- ICH GCP
- Реестр клинических исследований США
- Клиническое испытание NCT07224841
Разработка панели биомаркеров на основе cfDNA 5mC/5hmC для прогнозирования эффективности таргетной терапии при mCRC (EpiDRIVE)
Разработка панели эпигенетических биомаркеров на основе cfDNA 5mC/5hmC для определения детерминант ответа на VEGF/EGFR-таргетную терапию метастатического колоректального рака
Исследование EpiDRIVE направлено на выявление эпигенетических детерминант ответа, основанных на внеклеточной ДНК (cfDNA), у пациентов с метастатическим колоректальным раком (mCRC), получающих терапию, нацеленную на EGFR или VEGF.
Путем интеграции профилирования 5-метилцитозина (5mC) и 5-гидроксиметилцитозина (5hmC) это исследование стремится разработать панель предиктивных биомаркеров, способную дифференцировать пациентов, отвечающих и не отвечающих на целевую терапию.
Обзор исследования
Статус
Условия
Подробное описание
Метастатический колоректальный рак (мКРР) остается одной из основных причин смерти, связанной с раком. Хотя таргетные препараты, такие как анти-EGFR (цетуксимаб, панитумумаб) и анти-VEGF (бевацизумаб) терапии, улучшили выживаемость, ответ на лечение сильно варьируется даже среди молекулярно определенных подгрупп.
Традиционные биомаркеры, включая мутации RAS/BRAF и латерализацию опухоли, не позволяют точно предсказать терапевтическую эффективность.
Недавние исследования подчеркивают потенциал метилирования (5mC) и гидроксиметилирования (5hmC) бесклеточной ДНК (цфДНК) как чувствительных, неинвазивных показателей биологии опухоли и динамики лечения.
Исследование EpiDRIVE объединяет секвенирование цфДНК 5mC/5hmC и таргетную валидацию для обнаружения и проверки эпигенетических детерминант терапевтического ответа.
Фаза открытия: Полногеномное профилирование 5mC/5hmC для идентификации дифференциально модифицированных регионов между респондентами и нереспондентами.
Фаза обучения: Таргетное секвенирование для создания предсказательной эпигенетической панели цфДНК (панель EpiDRIVE).
Фаза валидации: Валидация выбранных маркеров методом qPCR в независимой когорте для подтверждения предсказательной точности.
Это исследование направлено на создание неинвазивной биомаркерной системы для прогнозирования и мониторинга эффективности терапии, нацеленной на EGFR и VEGF, при мКРР, что в конечном итоге позволит направлять персонализированный выбор лечения.
Тип исследования
Регистрация (Оцененный)
Контакты и местонахождение
Контакты исследования
- Имя: Ajay Goel, PhD
- Номер телефона: 626-359-8111
- Электронная почта: ajgoel@coh.org
Места учебы
-
-
California
-
Duarte, California, Соединенные Штаты, 91016
- Рекрутинг
- City of Hope Medical Center
-
Контакт:
- Ajay Goel, PhD
- Номер телефона: 626-218-3452
- Электронная почта: ajgoel@coh.org
-
-
Критерии участия
Критерии приемлемости
Возраст, подходящий для обучения
- Взрослый
- Пожилой взрослый
Принимает здоровых добровольцев
Метод выборки
Исследуемая популяция
Описание
Критерии включения:
- Гистологически подтвержденная метастатическая аденокарцинома толстой кишки (мРКР).
- Получали EGFR-таргетную терапию (цетуксимаб/панитумумаб) или VEGF-таргетную терапию (бевацизумаб).
- Наличие предварительного образца плазмы для анализа цфДНК.
- Документированная рентгенологическая оценка ответа (RECIST 1.1).
- Известный статус мутаций RAS/BRAF.
Критерии исключения:
- Неудовлетворительное качество цфДНК или низкий выход цфДНК.
- Неаденокарциномная гистология.
- Сопутствующее или предшествующее другое активное злокачественное новообразование.
- Активное воспалительное или аутоиммунное заболевание, влияющее на профили метилирования цфДНК.
Учебный план
Как устроено исследование?
