- ICH GCP
- Yhdysvaltain kliinisten tutkimusten rekisteri
- Kliininen tutkimus NCT04351503
Järjestelmällinen lähestymistapa SARS-CoV-2:n seurausten ennustamiseksi kaupungin väestössä; COVID 19
Järjestelmällinen lähestymistapa SARS-CoV-2:n seurausten ennustamiseksi kaupungin väestössä
Tutkimuksen yleiskatsaus
Tila
Interventio / Hoito
Yksityiskohtainen kuvaus
Uuden SARS-CoV-2:n vaikutuksen arvioimiseksi tässä tutkimuksessa analysoidaan systeemisen lähestymistavan avulla potilaiden, joilla on vahvistettu SARS-CoV-2-infektio, kliinisiä tuloksia. Tavoitteena on integroida erilaisia aineistoja, jotka kattavat kliiniset ja ei-kliiniset muuttujat. Isäntätekijöiden, kuten iän, sukupuolen, liitännäissairaudet ja hoidot, lisäksi mukana ovat mikrobiologiset tekijät, kuten SARS-CoV-2-viruskuormitukset (puoli)kvantitatiivisen nukleiinihappotestin (QNAT) avulla, genomisekvenssit ja virusspesifiset immuunivasteet. . Lisäksi epidemiologiset näkökohdat kaupungin sisällä, kuten tapausmäärät tietyillä alueilla ja niistä johtuva terveydenhuoltojärjestelmän kyllästyminen (esim. sairaalahoidossa olevien potilaiden määrä ja teho-osaston käyttöaste), analysoidaan. Lisää epidemiologisia tietoja tuotetaan biologisista mittauksista kaikista saatavilla olevista seerumi- ja hengitysnäytteistä (jäljellä oleva materiaali), jotka on kerätty helmikuusta 2020 marraskuuhun 2021 kahden kauden aikana, koska on todennäköistä, että toinen aalto kiertää seuraavana talvena 2020/2021.
Tässä hankkeessa tehdään kolme retrospektiivistä tutkimusta:
Tutkimus A: retrospektiivinen havainnollinen tapaus-verrokkitutkimus SARS-CoV-2-infektion kliinisten tulosten ja piirteiden ennustamiseksi. Selvitetään kliinisiä tuloksia SARSCoV-2-tartunnan saaneilla potilailla (tapaukset) ja ei-SARS-CoV-2-tartunnan saaneilla potilailla, joilla on tai ei ole muita hengitystieviruksia (kontrolli).
Tutkimus B: retrospektiivinen havainnollinen epidemiologinen seurantatutkimus SARS-CoV-2-epidemian epidemiologian kuvaamiseksi; kuvaus uuden SARS-CoV-2-viruksen epidemiologisesta leviämisestä Baselissa asuville ihmisille.
Tutkimus C: retrospektiivinen havainnollinen virusevoluutiotutkimus, jossa hengitysmateriaaleja sekä vastaavia veri- ja kudosmateriaaleja käytetään koko genomin sekvensointiin, jotta voidaan tutkia patogeenien kehitystä isäntien välillä sekä isäntäevoluutiota. Lisämateriaalia ei kerätä. Pandemian laajenemis-, huippu- ja supistumisvaiheessa saatuja virusgenomeja verrataan viruksen evoluution ennustajien, viruskuormien, enemmistön lajien, immuunipakomuunnelmien ja kliinisen lopputuloksen, diagnostisen havaitsemisen, hoidon ja rokotteen suunnittelun ennustajien tunnistamiseksi. . Erityisesti SARS-CoV-2-uudelleentartuntojen esiintymisen ja taajuuden sekä muunnelmien korreloiminen korkean aktiivisuuden ja altistumisriskin omaavissa kortteleissa on kiinnostavaa.
Tutkimus D: retrospektiivinen havainnollinen hoidon tulostutkimus, jossa kliinisiä tuloksia, laboratorio-, radiologisia, keuhkojen toiminta- ja virologisia tietoja sekä immuunivastetietoja käytetään eri hoitomuotojen turvallisuuden ja tehokkuuden tutkimiseen. Kaikki tiedot ja materiaalit kerätään rutiininomaisesti sairaalahoidon aikana ja avohoidossa, jotta voidaan arvioida eri hoitomuotojen turvallisuutta ja vaikutusta lopputulokseen.
