Reagenti innovativi per migliorare la diagnosi rapida delle infezioni da micobatteri (TIKA_TB)

Introduzione M. tuberculosis (TB) è un grave problema di salute pubblica nel Regno Unito e all'estero. Un totale di 7832 casi sono stati segnalati nel Regno Unito nel 2013. Di quelli confermati dalla coltura (59%) il tasso di resistenza ai farmaci era del 7,8%. In alcune popolazioni l'incidenza della resistenza ai farmaci è maggiore: i senzatetto, coloro che sono stati in carcere e in particolare quelli dell'Est Europa. In genere il paziente sarà in trattamento per 18 mesi o più e il PHE ha stimato il costo di questo fino a £ 50000.

La diagnosi attuale si basa sulla coltura del M. tuberculosis e sui test di sensibilità ai farmaci. Questo può richiedere sei o otto settimane, il che significa che i pazienti possono essere sottoposti a una terapia inefficace per un certo periodo di tempo, portando a un'ulteriore trasmissione e al deterioramento delle condizioni cliniche del paziente. Se si potesse aumentare sostanzialmente la velocità di coltura dell'organismo, allora si potrebbero ridurre i ritardi nella diagnosi e nell'avvio del trattamento corretto. Inoltre, se la percentuale di casi confermati dalla coltura potesse essere aumentata, il paziente e il medico ne trarrebbero beneficio. Spesso i pazienti iniziano il trattamento della tubercolosi senza una diagnosi sicura confermata dalla coltura. Altri micobatteri possono mascherarsi da tubercolosi causando ritardi nella diagnosi e incertezza terapeutica prima che sia disponibile il risultato confermato della coltura.

La tubercolosi verrà diagnosticata nel solito modo, mediante analisi di routine di campioni appropriati, inclusa la PCR standard e la coltura. I pazienti che si pensa abbiano o siano stati confermati affetti da tubercolosi verranno reclutati per la sperimentazione.

I pazienti saranno gestiti nel modo consueto secondo i protocolli standard per il trattamento della tubercolosi come indicato dal medico curante.

Attualmente la diagnosi di tubercolosi è un processo lungo che richiede diverse settimane di coltura dell'organismo. L'identificazione di un test più rapido o più semplice che potrebbe essere eseguito sui campioni porterebbe grandi benefici ai futuri pazienti. I ricercatori di questa ricerca stanno cercando di vedere se questo diverso metodo di coltura aumenterà in modo significativo la velocità della diagnosi.

Obiettivo primario Quantificare la velocità del nuovo metodo di coltura e confrontarla con i sistemi convenzionali.

Questo è uno studio osservazionale e non verranno eseguiti ulteriori interventi.

Metodi

Almeno 200 campioni di espettorato ottenuti da pazienti arruolati idonei in duplicato:

1. Il campione di routine sarà etichettato ed elaborato dal dipartimento locale di microbiologia medica del NHS Trust utilizzando metodi convenzionali e SOP convalidate, come di consueto.
2. Il campione di prova sarà collegato anonimizzato ed elaborato il più rapidamente possibile in un laboratorio di ricerca di categoria III separato presso SGUL da personale di ricerca qualificato. Questo estrarrà i micobatteri dal campione che verrà quindi inoculato in un nuovo terreno integrato con additivi per la crescita (TiKa Medium) . Ogni campione di test verrà quindi assegnato in modo casuale a uno dei tre diversi sistemi di flaconi di coltura disponibili in commercio (MGIT, BacTAlert, VersaTrek) ed elaborato come solitamente raccomandato dal produttore per un massimo di 42 giorni. Il tempo alla positività (TTP) sarà registrato e l'identità della coltura in crescita verificata utilizzando la metodologia convenzionale (sonda molecolare).

I valori TTP verranno raccolti in un database. Alla fine dello studio questo database sarà confrontato con i dati retrospettivi dei risultati delle colture micobatteriche di routine determinate dai campioni paralleli originali.

L'analisi dei dati determinerà il grado di miglioramento (come determinato in giorni alla positività) fornito da ciascun metodo e verificherà l'ipotesi che il mezzo TiKa possa significativamente (P<0,05) migliorare il recupero di fenotipi non coltivabili e fare in modo che i fenotipi coltivabili di micobatteri patogeni crescano più velocemente da campioni clinici, rispetto a quanto osservato in precedenza.

