie
Misure di risultato secondarie
Misura del risultato |
Misura Descrizione |
Lasso di tempo |
|---|---|---|
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Biodiversità descritta dall'indice di diversità di Shannon e dall'indice di Simpson
Lasso di tempo: Una media di 1 mese
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L'indice Shannon e l'indice Simpson sono calcolati utilizzando dati metagenomici.
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Una media di 1 mese
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Biodiversità descritta dall'analisi dei componenti principali (PCA)
Lasso di tempo: Una media di 1 mese
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La PCA viene eseguita per tutte le letture del gene rRNA 16S raggruppate con una somiglianza del 97%.
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Una media di 1 mese
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Collaboratori e investigatori
Sponsor
Sponsor
Pubblicazioni e link utili
Pubblicazioni generali
- Kim HJ, Kim YS, Kim KH, Choi JP, Kim YK, Yun S, Sharma L, Dela Cruz CS, Lee JS, Oh YM, Lee SD, Lee SW. The microbiome of the lung and its extracellular vesicles in nonsmokers, healthy smokers and COPD patients. Exp Mol Med. 2017 Apr 14;49(4):e316. doi: 10.1038/emm.2017.7.
- Marsland BJ, Trompette A, Gollwitzer ES. The Gut-Lung Axis in Respiratory Disease. Ann Am Thorac Soc. 2015 Nov;12 Suppl 2:S150-6. doi: 10.1513/AnnalsATS.201503-133AW.
- Pragman AA, Kim HB, Reilly CS, Wendt C, Isaacson RE. The lung microbiome in moderate and severe chronic obstructive pulmonary disease. PLoS One. 2012;7(10):e47305. doi: 10.1371/journal.pone.0047305. Epub 2012 Oct 11.
- Erb-Downward JR, Thompson DL, Han MK, Freeman CM, McCloskey L, Schmidt LA, Young VB, Toews GB, Curtis JL, Sundaram B, Martinez FJ, Huffnagle GB. Analysis of the lung microbiome in the "healthy" smoker and in COPD. PLoS One. 2011 Feb 22;6(2):e16384. doi: 10.1371/journal.pone.0016384.
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Inizio studio (Anticipato)
Inizio studio
Completamento primario (Anticipato)
Completamento primario
Completamento dello studio (Anticipato)
Completamento dello studio
Date di iscrizione allo studio
Primo inviato
Primo inviato
Primo inviato che soddisfa i criteri di controllo qualità
Primo inviato che soddisfa i criteri di controllo qualità
Primo Inserito (Effettivo)
Primo Inserito
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Ultimo aggiornamento pubblicato (Effettivo)
Ultimo aggiornamento pubblicato
Ultimo aggiornamento inviato che soddisfa i criteri QC
Ultimo aggiornamento inviato che soddisfa i criteri QC
Ultimo verificato
Ultimo verificato
Maggiori informazioni
Termini relativi a questo studio
Parole chiave
Termini MeSH pertinenti aggiuntivi
Altri numeri di identificazione dello studio
Altri numeri di identificazione dello studio
- 2018-0980 (Altro identificatore: M D Anderson Cancer Center)
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