Innovatiiviset reagenssit mykobakteeri-infektioiden nopean diagnosoinnin parantamiseen (TIKA_TB)

Johdanto M. tuberculosis (TB) on merkittävä kansanterveysongelma Yhdistyneessä kuningaskunnassa ja ulkomailla. Yhdistyneessä kuningaskunnassa ilmoitettiin vuonna 2013 yhteensä 7832 tapausta. Viljelyvarmistetuista (59 %) lääkeresistenssi oli 7,8 %. Tietyissä väestöryhmissä lääkeresistenssin ilmaantuvuus on suurempi: kodittomilla potilailla, vankilassa olleilla ja erityisesti Itä-Euroopasta tulevilla. Tyypillisesti potilas on hoidossa vähintään 18 kuukautta, ja PHE on arvioinut tämän kustannuksiksi jopa 50 000 puntaa.

Nykyinen diagnoosi perustuu M. tuberculosis -viljelmään ja lääkeherkkyystestaukseen. Tämä voi kestää kuusi tai kahdeksaan viikkoa, mikä tarkoittaa, että potilaat voivat olla tehottomana hoidossa jonkin aikaa, mikä johtaa edelleen tartunnan leviämiseen ja potilaan kliinisen tilan heikkenemiseen. Jos organismin viljelynopeutta voitaisiin lisätä oleellisesti, voidaan diagnoosin ja oikean hoidon aloittamisen viivästyksiä vähentää. Lisäksi jos viljelyvarmennettujen tapausten prosenttiosuutta voitaisiin lisätä, potilas ja lääkäri hyötyisivät. Usein potilaat aloitetaan tuberkuloosin hoidossa ilman varmaa viljelyn vahvistamaa diagnoosia. Muut mykobakteerit voivat naamioitua tuberkuloosiksi, mikä aiheuttaa viivästyksiä diagnoosissa ja hoidon epävarmuutta ennen kuin vahvistettu viljelytulos tulee saataville.

Tuberkuloosi diagnosoidaan tavanomaisella tavalla sopivien näytteiden rutiinianalyysillä, mukaan lukien standardi PCR ja viljely. Potilaat, joilla epäillään sairastavan tuberkuloosia tai joilla on todettu tuberkuloosi, otetaan mukaan tutkimukseen.

Potilaita hoidetaan tavalliseen tapaan tuberkuloosin hoidon standardiprotokollien mukaisesti hoitavan lääkärin ohjeiden mukaan.

Tällä hetkellä tuberkuloosin diagnoosi on pitkä prosessi, joka vaatii useiden viikkojen organismin viljelyä. Nopeamman tai helpomman testin tunnistaminen, joka voitaisiin suorittaa näytteille, hyödyttäisi suuresti tulevia potilaita. Tämän tutkimuksen tutkijat haluavat nähdä, nopeuttaako tämä erilainen viljelymenetelmä merkittävästi diagnoosin nopeutta.

Ensisijainen tavoite Uuden viljelymenetelmän nopeuden kvantifiointi ja vertailu perinteisiin järjestelmiin.

Tämä on havainnointitutkimus, eikä lisätoimenpiteitä tehdä.

menetelmät

Vähintään 200 yskösnäytettä, jotka on otettu tutkimuskelpoisilta potilailta kahtena rinnakkaisena:

1. Paikallinen NHS Trustin lääketieteellisen mikrobiologian osasto leimaa ja käsittelee rutiininäytteen käyttäen tavanomaisia ​​menetelmiä ja validoituja SOP-ohjeita, kuten tavallisesti.
2. Koulutetun tutkimushenkilöstön toimesta testinäyte linkitetään anonyymeiksi ja käsitellään niin nopeasti kuin mahdollista erillisessä kategorian III tutkimuslaboratoriossa SGUL:ssa. Tämä erottaa näytteestä mykobakteerit, jotka sitten siirrostetaan uuteen kasvualustaan, jota on täydennetty kasvatuslisäaineilla (TiKa Medium). . Jokainen testinäyte jaetaan sitten satunnaisesti yhteen kolmesta erilaisesta kaupallisesti saatavilla olevasta viljelypullojärjestelmästä (MGIT, BacTALert, VersaTrek) ja käsitellään valmistajan tavallisesti suosittelemalla tavalla enintään 42 päivää. Aika positiivisuuteen (TTP) kirjataan ja kasvavan viljelmän identiteetti varmistetaan käyttämällä tavanomaista (molekyylikoetin) metodologiaa.

TTP-arvot kootaan tietokantaan. Tutkimuksen lopussa tätä tietokantaa verrataan alkuperäisistä rinnakkaisista näytteistä määritettyjen rutiininomaisten mykobakteeriviljelytulosten retrospektiivisiin tietoihin.

Data-analyysi määrittää kunkin menetelmän tuottaman parannusasteen (määritettynä päivinä positiivisuuteen) ja testaa hypoteesin, jonka mukaan TiKa-väliaine voi merkittävästi (P<0,05) parantaa ei-viljeltävissä olevien fenotyyppien palautumista ja saada patogeenisten mykobakteerien viljellyt fenotyypit kasvamaan kliinisistä näytteistä nopeammin kuin aiemmin havaittiin.