Opintotyyppi
Ilmoittautuminen (Todellinen)
Yhteystiedot ja paikat
Opiskelupaikat
-
-
-
Allschwil, Sveitsi, 4123
- Viollier AG
-
Basel, Sveitsi, 4031
- University Hospital Basel
-
Basel, Sveitsi, 4056
- Biozentrum University of Basel
-
Basel, Sveitsi, 4056
- sciCore University of Basel
-
Basel, Sveitsi, 4058
- Department of Biosystems Science and Engineering ETH Zurich
-
Geneva, Sveitsi, 1202
- Swiss Institute of Bioinformatics
-
-
Osallistumiskriteerit
Kelpoisuusvaatimukset
Opintokelpoiset iät
- Lapsi
- Aikuinen
- Vanhempi Aikuinen
Hyväksyy terveitä vapaaehtoisia
Näytteenottomenetelmä
Tutkimusväestö
Kuvaus
Sisällyttämiskriteerit:
- Tutkimus A: Kaikki potilaat, jotka testataan SARS-CoV-2:n varalta Baselin yliopistollisessa sairaalassa (USB) ja joiden kotipaikka on Baselissa (Basel-Stadt, Riehen ja Bettingen), otetaan mukaan kliinisten tulosten arviointiin. Mukaan otetaan kaikki ikäryhmät. Lisäksi sisällytetään ei-kliiniset tiedot, kuten epidemiologiset ja sairaalaan liittyvät tiedot kaikista Baselissa asuvista, mutta joita ei välttämättä testattu Baselin yliopistollisessa sairaalassa.
- Tutkimus B: Epidemiologiset tiedot sekä seerumi- ja hengityselinten näytteet kaikista ikäryhmistä Baselissa (Basel-Stadt, Riehen ja Bettingen) asuvilta ihmisiltä, joilla on varmistettu SARS-CoV-2-infektio tai ei sitä.
- Tutkimus C: SARS-CoV-2-virusgenomianalyysi suoritetaan kaikista potilaista, joiden SARS-CoV-2-genomi on positiivinen NAT:n toimesta Baselin yliopistollisessa sairaalassa ja jotka asuvat Baselissa (Basel-Stadt, Riehen ja Bettingen). Lisäksi mainitut tutkimuskumppanit tekevät virusgenomianalyysin kaikista Baselissa asuvan NAT:n SARS-CoV-2 genomin toteamista ihmisistä. Mukaan otetaan kaikki ikäryhmät.
- Potilaat, joilla on parantunut SARS-CoV-2-infektio ja jotka tulevat plasman luovutukseen, otetaan mukaan kuvaamaan immunologista vastetta infektion onnistumisen jälkeen.
Poissulkemiskriteerit:
- dokumentoitu yleisen suostumuksen epääminen tai saatavilla oleva/tunnettu kirjallinen tai suullinen lausunto tutkimusta vastaan
- Ihmiset, jotka on testattu USB:llä ja jotka asuvat Baselin ulkopuolella (Basel-Stadt, Riehen ja Bettingen)
Opintosuunnitelma
Miten tutkimus on suunniteltu?
Suunnittelun yksityiskohdat
Kohortit ja interventiot
Ryhmä/Kohortti |
Interventio / Hoito |
|---|---|
|
SARSCoV-tartunnan saaneet potilaat (tapaukset)
|
Tutkimus A: tietojen kerääminen SARS-CoV-2-infektion kliinisistä tuloksista ja piirteistä.
Demografiset, kliiniset, mikrobiologiset, laboratorio-, epidemiologiset ja sairaalaan liittyvät tiedot analysoidaan.
Tähän tutkimusosaan otetaan mukaan vain potilaat, jotka ovat käyneet Baselin yliopistollisessa sairaalassa, jotta he voivat käyttää potilaskarttoja.
Tutkimus B: epidemiologisen seurantatietojen kerääminen SARS-CoV-2-epidemian epidemiologian kuvaamiseksi.
