- ICH GCP
- US-Register für klinische Studien
- Klinische Studie NCT07224841
Entwicklung eines cfDNA 5mC/5hmC-basierten Biomarker-Panels zur Vorhersage der Wirksamkeit zielgerichteter Therapien bei mCRC (EpiDRIVE)
Entwicklung eines cfDNA 5mC/5hmC-basierten epigenetischen Biomarkerpanels zur Identifizierung von Determinanten des Ansprechens auf VEGF/EGFR-zielgerichtete Therapie bei metastasierendem kolorektalem Karzinom
Die EpiDRIVE-Studie zielt darauf ab, epigenetische Determinanten der Reaktion auf Basis von cfDNA bei Patienten mit metastasierendem kolorektalem Karzinom (mCRC), die mit EGFR- oder VEGF-zielgerichteter Therapie behandelt werden, zu identifizieren.
Durch die Integration von 5-Methylcytosin (5mC)- und 5-Hydroxymethylcytosin (5hmC)-Profilierung strebt diese Studie an, einen prädiktiven Biomarker-Panel zu entwickeln, der in der Lage ist, Responder von Non-Respondern auf zielgerichtete Therapie zu unterscheiden.
Studienübersicht
Status
Bedingungen
Detaillierte Beschreibung
Metastasisierendes kolorektales Karzinom (mCRC) bleibt eine der häufigsten Ursachen für krebsbedingte Todesfälle. Obwohl zielgerichtete Wirkstoffe wie Anti-EGFR- (Cetuximab, Panitumumab) und Anti-VEGF-Therapien (Bevacizumab) das Überleben verbessert haben, variiert das Ansprechen auf die Behandlung selbst unter molekular definierten Untergruppen erheblich.
Traditionelle Biomarker, einschließlich RAS/BRAF-Mutation und Tumorseitenlage, versagen bei der genauen Vorhersage der therapeutischen Wirksamkeit.
Jüngste Studien heben das Potenzial von zellfreier DNA (cfDNA)-Methylierung (5mC) und Hydroxymethylierung (5hmC) als sensitive, nicht-invasive Indikatoren für Tumorbiolgie und Behandlungsdynamik hervor.
Die EpiDRIVE-Studie integriert cfDNA 5mC/5hmC-Sequenzierung und gezielte Validierung, um epigenetische Determinanten des Therapieansprechens zu entdecken und zu verifizieren.
Entdeckungsphase: Vollgenom-5mC/5hmC-Profiling zur Identifizierung unterschiedlich modifizierter Regionen zwischen Respondern und Non-Respondern.
Trainingsphase: Gezielte Sequenzierung zur Etablierung eines prädiktiven cfDNA-epigenetischen Panels (EpiDRIVE-Panel).
Validierungsphase: qPCR-basierte Validierung ausgewählter Marker in einer unabhängigen Kohorte zur Bestätigung der prädiktiven Genauigkeit.
Diese Studie zielt darauf ab, einen nicht-invasiven Biomarker-Rahmen bereitzustellen, um die Wirksamkeit von EGFR- und VEGF-zielgerichteten Therapien bei mCRC vorherzusagen und zu überwachen, um letztendlich die personalisierte Therapieauswahl zu lenken.
Studientyp
Einschreibung (Geschätzt)
Kontakte und Standorte
Studienkontakt
- Name: Ajay Goel, PhD
- Telefonnummer: 626-359-8111
- E-Mail: ajgoel@coh.org
Studienorte
-
-
California
-
Duarte, California, Vereinigte Staaten, 91016
- Rekrutierung
- City of Hope Medical Center
-
Kontakt:
- Ajay Goel, PhD
- Telefonnummer: 626-218-3452
- E-Mail: AJGOEL@COH.ORG
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Teilnahmekriterien
Zulassungskriterien
Studienberechtigtes Alter
- Erwachsene
- Älterer Erwachsener
Akzeptiert gesunde Freiwillige
Probenahmeverfahren
Studienpopulation
Beschreibung
Einschlusskriterien:
- Histologisch bestätigtes metastasiertes kolorektales Adenokarzinom (mCRC).
