Innovative reagenser for å forbedre rask diagnose av mykobakterielle infeksjoner (TIKA_TB)

Innledning M. tuberculosis (TB) er et betydelig folkehelseproblem i Storbritannia og i utlandet. Totalt 7832 tilfeller ble rapportert i Storbritannia i 2013. Av de som ble kulturbekreftet (59 %) var andelen medikamentresistens 7,8 %. I visse populasjoner er forekomsten av medikamentresistens høyere: hjemløse pasienter, de som har sittet i fengsel og spesielt de fra Øst-Europa. Vanligvis vil pasienten være på behandling i 18 måneder eller mer, og PHE har estimert kostnadene for dette til å være opptil £50000.

Nåværende diagnose hviler på kulturen av M. tuberculosis og medikamentsensitivitetstesting. Dette kan ta seks eller åtte uker, noe som betyr at pasienter kan være på ineffektiv behandling i noen tid, noe som fører til ytterligere overføring og forverring av pasientens kliniske tilstand. Hvis hastigheten på dyrkingen av organismen kunne økes betydelig, kan forsinkelsene i diagnose og å få riktig behandling i gang reduseres. Hvis prosentandelen av kulturbekreftede tilfeller i tillegg kunne økes, vil pasienten og klinikeren ha fordel. Ofte blir pasienter startet på tuberkulosebehandling uten en sikker kulturbekreftet diagnose. Andre mykobakterier kan maskere seg som tuberkulose og forårsake forsinkelser i diagnose og behandlingsusikkerhet før det bekreftede kulturresultatet blir tilgjengelig.

Tuberkulose vil bli diagnostisert på vanlig måte, ved rutineanalyse av passende prøver, inkludert standard PCR og kultur. Pasienter som antas å ha eller har blitt bekreftet å ha tuberkulose vil bli rekruttert til forsøket.

Pasientene vil bli behandlet på vanlig måte i henhold til standard protokoller for behandling av tuberkulose som anvist av behandlende lege.

For tiden er diagnosen tuberkulose en langvarig prosess som krever flere ukers dyrking av organismen. Identifisering av en raskere eller enklere test som kan utføres på prøver vil ha store fordeler for fremtidige pasienter. Etterforskerne av denne forskningen ser etter om denne forskjellige kulturmetoden vil øke hastigheten på diagnosen betydelig.

Primært mål Å kvantifisere hastigheten til ny kulturmetode og sammenligne med konvensjonelle systemer.

Dette er en observasjonsstudie og ingen ytterligere intervensjoner vil bli utført.

Metoder

Minst 200 sputumprøver innhentet fra kvalifiserte registrerte pasienter i duplikat:

1. Rutineprøven vil bli merket og behandlet av den lokale NHS Trust Medical Microbiology Department ved bruk av konvensjonelle metoder og validerte SOP-er, som vanlig.
2. Testprøven vil bli linkanonymisert og behandlet så raskt som praktisk mulig i et eget Kategori III forskningslaboratorium ved SGUL av utdannet forskningspersonell. Dette vil trekke ut mykobakterier fra prøven som deretter vil bli inokulert i et nytt medium supplert med veksttilsetningsstoffer (TiKa Medium) . Hver testprøve vil deretter bli tilfeldig allokert til ett av tre forskjellige kommersielt tilgjengelige kulturflaskesystemer (MGIT, BacTAlert, VersaTrek) og behandlet som vanligvis anbefalt av produsenten i opptil 42 dager. Tid til positivitet (TTP) vil bli registrert og identiteten til den voksende kulturen verifisert ved bruk av konvensjonell (molekylær probe) metodikk.

TTP-verdier vil bli samlet i en database. På slutten av studien vil denne databasen bli sammenlignet med retrospektive data fra rutinemessige mykobakterielle kulturresultater bestemt fra de originale parallelle prøvene.

Dataanalyse vil bestemme graden av forbedring (som bestemt i dager til positivitet) levert av hver metode og vil teste hypotesen om at TiKa Medium kan signifikant (P<0,05) forbedre utvinningen av ikke-dyrkbare fenotyper og få dyrkbare fenotyper av patogene mykobakterier til å vokse raskere fra kliniske prøver enn tidligere observert.

