Ezt az oldalt automatikusan lefordították, és a fordítás pontossága nem garantált. Kérjük, olvassa el a angol verzió forrásszöveghez.

NIPD a cffDNS-ről a hármas ismétlődő betegségekre

2021. január 4. frissítette: University Hospital, Montpellier

A szülői haplotípusok két NGS-fázisozási technikájának összehasonlítása a hármasfejű expanziós betegségek NIPD-jére

A tanulmány célja egy analitikus NIPD-teszt kidolgozása és validálása a triplett ismétlődő betegségekre anyai vérből származó NGS-analízissel, a családi mutáció felkutatása olyan családokban, amelyeknél fennáll a következő hármas ismétlődő betegségek valamelyike: Huntington-kór, Myotonic dystrophia, Fragile X szindróma.. Összehasonlítjuk két 3. generációs hosszú DNS-szekvenálási technikát. Ezek a módszerek a proband nélküli szülői haplotípusok fázisozási technikáin alapulnak.

A tanulmány áttekintése

Állapot

Aktív, nem toborzó

Körülmények

Beavatkozás / kezelés

Részletes leírás

Kontextus:

A magzati cfDNS szekvenálásának képessége izgalmas új fejleményekhez vezetett a monogén betegségek non-invazív genetikai diagnózisában (DPNI_MGR). Különféle teszteket javasolnak a túlnyomórészt de novo domináns, domináns apai és néhány recesszív apai mutációval járó betegségekre. Mindazonáltal az anyai allélegyensúly meghatározásával kapcsolatos technikai nehézségek továbbra is fennállnak, különösen a szülői haplotípusok szakaszosítása során egy trióstratégia szerint, amely megköveteli a szülői genomiális DNS-ek és legalább egy egészséges vagy érintett gyermek rendelkezésre állását. Ezenkívül a 2. generációs szekvenátorok nem teszik lehetővé a dinamikus mutációkat hordozó allélek haplotipizálását.

Célok:

Ez a projekt egy félig univerzális DPNI_MGR-teszt validálását javasolja, amely a szülői haplotípusok szakaszosításából származó DPN-kérésekben részt vevő gének és mutációk többségére alkalmazható 3. generációs hosszú fragmens DNS-szekvenálási technikákkal, valamint az anyai plazmából származó szabadon keringő DNS célzott szekvenálásával. . Ezt a tesztet a triplet expanziós betegségek segítségével validálják, amelyek a DPN második indikációja nemzeti szinten.

Módszertan:

Retrospektív vizsgálat 16 páron, akiknél fennáll a hármas expanzióval járó betegség átvitelének kockázata (Steinert myotóniás disztrófiája, Huntington-kór, FRAXA, SCA1, 2, 3)

1. fázis:

  • 8 pár szülői haplotípus meghatározása a "Nanopore Cas9 Targeted-Sequencing" (nCATS) technikával, valamint e módszer analitikai paramétereinek és minőségének validálása (érdekes régiók lefedettségi aránya, hibaarány, kóros allélt hordozó azonosítás a bővítés...),
  • A "Nanopore" technikával kapott szülői haplotípusok összehasonlítása a "Linked Reads 10xGenomics" technikával ugyanabban a 8 párban kapott haplotípusokkal (a szekvenálási és fázisozási adatok ezzel a 2. megközelítéssel egy korábbi tanulmányból állnak rendelkezésre),
  • A standard vizsgálat (DPN amniocentesis vagy choriocentesis) során kapott magzati genotípus eredményeinek és a PNID fázisosításának ezen új megközelítéseivel kapott eredmények egyezésének értékelése.

2. fázis:

- Az 1. fázis legjobban teljesítő munkafolyamatának (hatékonyság / költség) validálása 8 további páron a megközelítés klinikai átviteléhez.

Várható eredmények és kilátások:

Ennek a vizsgálatnak lehetővé kell tennie a triplet expanziós betegségek DPNI-jének legjobban teljesítő tesztjének meghatározását a szakterület ismeretének megfelelően, valamint a megközelítés klinikai gyakorlatában az átvitel feltételeinek validálását (berendezések, reagensek, költségelemzés, analitikai validálási kritériumok). ....).

