cfDNS 5mC/5hmC-alapú biomarker panel fejlesztése a célzott terápia hatékonyságának előrejelzésére mCRC-ben (EpiDRIVE)
cfDNS 5mC/5hmC-alapú epigenetikai biomarkerek paneljának fejlesztése a VEGF/EGFR-célzott terápia válaszának meghatározó tényezőinek azonosítására metasztatikus vastagbélrákban
Az EpiDRIVE vizsgálat célja, hogy azonosítsa a cfDNS-alapú epigenetikai válaszdeterminánsokat metasztatikus vastagbélrákban (mCRC) szenvedő betegeknél, akik EGFR- vagy VEGF-célzott terápiával kezeltek.
A 5-metilcitozin (5mC) és 5-hidroximetilcitozin (5hmC) profilozás integrálásával ez a vizsgálat egy prediktív biomarkercsoport kifejlesztésére törekszik, amely képes megkülönböztetni a célzott terápiára reagálókat és nem reagálókat.
A tanulmány áttekintése
Állapot
Körülmények
Részletes leírás
A metasztatikus vastagbélrák (mCRC) továbbra is a rákhalálok egyik vezető oka. Bár a célzott szerek, mint az anti-EGFR (cetuximab, panitumumab) és anti-VEGF (bevacizumab) terápiák javították a túlélést, a kezelési válasz erősen változik még molekulárisan meghatározott alcsoportokban is.
A hagyományos biomarkerek, beleértve a RAS/BRAF mutációt és a tumor oldalát, nem képesek pontosan előrejelezni a terápiás hatékonyságot.
Friss tanulmányok rávilágítanak a sejten kívüli DNS (cfDNS) metiláció (5mC) és hidroximetiláció (5hmC) potenciáljára, mint érzékeny, nem-invazív indikátorokra a tumor biológiájának és kezelési dinamikájának nyomon követésére.
Az EpiDRIVE tanulmány integrálja a cfDNS 5mC/5hmC szekvenálást és célzott validálást a terápiás választ meghatározó epigenetikai faktorok felfedezésére és ellenőrzésére.
Felfedezési fázis: Teljes genom 5mC/5hmC profilozás a válaszadók és nem válaszadók közötti különbözően módosult régiók azonosítására.
Képzési fázis: Célzott szekvenálás egy prediktív cfDNS epigenetikai panel (EpiDRIVE panel) létrehozására.
Validálási fázis: Kiválasztott markerek qPCR-alapú validálása egy független kohorszban a prediktív pontosság megerősítésére.
Ez a tanulmány célja, hogy nem-invazív biomarker keretrendszert nyújtson az EGFR- és VEGF-célzott terápiák hatékonyságának előrejelzésére és monitorozására mCRC-ben, végső soron személyre szabott kezelésválasztást segítve.
Tanulmány típusa
Beiratkozás (Becsült)
Kapcsolatok és helyek
Tanulmányi kapcsolat
- Név: Ajay Goel, PhD
- Telefonszám: 626-359-8111
- E-mail: ajgoel@coh.org
Tanulmányi helyek
-
-
California
-
Duarte, California, Egyesült Államok, 91016
- Toborzás
- City of Hope Medical Center
-
Kapcsolatba lépni:
- Ajay Goel, PhD
- Telefonszám: 626-218-3452
- E-mail: ajgoel@coh.org
-
-
Részvételi kritériumok
Jogosultsági kritériumok
Tanulmányozható életkorok
- Felnőtt
- Idősebb felnőtt
Egészséges önkénteseket fogad
Mintavételi módszer
Tanulmányi populáció
Leírás
Bevételi kritériumok:
- Hisztológiailag igazolt metastatikus kolorektális adenokarcinóma (mCRC).
- EGFR-célzott terápiát (cetuximab/panitumumab) vagy VEGF-célzott terápiát (bevacizumab) kapott.
- Preferápiás plazma minta rendelkezésre állása cfDNS elemzéshez.
- Dokumentált radiológiai válaszértékelés (RECIST 1.1).
- Ismert RAS/BRAF mutációs státusz.
Kizárási kritériumok:
- Nem megfelelő cfDNS minőség vagy alacsony cfDNS hozam.
- Nem adenokarcinóma hisztológia.
- Egyidejű vagy korábbi egyéb aktív malignitás.
- Aktív gyulladásos vagy autoimmun betegség, amely befolyásolja a cfDNS metilációs profilt.
Tanulási terv
Hogyan készül a tanulmány?
