Dlouhodobé zotavení a narušení osy mikrobioty-gut-mozek po traumatickém poranění mozku (OVERCOME-TBI)

Tento podrobný popis nastiňuje vědecké pozadí, postupy registru a strategie kontroly kvality pro studii Overcome-TBI. Studie staví na předchozích výzkumných kohortách na základě diagnostického a léčebného plánování léčby pro traumatické poranění mozku) a Pacos-TBI (patofyziologická charakterizace závažného traumatického poškození mozku) a klade za cíl komplexně prozkoumat dlouhodobé výsledky a dlouhodobě a longitudinární a longitudinární a longitudinární a longitudinární a longitudinární a longitudinární a longitudinární a longitudinární a longitudinární a longitudinární a longitudinární a longitudinární a longitudinární a longitudinály.

Studie Overcome-TBI používá prospektivní observační návrh zaměřený na pacienty se středně a těžkou TBI. Zahrnuje jak nedávno zraněné pacienty s TBI, tak dlouhodobé přeživší, aby zachytili širokou trajektorii zotavení z TBI. Studie bude zahrnovat širokou škálu modalit, včetně klinických hodnocení, neurokognitivního testování, pokročilého neuroimagingu (MRI, PET-MRI), biomarkerů krve, analýzy mikrobiomů a volitelné endoskopické biopsie. Tento integrovaný přístup je strukturován tak, aby poskytoval vhled do složitých biologických mechanismů, které ovlivňují výsledky TBI.

Celkovým cílem projektu Overcome-TBI je shromažďovat multimodální data přibližně 1-4 a 11-14 let po předchozím dobře zdokumentovaném TBI a prozkoumat faktory, které ovlivňují progresi onemocnění, aby získaly nové vědecké poznatky do dlouhodobé patofyziologie TBI a identifikovaly nové terapeutické cíle. Jádro návrhu studie zahrnuje předchozí sběr rozsáhlých klinických, radiologických a molekulárních dat ve více časových bodech: akutní hospitalizace (0-7 dní po poranění), včasné sledování (3-6 měsíců) a dlouhodobé sledování (≥ 12 měsíců). Klinické výsledky jsou hodnoceny pomocí validovaných nástrojů, jako je dotazník příznaků příznaků po konkurenci (RPQ). Cílem těchto hodnocení je zachytit jak funkční i kognitivní vzorce zotavení. Druhá část sběru dat zahrnuje průřezová data 1-4 a 11-14 let po TBI.

Pokud jde o postupy registru, je každý účastník zdokumentován v komplexním formuláři elektronické zprávy o případových zprávách (CRF), který zahrnuje demografické informace, údaje o zranění, kurz ICU a nemocnice, chirurgické zásahy a historii rehabilitace. CRF jsou vytvářeny a udržovány elektronicky prostřednictvím zabezpečených nemocničních systémů. Všechny CRF jsou chráněny ověřením uživatele. Registr také zahrnuje registr účastníků studie, který je vytvořen a udržován v souladu s pokyny pro obecné nařízení o ochraně údajů EU (GDPR) s cílem zajistit důvěrnost účastníka a dodržování předpisů.

Biologická složka studie zahrnuje sběr a skladování periferní krve, vzorky stolice a, pokud je to možné, střevní biopsie. Krev se shromažďuje v předdefinovaných intervalech a zpracovává se do séra a plazmy. Ty jsou uloženy při -70 ° C za podmínek biobanků se standardizovanými protokoly, aby byla zajištěna konzistence. Vzorky stolice se odebírají pro analýzu mikrobiomu a biopsie, pokud jsou provedeny, jsou uloženy při -70 ° C. Všechny vzorky jsou pseudonymizovány a sledovány pomocí jedinečných identifikátorů.

Ukázkové analýzy se provádějí v několika specializovaných laboratořích, včetně University of Turku (Finsko), Ženevské univerzity (Švýcarsko), Sahlgrenska Fakultní nemocnice (Švédsko) a Örebro University (Švédsko). Pro testy biomarkerů krve, profilování mikrobiomů a analýzu zánětlivých cytokinů byly vyvinuty standardní operační postupy (SOP). Zavedena měření kalibrace a kontroly kvality a kontrolu kvality, aby byla zajištěna reprodukovatelnost a srovnatelnost mezi místem.