- Erhaltene EGFR-zielgerichtete Therapie (Cetuximab/Panitumumab) oder VEGF-zielgerichtete Therapie (Bevacizumab).
- Verfügbarkeit einer prätherapeutischen Plasma-Probe für die cfDNA-Analyse.
- Dokumentierte radiologische Ansprechbewertung (RECIST 1.1).
- RAS/BRAF-Mutationsstatus bekannt.
Ausschlusskriterien:
- Unzureichende cfDNA-Qualität oder niedrige cfDNA-Ausbeute.
- Nicht-Adenokarzinom-Histologie.
- Gleichzeitige oder frühere andere aktive Malignität.
- Aktive entzündliche oder Autoimmunerkrankung, die die cfDNA-Methylierungsprofile beeinflusst.
Studienplan
Wie ist die Studie aufgebaut?
Designdetails
Kohorten und Interventionen
Gruppe / Kohorte |
Intervention / Behandlung |
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Entdeckungskohorte - Gruppe mit langem progressionsfreiem Überleben (Responder)
Patienten mit metastasierendem kolorektalem Karzinom (mCRC), die eine EGFR- oder VEGF-zielgerichtete Therapie erhielten und ein progressionsfreies Überleben (PFS) ≥ 12 Monate erreichten, wurden als klinische Responder eingestuft. Prätherapeutische Plasma-cfDNA-Proben wurden mittels genomweiter 5mC/5hmC-Sequenzierung analysiert, um epigenetische Determinanten zu identifizieren, die mit einem dauerhaften Therapieansprechen assoziiert sind. |
Hochdurchsatz-Genomweite Sequenzierung von cfDNA-Methylierungs- (5mC) und Hydroxymethylierungsprofilen (5hmC) aus Plasma-Proben vor der Behandlung in der Entdeckungskohorte zur Identifizierung epigenetischer Determinanten des Ansprechens auf zielgerichtete Therapie (PFS ≥ 12 Monate vs. < 12 Monate).
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Entdeckungskohorte - Kurze PFS-Gruppe (Non-Responder)
Patienten mit mCRC, die eine EGFR- oder VEGF-zielgerichtete Therapie erhielten und ein progressionsfreies Überleben (PFS) von < 12 Monaten aufwiesen, wurden als Non-Responder eingestuft. Prätherapeutische cfDNA-Proben wurden mittels genomweiter 5mC/5hmC-Sequenzierung analysiert und mit Langzeit-PFS-Respondern verglichen, um differentielle Methylierungs- und Hydroxymethylierungsmuster zu identifizieren, die mit Resistenz assoziiert sind. |
Hochdurchsatz-Genomweite Sequenzierung von cfDNA-Methylierungs- (5mC) und Hydroxymethylierungsprofilen (5hmC) aus Plasma-Proben vor der Behandlung in der Entdeckungskohorte zur Identifizierung epigenetischer Determinanten des Ansprechens auf zielgerichtete Therapie (PFS ≥ 12 Monate vs. < 12 Monate).
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Trainingskohorte - Gruppe mit langem PFS (Responder)
Unabhängige mCRC-Kohorte mit einem PFS ≥ 12 Monaten nach EGFR- oder VEGF-gerichteter Therapie. Kandidaten-cfDNA-5mC/5hmC-Marker, die in der Entdeckungsphase identifiziert wurden, wurden mittels gezielter Sequenzierung (EpiDRIVE-Assay) validiert, um den prädiktiven epigenetischen Biomarker-Panel zu konstruieren. |
Gezielte Sequenzierung oder qPCR-basierte Validierung von cfDNA 5mC/5hmC-Markern, die in der Entdeckungsphase identifiziert wurden, um ein prädiktives Biomodell zu entwickeln und zu validieren, das Patienten mit langem vs. kurzem progressionsfreiem Überleben nach EGFR-/VEGF-gerichteter Therapie unterscheidet.
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Trainingskohorte - Kurze PFS-Gruppe (Non-Responder)
Unabhängige mCRC-Patienten mit PFS < 12 Monaten nach gezielter Therapie.
Durch gezielte Sequenzierung mit dem EpiDRIVE-Assay wurde das prädiktive Modell durch den Vergleich von Kurz- und Lang-PFS-Fällen verfeinert und optimiert.