Детали дизайна
Когорты и вмешательства
Группа / когорта |
Вмешательство/лечение |
|---|---|
|
Когорта открытия - группа с длительным ВБП (ответчики)
Пациенты с метастатическим колоректальным раком (мКРР), получавшие таргетную терапию EGFR или VEGF и достигшие беспрогрессивной выживаемости (БПВ) ≥ 12 месяцев, классифицированы как клинические респондеры. Образцы плазменной cfDNA до лечения были проанализированы с помощью полногеномного секвенирования 5mC/5hmC для идентификации эпигенетических детерминант, связанных с длительным ответом на лечение. |
Высокопроизводительное полногеномное секвенирование профилей метилирования (5mC) и гидроксиметилирования (5hmC) циркулирующей бесклеточной ДНК (cfDNA) из предлечебных образцов плазмы в когорте открытия для выявления эпигенетических детерминант ответа на таргетную терапию (PFS ≥ 12 месяцев против < 12 месяцев).
|
|
Когорта открытия - группа с короткой ВБП (неответчики)
Пациенты с метастатическим колоректальным раком (мКРР), получавшие терапию, нацеленную на EGFR или VEGF, и показавшие выживаемость без прогрессирования (ВБП) < 12 месяцев, классифицированы как не отвечающие на лечение. Образцы циркулирующей свободной ДНК (цсДНК), взятые до лечения, были проанализированы с помощью полногеномного секвенирования 5mC/5hmC и сравнены с образцами пациентов с длительной ВБП для выявления дифференциальных паттернов метилирования и гидроксиметилирования, ассоциированных с резистентностью. |
Высокопроизводительное полногеномное секвенирование профилей метилирования (5mC) и гидроксиметилирования (5hmC) циркулирующей бесклеточной ДНК (cfDNA) из предлечебных образцов плазмы в когорте открытия для выявления эпигенетических детерминант ответа на таргетную терапию (PFS ≥ 12 месяцев против < 12 месяцев).
|
|
Обучающая когорта - группа с длительной ВБП (Респондер)
Независимая когорта mCRC с ВБП ≥ 12 месяцев после терапии, направленной на EGFR или VEGF. Кандидатные маркеры cfDNA 5mC/5hmC, выявленные на этапе открытия, были валидированы с помощью таргетного секвенирования (анализ EpiDRIVE) для построения прогностической панели эпигенетических биомаркеров. |
Целевое секвенирование или валидация на основе qPCR маркеров 5mC/5hmC в cfDNA, идентифицированных на этапе открытия, для разработки и валидации прогностической биомаркерной модели, дифференцирующей пациентов с длительной и короткой беспрогрессивной выживаемостью после таргетной терапии, направленной на EGFR/VEGF.
|
|
Обучающая Когорта - Группа с Короткой ВПП (Нереспондер)
Независимые пациенты с mCRC с ВБП < 12 месяцев после таргетной терапии.
Для уточнения и оптимизации прогностической модели было проведено таргетное секвенирование с использованием анализа EpiDRIVE путем сравнения случаев с короткой и длительной ВБП.
|
Целевое секвенирование или валидация на основе qPCR маркеров 5mC/5hmC в cfDNA, идентифицированных на этапе открытия, для разработки и валидации прогностической биомаркерной модели, дифференцирующей пациентов с длительной и короткой беспрогрессивной выживаемостью после таргетной терапии, направленной на EGFR/VEGF.
|
|
Валидационная когорта - группа с длительной ВБП (Респондер)
Отдельная валидационная когорта пациентов с метастатическим колоректальным раком, достигших беспрогрессивной выживаемости ≥ 12 месяцев при терапии, нацеленной на EGFR или VEGF. Для подтверждения прогностической точности панели биомаркеров cfDNA 5mC/5hmC в идентификации длительно отвечающих пациентов использовали анализ EpiDRIVE на основе qPCR. |
Целевое секвенирование или валидация на основе qPCR маркеров 5mC/5hmC в cfDNA, идентифицированных на этапе открытия, для разработки и валидации прогностической биомаркерной модели, дифференцирующей пациентов с длительной и короткой беспрогрессивной выживаемостью после таргетной терапии, направленной на EGFR/VEGF.
|
|
Валидационная когорта - группа с короткой ВБП (неответчики)
Независимая когорта валидации пациентов с метастатическим колоректальным раком (мКРР) с ВБП < 12 месяцев после таргетной терапии. цфДНК анализировали с использованием ПЦР-метода EpiDRIVE для оценки специфичности модели и区分 не отвечающих от долгосрочных отвечающих. |
Целевое секвенирование или валидация на основе qPCR маркеров 5mC/5hmC в cfDNA, идентифицированных на этапе открытия, для разработки и валидации прогностической биомаркерной модели, дифференцирующей пациентов с длительной и короткой беспрогрессивной выживаемостью после таргетной терапии, направленной на EGFR/VEGF.
|
Что измеряет исследование?