A validált munkafolyamatnak a lehető leguniverzálisabbnak kell lennie, hogy másodlagosan nemzeti szintű hozzáférést biztosítson a ritka betegségek széles skálájához, a szabadon keringő DNS-szekvenáló panelek géntartalmának jövőbeni módosításával.

Tanulmány típusa

Megfigyelő

Beiratkozás (Várható)

36

Kapcsolatok és helyek

Ez a rész a vizsgálatot végzők elérhetőségeit, valamint a vizsgálat lefolytatásának helyére vonatkozó információkat tartalmazza.

Tanulmányi helyek

Részvételi kritériumok

A kutatók olyan embereket keresnek, akik megfelelnek egy bizonyos leírásnak, az úgynevezett jogosultsági kritériumoknak. Néhány példa ezekre a kritériumokra a személy általános egészségi állapota vagy a korábbi kezelések.

Jogosultsági kritériumok

Tanulmányozható életkorok

1 év és régebbi (FELNŐTT, OLDER_ADULT, GYERMEK)

Egészséges önkénteseket fogad

Nem

Tanulmányozható nemek

Összes

Mintavételi módszer

Nem valószínűségi minta

Tanulmányi populáció

Retrospektív vizsgálat 16 páron, akiknél fennáll a hármas expanzióval járó betegség átvitelének kockázata (Steinert myotonic dystrophia, Huntington-kór, FRAXA) Dinamikus mutáció okozta monogén betegség miatt prenatális diagnózis alatt álló párok

Leírás

Bevételi kritériumok:

  • Egy pár veszélyeztetett (családi anamnézis vagy echográfiai leletek alapján) a következő betegségek valamelyikében: Huntington-kór, Steinert-miotóniás dystrophia, törékeny X
  • A DIACCIMEX vizsgálathoz írásos beleegyezést szereztek, és megemlítették, hogy "felhasználási engedély a családi patológiával kapcsolatos további vizsgálatokhoz. Valójában a DNS névtelenül felhasználható a nem invazív prenatális diagnosztika új elemzéseinek kidolgozásához.
  • A prenatális diagnózist a terhességre vonatkozóan végezték el, amely során anyai vért vettek
  • A következő betegségek (Huntington-kór, Steinert-féle myotóniás dystrophia, fragilis X és spinocerebelláris ataxiák 1, 2 vagy 3) páros molekuláris diagnosztikai eredményeinek ELKÉRHETŐNEK KELL KELL állnia.

Kizárási kritériumok:

  • A pár genomiális DNS nem érhető el
  • Olyan alanyok, akiknél fennáll a családi betegség átvitelének kockázata, de nem akarják tudni molekuláris állapotukat
  • Bírósági határozattal gondnokság alatt álló személyek

Tanulási terv

Ez a rész a vizsgálati terv részleteit tartalmazza, beleértve a vizsgálat megtervezését és a vizsgálat mérését.

Hogyan készül a tanulmány?

Tervezési részletek

Kohorszok és beavatkozások

Csoport / Kohorsz
Beavatkozás / kezelés
16 terhes nő és házastársuk
Genetikai: Nem invazív prenatális diagnózis
A szülői haplotípusok fázisbeosztásából származó DPN-kérésekben szerepet játszó családi mutációk 3. generációs, hosszú fragmentumú DNS-szekvenálási technikákkal, valamint az anyai plazmából származó szabad keringő DNS célzott szekvenálásával párosulva.

Mit mér a tanulmány?

Elsődleges eredményintézkedések

Eredménymérő
Intézkedés leírása
Időkeret
A sejtmentes magzati DNS-alapú genetika közötti összhang
Időkeret: 36 hónap
t egy kvalitatív analízis: minden egyes terhes nő minden mintájánál anyai vérből határozzák meg a triplet expanzióért felelős mutáció (vagy kóros haplotípus) hiányát (nem invazív terhességi diagnosztika). az eredmény lehet: egészséges magzat, érintett magzat vagy nem meggyőző eredmény (azaz az elemzés nem tette lehetővé annak megállapítását, hogy a magzat érintett lesz-e vagy sem) Ezt követően a sejtalapú genetikai non-invazív prenatális teszt és a konkordancia arányának meghatározása arany standard prenatális teszt (choiocentesis vagy amniocentesis). Az új NIPD (Non-Invasive Prenatal Diagnosis) módszerünkkel kapott prenatális eredmények és az aranystandard prenatális genetikai teszt során vakon kapott eredmények egybehangzó elemzését minden vizsgálatban részt vevő terhes nő esetében elvégezzük.
36 hónap

