Genomika a szívátültetésekben

Háttér: A szívtranszplantáció (HTx) a választott kezelés azon végstádiumú szívelégtelenségben szenvedő betegek számára, akik az optimális orvosi terápia ellenére is tünetek maradnak. Még a legjobb gyakorlatot követõ utókezelés mellett is nyolc HTx-beteg közül egy végül ischaemiás kardiomiopátiában és visszatérõ akut miokardiális infarktusban (AMI) hal meg. A klasszikus kockázati tényezők, mint például a szívtranszplantáció recipiens indikációja, megmagyarázzák a nemkívánatos kimenetelek egy részét, de önmagában egyetlen hagyományos kockázati tényező sem jósolná meg kielégítően a szív allograft vasculopathia (CAV) vagy a visszatérő AMI valószínűségét HTx betegekben; ráadásul a mögöttes patomechanizmusok is kevéssé ismertek.

Ezért sürgős szükség van a HTx-betegek visszatérő szívizom-ischaemiájához hozzájáruló tényezők jobb megértésére. A koszorúér-betegség genetikai architektúrájával kapcsolatos, az általános populációban végzett közelmúltbeli nagyszabású tanulmányok azt mutatják, hogy a poligén kockázati pontszámok (PRS) több betegségkockázatot magyaráznak, mint bármely nem genetikai kockázati tényező, de a longitudinális követési vizsgálatok hiánya miatt. mély fenotipizálással a PRS-t még nem alkalmazták széles körben a klinikai gyakorlatban. Ezenkívül a jelenlegi genetikai vizsgálatok microarray-eken vagy rövid leolvasású szekvenáláson alapulnak, ami súlyosan korlátozza a komplex vagy strukturális genetikai variációk hatásának jellemzését a teljes emberi genomban, valamint a HTx kimenetel szempontjából potenciálisan fontos kulcslókuszokban, amelyek befolyásolják, például a lipid anyagcsere (pl. LPA) és az immunogenetikai kompatibilitás (pl. a fő hisztokompatibilitási komplex).

Összefoglalva, jelenleg nincs olyan tanulmány, amely felhasználná a humán genom feloldásának jobb képességét régóta olvasott szekvenálási technológiákkal egy mélyen fenotípusos kohorszban a visszatérő szívizom-ischaemia jobb megértése érdekében.

A vizsgálat tervezése és céljai: Egy innovatív, háromkomponensű vizsgálati tervben átfogó fenotipizálás a legújabb, régóta olvasott szekvenálási technológiával és a számítási genomika algoritmikus fejlesztéseivel, hogy megvilágítsa a szívizom ischaemia genetikai és nem genetikai kockázati tényezőinek kölcsönhatását HTx-betegeknél, példátlan esetekben megoldást, és előkészíti az utat a részletes kockázati rétegződés és a személyre szabott kezelés felé

Jelentősége és transzlációs potenciál: A szerkezeti változatok, a nagy penetranciájú komplex variánsok és a nagy felbontású immunogenetika integrált elemzésének lehetővé tételével a hosszan leolvasott szekvenálás lehetővé teszi az ischaemia kialakulásának jobb genetikai modelljeit HTx-betegekben, és hozzájárul a betegség jobb megértéséhez. mögöttes patomechanizmusok. Ennek alapján a kutatók javaslatokat tehetnek az integrált kockázati pontszámok beépítésére a jövőbeni klinikai vizsgálatokba a személyre szabott kezelési rétegződés érdekében.