Innowacyjne odczynniki usprawniające szybką diagnostykę zakażeń mykobakteryjnych (TIKA_TB)

Wprowadzenie M. tuberculosis (TB) jest istotnym problemem zdrowia publicznego w Wielkiej Brytanii i za granicą. W 2013 roku w Wielkiej Brytanii zgłoszono łącznie 7832 przypadków. Spośród tych, u których potwierdzono hodowlę (59%), wskaźnik lekooporności wyniósł 7,8%. W niektórych populacjach częstość występowania oporności na leki jest wyższa: są to pacjenci bezdomni, osoby przebywające w więzieniach, a zwłaszcza osoby z Europy Wschodniej. Zazwyczaj pacjent będzie leczony przez 18 miesięcy lub dłużej, a PHE oszacował koszt leczenia na maksymalnie 50 000 GBP.

Obecna diagnoza opiera się na hodowli M. tuberculosis i testach wrażliwości na leki. Może to potrwać sześć lub osiem tygodni, co oznacza, że ​​pacjenci mogą przez pewien czas być na nieskutecznej terapii, co prowadzi do dalszego zakażenia i pogorszenia stanu klinicznego pacjenta. Gdyby można było znacznie zwiększyć szybkość hodowli organizmu, można by zredukować opóźnienia w diagnozie i rozpoczęciu właściwego leczenia. Ponadto, gdyby udało się zwiększyć odsetek przypadków potwierdzonych posiewem, skorzystaliby na tym zarówno pacjent, jak i klinicysta. Często pacjenci rozpoczynają leczenie gruźlicy bez pewnej diagnozy potwierdzonej posiewem. Inne prątki mogą podszywać się pod gruźlicę, powodując opóźnienia w diagnozie i niepewność leczenia, zanim potwierdzony wynik posiewu będzie dostępny.

Gruźlica zostanie zdiagnozowana w zwykły sposób, poprzez rutynową analizę odpowiednich próbek, w tym standardową reakcję PCR i hodowlę. Pacjenci, u których podejrzewa się lub potwierdzono gruźlicę, zostaną włączeni do badania.

Pacjenci będą leczeni w zwykły sposób, zgodnie ze standardowymi protokołami leczenia gruźlicy, zgodnie z zaleceniami lekarza prowadzącego.

Obecnie rozpoznanie gruźlicy to długotrwały proces wymagający kilkutygodniowej hodowli organizmu. Identyfikacja szybszego lub łatwiejszego testu, który można przeprowadzić na próbkach, przyniosłaby ogromne korzyści przyszłym pacjentom. Badacze tego badania chcą sprawdzić, czy ta inna metoda hodowli znacząco zwiększy szybkość diagnozy.

Główny cel Określenie ilościowe szybkości nowej metody hodowli i porównanie z konwencjonalnymi systemami.

Jest to badanie obserwacyjne i nie będą przeprowadzane żadne dodatkowe interwencje.

Metody

Co najmniej 200 próbek plwociny pobranych od kwalifikujących się włączonych pacjentów w dwóch powtórzeniach:

1. Rutynowa próbka zostanie oznaczona i przetworzona przez lokalny Departament Mikrobiologii Medycznej NHS Trust przy użyciu konwencjonalnych metod i zatwierdzonych standardowych procedur operacyjnych, jak zwykle.
2. Próbka testowa zostanie zanonimizowana i przetworzona tak szybko, jak to możliwe w oddzielnym laboratorium badawczym kategorii III w SGUL przez przeszkolony personel badawczy. W ten sposób zostaną wyodrębnione prątki z próbki, które następnie zostaną zaszczepione na nowej pożywce uzupełnionej dodatkami wzrostowymi (pożywka TiKa) . Każda próbka testowa zostanie następnie losowo przydzielona do jednego z trzech różnych dostępnych na rynku butelek do hodowli (MGIT, BacTAlert, VersaTrek) i przetwarzana zgodnie z zaleceniami producenta przez okres do 42 dni. Rejestrowany będzie czas do uzyskania pozytywnego wyniku (TTP), a tożsamość rosnącej kultury zostanie zweryfikowana przy użyciu konwencjonalnej metodologii (sonda molekularna).

Wartości TTP zostaną zebrane w bazie danych. Na koniec badania ta baza danych zostanie porównana z retrospektywnymi danymi z rutynowych wyników hodowli prątków, określonych z oryginalnych równoległych próbek.

Analiza danych określi stopień poprawy (określony w dniach do wyniku dodatniego) zapewniany przez każdą metodę i przetestuje hipotezę, że podłoże TiKa może znacząco (P <0,05) poprawić odzyskiwanie fenotypów nienadających się do hodowli i sprawić, że nadające się do hodowli fenotypy patogennych prątków rosną szybciej z próbek klinicznych, niż wcześniej obserwowano.