Másodlagos eredményintézkedések

Eredménymérő
Intézkedés leírása
Időkeret
Kvalitatív eljárás a sejtmentes magzati DNS elemzésének különböző lépéseinek meghatározására
Időkeret: 36 hónap
Minőségi választás: határozza meg a leghatékonyabb munkafolyamatot a költség/hatékonyság arány szempontjából a két hosszú fragmentum-szekvenálási készlet között (egyszerűség, gyorsaság, pontosság és a termékek költsége)
36 hónap

Együttműködők és nyomozók

Itt találhatja meg a tanulmányban érintett személyeket és szervezeteket.

Szponzor

University Hospital, Montpellier

Együttműködők

Agence de La Biomédecine

Publikációk és hasznos linkek

A vizsgálattal kapcsolatos információk beviteléért felelős személy önkéntesen bocsátja rendelkezésre ezeket a kiadványokat. Ezek bármiről szólhatnak, ami a tanulmányhoz kapcsolódik.

Általános kiadványok

Tanulmányi rekorddátumok

Ezek a dátumok nyomon követik a ClinicalTrials.gov webhelyre benyújtott vizsgálati rekordok és összefoglaló eredmények benyújtásának folyamatát. A vizsgálati feljegyzéseket és a jelentett eredményeket a Nemzeti Orvostudományi Könyvtár (NLM) felülvizsgálja, hogy megbizonyosodjon arról, hogy megfelelnek-e az adott minőség-ellenőrzési szabványoknak, mielőtt közzéteszik őket a nyilvános weboldalon.

Tanulmány főbb dátumok

Tanulmány kezdete (TÉNYLEGES)

2020. szeptember 1.

Elsődleges befejezés (VÁRHATÓ)

2023. szeptember 1.

A tanulmány befejezése (VÁRHATÓ)

2023. december 1.

Tanulmányi regisztráció dátumai

Először benyújtva

2020. szeptember 1.

Először nyújtották be, amely megfelel a minőségbiztosítási kritériumoknak

2021. január 4.

Első közzététel (TÉNYLEGES)

2021. január 7.

Tanulmányi rekordok frissítései

Utolsó frissítés közzétéve (TÉNYLEGES)

2021. január 7.

Az utolsó frissítés elküldve, amely megfelel a minőségbiztosítási kritériumoknak

2021. január 4.

Utolsó ellenőrzés

2020. szeptember 1.

Több információ

A tanulmányhoz kapcsolódó kifejezések

Kulcsszavak

További vonatkozó MeSH feltételek

Egyéb vizsgálati azonosító számok

  • RECHMPL20_0441

Terv az egyéni résztvevői adatokhoz (IPD)

Tervezi megosztani az egyéni résztvevői adatokat (IPD)?

ELDÖNTETLEN

IPD terv leírása

NC

Gyógyszer- és eszközinformációk, tanulmányi dokumentumok

Egy amerikai FDA által szabályozott gyógyszerkészítményt tanulmányoz

Nem

Egy amerikai FDA által szabályozott eszközterméket tanulmányoz

Nem

Ezt az információt közvetlenül a clinicaltrials.gov webhelyről szereztük be, változtatás nélkül. Ha bármilyen kérése van vizsgálati adatainak módosítására, eltávolítására vagy frissítésére, kérjük, írjon a következő címre: register@clinicaltrials.gov. Amint a változás bevezetésre kerül a clinicaltrials.gov oldalon, ez a webhelyünkön is automatikusan frissül. .

Klinikai vizsgálatok a Fragile X szindróma

Keressen hasonló próbaverziókban

Szponzorok és közreműködők

Egészségi állapot

Kábítószer-beavatkozások

CROs by country

CROs in Mozambique

Körülmények

Ritka betegségek

Kábítószer-beavatkozások

Táplálék-kiegészítők

Szponzor / közreműködők

Helyek

3
Iratkozz fel