Microbes manquants chez les nourrissons nés par césarienne (MiMIC)

Le microbiote intestinal au début de la vie joue un rôle majeur dans la santé et le développement du nourrisson, ayant un impact sur la maturation du système immunitaire, la protection contre les agents pathogènes et influençant le bien-être métabolique à long terme de l'hôte. L'acquisition de souches microbiennes de la mère au nourrisson peut se produire par plusieurs voies différentes, y compris le canal de naissance (et la proximité du canal de naissance à l'anus), le contact entre la mère et le nourrisson pendant les soins parentaux et par le lait maternel. De la naissance aux premières étapes du sevrage, la composition microbienne a un impact significatif sur l'intestin du nourrisson. Les avancées récentes dans les technologies de séquençage indépendantes de la culture ont permis d'identifier les principales espèces microbiennes impliquées dans le processus de colonisation initial, y compris les anaérobies facultatifs tels que Streptococcus, Staphylococcus et Enterobacter spp (Hill et al., 2017). Ainsi, le microbiome des nourrissons nés par voie vaginale, exclusivement allaités à terme, sans exposition antérieure aux antibiotiques, directement ou indirectement par la mère, pourrait être considéré comme le "gold standard". Le lait maternel, source naturelle de prébiotiques, fournit les ingrédients actifs optimaux pour la croissance des espèces microbiennes bénéfiques. Une perturbation de l'équilibre des habitants microbiens peut affecter la biologie de l'hôte humain de plusieurs façons. Les fonctions immunitaires, endocriniennes, cognitives ainsi que métaboliques peuvent être influencées par les communautés microbiennes présentes ; impliquant par la suite des problèmes de santé futurs tels que la résistance à l'insuline, les maladies allergiques, la dépression et peut-être même l'autisme. Les espèces microbiennes bénéfiques et leurs composés bioactifs associés, qui peuvent restaurer la santé intestinale globale, présentent donc un intérêt pour la nutrition infantile, qui, lorsqu'elles sont administrées, peuvent aider à traiter ou à prévenir une perturbation microbienne de l'environnement gastro-intestinal et avoir des effets bénéfiques à long terme sur la santé.

Le microbiote intestinal semble influencer le développement du comportement émotionnel, des systèmes de modulation du stress et de la douleur et des systèmes de neurotransmetteurs cérébraux. De plus, les perturbations du microbiote par les probiotiques et les antibiotiques exercent des effets modulateurs sur certaines de ces mesures ont été observées dans des modèles animaux adultes. Les preuves actuelles suggèrent que plusieurs mécanismes, y compris les voies endocrines et neurocrines, peuvent être impliqués dans la signalisation du microbiote intestinal au cerveau et que le cerveau peut à son tour modifier la composition et le comportement microbiens via le système nerveux autonome. Par conséquent, un autre aspect du travail impliquera des études portant sur la signalisation microbe-cerveau pour identifier et développer des produits de consortium de probiotiques commensaux (souches mixtes et éventuellement mélanges de souches/ingrédients) étayés par la science nécessaire adaptée au développement de probiotiques ciblés sur le microbiote-intestin. -l'axe cérébral, une communication bidirectionnelle entre le système gastro-intestinal et le cerveau, qui régule la fonction cérébrale et joue un rôle crucial dans le contrôle de l'humeur (Dinan et al., 2013). Il est bien établi qu'une intervention probiotique, du moins chez la souris, peut améliorer l'humeur et réduire l'anxiété dans divers modèles de stress (Bravo et al., 2011 ; Desbonnet et al., 2008 ; Desbonnet et al., 2010). Malgré des preuves confondantes, l'impact sur l'amélioration de l'humeur de l'intervention probiotique observé dans les études murines ne se traduit pas toujours chez l'homme (Kelly et al., 2017).

Les bébés nés par césarienne tirent le meilleur parti de l'allaitement, et souvent ces mères prennent des antibiotiques pendant 1 à 2 semaines après l'accouchement. Des antibiotiques sont administrés au moment de l'incision (pour les sections électives et d'urgence) pour prévenir l'infection de la plaie interne. Alors que le lait maternel lui-même pourrait être une source de bactéries pour le nourrisson en développement, influençant ainsi la colonisation microbienne intestinale après la naissance, de nombreuses questions subsistent quant à l'impact de la nutrition pendant la grossesse et l'allaitement, source du « microbiome du lait » et son impact sur l'établissement de le microbiote intestinal du nourrisson. Un nombre limité d'études ont examiné les communautés microbiennes présentes dans le lait maternel et suivi les altérations de la diversité microbienne tout au long de la période de lactation. Cependant, dans une étude récente, le groupe de chercheurs a signalé la présence d'un microbiome central du lait maternel en utilisant le séquençage Illumina MiSeq pour détecter 12 genres dominants chez les mères allaitantes (n = 10), constituant 81 % des taxons présents au cours des 6 premières semaines de la vie (Murphy et al., 2017). Un certain nombre de taxons fréquemment partagés, notamment Bifidobacterium, Lactobacillus, Staphylococcus et Enterococcus, étaient courants dans le lait maternel et les fèces du nourrisson au cours des 3 premiers mois de la vie, et une analyse dépendante de la culture a identifié des souches identiques de Bifidobacterium breve et de Lactobacillus plantarum présentes dans les deux le lait et les fèces infantiles, confirmant le concept de transmission mère-enfant (Murphy et al., 2017). Des résultats similaires ont été rapportés en utilisant l'ADN polymorphe amplifié au hasard (RAPD) et/ou le typage de séquences multilocus (MLST) pour identifier des modèles génomiques identiques de Bifidobacterium et Lactobacillus présents dans le lait maternel et les fèces infantiles correspondantes (Solís et al., 2010) ( Martin et al., 2006) (Martín et al.) (Makino et al., 2015).

Le traitement antibiotique tout au long de la grossesse représente 80 % des médicaments prescrits pendant la grossesse (Kuperman et Koren, 2016). La clinique Mayo décrit l'amoxicilline, l'ampicilline, la clindamycine, l'érythromycine, la pénicilline et la nitrofurantoïne comme étant généralement considérées comme sûres pendant la grossesse. Les tétracyclines peuvent endommager le foie d'une femme pendant la grossesse, et le triméthoprime + sulfaméthoxazole (couramment utilisés ensemble pour traiter les infections urinaires) peuvent être associés à un risque accru de malformations congénitales. Considérant qu'il est désormais admis qu'un établissement optimal du microbiote intestinal est hautement souhaitable pour le développement humain normal, le risque est que l'utilisation d'antibiotiques pendant la grossesse ait des effets indésirables sur le microbiome vaginal et laitier maternel, avec un impact négatif sur le développement précoce. microbiome du nourrisson. On estime qu'une femme enceinte sur cinq en Europe se voit prescrire au moins une cure d'antibiotiques pendant la grossesse ; aux États-Unis, ce taux est le double (Roberts et al., 2012). En cas d'infection maternelle avérée, les antibiotiques à spectre étroit doivent être privilégiés en raison de leurs effets moins étendus sur le microbiome, compte tenu de l'association des antibiotiques prénatals à un risque accru de maladie atopique infantile, d'épilepsie et d'obésité (Kuperman et Koren, 2016 ).