Ultraastes Gesamtgenomsequenzieren bei Krebs im Kindesalter (UF-WGS)

Die Cambridge University Hospitals NHS Foundation Trust (CUHNFT) ist das Hauptbehandlungszentrum für die Region Osten Englands, die für 120-150 Patienten <16 Jahre mit einer neuen Diagnose einer pädiatrischen Malignität jährlich verantwortlich ist; Leukämie umfasst ~ 25% dieser Fälle. Die derzeitige molekulare Diagnose von Untergruppen von Malignitäten im Kindesalter, insbesondere der Leukämie, basiert auf der Durchflusszytometrie, der fluoreszierenden In-situ-Hybridisierung (FISH) und einem einzelnen Nukleotidpolymorphim-Arrays (SNP), für die die übliche Turnaround-Zeit (TAT) 7-14 Tage beträgt. In der gegenwärtigen Ära des Zugangs zur gezielten Therapie ist eine schnelle Diagnose und Behandlung von Patienten in molekularen Untergruppen mit hohem Risiko von entscheidender Bedeutung für die Verbesserung der Ergebnisse. Kinder und Jugendliche mit Philadelphia-Chromosom-Positiv (PH+) Akute lymphoblastische Leukämie (alle) haben das Überleben signifikant verbessert, wenn sie mit Tyrosinkinase-Inhibitoren (TKI) behandelt werden. Patienten mit PH+-ähnlichen Mutationen (10-20% der pädiatrischen) haben ebenfalls eine schlechte Prognose, die eine Eskalation der Behandlung und die Zugabe einer gezielten Therapie erfordern. Die rasch identifizierende MyCN -Amplifikation ist auch von kritischer prognostischer Bedeutung bei embryonalen Tumoren im Kindesalter, einschließlich Neuroblastom (25%) und Medulloblastom, und wirkt sich von Anfang an direkt auf die Behandlung aus. Das Übernachtungs-Ganz-Genom-Sequenzierung (WGS) bedeutet, dass zusätzliche 5 ml periphere Blut (Pb) und Knochenmarkproben (BM) nach Proben zur routinemäßigen diagnostischen Aufarbeitung gesammelt wurden, und könnten den aktuellen Standard der Versorgung (SOC) ersetzen (SOC). Schnelle Informationen über somatische und Keimbahnmutationen ermöglichen eine frühe Risikostratifizierung und die Behandlung von Patienten mit hohem Risiko mit Krebs.