Первичные показатели результатов
Мера результата |
Мера Описание |
Временное ограничение |
|---|---|---|
|
Беспрогрессивная выживаемость (БПВ) в соответствии с профилем биомаркера cfDNA 5mC/5hmC
Временное ограничение: До 36 месяцев с момента начала терапии
|
Беспрогрессивная выживаемость (БПВ) среди пациентов с метастатическим колоректальным раком (мКРР), получающих EGFR- или VEGF-таргетную терапию, стратифицированная по статусу биомаркера на основе cfDNA 5mC/5hmC.
|
До 36 месяцев с момента начала терапии
|
Вторичные показатели результатов
Мера результата |
Мера Описание |
Временное ограничение |
|---|---|---|
|
Общая выживаемость (ОВ)
Временное ограничение: До 60 месяцев с начала терапии
|
Время от начала терапии, направленной на EGFR или VEGF, до смерти от любой причины.
Общая выживаемость будет проанализирована в отношении групп, определенных по биомаркеру cfDNA 5mC/5hmC (высокий vs низкий показатель EpiDRIVE), чтобы оценить, связаны ли эпигенетические профили cfDNA с различиями в показателях выживаемости.
|
До 60 месяцев с начала терапии
|
Соавторы и исследователи
Спонсор
Следователи
- Главный следователь: Ajay Goel, PhD, City of Hope Medical Center
Публикации и полезные ссылки
Общие публикации
- Xie YH, Chen YX, Fang JY. Comprehensive review of targeted therapy for colorectal cancer. Signal Transduct Target Ther. 2020 Mar 20;5(1):22. doi: 10.1038/s41392-020-0116-z.
- Siegel RL, Kratzer TB, Giaquinto AN, Sung H, Jemal A. Cancer statistics, 2025. CA Cancer J Clin. 2025 Jan-Feb;75(1):10-45. doi: 10.3322/caac.21871. Epub 2025 Jan 16.
- Zeng C, Stroup EK, Zhang Z, Chiu BC, Zhang W. Towards precision medicine: advances in 5-hydroxymethylcytosine cancer biomarker discovery in liquid biopsy. Cancer Commun (Lond). 2019 Mar 29;39(1):12. doi: 10.1186/s40880-019-0356-x.
- Xu C, Mannucci A, Esposito F, Oliveres H, Alonso-Orduna V, Yubero A, Fernandez-Martos C, Salud A, Gallego J, Martin-Richard M, Fernandez-Plana J, Guillot M, Aparicio J, Fakih M, Kopetz S, Feliu J, Maurel J, Goel A. An Exosome-Based Liquid Biopsy Predicts Depth of Response and Survival Outcomes to Cetuximab and Panitumumab in Metastatic Colorectal Cancer: The EXONERATE Study. Clin Cancer Res. 2025 Mar 17;31(6):1002-1015. doi: 10.1158/1078-0432.CCR-24-1934.
- Koroukian SM, Booker BD, Vu L, Schumacher FR, Rose J, Cooper GS, Selfridge JE, Markt SC. Receipt of Targeted Therapy and Survival Outcomes in Patients With Metastatic Colorectal Cancer. JAMA Netw Open. 2023 Jan 3;6(1):e2250030. doi: 10.1001/jamanetworkopen.2022.50030.
- Tirendi S, Marengo B, Domenicotti C, Bassi AM, Almonti V, Vernazza S. Colorectal cancer and therapy response: a focus on the main mechanisms involved. Front Oncol. 2023 Jul 19;13:1208140. doi: 10.3389/fonc.2023.1208140. eCollection 2023.
- Cai Z, Zhang J, He Y, Xia L, Dong X, Chen G, Zhou Y, Hu X, Zhong S, Wang Y, Chen H, Xie D, Liu X, Liu J. Liquid biopsy by combining 5-hydroxymethylcytosine signatures of plasma cell-free DNA and protein biomarkers for diagnosis and prognosis of hepatocellular carcinoma. ESMO Open. 2021 Feb;6(1):100021. doi: 10.1016/j.esmoop.2020.100021. Epub 2021 Jan 25.
- West-Szymanski DC, Zhang Z, Cui XL, Kowitwanich K, Gao L, Deng Z, Dougherty U, Williams C, Merkle S, He C, Zhang W, Bissonnette M. 5-Hydroxymethylated Biomarkers in Cell-Free DNA Predict Occult Colorectal Cancer up to 36 Months Before Diagnosis in the Prostate, Lung, Colorectal, and Ovarian Cancer Screening Trial. JCO Precis Oncol. 2024 Oct;8:e2400277. doi: 10.1200/PO.24.00277. Epub 2024 Oct 11.
- West-Szymanski DC, Zhang Z, Cui XL, Kowitwanich K, Gao L, Deng Z, Dougherty U, Williams C, Merkle S, Moore M, He C, Bissonnette M, Zhang W. Machine learning identifies cell-free DNA 5-hydroxymethylation biomarkers that detect occult colorectal cancer in PLCO Screening Trial subjects. bioRxiv [Preprint]. 2024 Feb 26:2024.02.25.581955. doi: 10.1101/2024.02.25.581955.
