Rendszerszemléletű megközelítés a SARS-CoV-2 kimenetelének előrejelzésére egy város lakosságában; COVID 19

Az új SARS-CoV-2 hatásának értékelése érdekében ez a tanulmány rendszerszemléletű megközelítéssel elemzi a SARS-CoV-2 fertőzésben igazolt betegek klinikai kimenetelét. A cél különböző, klinikai és nem klinikai változókat lefedő adatkészletek integrálása. A gazdatényezők, mint például az életkor, a nem, a társbetegségek és a kezelések mellett a mikrobiológiai tényezők, például a SARS-CoV-2 vírusterhelés (fél)kvantitatív nukleinsav teszt (QNAT) segítségével, a genomszekvenciák és a vírusspecifikus immunválaszok szerepelnek. . Ezen túlmenően a városon belüli epidemiológiai szempontok, mint például az esetszámok bizonyos területeken és az egészségügyi rendszer ebből eredő telítettsége (pl. a kórházi kezelésre kerülő betegek és az intenzív osztály foglaltsága), elemezni fogják. A 2020 februárja és 2021 novembere között 2020 februárja és 2021 novembere között gyűjtött összes rendelkezésre álló szérum- és légúti mintából (maradék anyagból) származó biológiai mérésekből további epidemiológiai adatokat állítanak elő, mivel valószínű, hogy a következő 2020/2021 telén egy második hullám kering majd.

Ebben a projektben három retrospektív tanulmány készül:

„A” vizsgálat: retrospektív megfigyeléses eset-kontroll vizsgálat a SARS-CoV-2 fertőzés klinikai kimenetelének és jellemzőinek előrejelzésére. Feltárják a SARSCoV-2-vel fertőzött betegek (esetek) és a nem SARS-CoV-2-fertőzött betegek klinikai kimenetelét, más légúti vírusokkal vagy anélkül (kontroll).

B. vizsgálat: retrospektív megfigyeléses epidemiológiai felügyeleti vizsgálat a SARS-CoV-2 járvány epidemiológiájának leírására; az új SARS-CoV-2 vírus epidemiológiai terjedésének leírása Bázelben élők körében.

C. vizsgálat: retrospektív megfigyelő vírusevolúciós vizsgálat, amelynek során légzőszervi anyagokat, valamint megfelelő vér- és szövetanyagokat használnak fel a teljes genom szekvenálásának elvégzésére a gazdaszervezetek közötti kórokozó-evolúció, valamint a gazdaszervezeten belüli evolúció tanulmányozására. További anyagokat nem gyűjtünk. A világjárvány terjeszkedési, csúcsponti és összehúzódási szakaszában nyert vírusgenomokat összehasonlítják majd a vírusfejlődés, a vírusterhelés, a többségi fajok, az immunszökés variánsainak, valamint a klinikai kimenetelre, a diagnosztikai kimutatásra, a kezelésre és az oltástervezésre gyakorolt ​​hatások meghatározására. . Különösen érdekes lehet a SARS-CoV-2 újrafertőződések előfordulásának, gyakoriságának és változatainak korrelációja a nagy aktivitású és expozíciós kockázatú várostömbökben.

D. vizsgálat: retrospektív megfigyeléses kezelési eredményvizsgálat, amelyben klinikai eredményeket, laboratóriumi, radiológiai, tüdőfunkciós és virológiai adatokat, valamint az immunválaszokra vonatkozó adatokat használják fel a különböző kezelési módok biztonságosságának és hatékonyságának tanulmányozására. Minden adatot és anyagot rutinszerűen gyűjtenek a kórházi kezelés alatt és a járóbeteg-körülmények között, hogy értékeljék a különböző kezelési módok biztonságosságát és hatását az eredményre.