Kelpoisuuskriteereihin ei tehdä poikkeuksia (poikkeuksia) ennen osallistujan ottamista mukaan tutkimukseen. Kaikkiin kelpoisuuteen liittyviin kysymyksiin tulee vastata ennen osallistujaan ilmoittautumista.

Osallistumiskriteerit: Jokaiselle potilaalle, jolla on mahdollinen tai diagnosoitu tuberkuloosi ja joka pystyy antamaan tietoisen suostumuksen, tarjotaan osallistumista tutkimukseen.

Poissulkemiskriteerit: Kaikki alle 18-vuotiaat potilaat tai potilaat, jotka eivät pysty antamaan tietoon perustuvaa suostumusta, suljetaan pois tästä tutkimuksesta. Säilöön otettuja henkilöitä ei oteta mukaan. Jokainen potilas, joka ei pysty antamaan näytettä.

Jokainen potilas voi vetäytyä tutkimuksesta milloin tahansa. Kaikkiin potilaisiin, jotka ovat kadonneet seurantaan, otetaan yhteyttä ja heidät pyritään saamaan uudelleen palveluihin tuberkuloosipotilaiden normaalin käytännön mukaisesti.

Osallistujien rekrytointi työmaalla alkaa vasta, kun todisteet seuraavista hyväksynnöistä/olennaisista asiakirjoista on olemassa:

1. Pääasiallinen REC-hyväksyntä, jos sellainen on
2. Lopullinen sponsorointi ja isäntäsivuston hyväksyntä,

Kaikki osallistujat, jotka haluavat osallistua tutkimukseen, seulotaan ja antaa suostumuksensa päätutkijalta tai tutkimukseen kliinisenä apututkijana osallistuvan pätevän kliinikon toimesta.

Rutiinikliininen tiimi lähestyy potilaita ja kysyy, olisivatko he kiinnostuneita. Jos he osoittavat kiinnostuksensa, joku tutkijoista ottaa heihin yhteyttä.

Suostumuksen saa tutkimusryhmän jäsen, jolla on kokemusta, koulutusta ja pätevyyttä hyvistä kliinisistä käytännöistä suostumuksen saamiseen liittyen.

Tutkimuksen osallistujalle annetaan kopio allekirjoitetusta suostumuslomakkeesta (ICF) sekä kopio potilastietolomakkeesta (PIS). Alkuperäinen allekirjoitettu ja päivätty suostumuslomake säilytetään lääketieteellisissä muistiinpanoissa ja kopio sijoitetaan ISF:ään.

Ilmoittautumisen yhteydessä tiedot kerätään pseudoanonymisoidussa muodossa pöytäkirjan mukaisesti.

Kaikkia tietoja käsitellään vuoden 1998 tietosuojalain mukaisesti. Tapausraporttilomakkeet (CRF) eivät sisällä osallistujan nimeä tai muita suoraan tunnistettavia tietoja. Vain osallistujan kokeilutunnistenumeroa (ID) käytetään tunnistamiseen. Sponsorin Subject ID -lokia JREOLOG0002 voidaan käyttää vertailemaan osallistujan tunnistetietoja.

Tapausraporttilomakkeet suunnittelee CI ja lopullisen version hyväksyy sponsori. Kaikki tiedot syötetään luettavasti mustalla musteella kuulakärkikynällä GCP:n mukaisesti.

Tämän kokeilun sovittu arkistointiaika on 5 vuotta. Tämä sisältää kaikki tutkimustietokannat.

Tutkimukseen otettavien potilaiden määrä on laskettu käyttämällä standarditeholaskelmaa, joka perustuu aikaisempiin kokeellisiin tietoihin, jotka viittaavat siihen, että vaikutuskoko > 0,3 olisi saavutettavissa tätä protokollaa käytettäessä odotetun keskihajonnan sisällä virhetodennäköisyydellä 0,05. Tämä arvioi 0,95 tehon olevan 20 % pienempi kuin odotettavissa oleva näytemäärä.

Ensisijainen päätepiste: Näyttää tilastollisen eron (P<0,05) testi- ja rutiiniryhmänäytteen TTP-tietojen välillä.

Tilastollinen analyysisuunnitelma: Yhteenveto lähtötiedoista ja potilasvirrasta. Tutkijat ehdottavat 200 potilasta rekisteröintiä yhdeksän kuukauden aikana. Tutkimuspaikka on tuberkuloosin huippuosaamisen keskus ja lähete, ja tutkijat odottavat täyttävänsä tämän osallistujamäärän. Tähän tutkimukseen ei sisälly erilaista potilashoitoa, eikä potilaiden satunnaistaminen tutkimukseen vaadita.

Testinäytteet kuitenkin satunnaistetaan jälkikäsittelyyn sisällytettäviksi kuhunkin kolmesta viljelykoneesta (käsivarresta) käyttämällä satunnaislukujen generoitua kaaviota (n=3), joka on rajoitettu antamaan sama määrä jokaiselle testihaaralle.

Tämä tutkimus on täysin rahoitettu Innovate UK:n rahoituksella