A vírussal összefüggő daganatok, a HIV vagy más immunrendszeri rendellenességek és a Castleman-kór hátterében előforduló daganatok molekuláris jellemzése

Háttér:

• A kiváló minőségű, klinikailag aláírt betegminták elérhetősége döntő fontosságú a vírussal összefüggő rosszindulatú daganatok, a HIV hátterében előforduló rosszindulatú daganatok és a Castleman-kór természetes anamnézisét befolyásoló biológiai tényezők vizsgálatához.
• A vírussal összefüggő rosszindulatú daganatok, a HIV hátterében előforduló rosszindulatú daganatok, az endogén retrovírusok által feltételezett daganatok és a Castleman-kór átfogó genomiális szekvenciája azonosíthatja a diagnosztikai vagy prognosztikai betegségek jeleit, valamint a vírustényezőkkel kölcsönhatásba lépő visszatérő vezetői változásokat, és azonosíthatja azokat. új terápiák céljait
• A HIV+ és HIV-fertőzött egyénekből származó rákos megbetegedések vagy Castleman-kór transzkriptumainak és genomjainak összehasonlítása új, nem humán szekvenciákat azonosíthat, amelyek potenciálisan utalhatnak az eddig fel nem fedezett onkogén vírus ágensek transzkriptumainak jelenlétére.

Célkitűzés:

- A protokoll elsődleges célja a vírussal összefüggő rosszindulatú daganatok, a HIV vagy más immunhiányos betegségek hátterében fellépő rosszindulatú daganatok, valamint a Castleman-kór molekuláris vizsgálatának támogatása, kiváló minőségű, klinikailag annotált szövetek felhalmozásával az ilyen betegektől, valamint daganatos betegektől. amelyek megfelelő kontrollként szolgálhatnak.

Jogosultság:

• Életkor >18 év
• HIV vagy más szerzett immunhiányos és rák ill
• Vírussal összefüggő rák ill
• HIV-negatív rákkal, amely gyakran előfordul HIV-fertőzötteknél vagy
• Kaposi-szarkóma herpeszvírus (KSHV) által okozott rosszindulatú daganat vagy kapcsolódó betegségek, mint például a többcentrikus Castleman-kór vagy
• Idiopátiás Castleman-kór ill
• Daganatok, amelyekről feltételezhető, hogy endogén retrovírusok okozzák

Tervezés:

• A minták feldolgozása projektspecifikus gyűjtési és feldolgozási protokollok segítségével történik.
• A nem tumoros minták gyűjtését általában a csíravonal genetikai anyagának kinyerése érdekében végzik. A daganat és a normál DNS közötti eredményeket elemzik a rákos szövetekben jelenlévő szomatikus változások azonosítása érdekében.
• Az értékelendő változások a következők lehetnek: kromoszómális változások kimutatása, mint például, de nem kizárólagosan, amplifikáció, deléciók, heterozigótaság elvesztése, transzlokációk stb.; valamint a transzlokációkból és mutációkból származó transzkriptumok expressziós profilozása és kimutatása, beleértve az egy nukleotid variánsokat, inszerciókat, deléciókat stb.
• A projektspecifikus elemzések többféle formája elvégezhető, beleértve a polimorfizmusok, mutációk, génexpresszió, keringési és szöveti biomarkerek értékelését, teljes exome szekvenálást és klinikai patológiai korrelációt a projektspecifikus statisztikai és bioinformatikai tervek alapján.
• A változások az adott projektben értékelt biológiai utak és rendszerbiológia összefüggésében is elemezhetők.