- ICH GCP
- Реестр клинических исследований США
- Клиническое испытание NCT04698551
NIPD на cffDNA при триплетных повторных заболеваниях
Сравнение двух методов NGS фазирования родительских гаплотипов для NIPD болезней экспансии триплетов
Обзор исследования
Статус
Вмешательство/лечение
Подробное описание
Контекст:
Возможность секвенировать вкДНК плода привела к новым захватывающим разработкам в области неинвазивной генетической диагностики моногенных заболеваний (DPNI_MGR). Предлагаются различные тесты для заболеваний с преимущественно de novo доминантными, доминантными отцовскими и некоторыми рецессивными отцовскими мутациями. Тем не менее, технические трудности, связанные с определением материнского аллельного баланса, остаются, в частности, во время фазирования родительских гаплотипов в соответствии со стратегией трио, которая требует наличия родительских геномных ДНК и по крайней мере одного здорового или больного ребенка. Более того, секвенаторы 2-го поколения не позволяют проводить гаплотипирование аллелей, несущих динамические мутации.
Цели:
В этом проекте предлагается валидация полууниверсального теста DPNI_MGR, применимого к большинству генов и мутаций, участвующих в запросах DPN, от фазирования родительских гаплотипов с помощью методов секвенирования длинных фрагментов ДНК 3-го поколения в сочетании с целевым секвенированием свободно циркулирующей ДНК из материнской плазмы. . Этот тест будет подтвержден с использованием болезней тройной экспансии, которые являются вторым показанием к ДПН на национальном уровне.
Методология:
Ретроспективное исследование 16 пар с риском передачи заболевания с триплетной экспансией (миотоническая дистрофия Штейнерта, болезнь Хантингтона, FRAXA, SCA1, 2, 3)
Фаза 1 :
- Определение 8 пар родительских гаплотипов по методике «Nanopore Cas9 Targeted-Sequencing» (nCATS) и валидация аналитических параметров и качества данной методики (степень охвата областей интереса, частота ошибок, идентификация патологического аллеля, несущего расширение...),
- Сравнение родительских гаплотипов, полученных методом «Nanopore», с гаплотипами, полученными методом «Linked Reads 10xGenomics» в тех же 8 парах (данные секвенирования и фазирования с помощью этого второго подхода доступны из предыдущего исследования),
- Оценка соответствия результатов генотипа плода, полученных при стандартном обследовании (ДПН путем амниоцентеза или хориоцентеза) и данных, полученных при этих новых подходах фазирования в PNID.
Фаза 2:
- Проверка наилучшего рабочего процесса (эффективность / стоимость) фазы 1 по 8 дополнительным парам для клинического переноса подхода.
Ожидаемые результаты и перспективы:
Это исследование должно позволить определить наиболее эффективный тест для DPNI заболеваний триплетной экспансии в соответствии со знаниями в данной области и подтвердить условия переноса в клиническую практику подхода (оборудование, реагенты, анализ затрат, критерии аналитической валидации). ....).
Утвержденный рабочий процесс должен быть как можно более универсальным, чтобы во вторую очередь обеспечить доступ на национальном уровне к широкому спектру NIDP редких заболеваний путем будущих корректировок содержания генов в свободно циркулирующих панелях секвенирования ДНК.
Тип исследования
Регистрация (Ожидаемый)
Контакты и местонахождение
Места учебы
-
-
-
Montpellier, Франция, 34295
- CHU Montpellier
-
-
Критерии участия
Критерии приемлемости
Возраст, подходящий для обучения
Принимает здоровых добровольцев
Полы, имеющие право на обучение
Метод выборки
Исследуемая популяция
Описание
Критерии включения:
- Пара подвержена риску (на основании семейного анамнеза или результатов эхографии) одного из следующих заболеваний: болезнь Гентингтона, миотоническая дистрофия Штейнерта, ломкая X
- На исследование DIACCIMEX было получено письменное информированное согласие, в котором упоминалось «разрешение на использование для дальнейших исследований семейной патологии». Действительно, ДНК можно использовать анонимно для разработки новых анализов неинвазивной пренатальной диагностики».
- Пренатальная диагностика была проведена для беременных, во время которых был взят образец материнской крови.
- ДОЛЖНЫ БЫТЬ ДОСТУПНЫ парные результаты молекулярной диагностики одного из следующих заболеваний (болезнь Гентингтона, миотоническая дистрофия Штейнерта, ломкая Х-хромосома и спиноцеребеллярная атаксия 1, 2 или 3).
Критерий исключения:
- Геномная ДНК пары недоступна
- Субъекты, подверженные риску передачи семейного заболевания, но не желающие знать свой молекулярный статус
- Лица, находящиеся под опекой по решению суда
Учебный план
Как устроено исследование?
Детали дизайна
Когорты и вмешательства
Группа / когорта |
Вмешательство/лечение |
---|---|
16 беременных женщин и их супругов
|
Поиск семейной мутации, связанной с запросами DPN от фазирования родительских гаплотипов, с помощью методов секвенирования длинных фрагментов ДНК 3-го поколения в сочетании с целевым секвенированием свободно циркулирующей ДНК из материнской плазмы.
|
Что измеряет исследование?
