- ICH GCP
- Rejestr badań klinicznych w USA
- Badanie kliniczne NCT04351503
Podejście systemowe do przewidywania skutków SARS-CoV-2 w populacji miasta; COVID 19
Podejście systemowe do przewidywania skutków SARS-CoV-2 w populacji miasta
Przegląd badań
Status
Interwencja / Leczenie
Szczegółowy opis
Aby ocenić wpływ nowego wirusa SARS-CoV-2, w niniejszym badaniu przeanalizowano wyniki kliniczne pacjentów z potwierdzoną infekcją SARS-CoV-2, stosując podejście systemowe. Celem jest integracja różnych zestawów danych obejmujących zmienne kliniczne i niekliniczne. Oprócz czynników gospodarza, takich jak wiek, płeć, choroby współistniejące i leczenie, uwzględniono czynniki mikrobiologiczne, takie jak miano wirusa SARS-CoV-2 przy użyciu (pół)ilościowego testu kwasu nukleinowego (QNAT), sekwencje genomu i specyficzne dla wirusa odpowiedzi immunologiczne . Ponadto aspekty epidemiologiczne w obrębie miasta, takie jak liczba zachorowań na określonych obszarach i wynikające z tego nasycenie systemu opieki zdrowotnej (np. hospitalizowanych pacjentów i zajętości OIOM), zostaną przeanalizowane. Dalsze dane epidemiologiczne zostaną wygenerowane na podstawie pomiarów biologicznych ze wszystkich dostępnych próbek surowicy i dróg oddechowych (materiał resztkowy) pobranych od lutego 2020 r. do listopada 2021 r. w ciągu dwóch sezonów, ponieważ prawdopodobne jest, że druga fala będzie krążyć w następnej zimie 2020/2021.
W ramach tego projektu zostaną przeprowadzone trzy badania retrospektywne:
Badanie A: retrospektywne obserwacyjne badanie kliniczno-kontrolne w celu przewidywania wyników klinicznych i cech zakażenia SARS-CoV-2. Zbadane zostaną wyniki kliniczne pacjentów zakażonych SARSCoV-2 (przypadki) i pacjentów niezakażonych SARS-CoV-2 z innymi wirusami układu oddechowego lub bez nich (grupa kontrolna).
Badanie B: retrospektywne obserwacyjne badanie epidemiologiczne w celu opisania epidemiologii wybuchu SARS-CoV-2; opis rozprzestrzeniania się epidemiologicznego nowego wirusa SARS-CoV-2 wśród osób mieszkających w Bazylei.
Badanie C: retrospektywne obserwacyjne badanie ewolucji wirusów, w ramach którego materiały oddechowe i pasujące materiały krwi i tkanek zostaną wykorzystane do przeprowadzenia sekwencjonowania całego genomu w celu zbadania ewolucji patogenu między żywicielami, jak również ewolucji wewnątrz żywiciela. Żadne dodatkowe materiały nie będą zbierane. Genomy wirusów uzyskane podczas fazy ekspansji, szczytu i kurczenia się pandemii zostaną porównane w celu zidentyfikowania predyktorów ewolucji wirusa, miana wirusa, większości gatunków, wariantów ucieczki immunologicznej oraz implikacji dla wyników klinicznych, wykrywania diagnostycznego, leczenia i projektowania szczepionek . Interesujące będzie korelowanie w szczególności występowania i częstości oraz wariantów ponownych zakażeń SARS-CoV-2 w blokach miejskich o wysokiej aktywności i ryzyku narażenia.
Badanie D: retrospektywne obserwacyjne badanie wyników leczenia, w którym wyniki kliniczne, dane laboratoryjne, radiologiczne, dotyczące czynności płuc i wirusologiczne, a także dane dotyczące odpowiedzi immunologicznej zostaną wykorzystane do zbadania bezpieczeństwa i skuteczności różnych metod leczenia. Wszystkie dane i materiały będą zbierane rutynowo podczas hospitalizacji iw warunkach ambulatoryjnych w celu oceny bezpieczeństwa i wpływu różnych metod leczenia na wynik.