Det vil ikke være noen unntak (fraskrivelser) fra kvalifikasjonskriteriene før deltakeren blir inkludert i studien. Eventuelle spørsmål som stilles om kvalifisering bør tas opp før deltakeren melder seg inn.

Inklusjonskriterier: Enhver pasient med mulig eller diagnostisert tuberkulose som er i stand til å gi informert samtykke vil bli tilbudt å bli inkludert i forsøket.

Eksklusjonskriterier: Enhver pasient under 18 år eller som ikke er i stand til å gi informert samtykke vil bli ekskludert fra denne studien. Eventuelle personer i varetekt vil ikke bli inkludert. Enhver pasient som ikke er i stand til å gi prøve.

Enhver pasient kan trekke seg fra studien når som helst. Alle pasienter som går tapt for å følge opp vil bli kontaktet og det vil bli gjort forsøk på å få dem i kontakt med tjenester som er standard praksis for pasienter med tuberkulose.

Deltakerrekruttering på et nettsted vil bare starte når bevis på følgende godkjenning/essensielle dokumenter er på plass:

1. Den viktigste REC-godkjenningen, hvis aktuelt
2. Endelig sponsing og godkjenning av vertsside,

Alle deltakere som ønsker å delta i studien vil bli fullstendig screenet og samtykket av sjefsetterforskeren, eller en av de kvalifiserte klinikerne som er involvert i studien som Clinical Co-investigator.

Pasientene vil bli kontaktet av det rutinemessige kliniske teamet og spurt om de vil være interessert. Dersom de viser interesse vil en av forskerne kontakte dem.

Samtykke vil bli tatt av et medlem av forskerteamet som har erfaring, opplæring og kvalifikasjoner i god klinisk praksis rundt samtykke.

En kopi av det signerte skjemaet for informert samtykke (ICF) sammen med en kopi av pasientinformasjonsskjemaet (PIS) vil bli gitt til studiedeltakeren. Et originalt signert og datert samtykkeskjema vil bli beholdt i de medisinske notatene og en kopi vil bli plassert i ISF.

Ved påmelding vil data bli samlet inn i pseudoanonymisert form i henhold til protokoll.

Alle data vil bli behandlet i samsvar med Data Protection Act 1998. Case Report Forms (CRFs) vil ikke inneholde deltakerens navn eller andre direkte identifiserbare data. Kun deltakerens prøveidentifikasjonsnummer (ID) vil bli brukt til identifikasjon. Sponsorens emne-ID-logg JREOLOG0002 kan brukes til å kryssreferanser deltakerens identifiserbare informasjon.

Saksrapportskjemaer vil bli utformet av CI og den endelige versjonen vil bli godkjent av sponsoren. Alle data vil bli lagt inn leselig med svart blekk med en kulepenn i henhold til GCP.

Avtalt arkiveringsperiode for denne rettssaken vil være 5 år. Dette vil inkludere eventuelle studiedatabaser.

Antall pasienter som skal delta i studien er beregnet ved å bruke en standard kraftberegning basert på tidligere eksperimentelle data som antyder at en effektstørrelse på >0,3 ville være oppnåelig innenfor standardavviket som forventes ved bruk av denne protokollen ved en feilsannsynlighet på 0,05. Dette vil anslå en kraft på 0,95 til å være 20 % under antallet prøver som forventes å samles inn.

Primært endepunkt: For å vise statistisk forskjell (P<0,05) mellom test- og rutinegruppeprøve-TTP-data.

Statistisk analyseplan: Oppsummering av baseline data og flyt av pasienter. Forskerne foreslår å registrere 200 pasienter over en periode på 9 måneder. Forskningssiden er et senter for ekspertise og henvisning for tuberkulose, og forskerne forventer fullt ut å møte dette deltakerantallet. Det er ingen differensiell pasientbehandling involvert i denne studien, og det vil ikke være noe krav om å randomisere pasienter i studien.

Testprøver vil imidlertid bli randomisert etterbehandling for inkludering i hver av de tre kulturmaskinene (armene) ved å bruke et tilfeldig tall generert diagram (n=3) begrenset til å gi like antall til hver testarm.

Denne studien er fullfinansiert med finansiering fra Innovate UK