cfDNA 5mC/5hmCに基づくバイオマーカーパネルの開発:転移性大腸癌における標的治療効果の予測 (EpiDRIVE)
転移性大腸癌におけるVEGF/EGFR標的療法への反応決定因子を同定するためのcfDNA 5mC/5hmCベースのエピジェネティックバイオマーカーパネルの開発
EpiDRIVE研究は、EGFR標的療法またはVEGF標的療法を受けた転移性大腸癌(mCRC)患者における、cfDNAに基づくエピジェネティックな反応決定因子を特定することを目的としています。
5-メチルシトシン(5mC)と5-ヒドロキシメチルシトシン(5hmC)のプロファイリングを統合することにより、この研究は標的療法に対する反応者と非反応者を区別可能な予測バイオマーカーパネルの開発を目指しています。
調査の概要
状態
条件
詳細な説明
転移性大腸癌(mCRC)は、がん関連死の主要な原因の一つであり続けています。 抗EGFR(セツキシマブ、パニツムマブ)や抗VEGF(ベバシズマブ)療法などの標的薬が生存率を改善したものの、分子学的に定義されたサブグループ間でも治療反応は大きく異なります。
RAS/BRAF変異や腫瘍側性を含む従来のバイオマーカーは、治療効果を正確に予測することができません。
最近の研究では、遊離DNA(cfDNA)のメチル化(5mC)とヒドロキシメチル化(5hmC)が、腫瘍生物学と治療動態の感度の高い非侵襲的指標としての可能性が強調されています。
EpiDRIVE研究は、cfDNAの5mC/5hmCシーケンシングと標的検証を統合し、治療反応のエピジェネティックな決定因子を発見・検証します。
発見段階:全ゲノム5mC/5hmCプロファイリングにより、奏効者と非奏効者の間で差次的に修飾された領域を同定します。
訓練段階:標的シーケンシングにより、予測的cfDNAエピジェネティックパネル(EpiDRIVEパネル)を確立します。
検証段階:独立したコホートにおける選択されたマーカーのqPCRベースの検証により、予測精度を確認します。
この研究は、mCRCにおけるEGFRおよびVEGF標的療法の効果を予測・モニタリングする非侵襲的バイオマーカーフレームワークを提供し、最終的には個別化治療選択を導くことを目指しています。
研究の種類
入学 (推定)
連絡先と場所
研究連絡先
- 名前:Ajay Goel, PhD
- 電話番号:626-359-8111
- メール:ajgoel@coh.org
研究場所
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California
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Duarte、California、アメリカ、91016
- 募集
- City of Hope Medical Center
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コンタクト:
- Ajay Goel, PhD
- 電話番号:626-218-3452
- メール:ajgoel@coh.org
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参加基準
適格基準
就学可能な年齢
- 大人
- 高齢者
健康ボランティアの受け入れ
サンプリング方法
調査対象母集団
説明
対象基準:
- 組織学的に確認された転移性結腸直腸腺癌(mCRC)。
- EGFR標的療法(セツキシマブ/パニツムマブ)またはVEGF標的療法(ベバシズマブ)の投与歴がある。
- 前処置血漿サンプルがcfDNA分析に利用可能であること。
- 文書化された放射線学的反応評価(RECIST 1.1)がある。
- RAS/BRAF変異ステータスが既知である。
除外基準:
- 不適切なcfDNA品質または低いcfDNA収量。
- 非腺癌の組織型。
- 同時または過去の他の活動性悪性腫瘍。
- cfDNAメチル化プロファイルに影響を与える活動性炎症性疾患または自己免疫疾患。
研究計画
研究はどのように設計されていますか?