Nie będzie żadnych wyjątków (zrzeczeń) od kryteriów kwalifikowalności przed włączeniem uczestnika do badania. Wszelkie pytania dotyczące kwalifikowalności należy rozpatrzyć przed zgłoszeniem uczestnika.

Kryteria włączenia: Każdemu pacjentowi z podejrzeniem lub rozpoznaniem gruźlicy, który jest w stanie wyrazić świadomą zgodę, zostanie zaproponowane włączenie do badania.

Kryteria wykluczenia: Każdy pacjent w wieku poniżej 18 lat lub niezdolny do wyrażenia świadomej zgody zostanie wykluczony z tego badania. Osoby zatrzymane nie zostaną uwzględnione. Każdy pacjent, który nie może oddać próbki.

Każdy pacjent może w dowolnym momencie wycofać się z badania. Skontaktujemy się z każdym pacjentem, którego nie będzie można śledzić, i zostaną podjęte próby ponownego zaangażowania ich w usługi, jak to jest standardową praktyką dla pacjentów z gruźlicą.

Rekrutacja uczestników na miejscu rozpocznie się dopiero po przedstawieniu następujących zatwierdzeń/niezbędnych dokumentów:

1. Główne zatwierdzenie REC, jeśli dotyczy
2. Ostateczne zatwierdzenie sponsoringu i strony hosta,

Wszyscy uczestnicy, którzy chcą wziąć udział w badaniu, zostaną w pełni przebadani i uzyskają zgodę głównego badacza lub jednego z wykwalifikowanych klinicystów biorących udział w badaniu jako kliniczny współbadacz.

Do pacjentów podejdzie rutynowy zespół kliniczny i zapyta, czy byliby zainteresowani. Jeśli wyrażą zainteresowanie, jeden z badaczy skontaktuje się z nimi.

Zgoda zostanie podjęta przez członka zespołu badawczego, który posiada doświadczenie, przeszkolenie i kwalifikacje w zakresie Dobrej Praktyki Klinicznej w zakresie uzyskiwania zgody.

Uczestnikowi badania zostanie wręczona kopia podpisanego formularza świadomej zgody (ICF) wraz z kopią karty informacyjnej pacjenta (PIS). Oryginał podpisanego i opatrzonego datą formularza zgody zostanie zachowany w dokumentacji medycznej, a kopia zostanie umieszczona w ISF.

Podczas rejestracji dane będą gromadzone w formie pseudoanonimowej zgodnie z protokołem.

Wszystkie dane będą przetwarzane zgodnie z ustawą o ochronie danych osobowych z 1998 r. Formularze opisu przypadku (CRF) nie będą zawierały imienia i nazwiska uczestnika ani innych danych umożliwiających bezpośrednią identyfikację. Do identyfikacji zostanie wykorzystany wyłącznie numer identyfikacyjny (ID) uczestnika. Dziennik identyfikatora podmiotu sponsora JREOLOG0002 może służyć do porównywania informacji umożliwiających identyfikację uczestnika.

Formularze opisu przypadku zostaną zaprojektowane przez CI, a ostateczna wersja zostanie zatwierdzona przez Sponsora. Wszystkie dane będą wprowadzane czytelnie czarnym atramentem długopisem zgodnie z GCP.

Uzgodniony okres archiwizacji dla tej wersji próbnej wynosi 5 lat. Obejmuje to wszelkie bazy danych badań.

Liczbę pacjentów, którzy mają zostać włączeni do badania, obliczono przy użyciu standardowego obliczenia mocy w oparciu o wcześniejsze dane eksperymentalne sugerujące, że wielkość efektu > 0,3 byłaby osiągalna w ramach odchylenia standardowego oczekiwanego przy użyciu tego protokołu przy prawdopodobieństwie błędu równym 0,05. Oznaczałoby to, że moc 0,95 byłaby o 20% niższa od oczekiwanej liczby próbek do pobrania.

Pierwszorzędowy punkt końcowy: wykazanie różnicy statystycznej (P<0,05) między danymi TTP z grupy testowej i rutynowej.

Plan analizy statystycznej: Podsumowanie danych wyjściowych i przepływu pacjentów. Naukowcy proponują włączenie 200 pacjentów w okresie 9 miesięcy. Ośrodek badawczy jest ośrodkiem doskonałości i skierowań na gruźlicę, a naukowcy w pełni spodziewają się sprostać tej liczbie uczestników. W tym badaniu nie stosuje się zróżnicowanego leczenia pacjentów i nie będzie wymogu randomizacji pacjentów w ramach badania.

Próbki testowe będą jednak poddane losowej obróbce końcowej w celu włączenia do każdej z trzech maszyn do hodowli (ramiona) przy użyciu wykresu generowanego losowo (n=3) ograniczonego do zapewnienia równych liczb dla każdego ramienia testowego.

Badanie to jest w pełni finansowane z funduszy Innovate UK