Tervezési részletek
Kohorszok és beavatkozások
Csoport / Kohorsz |
Beavatkozás / kezelés |
|---|---|
|
Felfedező Kohorsz - Hosszú PFS Csoport (Válaszadó)
A metasztatikus vastagbélrákban (mCRC) szenvedő betegek, akik EGFR- vagy VEGF-célzott terápiát kaptak és legalább 12 hónapos progressziómentes túlélést (PFS) értek el, klinikai válaszadókként lettek besorolva. A kezelés előtti plazma cfDNS mintákat genomszerinti 5mC/5hmC szekvenálással elemeztük, hogy azonosítsuk a tartós kezelési válasszal összefüggő epigenetikai meghatározókat. |
A felfedező kohorsz prekezelési plazmamintáinak nagy átviteli sebességű, genom-széles cfDNS metilációs (5mC) és hidroximetilációs (5hmC) profiljainak szekvenálása a célzott terápiára adott válasz epigenetikai meghatározóinak azonosítására (PFS ≥ 12 hónap vs < 12 hónap).
|
|
Felfedező Kohorsz - Rövid PFS Csoport (Nem Válaszoló)
A mCRC-ben szenvedő betegek, akik EGFR- vagy VEGF-célzott terápiát kaptak és progressziómentes túlélés (PFS) < 12 hónapot mutattak, nem válaszolókként lettek osztályozva. A kezelés előtti cfDNS-mintákat genom-szintű 5mC/5hmC szekvenálással elemezték és összehasonlították a hosszú PFS-ű válaszolókkal, hogy azonosítsák a rezisztenciához társuló differenciális metilációs és hidroximetilációs mintákat. |
A felfedező kohorsz prekezelési plazmamintáinak nagy átviteli sebességű, genom-széles cfDNS metilációs (5mC) és hidroximetilációs (5hmC) profiljainak szekvenálása a célzott terápiára adott válasz epigenetikai meghatározóinak azonosítására (PFS ≥ 12 hónap vs < 12 hónap).
|
|
Képző Kohorsz - Hosszú PFS Csoport (Válaszadó)
Független mCRC kohorsz, amelynél a progressziómentes túlélés (PFS) ≥ 12 hónap EGFR- vagy VEGF-célzott terápia után. A feltárási fázisban azonosított jelölt cfDNS 5mC/5hmC markereket célzott szekvenálással (EpiDRIVE teszt) validálták a prediktív epigenetikai biomarkereket tartalmazó panel összeállításához. |
Célzott szekvenálás vagy qPCR-alapú validáció a cfDNS 5mC/5hmC markereinek, amelyeket a felfedezési fázisban azonosítottak, egy prediktív biomarkermodell kifejlesztésére és validálására, amely megkülönbözteti a hosszú vs. rövid progressziómentes túlélést mutató betegeket EGFR-/VEGF-célzott terápia után.
|
|
Képző Kohorsz - Rövid PFS Csoport (Nem Válaszoló)
Független mRCC betegek, akiknél a célzott terápia után a PFS < 12 hónap.
A prediktív modell finomítására és optimalizálására az EpiDRIVE teszt segítségével célzott szekvenálást végeztek, összehasonlítva a rövid és hosszú PFS eseteket.
|
Célzott szekvenálás vagy qPCR-alapú validáció a cfDNS 5mC/5hmC markereinek, amelyeket a felfedezési fázisban azonosítottak, egy prediktív biomarkermodell kifejlesztésére és validálására, amely megkülönbözteti a hosszú vs. rövid progressziómentes túlélést mutató betegeket EGFR-/VEGF-célzott terápia után.
|
|
Validációs Kohorsz - Hosszú PFS Csoport (Válaszadó)
Az EGFR- vagy VEGF-célzott terápiával kezelt mCRC betegek külön validációs kohorszja, akiknél a PFS ≥ 12 hónapot ért el. A qPCR-alapú EpiDRIVE tesztet alkalmazták a cfDNA 5mC/5hmC biomarkercsoport prediktív pontosságának megerősítésére a tartós válaszadók azonosításában. |
Célzott szekvenálás vagy qPCR-alapú validáció a cfDNS 5mC/5hmC markereinek, amelyeket a felfedezési fázisban azonosítottak, egy prediktív biomarkermodell kifejlesztésére és validálására, amely megkülönbözteti a hosszú vs. rövid progressziómentes túlélést mutató betegeket EGFR-/VEGF-célzott terápia után.
|
|
Validációs Kohorsz - Rövid PFS Csoport (Nem Válaszolók)
Független validációs kohorsz targetterápiát követően 12 hónapnál rövidebb PFS-zel rendelkező mCRC betegekből. A cfDNS-t a qPCR-alapú EpiDRIVE teszt segítségével elemezték a modell specifikitásának értékelésére és a nem válaszolók elkülönítésére a hosszú távú válaszadóktól. |
Célzott szekvenálás vagy qPCR-alapú validáció a cfDNS 5mC/5hmC markereinek, amelyeket a felfedezési fázisban azonosítottak, egy prediktív biomarkermodell kifejlesztésére és validálására, amely megkülönbözteti a hosszú vs. rövid progressziómentes túlélést mutató betegeket EGFR-/VEGF-célzott terápia után.
|
Mit mér a tanulmány?