Typ studiów
Zapisy (Rzeczywisty)
Kontakty i lokalizacje
Lokalizacje studiów
-
-
-
Allschwil, Szwajcaria, 4123
- Viollier AG
-
Basel, Szwajcaria, 4031
- University Hospital Basel
-
Basel, Szwajcaria, 4056
- Biozentrum University of Basel
-
Basel, Szwajcaria, 4056
- sciCore University of Basel
-
Basel, Szwajcaria, 4058
- Department of Biosystems Science and Engineering ETH Zurich
-
Geneva, Szwajcaria, 1202
- Swiss Institute of Bioinformatics
-
-
Kryteria uczestnictwa
Kryteria kwalifikacji
Wiek uprawniający do nauki
- Dziecko
- Dorosły
- Starszy dorosły
Akceptuje zdrowych ochotników
Metoda próbkowania
Badana populacja
Opis
Kryteria przyjęcia:
- Badanie A: Wszyscy pacjenci poddawani testom na SARS-CoV-2 w szpitalu uniwersyteckim w Bazylei (USB) i mieszkający w Bazylei (Bazylea-Miasto, Riehen i Bettingen) zostaną włączeni do oceny wyników klinicznych. Uwzględnione zostaną wszystkie grupy wiekowe. Ponadto uwzględnione zostaną dane niekliniczne, takie jak dane epidemiologiczne i związane ze szpitalem wszystkich osób mieszkających w Bazylei, ale niekoniecznie przebadanych w Szpitalu Uniwersyteckim w Bazylei
- Badanie B: Uwzględnione zostaną dane epidemiologiczne oraz próbki surowicy i próbek z dróg oddechowych we wszystkich grupach wiekowych od osób mieszkających w Bazylei (Bazylea-Miasto, Riehen i Bettingen) z potwierdzoną infekcją SARS-CoV-2 i bez niej
- Badanie C: Analiza genomu wirusa SARS-CoV-2 zostanie przeprowadzona u wszystkich pacjentów z pozytywnym wynikiem badania na obecność genomu SARS-CoV-2 przez NAT w Szpitalu Uniwersyteckim w Bazylei i mieszkających w Bazylei (Bazylea-Miasto, Riehen i Bettingen). Ponadto analiza genomu wirusowego zostanie przeprowadzona od wszystkich osób, u których uzyskano pozytywny wynik testu na obecność genomu SARS-CoV-2 przez NAT mieszkających w Bazylei przez wspomnianych partnerów badania. Wszystkie grupy wiekowe zostaną uwzględnione.
- Pacjenci z wyleczoną infekcją SARS-CoV-2 zgłaszający się na pobranie osocza zostaną uwzględnieni w celu opisania odpowiedzi immunologicznej po pomyślnym wyleczeniu infekcji.
Kryteria wyłączenia:
- udokumentowana odmowa zgody ogólnej lub dostępne/znane pisemne lub ustne oświadczenie przeciwko Research
- Osoby, które są testowane w USB, mieszkające poza Bazyleą (Bazylea-Miasto, Riehen i Bettingen)
Plan studiów
Jak projektuje się badanie?
Szczegóły projektu
Kohorty i interwencje
Grupa / Kohorta |
Interwencja / Leczenie |
|---|---|
|
Pacjenci zakażeni SARSCoV (przypadki)
|
Badanie A: gromadzenie danych dotyczących wyników klinicznych i cech zakażenia SARS-CoV-2.
Analizie poddane zostaną dane demograficzne, kliniczne, mikrobiologiczne, laboratoryjne, epidemiologiczne i szpitalne.
W tej części badania uwzględnieni zostaną tylko pacjenci z wizytą w szpitalu uniwersyteckim w Bazylei, aby uzyskać dostęp do kart pacjentów.
Badanie B: gromadzenie danych z nadzoru epidemiologicznego w celu opisania epidemiologii wybuchu SARS-CoV-2.