Influenssavirusten epidemia leviäminen Baselin kaupungissa toimii tärkeänä viittauksena tunnistamaan yhtäläisyyksiä ja eroja pandeemisen SARS-CoV-2-tilanteen kanssa.
Lisäksi Influenssa-hankkeiden aikana kerätyt tiedot - erityisesti tiedot kaupungin tilastokortteista, mm.
väestötiheys, tulot ja asuintila käytetään uudelleen.
Jo kerätyt ja varastoidut näytteet, kuten seerumi ja hengitysmateriaali (jäljelle jäänyt materiaali), käytetään (uudelleen).
Tutkimus C: tiedonkeruu viruksen evoluutiota varten.
Hengitysmateriaaleja sekä vastaavia veri- ja kudosmateriaaleja käytetään koko genomin sekvensointiin, jotta voidaan tutkia patogeenien kehitystä isäntien välillä sekä isäntäevoluutiota.
Lisämateriaalia ei kerätä.
Tutkimus D: eri hoitomenetelmien turvallisuutta ja tehoa koskevien tietojen kerääminen. Tällä hetkellä seuraavia hoitoja pidetään osana hoitoa:
|
|
ei-SARS-CoV-2-tartunnan saaneet potilaat (kontrolli)
ei-SARS-CoV-2-tartunnan saaneet potilaat, joilla on tai ei ole muita hengitystieviruksia (kontrolli).
|
Tutkimus A: tietojen kerääminen SARS-CoV-2-infektion kliinisistä tuloksista ja piirteistä.
Demografiset, kliiniset, mikrobiologiset, laboratorio-, epidemiologiset ja sairaalaan liittyvät tiedot analysoidaan.
Tähän tutkimusosaan otetaan mukaan vain potilaat, jotka ovat käyneet Baselin yliopistollisessa sairaalassa, jotta he voivat käyttää potilaskarttoja.
|
Mitä tutkimuksessa mitataan?
Ensisijaiset tulostoimenpiteet
Tulosmittaus |
Toimenpiteen kuvaus |
Aikaikkuna |
|---|---|---|
|
(i) infektioon liittyvien tekijöiden tunnistaminen (binäärinen, kyllä/ei), (ii) sairaalahoito (binaarinen, kyllä/ei), (iii) teho-osastohoidon tarve (binaarinen, kyllä/ei)
Aikaikkuna: lähtötasolla
|
(i) infektioon liittyvien tekijöiden tunnistaminen (binäärinen, kyllä/ei), (ii) sairaalahoito (binaarinen, kyllä/ei), (iii) teho-osastohoidon tarve (binaarinen, kyllä/ei)
|
lähtötasolla
|
|
sairaalahoidon kesto (päivissä)
Aikaikkuna: lähtötasolla
|
sairaalahoidon kesto (päivissä)
|
lähtötasolla
|
|
tehohoitoyksikön (ICU) oleskelun kesto (päivinä)
Aikaikkuna: lähtötasolla
|
tehohoitojakson kesto (päivissä)
|
lähtötasolla
|
|
sairaalakuolleisuus (binaarinen, kyllä/ei)
Aikaikkuna: lähtötasolla
|
sairaalakuolleisuus (binaarinen, kyllä/ei)
|
lähtötasolla
|
|
Tartuntatapausten määrä Baselin kaupungissa
Aikaikkuna: lähtötasolla
|
Infektoituneiden tapausten määrä, jotka on vahvistettu joko nukleiinihappotestillä (NAT) tai positiivisella serologialla Baselin kaupungissa ilmaistuna ilmaantuvuudena tilastollista lohkoa kohti
|
lähtötasolla
|
|
koko genomin sekvensointi patogeenien evoluution tutkimiseksi (virusgenomin lukumäärä, tyyppi ja monimutkaisuus)
Aikaikkuna: lähtötasolla
|
Syvällä sekvensoinnilla tunnistettujen virusgenomivarianttien ja kvasilajien lukumäärä, tyyppi ja monimutkaisuus pandemian nousun, huipun ja supistumisen aikana potilailla ja maantieteellisillä alueilla.