Elsődleges eredményintézkedések
Eredménymérő |
Intézkedés leírása |
Időkeret |
|---|---|---|
|
Progressziómentes túlélés (PFS) a cfDNS 5mC/5hmC biomarkerkedvezmény profil szerint
Időkeret: A terápia megkezdésétől számított legfeljebb 36 hónap
|
A metasztatikus vastagbélrákban (mCRC) szenvedő betegek progressziómentes túlélése (PFS) EGFR- vagy VEGF-célzott terápiával, rétegezve cfDNS 5mC/5hmC-alapú biomarkerek státusza alapján.
|
A terápia megkezdésétől számított legfeljebb 36 hónap
|
Másodlagos eredményintézkedések
Eredménymérő |
Intézkedés leírása |
Időkeret |
|---|---|---|
|
Teljes túlélés (OS)
Időkeret: A terápia megkezdésétől számított legfeljebb 60 hónap
|
Az EGFR- vagy VEGF-célterápiától bármely okból bekövetkezett halálig eltelt idő.
Az össztúlélést a cfDNS 5mC/5hmC biomarkerek által meghatározott csoportok (magas vs alacsony EpiDRIVE-pontszám) tekintetében elemezzük annak értékelésére, hogy az epigenetikai cfDNS-profilok összefüggenek-e a túlélési eredmények különbségeivel.
|
A terápia megkezdésétől számított legfeljebb 60 hónap
|
Együttműködők és nyomozók
Szponzor
Nyomozók
- Kutatásvezető: Ajay Goel, PhD, City of Hope Medical Center
Publikációk és hasznos linkek
Általános kiadványok
- Xie YH, Chen YX, Fang JY. Comprehensive review of targeted therapy for colorectal cancer. Signal Transduct Target Ther. 2020 Mar 20;5(1):22. doi: 10.1038/s41392-020-0116-z.
- Siegel RL, Kratzer TB, Giaquinto AN, Sung H, Jemal A. Cancer statistics, 2025. CA Cancer J Clin. 2025 Jan-Feb;75(1):10-45. doi: 10.3322/caac.21871. Epub 2025 Jan 16.
- Zeng C, Stroup EK, Zhang Z, Chiu BC, Zhang W. Towards precision medicine: advances in 5-hydroxymethylcytosine cancer biomarker discovery in liquid biopsy. Cancer Commun (Lond). 2019 Mar 29;39(1):12. doi: 10.1186/s40880-019-0356-x.
- Xu C, Mannucci A, Esposito F, Oliveres H, Alonso-Orduna V, Yubero A, Fernandez-Martos C, Salud A, Gallego J, Martin-Richard M, Fernandez-Plana J, Guillot M, Aparicio J, Fakih M, Kopetz S, Feliu J, Maurel J, Goel A. An Exosome-Based Liquid Biopsy Predicts Depth of Response and Survival Outcomes to Cetuximab and Panitumumab in Metastatic Colorectal Cancer: The EXONERATE Study. Clin Cancer Res. 2025 Mar 17;31(6):1002-1015. doi: 10.1158/1078-0432.CCR-24-1934.
- Koroukian SM, Booker BD, Vu L, Schumacher FR, Rose J, Cooper GS, Selfridge JE, Markt SC. Receipt of Targeted Therapy and Survival Outcomes in Patients With Metastatic Colorectal Cancer. JAMA Netw Open. 2023 Jan 3;6(1):e2250030. doi: 10.1001/jamanetworkopen.2022.50030.
- Tirendi S, Marengo B, Domenicotti C, Bassi AM, Almonti V, Vernazza S. Colorectal cancer and therapy response: a focus on the main mechanisms involved. Front Oncol. 2023 Jul 19;13:1208140. doi: 10.3389/fonc.2023.1208140. eCollection 2023.
- Cai Z, Zhang J, He Y, Xia L, Dong X, Chen G, Zhou Y, Hu X, Zhong S, Wang Y, Chen H, Xie D, Liu X, Liu J. Liquid biopsy by combining 5-hydroxymethylcytosine signatures of plasma cell-free DNA and protein biomarkers for diagnosis and prognosis of hepatocellular carcinoma. ESMO Open. 2021 Feb;6(1):100021. doi: 10.1016/j.esmoop.2020.100021. Epub 2021 Jan 25.
