クローン病腸細胞アトラスのためのコンビナトリアル単一細胞戦略

炎症性腸疾患 (IBD) は、クローン病 (CD) と潰瘍性大腸炎の 2 つの主要な形態で構成され、米国だけで 160 万人以上が罹患しています。 現在の治療法にもかかわらず、寛解は患者の約半数にしか発生しません。 研究の目標は、回腸/上行結腸のスペクトル全体にわたる単一細胞の空間的関係を、健康な対照患者から非関与/静止および関与/活動中のCD患者にマッピングし、単一細胞データと患者の臨床データとの関係を評価することです。

研究者は、内視鏡的粘膜生検と外科的切除標本を利用して、新鮮な組織を RNA シーケンシング用の単一細胞調製物に迅速に移し、組織を RNA 蛍光 in situ ハイブリダイゼーションおよび多重免疫蛍光に使用します。 機械学習の画像解析とバイオインフォマティクスに加えて、これにより、正常組織に対するすべての疾患活動における回腸結腸 CD の堅牢で詳細な単一細胞腸細胞アトラス (GCA) が生成されます。 この研究では、内視鏡的粘膜生検の結果と、Cooperative Human Tissue Network (CHTN) を利用して全層外科標本から得られた結果も比較します。

研究者は、GCA データが疾患の病因に関する新たな洞察を提供し、新たな治療標的につながると予想しています。