- ICH GCP
- US Clinical Trials Registry
- Klinisk utprøving NCT07224841
Utvikling av en cfDNA 5mC/5hmC-basert biomarkørpanel for å forutsi målrettet terapi-effektivitet i mCRC (EpiDRIVE)
Utvikling av en cfDNA 5mC/5hmC-basert epigenetisk biomarkørpanel for å identifisere determinanter for respons ved VEGF/EGFR-rettert terapi for metastatisk kolorektalkreft
EpiDRIVE-studien har som mål å identifisere cfDNA-baserte epigenetiske determinanter for respons hos pasienter med metastatisk kolorektalkreft (mCRC) som blir behandlet med EGFR- eller VEGF-måltrett terapi.
Ved å integrere 5-metylcytosin (5mC) og 5-hydroksymetylcytosin (5hmC)-profilering, søker denne studien å utvikle et prediktivt biomarkørpanel som kan skille respondenter fra ikke-respondenter på målrettet terapi.
Studieoversikt
Status
Forhold
Detaljert beskrivelse
Metastatisk kolorektalkreft (mCRC) forblir en av de ledende årsakene til kreftrelatert død. Selv om målrettede midler som anti-EGFR (cetuximab, panitumumab) og anti-VEGF (bevacizumab) terapi har forbedret overlevelsen, varierer behandlingsresponsen betydelig selv blant molekylært definerte undergrupper.
Tradisjonelle biomarkører, inkludert RAS/BRAF-mutasjon og tumorsidighet, klarer ikke å nøyaktig forutsi terapeutisk effekt.
Nylige studier fremhever potensialet til cellefri DNA (cfDNA) metylering (5mC) og hydroksymetylering (5hmC) som følsomme, ikke-invasive indikatorer for tumorbiolologi og behandlingsdynamikk.
EpiDRIVE-studien integrerer cfDNA 5mC/5hmC-sekvensering og målrettet validering for å oppdage og verifisere epigenetiske determinanter for terapeutisk respons.
Oppdagelsesfase: Helgenom 5mC/5hmC-profilering for å identifisere differensielt modifiserte regioner mellom respondenter og ikke-respondenter.
Opplæringsfase: Målrettet sekvensering for å etablere en prediktiv cfDNA epigenetisk panel (EpiDRIVE-panel).
Valideringsfase: qPCR-basert validering av utvalgte markører i en uavhengig kohort for å bekrefte prediktiv nøyaktighet.
Denne studien tar sikte på å gi et ikke-invasivt biomarkørrammeverk for å forutsi og overvåke effekten av EGFR- og VEGF-målrettede terapier i mCRC, og til slutt veilede personalisert behandlingsvalg.
Studietype
Registrering (Antatt)
Kontakter og plasseringer
Studiekontakt
- Navn: Ajay Goel, PhD
- Telefonnummer: 626-359-8111
- E-post: ajgoel@coh.org
Studiesteder
-
-
California
-
Duarte, California, Forente stater, 91016
- Rekruttering
- City of Hope Medical Center
-
Ta kontakt med:
- Ajay Goel, PhD
- Telefonnummer: 626-218-3452
- E-post: ajgoel@coh.org
-
-
Deltakelseskriterier
Kvalifikasjonskriterier
Alder som er kvalifisert for studier
- Voksen
- Eldre voksen
Tar imot friske frivillige
Prøvetakingsmetode
Studiepopulasjon
Beskrivelse
Inklusjonskriterier:
- Histologisk bekreftet metastatisk kolorektal adenokarcinom (mCRC).
- Har mottatt EGFR-rettert terapi (cetuximab/panitumumab) eller VEGF-rettert terapi (bevacizumab).
- Tilgjengelighet av pre-behandlings plasma-prøve for cfDNA-analyse.
- Dokumentert radiologisk responsvurdering (RECIST 1.1).
- RAS/BRAF-mutasjonsstatus kjent.
Eksklusjonskriterier:
- Utilstrekkelig cfDNA-kvalitet eller lavt cfDNA-utbytte.
- Ikke-adenokarcinom histologi.
- Samtidig eller tidligere annen aktiv malignitet.
- Aktiv inflammatorisk eller autoimmun sykdom som påvirker cfDNA-metyleringsprofiler.
Studieplan
Hvordan er studiet utformet?