- West-Szymanski DC, Zhang Z, Cui XL, Kowitwanich K, Gao L, Deng Z, Dougherty U, Williams C, Merkle S, He C, Zhang W, Bissonnette M. 5-Hydroxymethylated Biomarkers in Cell-Free DNA Predict Occult Colorectal Cancer up to 36 Months Before Diagnosis in the Prostate, Lung, Colorectal, and Ovarian Cancer Screening Trial. JCO Precis Oncol. 2024 Oct;8:e2400277. doi: 10.1200/PO.24.00277. Epub 2024 Oct 11.
- West-Szymanski DC, Zhang Z, Cui XL, Kowitwanich K, Gao L, Deng Z, Dougherty U, Williams C, Merkle S, Moore M, He C, Bissonnette M, Zhang W. Machine learning identifies cell-free DNA 5-hydroxymethylation biomarkers that detect occult colorectal cancer in PLCO Screening Trial subjects. bioRxiv [Preprint]. 2024 Feb 26:2024.02.25.581955. doi: 10.1101/2024.02.25.581955.
- Song D, Zhang Z, Zheng J, Zhang W, Cai J. 5-Hydroxymethylcytosine modifications in circulating cell-free DNA: frontiers of cancer detection, monitoring, and prognostic evaluation. Biomark Res. 2025 Mar 7;13(1):39. doi: 10.1186/s40364-025-00751-9.
- Baldassarre G, L de la Serna I, Vallette FM. Death-ision: the link between cellular resilience and cancer resistance to treatments. Mol Cancer. 2025 May 15;24(1):144. doi: 10.1186/s12943-025-02339-1.
- Ferrara R, Imbimbo M, Malouf R, Paget-Bailly S, Calais F, Marchal C, Westeel V. Single or combined immune checkpoint inhibitors compared to first-line platinum-based chemotherapy with or without bevacizumab for people with advanced non-small cell lung cancer. Cochrane Database Syst Rev. 2021 Apr 30;4(4):CD013257. doi: 10.1002/14651858.CD013257.pub3.
- Guler GD, Ning Y, Coruh C, Mognol GP, Phillips T, Nabiyouni M, Hazen K, Scott A, Volkmuth W, Levy S. Plasma cell-free DNA hydroxymethylation profiling reveals anti-PD-1 treatment response and resistance biology in non-small cell lung cancer. J Immunother Cancer. 2024 Jan 11;12(1):e008028. doi: 10.1136/jitc-2023-008028.
- Shao J, Xu Y, Olsen RJ, Kasparian S, Sun K, Mathur S, Zhang J, He C, Chen SH, Bernicker EH, Li Z. 5-Hydroxymethylcytosine in Cell-Free DNA Predicts Immunotherapy Response in Lung Cancer. Cells. 2024 Apr 19;13(8):715. doi: 10.3390/cells13080715.
- Li Q, Huang CC, Huang S, Tian Y, Huang J, Bitaraf A, Dong X, Nevalanen MT, Patel M, Wong J, Zhang J, Manley BJ, Park JY, Kohli M, Gore EM, Kilari D, Wang L. 5-hydroxymethylcytosine sequencing in plasma cell-free DNA identifies unique epigenomic features in prostate cancer patients resistant to androgen deprivation therapies. medRxiv [Preprint]. 2024 Oct 17:2023.10.13.23296758. doi: 10.1101/2023.10.13.23296758.
Tanulmányi rekorddátumok
Tanulmány főbb dátumok
Tanulmány kezdete (Tényleges)
Elsődleges befejezés (Becsült)
A tanulmány befejezése (Becsült)
Tanulmányi regisztráció dátumai
Először benyújtva
Először nyújtották be, amely megfelel a minőségbiztosítási kritériumoknak
Első közzététel (Tényleges)
Tanulmányi rekordok frissítései
Utolsó frissítés közzétéve (Tényleges)
Az utolsó frissítés elküldve, amely megfelel a minőségbiztosítási kritériumoknak
Utolsó ellenőrzés
Több információ
A tanulmányhoz kapcsolódó kifejezések
Kulcsszavak
További vonatkozó MeSH feltételek
Egyéb vizsgálati azonosító számok
- 23228/EpiDRIVE
Terv az egyéni résztvevői adatokhoz (IPD)
Tervezi megosztani az egyéni résztvevői adatokat (IPD)?
IPD terv leírása
Gyógyszer- és eszközinformációk, tanulmányi dokumentumok
Egy amerikai FDA által szabályozott gyógyszerkészítményt tanulmányoz
Egy amerikai FDA által szabályozott eszközterméket tanulmányoz
Ezt az információt közvetlenül a clinicaltrials.gov webhelyről szereztük be, változtatás nélkül. Ha bármilyen kérése van vizsgálati adatainak módosítására, eltávolítására vagy frissítésére, kérjük, írjon a következő címre: register@clinicaltrials.gov. Amint a változás bevezetésre kerül a clinicaltrials.gov oldalon, ez a webhelyünkön is automatikusan frissül. .