Neuroimagingová složka zahrnuje MRI a PET-MRI. Sekvence MRI zahrnují T1-vážené, vkus, SWI a DTI pro posouzení strukturálních a mikrostrukturálních změn. Zobrazování PET se provádí s radioligandy, které cílí na expresi translokatorového proteinu (TSPO) a poskytují vhled do neuroinflamace. Zobrazovací data budou analyzována centrálně v Turku a Cambridge pomocí harmonizovaných potrubí a metod segmentace strojového učení.

Funkční a kognitivní hodnocení jsou nedílnou součástí protokolu. Kromě Gose a RPQ se provádí testovací baterie CANTAB. Cílem těchto testů je identifikovat běžné neuropsychiatrické následky a zkoumat korelace s biologickými a zobrazovacími markery.

Postupy ochrany údajů a řízení údajů jsou ústřední součástí protokolu. Všechna shromážděná data budou zadána do zabezpečené datové platformy kompatibilní s GDPR. Anonymizace je dosaženo pomocí pseudonymizace a šifrovacích strategií. Výbor pro přístup k datům reguluje sdílení dat a všechny sdílené datové sady jsou odvozeny z anonymizovaných hlavních souborů v rámci dohod o využití dat. Centrální databáze je hostována ve Fakultní nemocnici Turku a je předmětem přísných protokolů o zálohování a archivaci.

Informovaný souhlas bude získán od všech účastníků nebo jejich právních zástupců před zařazením do studie. Postup zahrnuje ústní vysvětlení, písemný informační list a čas na otázky. U kognitivně narušených pacientů bude zdokumentován souhlas z zástupce podle pokynů místní etické komise. Všechny formuláře souhlasu budou uchovávány v CRF účastníka.

Studie byla schválena etickou komisí The Wellbeing Services County jihozápadního Finska a klinické služby okresu Wellbeing Services County jihozápadního Finska v souladu s Helsinskou deklarací. Postupy zahrnující záření (PET-MRI) a invazivní vzorkování (biopsie) budou prováděny v rámci stanovených bezpečnostních limitů. Protokoly řízení rizik identifikují potenciální újmu a definují opatření pro nežádoucí účinky.

Kontrola kvality je zabudována do každé fáze studie. Zdůrazňují se standardizace sběru dat, harmonizace manipulace s vzorky, školení zaměstnanců a auditů pro všechny datové položky.

Pro řešení možných omezení velikosti vzorku nebo heterogenity dat zahrnuje protokol ustanovení pro externí spolupráci. Studie je zejména v souladu s mezinárodním rámcem INTBIR (International Initiative for Traumatic More Insure Research), který usnadňuje sdružování a harmonizaci dat s globálními datovými sadami.

Mezi analytické strategie patří logistická regrese, lineární smíšené modely a klasifikátory strojového učení. Multimodální fúzní analýzy prozkoumají souvislosti mezi neuroimagingovými rysy, kognitivními výsledky a biologickými markery. Data časové řady budou použita k identifikaci trajektorií a fenotypů zotavení. Chybějící data budou léčena s více imputací nebo metodami maximální pravděpodobnosti s úplnými informacemi v závislosti na analýze.

Dokumentace a archivace se provádějí podle mezinárodních standardů. Veškerá fyzická dokumentace bude uložena bezpečně a elektronické soubory budou uloženy na institucionálních serverech s omezeným přístupem. Údaje o výzkumu jsou zachovány po dobu nejméně 20 let.

Studie je financována Finskou Radou pro výzkum, nadace Sigrid Jusélius a financováním finského státního výzkumu. Pojistné krytí poskytuje univerzitní nemocnice Turku a zahrnuje všechny výzkumné činnosti související s pacientem.

Stručně řečeno, protokol Overcome-TBI představuje komplexní, eticky zdravý a vědecky přísný studijní rámec. Integruje vysoce kvalitní metody registru, analýzu biologických vzorků, kognitivní a gastrointestinální hodnocení a nejmodernější zobrazování. Zajištění kvality je vynucována prostřednictvím robustních postupů na všech úrovních, aby bylo dosaženo spolehlivých, zobecnitelných a klinicky smysluplných výsledků v oblasti výzkumu TBI.