デザインの詳細
コホートと介入
グループ/コホート |
介入・治療 |
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発見コホート - 長期PFS群(レスポンダー)
EGFRまたはVEGF標的療法を受けて無増悪生存期間(PFS)が12か月以上となり、臨床的奏効者と分類された転移性大腸癌(mCRC)患者。 持続的な治療反応に関連するエピジェネティックな決定因子を特定するため、治療前血漿cfDNAサンプルを全ゲノム5mC/5hmCシーケンシングにより解析した。 |
前治療血漿サンプルからのcfDNAメチル化(5mC)およびヒドロキシメチル化(5hmC)プロファイルのハイスループット全ゲノムシーケンシングを探索コホートで実施し、標的治療反応(PFS ≥ 12ヶ月 vs < 12ヶ月)のエピジェネティック決定因子を同定する。
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発見コホート - 短期PFS群(無効例)
EGFRまたはVEGF標的療法を受け、無増悪生存期間(PFS)が12ヶ月未満であったmCRC患者は、無反応者と分類されました。 治療前cfDNAサンプルを全ゲノム5mC/5hmCシーケンス解析により分析し、長期間PFSの反応者と比較することで、耐性に関連する差異的メチル化およびヒドロキシメチル化パターンを特定しました。 |
前治療血漿サンプルからのcfDNAメチル化(5mC)およびヒドロキシメチル化(5hmC)プロファイルのハイスループット全ゲノムシーケンシングを探索コホートで実施し、標的治療反応(PFS ≥ 12ヶ月 vs < 12ヶ月)のエピジェネティック決定因子を同定する。
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トレーニングコホート - 長期PFS群(レスポンダー)
EGFRまたはVEGF標的療法後12か月以上のPFSを有する独立したmCRCコホート。 発見段階で同定された候補cfDNA 5mC/5hmCマーカーは、予測エピジェネティックバイオマーカーパネルを構築するためにターゲットシーケンシング(EpiDRIVEアッセイ)を用いて検証されました。 |
探索段階で特定されたcfDNA 5mC/5hmCマーカーのターゲットシーケンシングまたはqPCRベースの検証により、EGFR/VEGF標的療法後の長い vs 短い無増悪生存期間を示す患者を識別する予測バイオマーカーモデルの開発と検証を行う。
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トレーニングコホート - 短期PFS群(非応答者)
標的療法後12か月未満でPFSを有する独立したmCRC患者。
短期PFS症例と長期PFS症例を比較することにより、予測モデルを洗練・最適化するためにEpiDRIVEアッセイを用いた標的シーケンシングを実施しました。
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探索段階で特定されたcfDNA 5mC/5hmCマーカーのターゲットシーケンシングまたはqPCRベースの検証により、EGFR/VEGF標的療法後の長い vs 短い無増悪生存期間を示す患者を識別する予測バイオマーカーモデルの開発と検証を行う。
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検証コホート - 長期PFS群(レスポンダー)
EGFRまたはVEGF標的療法下でPFSが12ヶ月以上持続したmCRC患者の独立した検証コホート。 持続的奏効者を同定するためのcfDNA 5mC/5hmCバイオマーカーパネルの予測精度を確認するために、qPCRベースのEpiDRIVEアッセイが使用されました。 |
探索段階で特定されたcfDNA 5mC/5hmCマーカーのターゲットシーケンシングまたはqPCRベースの検証により、EGFR/VEGF標的療法後の長い vs 短い無増悪生存期間を示す患者を識別する予測バイオマーカーモデルの開発と検証を行う。
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検証コホート - 短期PFS群(無効例)
標的療法後12か月以内に無増悪生存期間(PFS)が認められた大腸癌(mCRC)患者からなる独立検証コホート。 モデルの特異性を評価し、長期奏効者と非奏効者を区別するため、qPCRベースのEpiDRIVEアッセイを用いて血漿中遊離DNA(cfDNA)を解析しました。 |
探索段階で特定されたcfDNA 5mC/5hmCマーカーのターゲットシーケンシングまたはqPCRベースの検証により、EGFR/VEGF標的療法後の長い vs 短い無増悪生存期間を示す患者を識別する予測バイオマーカーモデルの開発と検証を行う。
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この研究は何を測定していますか?