Epidemia przenoszenia wirusów grypy w mieście Bazylea służy jako ważny punkt odniesienia do identyfikacji podobieństw i różnic w sytuacji związanej z pandemią SARS-CoV-2.
Dodatkowo dane zbierane w ramach projektów Influenza – w szczególności dane dotyczące bloków statystycznych miasta, m.in.
gęstość zaludnienia, dochody i przestrzeń życiowa zostaną ponownie wykorzystane.
Próbki już pobrane i przechowywane, takie jak surowica i materiał oddechowy (pozostałości materiału), zostaną (ponownie) wykorzystane.
Badanie C: gromadzenie danych dotyczących ewolucji wirusów.
Materiały oddechowe oraz pasujące materiały krwi i tkanek zostaną wykorzystane do przeprowadzenia sekwencjonowania całego genomu w celu zbadania ewolucji patogenów między żywicielami, jak również ewolucji wewnątrz żywiciela.
Żadne dodatkowe materiały nie będą zbierane.
Badanie D: gromadzenie danych dotyczących bezpieczeństwa i skuteczności różnych metod leczenia. Obecnie w ramach leczenia brane są pod uwagę następujące zabiegi:
|
|
pacjenci niezakażeni SARS-CoV-2 (kontrola)
pacjenci niezakażeni SARS-CoV-2 z lub bez innych wirusów układu oddechowego (kontrola).
|
Badanie A: gromadzenie danych dotyczących wyników klinicznych i cech zakażenia SARS-CoV-2.
Analizie poddane zostaną dane demograficzne, kliniczne, mikrobiologiczne, laboratoryjne, epidemiologiczne i szpitalne.
W tej części badania uwzględnieni zostaną tylko pacjenci z wizytą w szpitalu uniwersyteckim w Bazylei, aby uzyskać dostęp do kart pacjentów.
|
Co mierzy badanie?
Podstawowe miary wyniku
Miara wyniku |
Opis środka |
Ramy czasowe |
|---|---|---|
|
Identyfikacja czynników związanych z (i) infekcją (binarnie, tak/nie), (ii) hospitalizacją (binarnie, tak/nie), (iii) wymogiem leczenia na OIT (binarnie, tak/nie)
Ramy czasowe: na linii bazowej
|
Identyfikacja czynników związanych z (i) infekcją (binarnie, tak/nie), (ii) hospitalizacją (binarnie, tak/nie), (iii) wymogiem leczenia na OIT (binarnie, tak/nie)
|
na linii bazowej
|
|
czas hospitalizacji (w dniach)
Ramy czasowe: na linii bazowej
|
czas hospitalizacji (w dniach)
|
na linii bazowej
|
|
czas pobytu na Oddziale Intensywnej Terapii (OIOM) (w dniach)
Ramy czasowe: na linii bazowej
|
czas pobytu na OIT (w dniach)
|
na linii bazowej
|
|
śmiertelność wewnątrzszpitalna (binarna, tak/nie)
Ramy czasowe: na linii bazowej
|
śmiertelność wewnątrzszpitalna (binarna, tak/nie)
|
na linii bazowej
|
|
Liczba zakażonych przypadków w mieście Bazylea
Ramy czasowe: na linii bazowej
|
Liczba zakażonych przypadków potwierdzonych testem kwasu nukleinowego (NAT) lub pozytywną serologią w mieście Bazylea wyrażona jako częstość występowania na blok statystyczny
|
na linii bazowej
|
|
sekwencjonowanie całego genomu w celu zbadania ewolucji patogenów (liczba, typ i złożoność genomu wirusowego)
Ramy czasowe: na linii bazowej
|
Liczba, rodzaj i złożoność wariantów i quasi-gatunków genomu wirusowego zidentyfikowanych przez głębokie sekwencjonowanie podczas wzrostu, szczytu i kurczenia się pandemii u pacjentów i obszarów geograficznych.