|
lähtötasolla
|
|
Tunnistaminen, mikä hoitomuoto liittyy haittatapahtumiin (binaarinen, kyllä/ei)
Aikaikkuna: lähtötasolla
|
Tunnistaminen, mikä hoitomuoto liittyy haittatapahtumiin (binaarinen, kyllä/ei)
|
lähtötasolla
|
|
Tunnistaminen, mikä hoitomuoto liittyy keuhkojen palautumiseen (binaarinen, kyllä/ei)
Aikaikkuna: 30 ja 90 päivän jälkeen
|
Tunnistaminen, mikä hoitomuoto liittyy keuhkojen palautumiseen (binaarinen, kyllä/ei)
|
30 ja 90 päivän jälkeen
|
Yhteistyökumppanit ja tutkijat
Yhteistyökumppanit
Tutkijat
- Päätutkija: Adrian Egli, Prof. Dr. med., Division of Clinical Bacteriology & Mycology, University Hospital Basel
Julkaisuja ja hyödyllisiä linkkejä
Yleiset julkaisut
- Sava M, Sommer G, Daikeler T, Woischnig AK, Martinez AE, Leuzinger K, Hirsch HH, Erlanger T, Wiencierz A, Bassetti S, Tamm M, Tschudin-Sutter S, Stoeckle M, Pargger H, Siegemund M, Boss R, Zimmer G, Vu DL, Kaiser L, Dell-Kuster S, Weisser M, Battegay M, Hostettler K, Khanna N. Ninety-day outcome of patients with severe COVID-19 treated with tocilizumab - a single centre cohort study. Swiss Med Wkly. 2021 Aug 10;151:w20550. doi: 10.4414/smw.2021.20550. eCollection 2021 Aug 2.
- Seth-Smith H, Vesenbeckh S, Egli A, Ott S. SARS-CoV-2 in an immunocompromised host: convalescent plasma therapy and viral evolution elucidated by whole genome sequencing. BMJ Case Rep. 2023 Dec 9;16(12):e255255. doi: 10.1136/bcr-2023-255255.
- Peter JK, Wegner F, Gsponer S, Helfenstein F, Roloff T, Tarnutzer R, Grosheintz K, Back M, Schaubhut C, Wagner S, Seth-Smith HMB, Scotton P, Redondo M, Beckmann C, Stadler T, Salzmann A, Kurth H, Leuzinger K, Bassetti S, Bingisser R, Siegemund M, Weisser M, Battegay M, Sutter ST, Lebrand A, Hirsch HH, Fuchs S, Egli A. SARS-CoV-2 Vaccine Alpha and Delta Variant Breakthrough Infections Are Rare and Mild but Can Happen Relatively Early after Vaccination. Microorganisms. 2022 Apr 21;10(5):857. doi: 10.3390/microorganisms10050857.
- Bruningk SC, Klatt J, Stange M, Mari A, Brunner M, Roloff TC, Seth-Smith HMB, Schweitzer M, Leuzinger K, Sogaard KK, Albertos Torres D, Gensch A, Schlotterbeck AK, Nickel CH, Ritz N, Heininger U, Bielicki J, Rentsch K, Fuchs S, Bingisser R, Siegemund M, Pargger H, Ciardo D, Dubuis O, Buser A, Tschudin-Sutter S, Battegay M, Schneider-Sliwa R, Borgwardt KM, Hirsch HH, Egli A. Determinants of SARS-CoV-2 transmission to guide vaccination strategy in an urban area. Virus Evol. 2022 Mar 17;8(1):veac002. doi: 10.1093/ve/veac002. eCollection 2022.
- Stange M, Mari A, Roloff T, Seth-Smith HM, Schweitzer M, Brunner M, Leuzinger K, Sogaard KK, Gensch A, Tschudin-Sutter S, Fuchs S, Bielicki J, Pargger H, Siegemund M, Nickel CH, Bingisser R, Osthoff M, Bassetti S, Schneider-Sliwa R, Battegay M, Hirsch HH, Egli A. SARS-CoV-2 outbreak in a tri-national urban area is dominated by a B.1 lineage variant linked to a mass gathering event. PLoS Pathog. 2021 Mar 19;17(3):e1009374. doi: 10.1371/journal.ppat.1009374. eCollection 2021 Mar.
