Studie uložených vzorků nádorů u mladých pacientů s nádory mozku

Celkovým cílem tohoto neterapeutického protokolu je vyvinout a molekulárně charakterizovat ortotopické xenoimplantáty (PDOX), organoidy a in vitro modely odvozené z meduloblastomů, neuroepiteliálních nádorů vysokého stupně (HGNET), embryonálních nádorů CNS, atypických teratoidních rhabdoidních nádorů ( ATRT), karcinomy choroidního plexu (CPC), ependymomy a gliomy. Výzkumníci budou charakterizovat genomovou mutaci, expresi a epigenetické podpisy těchto modelů a porovnat je s primárními nádory, ze kterých byly odvozeny, čímž vytvoří dobře charakterizovaný a neocenitelný zdroj pro výzkum těchto vzácných a smrtelných dětských mozkových nádorů. To také poskytne důležité poznatky o intratumorální heterogenitě a molekulárních abnormalitách, které mohou ovlivnit selektivní tlaky řídící evoluci a růst nádoru jako u PDOX, organoidů nebo in vitro kultur a definovat vztah mezi těmito abnormalitami a histologickými a klinickými charakteristikami nádoru. Tohoto cíle bude dosaženo aplikací nejmodernějších nástrojů pro analýzu DNA, RNA a epigenomů na studium čerstvě zmrazených a/nebo kryokonzervovaných, fixovaných a kultivovaných nádorových buněk, PDOX a organoidů. Vytvoření ortotopických xenoimplantátů, organoidů a buněčných kultur z každého vzorku nádoru pocházejících od pacienta také umožní in vitro a in vivo analýzu růstu nádorových buněk, signalizace a terapeutické odpovědi.