Estrategias combinatorias de células individuales para un atlas de células intestinales de la enfermedad de Crohn

La enfermedad inflamatoria intestinal (EII), que consta de dos formas principales, la enfermedad de Crohn (EC) y la colitis ulcerosa, afecta a más de 1,6 millones de personas solo en los Estados Unidos. A pesar de las terapias actuales, la remisión solo ocurre en aproximadamente la mitad de los pacientes. El objetivo del estudio es mapear las relaciones espaciales de una sola célula en todo el espectro de íleon/colon ascendente desde pacientes de control sanos hasta pacientes con EC no involucrados/inactivos y involucrados/activos y evaluar las relaciones entre los datos de una sola célula y los datos clínicos del paciente.

Los investigadores utilizarán biopsias mucosas endoscópicas y especímenes de resección quirúrgica con transferencia rápida de tejido fresco a la preparación de una sola célula para secuenciación de ARN y uso de tejidos para hibridación in situ con fluorescencia de ARN e inmunofluorescencia multiplex. Junto con el análisis de imágenes de aprendizaje automático y la bioinformática, esto generará un atlas de células intestinales (GCA) de una sola célula sólido/detallado de CD ileo-colónica en todas las actividades de la enfermedad en comparación con los tejidos normales. El estudio también comparará los resultados de las biopsias mucosas endoscópicas con los obtenidos a partir de especímenes quirúrgicos de espesor completo utilizando la Red Cooperativa de Tejidos Humanos (CHTN).

Los investigadores anticipan que los datos de GCA proporcionarán nuevos conocimientos sobre la patogénesis de la enfermedad, lo que conducirá a nuevos objetivos terapéuticos.