Profils d'expression génique pour catégoriser les tumeurs de Wilms

OBJECTIFS:

I. Identifier de nouvelles catégories moléculaires de tumeur de Wilms (WT) sur la base des profils d'expression génique d'échantillons provenant de patients atteints de cette maladie.

II. Développer un système de classification (classificateur) qui prédira un nombre défini de catégories cliniquement pertinentes basées sur l'expression d'un ensemble établi de gènes.

III. Confirmer et tester le classificateur avec une analyse plus approfondie des gènes par plusieurs méthodologies différentes, en utilisant des échantillons de patients supplémentaires qui sont en dehors du cas/de la cohorte mais qui possèdent le paramètre cliniquement ou scientifiquement pertinent.

IV. Valider l'utilisation du classificateur pour prédire des groupes définis dans un deuxième ensemble d'échantillons (pour lesquels les enquêteurs sont aveuglés aux données cliniques et biologiques) par comparaison ultérieure avec l'incidence réelle des marqueurs pertinents.

CONTOUR:

Trois cents échantillons de tumeurs sont analysés pour les profils d'expression génétique à l'aide des tests Affymetrix. Des gènes spécifiques sont identifiés comme classificateurs et analysés à l'aide de matrices de tissus. 300 échantillons supplémentaires sont examinés pour l'expression des gènes et classés selon les classificateurs.