Designdetaljer
Kohorter og intervensjoner
Gruppe / Kohort |
Intervensjon / Behandling |
|---|---|
|
Oppdagelseskohort - Lang PFS-gruppe (Responder)
Pasienter med metastatisk kolorektalkreft (mCRC) som fikk EGFR- eller VEGF-målt terapi og oppnådde en progresjonsfri overlevelse (PFS) ≥ 12 måneder, klassifisert som kliniske respondenter. Pre-behandlings plasma cfDNA-prøver ble analysert ved genomomfattende 5mC/5hmC-sekvensering for å identifisere epigenetiske determinanter assosiert med vedvarende behandlingsrespons. |
Høy-gjennomstrømning genomvid sekvensering av cfDNA-metylering (5mC) og hydroksymetylering (5hmC) profiler fra pre-behandlings plasma prøver i oppdagelseskohorten for å identifisere epigenetiske determinanter av målrettet terapi respons (PFS ≥ 12 måneder vs < 12 måneder).
|
|
Oppdagelseskohort - Kort PFS-gruppe (Ikke-svarer)
Pasienter med mCRC som mottok EGFR- eller VEGF-rettert terapi og viste progresjonsfri overlevelse (PFS) < 12 måneder, klassifisert som ikke-responderende. Forbehandlede cfDNA-prøver ble analysert ved hjelp av genomomfattende 5mC/5hmC-sekvensering og sammenlignet med lang-PFS-respondenter for å identifisere differensielle metylerings- og hydroksymyleringsmønstre assosiert med resistens. |
Høy-gjennomstrømning genomvid sekvensering av cfDNA-metylering (5mC) og hydroksymetylering (5hmC) profiler fra pre-behandlings plasma prøver i oppdagelseskohorten for å identifisere epigenetiske determinanter av målrettet terapi respons (PFS ≥ 12 måneder vs < 12 måneder).
|
|
Treningkohort - Lang PFS-gruppe (Responsdeltaker)
Uavhengig mCRC-kohort med PFS ≥ 12 måneder etter EGFR- eller VEGF-målt terapi. Kandidat cfDNA 5mC/5hmC-markører identifisert i oppdagelsesfasen ble validert ved bruk av målrettet sekvensering (EpiDRIVE-test) for å konstruere det prediktive epigenetiske biomarkørpanelet. |
Målt sekvensering eller qPCR-basert validering av cfDNA 5mC/5hmC-markører identifisert fra oppdagelsesfasen for å utvikle og validere en prediktiv biomarkørmodell som skiller pasienter med lang versus kort progresjonsfri overlevelse etter EGFR-/VEGF-målt terapi.
|
|
Treningkohort - Kort PFS-gruppe (Ikke-svarer)
Uavhengige mCRC-pasienter med PFS < 12 måneder etter målrettet behandling.
Målt sekvensering med EpiDRIVE-testen ble utført for å avgrense og optimalisere den prediktive modellen ved å sammenligne kort- vs lang-PFS-tilfeller.
|
Målt sekvensering eller qPCR-basert validering av cfDNA 5mC/5hmC-markører identifisert fra oppdagelsesfasen for å utvikle og validere en prediktiv biomarkørmodell som skiller pasienter med lang versus kort progresjonsfri overlevelse etter EGFR-/VEGF-målt terapi.
|
|
Valideringskohort - Lang PFS-gruppe (Responder)
Separat valideringskohort av mCRC-pasienter som oppnådde PFS ≥ 12 måneder under EGFR- eller VEGF-måltrett terapi. qPCR-basert EpiDRIVE-test ble brukt for å bekrefte prediktiv nøyaktighet av cfDNA 5mC/5hmC biomarkørpanelet i identifisering av varige respondenter. |
Målt sekvensering eller qPCR-basert validering av cfDNA 5mC/5hmC-markører identifisert fra oppdagelsesfasen for å utvikle og validere en prediktiv biomarkørmodell som skiller pasienter med lang versus kort progresjonsfri overlevelse etter EGFR-/VEGF-målt terapi.
|
|
Valideringskohort - Kort PFS-gruppe (Ikke-respons)
Uavhengig valideringskohorte av mCRC-pasienter med PFS < 12 måneder etter målrettet behandling. cfDNA ble analysert ved hjelp av qPCR-baserte EpiDRIVE-test for å vurdere modellspesifisitet og skille ikke-responderende fra langsiktige responderende. |
Målt sekvensering eller qPCR-basert validering av cfDNA 5mC/5hmC-markører identifisert fra oppdagelsesfasen for å utvikle og validere en prediktiv biomarkørmodell som skiller pasienter med lang versus kort progresjonsfri overlevelse etter EGFR-/VEGF-målt terapi.
|
Hva måler studien?
Primære resultatmål
Resultatmål |
Tiltaksbeskrivelse |
Tidsramme |
|---|---|---|
|
Progresjonsfri overlevelse (PFS) i henhold til cfDNA 5mC/5hmC biomarkørprofil
Tidsramme: Opptil 36 måneder fra behandlingsstart
|
Progressjonsfri overlevelse (PFS) blant pasienter med metastatisk kolorektalkreft (mCRC) som mottar EGFR- eller VEGF-målt terapi, stratifisert etter cfDNA 5mC/5hmC-basert biomarkørstatus.
|
Opptil 36 måneder fra behandlingsstart
|
Sekundære resultatmål
Resultatmål |
Tiltaksbeskrivelse |
Tidsramme |
|---|---|---|
|
Samlet overlevelse (OS)
Tidsramme: Opptil 60 måneder fra behandlingsstart
|
Tid fra start av EGFR- eller VEGF-målrettet terapi til død av hvilken som helst årsak.