Первичные показатели результатов
Мера результата |
Мера Описание |
Временное ограничение |
---|---|---|
Коэффициент соответствия между генетическими данными на основе бесклеточной ДНК плода
Временное ограничение: 36 месяцев
|
Это качественный анализ: для каждого образца каждой беременной женщины будет определяться наличие или отсутствие мутации (или болезненного гаплотипа), ответственной за экспансию триплета, в материнской крови (неинвазивная диагностика беременности). результатом может быть: здоровый плод, пораженный плод или неокончательный результат (т. е. анализ не позволил сделать вывод, будет ли поражен плод или нет). Золотой стандарт пренатального теста (хориоцентез или амниоцентез).
Для каждой беременной женщины, участвующей в исследовании, будет проведен анализ соответствия пренатальных результатов, полученных с помощью нашего нового подхода NIPD (неинвазивная пренатальная диагностика), и результатов, полученных вслепую во время пренатального генетического теста золотого стандарта.
|
36 месяцев
|
Вторичные показатели результатов
Мера результата |
Мера Описание |
Временное ограничение |
---|---|---|
Качественный процесс для определения различных этапов анализа бесклеточной ДНК плода.
Временное ограничение: 36 месяцев
|
Качественный выбор: определите наиболее эффективный рабочий процесс с точки зрения соотношения стоимость/эффективность между двумя наборами для секвенирования длинных фрагментов (простота, скорость, точность и стоимость продуктов).
|
36 месяцев
|
Соавторы и исследователи
Спонсор
Соавторы
Публикации и полезные ссылки
Даты записи исследования
Изучение основных дат
Начало исследования (ДЕЙСТВИТЕЛЬНЫЙ)
Первичное завершение (ОЖИДАЕТСЯ)
Завершение исследования (ОЖИДАЕТСЯ)
Даты регистрации исследования
Первый отправленный
Впервые представлено, что соответствует критериям контроля качества
Первый опубликованный (ДЕЙСТВИТЕЛЬНЫЙ)
Обновления учебных записей
Последнее опубликованное обновление (ДЕЙСТВИТЕЛЬНЫЙ)
Последнее отправленное обновление, отвечающее критериям контроля качества
Последняя проверка
Дополнительная информация
Термины, связанные с этим исследованием
Ключевые слова
Дополнительные соответствующие термины MeSH
- Психические расстройства
- Заболевания головного мозга
- Заболевания центральной нервной системы
- Заболевания нервной системы
- Неврологические проявления
- Нейроповеденческие проявления
- Нейрокогнитивные расстройства
- Врожденные аномалии
- Генетические заболевания, врожденные
- Генетические заболевания, сцепленные с Х-хромосомой
- Заболевания опорно-двигательного аппарата
- Мышечные заболевания
- Нервно-мышечные заболевания
- Заболевания базальных ганглиев
- Двигательные расстройства
- Нейродегенеративные заболевания
- Дискинезии
- Мышечные расстройства, атрофические
- Умственная отсталость, Х-сцепленный
- Интеллектуальная недееспособность
- Наследственные дегенеративные заболевания, нервная система
- Слабоумие
- Когнитивные расстройства
- Хромосомные нарушения
- Нарушения половых хромосом
- Хорея
- Мышечные дистрофии
- Миотонические расстройства
- Синдром ломкой Х-хромосомы
- Болезнь Гентингтона
- Миотоническая дистрофия
Другие идентификационные номера исследования
- RECHMPL20_0441
Планирование данных отдельных участников (IPD)
Планируете делиться данными об отдельных участниках (IPD)?
Описание плана IPD
Информация о лекарствах и устройствах, исследовательские документы
Изучает лекарственный продукт, регулируемый FDA США.
Изучает продукт устройства, регулируемый Управлением по санитарному надзору за качеством пищевых продуктов и медикаментов США.
Эта информация была получена непосредственно с веб-сайта clinicaltrials.gov без каких-либо изменений. Если у вас есть запросы на изменение, удаление или обновление сведений об исследовании, обращайтесь по адресу register@clinicaltrials.gov. Как только изменение будет реализовано на clinicaltrials.gov, оно будет автоматически обновлено и на нашем веб-сайте. .
Клинические исследования Синдром ломкой Х-хромосомы
-
University of California, DavisNational Institute on Aging (NIA); Forest LaboratoriesЗавершенныйХрупкий Х-ассоциированный тремор/синдром атаксии | Премутационные носители Fragile XСоединенные Штаты
-
University of California, DavisNational Institute of Mental Health (NIMH)ЗавершенныйХрупкая премутация XСоединенные Штаты
-
The Catholic University of KoreaЗавершенныйМетаболический синдром X | Метаболический сердечно-сосудистый синдром | Синдром резистентности к инсулину X | Дисметаболический синдром XКорея, Республика
-
University of Colorado, DenverЗавершенныйСиндром Тернера | Синдром Тернера Мозаицизм, 45, X/46, XX или XY | Синдром Тернера Мозаицизм 46,X,I(X)(Q10)/45,X | Синдром Тернера Кариотип 46, X с аномальной половой хромосомой, кроме I (Xq)Соединенные Штаты
-
West China HospitalРекрутинг
-
Centre Hospitalier Universitaire de NīmesЗавершенныйРезистентность к инсулину | Метаболический синдром XФранция
-
Maastricht University Medical CenterЗавершенный
-
University of California, DavisЗавершенный
-
University of GuelphЗавершенныйМетаболический синдром XКанада
-
GlaxoSmithKlineЗавершенныйМетаболический синдром XИспания, Аргентина, Австралия, Латвия, Индия, Мексика, Пакистан, Словакия, Коста-Рика, Новая Зеландия, Румыния, Российская Федерация, Чили