Inovativní činidla pro zlepšení rychlé diagnostiky mykobakteriálních infekcí (TIKA_TB)

Úvod M. tuberculosis (TB) je významným problémem veřejného zdraví ve Spojeném království i v zahraničí. V roce 2013 bylo ve Spojeném království hlášeno celkem 7832 případů. Z těch, které byly kultivačně potvrzeny (59 %), byla míra lékové rezistence 7,8 %. V některých populacích je výskyt lékové rezistence vyšší: pacienti bez domova, ti, kteří byli ve vězení, a zejména ti z východní Evropy. Obvykle bude pacient léčen 18 měsíců nebo déle a PHE odhadl náklady na tuto léčbu až na 50 000 GBP.

Současná diagnóza spočívá na kultivaci M. tuberculosis a testování citlivosti na léky. To může trvat šest až osm týdnů, což znamená, že pacienti mohou být nějakou dobu na neúčinné terapii, což vede k dalšímu přenosu a zhoršování klinického stavu pacienta. Pokud by se podstatně zvýšila rychlost kultivace organismu, mohla by se snížit prodlevy v diagnostice a zahájení správné léčby. Kromě toho, pokud by bylo možné zvýšit procento případů kultivačně potvrzených, pak by to prospělo pacientovi a klinickému lékaři. Pacienti jsou často zahajováni s léčbou TBC bez sebevědomé kultivačně potvrzené diagnózy. Jiné mykobakterie se mohou maskovat jako TBC a způsobit zpoždění v diagnostice a nejistotě léčby, než bude k dispozici potvrzený výsledek kultivace.

Tuberkulóza bude diagnostikována běžným způsobem, rutinní analýzou vhodných vzorků, včetně standardní PCR a kultivace. Do studie budou zařazeni pacienti, u kterých se předpokládá, že mají nebo u kterých byla potvrzena tuberkulóza.

Pacienti budou léčeni obvyklým způsobem podle standardních protokolů pro léčbu tuberkulózy podle pokynů ošetřujícího lékaře.

V současné době je diagnostika tuberkulózy zdlouhavým procesem vyžadujícím několikatýdenní kultivaci organismu. Identifikace rychlejšího nebo snadnějšího testu, který by mohl být proveden na vzorcích, by měla velký přínos pro budoucí pacienty. Vyšetřovatelé tohoto výzkumu se snaží zjistit, zda tato odlišná metoda kultivace výrazně zvýší rychlost diagnózy.

Primární cíl Kvantifikovat rychlost nové kultivační metody a porovnat ji s konvenčními systémy.

Jedná se o observační studii a nebudou prováděny žádné další intervence.

Metody

Alespoň 200 vzorků sputa získaných od vhodných zařazených pacientů v duplikátech:

1. Rutinní vzorek bude označen a zpracován místním oddělením lékařské mikrobiologie NHS Trust pomocí konvenčních metod a ověřených standardních operačních postupů, jako obvykle.
2. Testovaný vzorek bude anonymizován a zpracován tak rychle, jak to jen bude možné, v samostatné výzkumné laboratoři kategorie III v SGUL vyškoleným výzkumným personálem. Tím se ze vzorku extrahují mykobakterie, které budou poté naočkovány do nového média doplněného růstovými aditivy (TiKa Medium) . Každý testovací vzorek bude poté náhodně přidělen do jednoho ze tří různých komerčně dostupných systémů kultivačních lahví (MGIT, BacTAlert, VersaTrek) a zpracován tak, jak obvykle doporučuje výrobce, po dobu až 42 dnů. Čas do pozitivity (TTP) bude zaznamenán a identita rostoucí kultury ověřena konvenční (molekulární sondou) metodologií.

Hodnoty TTP budou srovnány v databázi. Na konci studie bude tato databáze porovnána s retrospektivními daty z rutinních výsledků kultivace mykobakterií stanovenými z původních paralelních vzorků.

Analýza dat určí stupeň zlepšení (určený ve dnech do pozitivity) dodaného každou metodou a otestuje hypotézu, že médium TiKa může významně (P<0,05) zlepšit obnovu nekultivovatelných fenotypů a zajistit, aby kultivovatelné fenotypy patogenních mykobakterií rostly rychleji z klinických vzorků, než bylo dříve pozorováno.

