Caracterização Molecular de Tumores Associados a Virais, Tumores que Ocorrem no Cenário de HIV ou Outros Distúrbios Imunológicos e Doença de Castleman

Fundo:

• A disponibilidade de amostras de pacientes clinicamente anotadas de alta qualidade é crucial para o estudo de fatores biológicos que influenciam a história natural de malignidades relacionadas a vírus, malignidades que ocorrem no cenário de HIV e doença de Castleman
• A sequência genômica abrangente de malignidades associadas a vírus, malignidades que ocorrem no contexto do HIV, tumores hipoteticamente causados ​​por retrovírus endógenos e doença de Castleman podem identificar assinaturas de doenças de diagnóstico ou prognóstico e alterações recorrentes que interagem com fatores virais e podem identificar alvos de novas terapias
• A comparação de transcriptomas e genomas entre cânceres ou doença de Castleman de indivíduos HIV+ e HIV- pode identificar novas sequências não humanas que poderiam potencialmente sugerir a presença de transcritos de agentes virais oncogênicos até então desconhecidos

Objetivo:

-O principal objetivo deste protocolo é apoiar a investigação molecular de malignidades associadas a vírus, malignidades que ocorrem no cenário de HIV ou outras imunodeficiências e doença de Castleman, por acúmulo de tecido clinicamente anotado de alta qualidade de tais pacientes, bem como pacientes com tumores que podem servir como controles apropriados.

Elegibilidade:

• Idade >18 anos
• HIV ou outra imunodeficiência adquirida e câncer ou
• Câncer associado a vírus ou
• HIV negativo com câncer que comumente ocorre em pessoas com HIV ou
• Malignidade associada ao vírus do herpes do sarcoma de Kaposi (KSHV) ou doenças relacionadas, como doença de Castleman multicêntrica ou
• Doença de Castleman idiopática ou
• Tumores hipoteticamente causados ​​por retrovírus endógenos

Projeto:

• As amostras serão processadas usando protocolos de coleta e processamento específicos do projeto.
• A coleta de espécimes não tumorais geralmente será realizada para obter material genético de linhagem germinativa. Os resultados entre DNA tumoral e normal serão analisados ​​para identificar as alterações somáticas presentes nos tecidos cancerosos.
• Alterações a serem avaliadas podem incluir: detecção de alterações cromossômicas, tais como, mas não limitadas a, amplificação, deleções, perda de heterozigosidade, translocações, etc.; bem como perfis de expressão e detecção de transcritos resultantes de translocações e mutações, incluindo variantes de nucleotídeo único, inserções, deleções, etc.
• Múltiplas formas de análises específicas do projeto podem ser realizadas, incluindo avaliação de polimorfismos, mutações, expressão gênica, biomarcadores circulatórios e baseados em tecidos, sequenciamento completo do exoma e correlação patológica clínica com base em planos estatísticos e bioinformáticos específicos do projeto.
• As alterações também podem ser analisadas no contexto das vias biológicas e da biologia dos sistemas que estão sendo avaliados em um determinado projeto.