Non ci saranno eccezioni (deroghe) ai criteri di ammissibilità prima dell'inclusione dei partecipanti nello studio. Eventuali domande sollevate sull'idoneità devono essere affrontate prima dell'ingresso del partecipante.

Criteri di inclusione: qualsiasi paziente con possibile o diagnosticata tubercolosi che sia in grado di dare il consenso informato verrà offerto per essere incluso nello studio.

Criteri di esclusione: Qualsiasi paziente sotto i 18 anni o che non è in grado di dare il consenso informato sarà escluso da questo studio. Eventuali persone detenute non saranno incluse. Qualsiasi paziente che non è in grado di fornire un campione.

Qualsiasi paziente può ritirarsi dallo studio in qualsiasi momento. Tutti i pazienti persi al follow-up verranno contattati e si cercherà di coinvolgerli nuovamente con i servizi come è prassi standard per i pazienti con tubercolosi.

Il reclutamento dei partecipanti presso un sito inizierà solo una volta che saranno disponibili le prove dei seguenti documenti essenziali/di approvazione:

1. L'approvazione REC principale, se applicabile
2. Sponsorizzazione finale e approvazione del sito ospitante,

Tutti i partecipanti che desiderano entrare nello studio saranno completamente selezionati e acconsentiti dal capo sperimentatore o da uno dei clinici qualificati coinvolti nello studio come co-ricercatore clinico.

I pazienti saranno avvicinati dal team clinico di routine e gli verrà chiesto se sarebbero interessati. Se manifestano interesse uno dei ricercatori li contatterà.

Il consenso sarà preso da un membro del gruppo di ricerca che ha avuto esperienza, formazione e qualifiche in Good Clinical Practice sull'acquisizione del consenso.

Una copia del Modulo di consenso informato (ICF) firmato insieme a una copia del Foglio informativo per il paziente (PIS) verrà consegnata al partecipante allo studio. Un modulo di consenso originale firmato e datato verrà conservato nelle note mediche e una copia verrà inserita nell'ISF.

Al momento dell'iscrizione i dati saranno raccolti in forma pseudoanonimizzata come da protocollo.

Tutti i dati saranno trattati in conformità con il Data Protection Act 1998. I Case Report Forms (CRF) non riporteranno il nome del partecipante o altri dati direttamente identificabili. Solo il numero di identificazione (ID) della prova del partecipante verrà utilizzato per l'identificazione. Il registro ID soggetto sponsor JREOLOG0002 può essere utilizzato per fare riferimento alle informazioni identificabili del partecipante.

I Case Report Forms saranno progettati dall'IC e la versione finale sarà approvata dallo Sponsor. Tutti i dati saranno inseriti in modo leggibile con inchiostro nero con una penna a sfera come da GCP.

Il periodo di archiviazione concordato per questo processo sarà di 5 anni. Ciò includerà qualsiasi database di studio.

Il numero di pazienti da arruolare nello studio è stato calcolato utilizzando un calcolo di potenza standard basato su dati sperimentali precedenti che suggeriscono che una dimensione dell'effetto >0,3 sarebbe ottenibile all'interno della deviazione standard prevista utilizzando questo protocollo con una probabilità di errore di 0,05. Ciò stimerebbe che una potenza di 0,95 sia inferiore del 20% al numero di campioni che si prevede di raccogliere.

Endpoint primario: per mostrare la differenza statistica (P<0,05) tra i dati TTP del campione del gruppo Test e Routine.

Piano di analisi statistica: riepilogo dei dati di base e flusso dei pazienti. I ricercatori propongono di arruolare 200 pazienti per un periodo di 9 mesi. Il sito di ricerca è un centro di eccellenza e di riferimento per la tubercolosi ei ricercatori si aspettano pienamente di raggiungere questo numero di partecipanti. Non vi è alcun trattamento differenziato del paziente coinvolto in questo studio e non sarà necessario randomizzare i pazienti all'interno dello studio.

Tuttavia, i campioni di test verranno randomizzati dopo l'elaborazione per l'inclusione in ciascuna delle tre macchine di coltura (bracci) utilizzando un grafico generato da un numero casuale (n=3) limitato a fornire numeri uguali a ciascun braccio di test.

Questo studio è interamente finanziato con finanziamenti da Innovate UK