Genexpressionsprofile zur Kategorisierung von Wilms-Tumoren

ZIELE:

I. Identifizierung neuer molekularer Kategorien des Wilms-Tumors (WT) basierend auf den Genexpressionsprofilen von Proben von Patienten mit dieser Krankheit.

II. Entwickeln Sie ein Klassifizierungssystem (Klassifikator), das eine definierte Anzahl klinisch relevanter Kategorien basierend auf der Expression eines etablierten Satzes von Genen vorhersagt.

III. Bestätigen und testen Sie den Klassifikator mit weiterer Analyse der Gene durch mehrere verschiedene Methoden unter Verwendung zusätzlicher Patientenproben, die außerhalb des Falls/der Kohorte liegen, aber die klinisch oder wissenschaftlich relevanten Parameter besitzen.

IV. Validieren Sie die Verwendung des Klassifikators zur Vorhersage definierter Gruppen innerhalb eines zweiten Satzes von Proben (für die die Ermittler gegenüber den klinischen und biologischen Daten blind sind) durch anschließenden Vergleich mit der tatsächlichen Inzidenz relevanter Marker.

UMRISS:

Dreihundert Tumorproben werden mit Affymetrix-Assays auf genetische Expressionsprofile analysiert. Spezifische Gene werden als Klassifikatoren identifiziert und mit Gewebearrays analysiert. Weitere 300 Proben werden auf Genexpression untersucht und nach den Klassifikatoren kategorisiert.