|
na linii bazowej
|
|
Identyfikacja, która metoda leczenia jest związana ze zdarzeniami niepożądanymi (binarnie, tak/nie)
Ramy czasowe: na linii bazowej
|
Identyfikacja, która metoda leczenia jest związana ze zdarzeniami niepożądanymi (binarnie, tak/nie)
|
na linii bazowej
|
|
Identyfikacja, która metoda leczenia jest związana z regeneracją płuc (binarnie, tak/nie)
Ramy czasowe: po 30 i 90 dniach
|
Identyfikacja, która metoda leczenia jest związana z regeneracją płuc (binarnie, tak/nie)
|
po 30 i 90 dniach
|
Współpracownicy i badacze
Współpracownicy
Śledczy
- Główny śledczy: Adrian Egli, Prof. Dr. med., Division of Clinical Bacteriology & Mycology, University Hospital Basel
Publikacje i pomocne linki
Publikacje ogólne
- Sava M, Sommer G, Daikeler T, Woischnig AK, Martinez AE, Leuzinger K, Hirsch HH, Erlanger T, Wiencierz A, Bassetti S, Tamm M, Tschudin-Sutter S, Stoeckle M, Pargger H, Siegemund M, Boss R, Zimmer G, Vu DL, Kaiser L, Dell-Kuster S, Weisser M, Battegay M, Hostettler K, Khanna N. Ninety-day outcome of patients with severe COVID-19 treated with tocilizumab - a single centre cohort study. Swiss Med Wkly. 2021 Aug 10;151:w20550. doi: 10.4414/smw.2021.20550. eCollection 2021 Aug 2.
- Seth-Smith H, Vesenbeckh S, Egli A, Ott S. SARS-CoV-2 in an immunocompromised host: convalescent plasma therapy and viral evolution elucidated by whole genome sequencing. BMJ Case Rep. 2023 Dec 9;16(12):e255255. doi: 10.1136/bcr-2023-255255.
- Peter JK, Wegner F, Gsponer S, Helfenstein F, Roloff T, Tarnutzer R, Grosheintz K, Back M, Schaubhut C, Wagner S, Seth-Smith HMB, Scotton P, Redondo M, Beckmann C, Stadler T, Salzmann A, Kurth H, Leuzinger K, Bassetti S, Bingisser R, Siegemund M, Weisser M, Battegay M, Sutter ST, Lebrand A, Hirsch HH, Fuchs S, Egli A. SARS-CoV-2 Vaccine Alpha and Delta Variant Breakthrough Infections Are Rare and Mild but Can Happen Relatively Early after Vaccination. Microorganisms. 2022 Apr 21;10(5):857. doi: 10.3390/microorganisms10050857.
- Bruningk SC, Klatt J, Stange M, Mari A, Brunner M, Roloff TC, Seth-Smith HMB, Schweitzer M, Leuzinger K, Sogaard KK, Albertos Torres D, Gensch A, Schlotterbeck AK, Nickel CH, Ritz N, Heininger U, Bielicki J, Rentsch K, Fuchs S, Bingisser R, Siegemund M, Pargger H, Ciardo D, Dubuis O, Buser A, Tschudin-Sutter S, Battegay M, Schneider-Sliwa R, Borgwardt KM, Hirsch HH, Egli A. Determinants of SARS-CoV-2 transmission to guide vaccination strategy in an urban area. Virus Evol. 2022 Mar 17;8(1):veac002. doi: 10.1093/ve/veac002. eCollection 2022.
- Stange M, Mari A, Roloff T, Seth-Smith HM, Schweitzer M, Brunner M, Leuzinger K, Sogaard KK, Gensch A, Tschudin-Sutter S, Fuchs S, Bielicki J, Pargger H, Siegemund M, Nickel CH, Bingisser R, Osthoff M, Bassetti S, Schneider-Sliwa R, Battegay M, Hirsch HH, Egli A. SARS-CoV-2 outbreak in a tri-national urban area is dominated by a B.1 lineage variant linked to a mass gathering event. PLoS Pathog. 2021 Mar 19;17(3):e1009374. doi: 10.1371/journal.ppat.1009374. eCollection 2021 Mar.