Před zařazením účastníka do studie nebudou existovat žádné výjimky (zproštění) kritérií způsobilosti. Jakékoli otázky týkající se způsobilosti by měly být vyřešeny před vstupem účastníka.

Kritéria zařazení: Každému pacientovi s možnou nebo diagnostikovanou tuberkulózou, který je schopen dát informovaný souhlas, bude nabídnuto zařazení do studie.

Kritéria vyloučení: Z této studie bude vyloučen každý pacient mladší 18 let nebo pacient, který není schopen dát informovaný souhlas. Zadržené osoby nebudou zahrnuty. Každý pacient, který není schopen poskytnout vzorek.

Každý pacient může ze studie kdykoli odstoupit. Všichni pacienti, kteří nebudou sledováni, budou kontaktováni a budou učiněny pokusy o opětovné zapojení do služeb, jak je standardní praxí u pacientů s tuberkulózou.

Nábor účastníků na místě bude zahájen až poté, co budou předloženy důkazy o následujícím schválení/zásadních dokumentech:

1. Hlavní schválení REC, pokud existuje
2. Konečné schválení sponzorství a hostitelského webu,

Všichni účastníci, kteří si přejí vstoupit do studie, budou plně prověřeni a budou schváleni hlavním zkoušejícím nebo jedním z kvalifikovaných klinických lékařů zapojených do studie jako klinický spoluřešitel.

Pacienty osloví rutinní klinický tým a zeptá se, zda by měli zájem. Pokud projeví zájem, jeden z výzkumníků je bude kontaktovat.

Souhlas udělí člen výzkumného týmu, který má zkušenosti, školení a kvalifikaci v oblasti správné klinické praxe týkající se získání souhlasu.

Účastníkovi studie bude předána kopie podepsaného formuláře informovaného souhlasu (ICF) spolu s kopií informačního listu pacienta (PIS). Originál podepsaného a datovaného formuláře souhlasu bude uchován v lékařských záznamech a kopie bude umístěna v ISF.

Při registraci budou údaje shromažďovány v pseudoanonymizované podobě podle protokolu.

Se všemi údaji bude nakládáno v souladu se zákonem o ochraně osobních údajů z roku 1998. Formuláře pro hlášení případů (CRF) nebudou obsahovat jméno účastníka ani jiné přímo identifikovatelné údaje. K identifikaci bude použito pouze zkušební identifikační číslo (ID). Protokol ID subjektu sponzora JREOLOG0002 lze použít ke křížovému odkazu na identifikovatelné informace účastníka.

Formuláře hlášení případů navrhne CI a konečnou verzi schválí sponzor. Všechny údaje budou zadány čitelně černým inkoustem pomocí kuličkového pera podle GCP.

Sjednaná doba archivace pro tento pokus bude 5 let. To bude zahrnovat veškeré studijní databáze.

Počet pacientů, kteří mají být zahrnuti do studie, byl vypočítán pomocí standardního výpočtu výkonu založeného na předchozích experimentálních datech, která naznačují, že velikost účinku >0,3 by byla dosažitelná v rámci standardní odchylky očekávané pomocí tohoto protokolu při pravděpodobnosti chyby 0,05. To by odhadlo, že síla 0,95 bude o 20 % nižší než počet vzorků, které se mají shromáždit.

Primární koncový bod: Ukázat statistický rozdíl (P<0,05) mezi testovacími a rutinními daty vzorku TTP.

Plán statistické analýzy: Souhrn výchozích údajů a toku pacientů. Vědci navrhují zapsat 200 pacientů po dobu 9 měsíců. Výzkumné místo je centrem excelence a doporučením pro tuberkulózu a vědci plně očekávají, že splní tento počet účastníků. V této studii není zahrnuta žádná rozdílná léčba pacientů a nebude zde žádný požadavek na randomizaci pacientů v rámci studie.

Testovací vzorky však budou po zpracování náhodně rozděleny pro zahrnutí do každého ze tří kultivačních strojů (ramen) pomocí tabulky generované náhodnými čísly (n=3) omezené tak, aby poskytovala stejná čísla pro každé testovací rameno.

Tato studie je plně financována z prostředků Innovate UK