Opintojen ennätyspäivät
Opi tärkeimmät päivämäärät
Opiskelun aloitus (Todellinen)
Ensisijainen valmistuminen (Todellinen)
Opintojen valmistuminen (Todellinen)
Opintoihin ilmoittautumispäivät
Ensimmäinen lähetetty
Ensimmäinen toimitettu, joka täytti QC-kriteerit
Ensimmäinen Lähetetty (Todellinen)
Tutkimustietojen päivitykset
Viimeisin päivitys julkaistu (Todellinen)
Viimeisin lähetetty päivitys, joka täytti QC-kriteerit
Viimeksi vahvistettu
Lisää tietoa
Tähän tutkimukseen liittyvät termit
Muita asiaankuuluvia MeSH-ehtoja
Muut tutkimustunnusnumerot
- 2020-00769; qu20Egli2
Lääke- ja laitetiedot, tutkimusasiakirjat
Tutkii yhdysvaltalaista FDA sääntelemää lääkevalmistetta
Tutkii yhdysvaltalaista FDA sääntelemää laitetuotetta
Nämä tiedot haettiin suoraan verkkosivustolta clinicaltrials.gov ilman muutoksia. Jos sinulla on pyyntöjä muuttaa, poistaa tai päivittää tutkimustietojasi, ota yhteyttä register@clinicaltrials.gov. Heti kun muutos on otettu käyttöön osoitteessa clinicaltrials.gov, se päivitetään automaattisesti myös verkkosivustollemme .
Kliiniset tutkimukset SARS-koronavirus (SARS-CoV-2) -infektio
-
VA Office of Research and DevelopmentValmisSARS Coronavirus 2 RT-PCR-testausYhdysvallat
-
AIM Vaccine Co., Ltd.Zhejiang Provincial Center for Disease Control and PreventionEi vielä rekrytointia
-
AIM Vaccine Co., Ltd.First Affiliated Hospital Bengbu Medical College; Ningbo Rongan Biological...Ei vielä rekrytointia
-
University Hospital, Montpelliersociete SkillCell - 97198 Jarry; CNRS Alcediag UMR9005 - societe Sys2Diag...Valmis
-
AIM Vaccine Co., Ltd.First Affiliated Hospital Bengbu Medical CollegeAktiivinen, ei rekrytointi
-
AIM Vaccine Co., Ltd.Hunan Provincial Center for Disease Control and PreventionValmis
-
Indiana UniversityValmis
-
Peking UniversityCenters for Disease Control and Prevention, China; Beijing Pinggu District... ja muut yhteistyökumppanitValmis
-
Assistance Publique - Hôpitaux de ParisValmis
-
Centre Hospitalier Universitaire DijonValmis
Kliiniset tutkimukset Tutkimus A
-
Radicle ScienceValmis
-
University of MichiganValmis
-
Radicle ScienceValmisNukkumishäiriö | Nukkua | UnihäiriötYhdysvallat
-
Radicle ScienceValmisKipu | Neuropaattinen kipu | Nosiseptiivinen kipuYhdysvallat
-
Radicle ScienceValmisKognitiivinen toimintoYhdysvallat
-
Radicle ScienceValmisMasennus | Kipu | Nukkua | AhdistusYhdysvallat
-
Radboud University Medical CenterUCB Pharma; Verily Life Sciences LLCAktiivinen, ei rekrytointiAivojen sairaudet | Keskushermoston sairaudet | Hermoston sairaudet | Parkinsonin tauti | Parkinsonin häiriöt | Basal ganglia -taudit | Liikkumishäiriöt | Neurodegeneratiiviset sairaudetAlankomaat
-
Radboud University Medical CenterUCB Pharma; Verily Life Sciences LLCValmisAivojen sairaudet | Liikkumishäiriöt | Neurodegeneratiiviset sairaudet | Progressiivinen supranukleaarinen halvausAlankomaat
-
Société des Produits Nestlé (SPN)ValmisEksokriininen haiman vajaatoimintaAustralia, Uusi Seelanti