Molekulare Charakterisierung von Virus-assoziierten Tumoren, Tumoren, die im Zusammenhang mit HIV oder anderen Immunerkrankungen und der Castleman-Krankheit auftreten

Hintergrund:

• Die Verfügbarkeit qualitativ hochwertiger, klinisch kommentierter Patientenproben ist entscheidend für die Untersuchung biologischer Faktoren, die den natürlichen Verlauf viral bedingter Malignome, Malignome, die im Zusammenhang mit HIV auftreten, und der Castleman-Krankheit beeinflussen
• Umfassende genomische Sequenzen von Virus-assoziierten Malignomen, Malignomen, die im Rahmen von HIV auftreten, Tumoren, von denen angenommen wird, dass sie durch endogene Retroviren verursacht werden, und Castleman-Krankheit können diagnostische oder prognostische Krankheitssignaturen und wiederkehrende Treiberveränderungen, die mit viralen Faktoren interagieren, identifizieren und identifizieren Angriffspunkte für neue Therapien
• Der Vergleich von Transkriptomen und Genomen zwischen Krebserkrankungen oder der Castleman-Krankheit von HIV-positiven und HIV-individuellen Personen könnte neue nicht-menschliche Sequenzen identifizieren, die möglicherweise auf das Vorhandensein von Transkripten von bisher unentdeckten onkogenen viralen Agenzien hindeuten könnten

Zielsetzung:

-Das Hauptziel dieses Protokolls ist die Unterstützung der molekularen Untersuchung von viral assoziierten Malignomen, Malignomen, die im Zusammenhang mit HIV oder anderen Immundefekten und der Castleman-Krankheit auftreten, indem qualitativ hochwertiges, klinisch annotiertes Gewebe von solchen Patienten sowie Patienten mit Tumoren gesammelt wird die als geeignete Kontrollen dienen können.

Teilnahmeberechtigung:

• Alter >18 Jahre
• HIV oder andere erworbene Immunschwäche und Krebs oder
• Virusassoziierter Krebs bzw
• HIV-negativ mit Krebs, der häufig bei Menschen mit HIV auftritt oder
• Kaposi-Sarkom-Herpesvirus (KSHV)-assoziierte Malignität oder verwandte Krankheiten, wie z. B. Multizentrische Castleman-Krankheit oder
• Idiopathische Castleman-Krankheit bzw
• Tumore, von denen angenommen wird, dass sie durch endogene Retroviren verursacht werden

Design:

• Die Proben werden unter Verwendung projektspezifischer Entnahme- und Verarbeitungsprotokolle verarbeitet.
• Die Entnahme von Nicht-Tumorproben wird im Allgemeinen durchgeführt, um genetisches Keimbahnmaterial zu erhalten. Die Ergebnisse zwischen Tumor- und normaler DNA werden analysiert, um die im Krebsgewebe vorhandenen somatischen Veränderungen zu identifizieren.
• Zu bewertende Veränderungen können beinhalten: Nachweis von chromosomalen Veränderungen, wie, aber nicht beschränkt auf, Amplifikation, Deletionen, Verlust der Heterozygotie, Translokationen usw.; sowie Expressionsprofilierung und Erkennung von Transkripten, die aus Translokationen und Mutationen resultieren, einschließlich einzelner Nukleotidvarianten, Insertionen, Deletionen usw.
• Es können mehrere Formen projektspezifischer Analysen durchgeführt werden, einschließlich der Bewertung von Polymorphismen, Mutationen, Genexpression, Kreislauf- und gewebebasierten Biomarkern, Sequenzierung des gesamten Exoms und klinisch-pathologischer Korrelation auf der Grundlage projektspezifischer statistischer und bioinformatischer Pläne.
• Änderungen können auch im Zusammenhang mit biologischen Wegen und Systembiologie, die in einem bestimmten Projekt evaluiert werden, analysiert werden.