- Song D, Zhang Z, Zheng J, Zhang W, Cai J. 5-Hydroxymethylcytosine modifications in circulating cell-free DNA: frontiers of cancer detection, monitoring, and prognostic evaluation. Biomark Res. 2025 Mar 7;13(1):39. doi: 10.1186/s40364-025-00751-9.
- Baldassarre G, L de la Serna I, Vallette FM. Death-ision: the link between cellular resilience and cancer resistance to treatments. Mol Cancer. 2025 May 15;24(1):144. doi: 10.1186/s12943-025-02339-1.
- Ferrara R, Imbimbo M, Malouf R, Paget-Bailly S, Calais F, Marchal C, Westeel V. Single or combined immune checkpoint inhibitors compared to first-line platinum-based chemotherapy with or without bevacizumab for people with advanced non-small cell lung cancer. Cochrane Database Syst Rev. 2021 Apr 30;4(4):CD013257. doi: 10.1002/14651858.CD013257.pub3.
- Guler GD, Ning Y, Coruh C, Mognol GP, Phillips T, Nabiyouni M, Hazen K, Scott A, Volkmuth W, Levy S. Plasma cell-free DNA hydroxymethylation profiling reveals anti-PD-1 treatment response and resistance biology in non-small cell lung cancer. J Immunother Cancer. 2024 Jan 11;12(1):e008028. doi: 10.1136/jitc-2023-008028.
- Shao J, Xu Y, Olsen RJ, Kasparian S, Sun K, Mathur S, Zhang J, He C, Chen SH, Bernicker EH, Li Z. 5-Hydroxymethylcytosine in Cell-Free DNA Predicts Immunotherapy Response in Lung Cancer. Cells. 2024 Apr 19;13(8):715. doi: 10.3390/cells13080715.
- Li Q, Huang CC, Huang S, Tian Y, Huang J, Bitaraf A, Dong X, Nevalanen MT, Patel M, Wong J, Zhang J, Manley BJ, Park JY, Kohli M, Gore EM, Kilari D, Wang L. 5-hydroxymethylcytosine sequencing in plasma cell-free DNA identifies unique epigenomic features in prostate cancer patients resistant to androgen deprivation therapies. medRxiv [Preprint]. 2024 Oct 17:2023.10.13.23296758. doi: 10.1101/2023.10.13.23296758.
Даты записи исследования
Изучение основных дат
Начало исследования (Действительный)
Первичное завершение (Оцененный)
Завершение исследования (Оцененный)
Даты регистрации исследования
Первый отправленный
Впервые представлено, что соответствует критериям контроля качества
Первый опубликованный (Оцененный)
Обновления учебных записей
Последнее опубликованное обновление (Оцененный)
Последнее отправленное обновление, отвечающее критериям контроля качества
Последняя проверка
Дополнительная информация
Термины, связанные с этим исследованием
Ключевые слова
Дополнительные соответствующие термины MeSH
- Новообразования по локализации
- Новообразования
- Кишечные заболевания
- Желудочно-кишечные новообразования
- Новообразования пищеварительной системы
- Заболевания пищеварительной системы
- Желудочно-кишечные заболевания
- Новообразования кишечника
- Заболевания прямой кишки
- Заболевания толстой кишки
- Колоректальные новообразования
Другие идентификационные номера исследования
- 23228/EpiDRIVE
Планирование данных отдельных участников (IPD)
Планируете делиться данными об отдельных участниках (IPD)?
Описание плана IPD
Информация о лекарствах и устройствах, исследовательские документы
Изучает лекарственный продукт, регулируемый FDA США.
Изучает продукт устройства, регулируемый Управлением по санитарному надзору за качеством пищевых продуктов и медикаментов США.
Эта информация была получена непосредственно с веб-сайта clinicaltrials.gov без каких-либо изменений. Если у вас есть запросы на изменение, удаление или обновление сведений об исследовании, обращайтесь по адресу register@clinicaltrials.gov. Как только изменение будет реализовано на clinicaltrials.gov, оно будет автоматически обновлено и на нашем веб-сайте. .
Клинические исследования КРР (колоректальный рак)
-
Hansoh BioMedical R&D CompanyРекрутинг
-
Shanghai Henlius BiotechЕще не набирают
-
Motus GI Medical Technologies LtdЗавершенный
-
Motus GI Medical Technologies LtdЗавершенный
-
Chinese University of Hong KongЗавершенный
-
Niguarda HospitalUniversity of Turin, Italy; Fondazione del Piemonte per l'OncologiaЗавершенный
-
NGM Biopharmaceuticals, IncОтозван
-
Motus GI Medical Technologies LtdПрекращено
-
Chang Gung Memorial HospitalFBD Biologics LimitedРекрутинг
-
Chinese University of Hong KongОтозван