主要な結果の測定
結果測定 |
メジャーの説明 |
時間枠 |
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cfDNA 5mC/5hmCバイオマーカープロファイルに基づく無増悪生存期間(PFS)
時間枠:治療開始から最大36ヶ月
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転移性大腸癌(mCRC)患者におけるEGFR標的療法またはVEGF標的療法を受けた患者の無増悪生存期間(PFS)を、cfDNA 5mC/5hmCベースのバイオマーカーステータスで層別化したもの。
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治療開始から最大36ヶ月
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二次結果の測定
結果測定 |
メジャーの説明 |
時間枠 |
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全生存期間 (OS)
時間枠:治療開始から最大60ヶ月間
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EGFRまたはVEGFを標的とする治療の開始からあらゆる原因による死亡までの時間。全生存期間は、cfDNA 5mC/5hmCバイオマーカーで定義された群(EpiDRIVEスコア高値群 vs 低値群)に関連して解析され、エピジェネティックなcfDNAプロファイルが生存転帰の差異と関連しているかどうかを評価する。
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治療開始から最大60ヶ月間
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協力者と研究者
捜査官
- 主任研究者:Ajay Goel, PhD、City of Hope Medical Center
出版物と役立つリンク
一般刊行物
- Xie YH, Chen YX, Fang JY. Comprehensive review of targeted therapy for colorectal cancer. Signal Transduct Target Ther. 2020 Mar 20;5(1):22. doi: 10.1038/s41392-020-0116-z.
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- Xu C, Mannucci A, Esposito F, Oliveres H, Alonso-Orduna V, Yubero A, Fernandez-Martos C, Salud A, Gallego J, Martin-Richard M, Fernandez-Plana J, Guillot M, Aparicio J, Fakih M, Kopetz S, Feliu J, Maurel J, Goel A. An Exosome-Based Liquid Biopsy Predicts Depth of Response and Survival Outcomes to Cetuximab and Panitumumab in Metastatic Colorectal Cancer: The EXONERATE Study. Clin Cancer Res. 2025 Mar 17;31(6):1002-1015. doi: 10.1158/1078-0432.CCR-24-1934.
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- Li Q, Huang CC, Huang S, Tian Y, Huang J, Bitaraf A, Dong X, Nevalanen MT, Patel M, Wong J, Zhang J, Manley BJ, Park JY, Kohli M, Gore EM, Kilari D, Wang L. 5-hydroxymethylcytosine sequencing in plasma cell-free DNA identifies unique epigenomic features in prostate cancer patients resistant to androgen deprivation therapies. medRxiv [Preprint]. 2024 Oct 17:2023.10.13.23296758. doi: 10.1101/2023.10.13.23296758.
研究記録日
主要日程の研究
研究開始 (実際)
一次修了 (推定)
研究の完了 (推定)
試験登録日
最初に提出
QC基準を満たした最初の提出物
最初の投稿 (推定)
学習記録の更新
投稿された最後の更新 (推定)
QC基準を満たした最後の更新が送信されました
最終確認日
詳しくは
本研究に関する用語
その他の研究ID番号
- 23228/EpiDRIVE
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個々の参加者データ (IPD) を共有する予定はありますか?
IPD プランの説明
医薬品およびデバイス情報、研究文書
米国FDA規制医薬品の研究
米国FDA規制機器製品の研究
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CRC(結腸直腸がん)の臨床試験
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Shanghai Henlius Biotechまだ募集していません
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Niguarda HospitalUniversity of Turin, Italy; Fondazione del Piemonte per l'Oncologia完了
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Jubaan Ltd.募集
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Chang Gung Memorial HospitalFBD Biologics Limited募集
cfDNA 5mC/5hmCシークエンシング(EpiDRIVEディスカバリーフェーズ)の臨床試験
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City of Hope Medical Center募集