Overlevelse vil bli analysert i forhold til cfDNA 5mC/5hmC biomarkør-definerte grupper (høy vs lav EpiDRIVE-score) for å vurdere om epigenetiske cfDNA-profiler er assosiert med forskjeller i overlevelsessresultater.
|
Opptil 60 måneder fra behandlingsstart
|
Samarbeidspartnere og etterforskere
Sponsor
Etterforskere
- Hovedetterforsker: Ajay Goel, PhD, City of Hope Medical Center
Publikasjoner og nyttige lenker
Generelle publikasjoner
- Xie YH, Chen YX, Fang JY. Comprehensive review of targeted therapy for colorectal cancer. Signal Transduct Target Ther. 2020 Mar 20;5(1):22. doi: 10.1038/s41392-020-0116-z.
- Siegel RL, Kratzer TB, Giaquinto AN, Sung H, Jemal A. Cancer statistics, 2025. CA Cancer J Clin. 2025 Jan-Feb;75(1):10-45. doi: 10.3322/caac.21871. Epub 2025 Jan 16.
- Zeng C, Stroup EK, Zhang Z, Chiu BC, Zhang W. Towards precision medicine: advances in 5-hydroxymethylcytosine cancer biomarker discovery in liquid biopsy. Cancer Commun (Lond). 2019 Mar 29;39(1):12. doi: 10.1186/s40880-019-0356-x.
- Xu C, Mannucci A, Esposito F, Oliveres H, Alonso-Orduna V, Yubero A, Fernandez-Martos C, Salud A, Gallego J, Martin-Richard M, Fernandez-Plana J, Guillot M, Aparicio J, Fakih M, Kopetz S, Feliu J, Maurel J, Goel A. An Exosome-Based Liquid Biopsy Predicts Depth of Response and Survival Outcomes to Cetuximab and Panitumumab in Metastatic Colorectal Cancer: The EXONERATE Study. Clin Cancer Res. 2025 Mar 17;31(6):1002-1015. doi: 10.1158/1078-0432.CCR-24-1934.
- Koroukian SM, Booker BD, Vu L, Schumacher FR, Rose J, Cooper GS, Selfridge JE, Markt SC. Receipt of Targeted Therapy and Survival Outcomes in Patients With Metastatic Colorectal Cancer. JAMA Netw Open. 2023 Jan 3;6(1):e2250030. doi: 10.1001/jamanetworkopen.2022.50030.
- Tirendi S, Marengo B, Domenicotti C, Bassi AM, Almonti V, Vernazza S. Colorectal cancer and therapy response: a focus on the main mechanisms involved. Front Oncol. 2023 Jul 19;13:1208140. doi: 10.3389/fonc.2023.1208140. eCollection 2023.
- Cai Z, Zhang J, He Y, Xia L, Dong X, Chen G, Zhou Y, Hu X, Zhong S, Wang Y, Chen H, Xie D, Liu X, Liu J. Liquid biopsy by combining 5-hydroxymethylcytosine signatures of plasma cell-free DNA and protein biomarkers for diagnosis and prognosis of hepatocellular carcinoma. ESMO Open. 2021 Feb;6(1):100021. doi: 10.1016/j.esmoop.2020.100021. Epub 2021 Jan 25.
- West-Szymanski DC, Zhang Z, Cui XL, Kowitwanich K, Gao L, Deng Z, Dougherty U, Williams C, Merkle S, He C, Zhang W, Bissonnette M. 5-Hydroxymethylated Biomarkers in Cell-Free DNA Predict Occult Colorectal Cancer up to 36 Months Before Diagnosis in the Prostate, Lung, Colorectal, and Ovarian Cancer Screening Trial. JCO Precis Oncol. 2024 Oct;8:e2400277. doi: 10.1200/PO.24.00277. Epub 2024 Oct 11.
- West-Szymanski DC, Zhang Z, Cui XL, Kowitwanich K, Gao L, Deng Z, Dougherty U, Williams C, Merkle S, Moore M, He C, Bissonnette M, Zhang W. Machine learning identifies cell-free DNA 5-hydroxymethylation biomarkers that detect occult colorectal cancer in PLCO Screening Trial subjects. bioRxiv [Preprint]. 2024 Feb 26:2024.02.25.581955. doi: 10.1101/2024.02.25.581955.
