Комбинаторные стратегии отдельных клеток для атласа клеток кишечника при болезни Крона

Воспалительное заболевание кишечника (ВЗК), состоящее из двух основных форм, болезни Крона (БК) и язвенного колита, поражает более 1,6 миллиона человек только в Соединенных Штатах. Несмотря на современные методы лечения, ремиссия наступает примерно у половины пациентов. Целью исследования является картирование пространственных отношений одиночных клеток по всему спектру подвздошной/восходящей ободочной кишки от здоровых контрольных пациентов до невовлеченных/спокойных и вовлеченных/активных пациентов с болезнью Крона и оценка взаимосвязи между одноклеточными данными и клиническими данными пациентов.

Исследователи будут использовать эндоскопические биоптаты слизистой оболочки и образцы хирургической резекции с быстрым переносом свежей ткани в одноклеточный препарат для секвенирования РНК и использования тканей для флуоресцентной РНК-гибридизации in situ и мультиплексной иммунофлуоресценции. Наряду с анализом изображений с помощью машинного обучения и биоинформатикой это позволит создать надежный / подробный атлас одноклеточных клеток кишечника (GCA) CD подвздошно-ободочной кишки при всех проявлениях болезни по сравнению с нормальными тканями. В исследовании также будут сравниваться результаты эндоскопической биопсии слизистой оболочки с результатами, полученными из хирургических образцов полной толщины с использованием сети Cooperative Human Tissue Network (CHTN).

Исследователи ожидают, что данные GCA дадут новое понимание патогенеза заболевания, что приведет к новым терапевтическим целям.