Daty zapisu na studia
Główne daty studiów
Rozpoczęcie studiów (Rzeczywisty)
Zakończenie podstawowe (Rzeczywisty)
Ukończenie studiów (Rzeczywisty)
Daty rejestracji na studia
Pierwszy przesłany
Pierwszy przesłany, który spełnia kryteria kontroli jakości
Pierwszy wysłany (Rzeczywisty)
Aktualizacje rekordów badań
Ostatnia wysłana aktualizacja (Rzeczywisty)
Ostatnia przesłana aktualizacja, która spełniała kryteria kontroli jakości
Ostatnia weryfikacja
Więcej informacji
Terminy związane z tym badaniem
Słowa kluczowe
Dodatkowe istotne warunki MeSH
Inne numery identyfikacyjne badania
- 2020-00769; qu20Egli2
Informacje o lekach i urządzeniach, dokumenty badawcze
Bada produkt leczniczy regulowany przez amerykańską FDA
Bada produkt urządzenia regulowany przez amerykańską FDA
Te informacje zostały pobrane bezpośrednio ze strony internetowej clinicaltrials.gov bez żadnych zmian. Jeśli chcesz zmienić, usunąć lub zaktualizować dane swojego badania, skontaktuj się z register@clinicaltrials.gov. Gdy tylko zmiana zostanie wprowadzona na stronie clinicaltrials.gov, zostanie ona automatycznie zaktualizowana również na naszej stronie internetowej .
Badania kliniczne na Zakażenie koronawirusem SARS (SARS-CoV-2).
-
VA Office of Research and DevelopmentZakończonyTestowanie SARS Coronavirus 2 RT-PCRStany Zjednoczone
-
AIM Vaccine Co., Ltd.Zhejiang Provincial Center for Disease Control and PreventionJeszcze nie rekrutacja
-
AIM Vaccine Co., Ltd.First Affiliated Hospital Bengbu Medical College; Ningbo Rongan Biological Pharmaceutical...Jeszcze nie rekrutacja
-
AIM Vaccine Co., Ltd.First Affiliated Hospital Bengbu Medical CollegeAktywny, nie rekrutujący
-
AIM Vaccine Co., Ltd.Hunan Provincial Center for Disease Control and PreventionZakończony
-
Indiana UniversityZakończonySARS-CoV-2Stany Zjednoczone
-
Peking UniversityCenters for Disease Control and Prevention, China; Beijing Pinggu District Hospital i inni współpracownicyZakończony
-
Assistance Publique - Hôpitaux de ParisZakończony
-
University Hospital, Montpelliersociete SkillCell - 97198 Jarry; CNRS Alcediag UMR9005 - societe Sys2Diag -...Zakończony
-
Centre Hospitalier Universitaire DijonZakończony
Badania kliniczne na Studium A
-
Baylor College of MedicineUniversity of Houston; Prairie View A&M UniversityRekrutacyjnyDziecięca otyłość | Nawyki żywieniowe | Zachowanie żywieniowe | Wybór żywnościStany Zjednoczone
-
Radicle ScienceZakończony
-
Radicle ScienceZakończonyDepresja | Ból | Spać | LękStany Zjednoczone
-
University of MichiganZakończony
-
University of MichiganZakończonyTelemedycynaStany Zjednoczone
-
M2 IngredientsRekrutacyjnySpadek poznawczyStany Zjednoczone
-
Apple Inc.Stanford UniversityZakończonyMigotanie przedsionków | Zaburzenia rytmu serca | Trzepotanie przedsionkówStany Zjednoczone
-
Radicle ScienceZakończonyFunkcja poznawczaStany Zjednoczone
-
Radicle ScienceZakończony
-
Zhujiang HospitalZakończonyChoroba wątroby związana z alkoholemChiny