- Song D, Zhang Z, Zheng J, Zhang W, Cai J. 5-Hydroxymethylcytosine modifications in circulating cell-free DNA: frontiers of cancer detection, monitoring, and prognostic evaluation. Biomark Res. 2025 Mar 7;13(1):39. doi: 10.1186/s40364-025-00751-9.
- Baldassarre G, L de la Serna I, Vallette FM. Death-ision: the link between cellular resilience and cancer resistance to treatments. Mol Cancer. 2025 May 15;24(1):144. doi: 10.1186/s12943-025-02339-1.
- Ferrara R, Imbimbo M, Malouf R, Paget-Bailly S, Calais F, Marchal C, Westeel V. Single or combined immune checkpoint inhibitors compared to first-line platinum-based chemotherapy with or without bevacizumab for people with advanced non-small cell lung cancer. Cochrane Database Syst Rev. 2021 Apr 30;4(4):CD013257. doi: 10.1002/14651858.CD013257.pub3.
- Guler GD, Ning Y, Coruh C, Mognol GP, Phillips T, Nabiyouni M, Hazen K, Scott A, Volkmuth W, Levy S. Plasma cell-free DNA hydroxymethylation profiling reveals anti-PD-1 treatment response and resistance biology in non-small cell lung cancer. J Immunother Cancer. 2024 Jan 11;12(1):e008028. doi: 10.1136/jitc-2023-008028.
- Shao J, Xu Y, Olsen RJ, Kasparian S, Sun K, Mathur S, Zhang J, He C, Chen SH, Bernicker EH, Li Z. 5-Hydroxymethylcytosine in Cell-Free DNA Predicts Immunotherapy Response in Lung Cancer. Cells. 2024 Apr 19;13(8):715. doi: 10.3390/cells13080715.
- Li Q, Huang CC, Huang S, Tian Y, Huang J, Bitaraf A, Dong X, Nevalanen MT, Patel M, Wong J, Zhang J, Manley BJ, Park JY, Kohli M, Gore EM, Kilari D, Wang L. 5-hydroxymethylcytosine sequencing in plasma cell-free DNA identifies unique epigenomic features in prostate cancer patients resistant to androgen deprivation therapies. medRxiv [Preprint]. 2024 Oct 17:2023.10.13.23296758. doi: 10.1101/2023.10.13.23296758.
Studierekorddatoer
Studer hoveddatoer
Studiestart (Faktiske)
Primær fullføring (Antatt)
Studiet fullført (Antatt)
Datoer for studieregistrering
Først innsendt
Først innsendt som oppfylte QC-kriteriene
Først lagt ut (Antatt)
Oppdateringer av studieposter
Sist oppdatering lagt ut (Antatt)
Siste oppdatering sendt inn som oppfylte QC-kriteriene
Sist bekreftet
Mer informasjon
Begreper knyttet til denne studien
Nøkkelord
Ytterligere relevante MeSH-vilkår
Andre studie-ID-numre
- 23228/EpiDRIVE
Plan for individuelle deltakerdata (IPD)
Planlegger du å dele individuelle deltakerdata (IPD)?
IPD-planbeskrivelse
Legemiddel- og utstyrsinformasjon, studiedokumenter
Studerer et amerikansk FDA-regulert medikamentprodukt
Studerer et amerikansk FDA-regulert enhetsprodukt
Denne informasjonen ble hentet direkte fra nettstedet clinicaltrials.gov uten noen endringer. Hvis du har noen forespørsler om å endre, fjerne eller oppdatere studiedetaljene dine, vennligst kontakt register@clinicaltrials.gov. Så snart en endring er implementert på clinicaltrials.gov, vil denne også bli oppdatert automatisk på nettstedet vårt. .
Kliniske studier på CRC (kolorektal kreft)
-
Stingray TherapeuticsRekrutteringRefractory Metastatic Microsatelite Stabil Colorectal Cancer (MSS-CRC)Forente stater
-
Hansoh BioMedical R&D CompanyRekruttering
-
Shanghai Henlius BiotechHar ikke rekruttert ennå
-
Motus GI Medical Technologies LtdFullført
-
Motus GI Medical Technologies LtdFullført
-
NGM Biopharmaceuticals, IncTilbaketrukket
-
Motus GI Medical Technologies LtdAvsluttet
-
Jun HuangHar ikke rekruttert ennåCRC | Levermetastase TykktarmskreftKina
-
Chang Gung Memorial HospitalFBD Biologics LimitedRekruttering
-
Chinese University of Hong KongTilbaketrukket
Kliniske studier på cfDNA 5mC/5hmC-sekvensering (EpiDRIVE Discovery-fase)
-
City of Hope Medical CenterRekrutteringcfDNA 5mC/5hmC biomarkører for å forutsi kjemoterapirespons ved metastatisk tykktarmskreft (EpiCORE)CRC (kolorektal kreft)Forente stater