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Gezielte Sequenzierung oder qPCR-basierte Validierung von cfDNA 5mC/5hmC-Markern, die in der Entdeckungsphase identifiziert wurden, um ein prädiktives Biomodell zu entwickeln und zu validieren, das Patienten mit langem vs. kurzem progressionsfreiem Überleben nach EGFR-/VEGF-gerichteter Therapie unterscheidet.
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Validierungskohorte - Längere PFS-Gruppe (Responder)
Separate Validierungskohorte von mCRC-Patienten, die unter EGFR- oder VEGF-zielgerichteter Therapie ein PFS von ≥ 12 Monaten erreichten. Der qPCR-basierte EpiDRIVE-Assay wurde verwendet, um die prädiktive Genauigkeit des cfDNA-5mC/5hmC-Biomarkerpanels bei der Identifizierung von Langzeitansprechern zu bestätigen. |
Gezielte Sequenzierung oder qPCR-basierte Validierung von cfDNA 5mC/5hmC-Markern, die in der Entdeckungsphase identifiziert wurden, um ein prädiktives Biomodell zu entwickeln und zu validieren, das Patienten mit langem vs. kurzem progressionsfreiem Überleben nach EGFR-/VEGF-gerichteter Therapie unterscheidet.
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Validierungskohorte - Kurze PFS-Gruppe (Non-Responder)
Unabhängige Validierungskohorte von mCRC-Patienten mit PFS < 12 Monaten nach zielgerichteter Therapie. cfDNA wurde mit dem qPCR-basierten EpiDRIVE-Assay analysiert, um die Modellspezifität zu bewerten und Non-Responder von Langzeit-Respondern zu unterscheiden. |
Gezielte Sequenzierung oder qPCR-basierte Validierung von cfDNA 5mC/5hmC-Markern, die in der Entdeckungsphase identifiziert wurden, um ein prädiktives Biomodell zu entwickeln und zu validieren, das Patienten mit langem vs. kurzem progressionsfreiem Überleben nach EGFR-/VEGF-gerichteter Therapie unterscheidet.
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Was misst die Studie?
Primäre Ergebnismessungen
Ergebnis Maßnahme |
Maßnahmenbeschreibung |
Zeitfenster |
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Progressionsfreies Überleben (PFS) gemäß cfDNA 5mC/5hmC-Biomarkerprofil
Zeitfenster: Bis zu 36 Monate nach Therapiebeginn
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Progressionsfreies Überleben (PFS) bei Patienten mit metastasierendem kolorektalem Karzinom (mCRC), die eine EGFR- oder VEGF-zielgerichtete Therapie erhalten, stratifiziert nach cfDNA 5mC/5hmC-basiertem Biomarker-Status.
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Bis zu 36 Monate nach Therapiebeginn
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Sekundäre Ergebnismessungen
Ergebnis Maßnahme |
Maßnahmenbeschreibung |
Zeitfenster |
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Gesamtüberleben (OS)
Zeitfenster: Bis zu 60 Monate nach Therapiebeginn
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Zeit vom Beginn der EGFR- oder VEGF-zielgerichteten Therapie bis zum Tod aus irgendeinem Grund.
Das Gesamtüberleben wird in Bezug auf cfDNA-5mC-/5hmC-Biomarker-definierte Gruppen (hoher vs. niedriger EpiDRIVE-Score) analysiert, um zu bewerten, ob epigenetische cfDNA-Profile mit Unterschieden im Überleben verbunden sind.
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Bis zu 60 Monate nach Therapiebeginn
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Mitarbeiter und Ermittler
Sponsor
Ermittler
- Hauptermittler: Ajay Goel, PhD, City of Hope Medical Center
Publikationen und hilfreiche Links
Allgemeine Veröffentlichungen
- Xie YH, Chen YX, Fang JY. Comprehensive review of targeted therapy for colorectal cancer. Signal Transduct Target Ther. 2020 Mar 20;5(1):22. doi: 10.1038/s41392-020-0116-z.
- Siegel RL, Kratzer TB, Giaquinto AN, Sung H, Jemal A. Cancer statistics, 2025. CA Cancer J Clin. 2025 Jan-Feb;75(1):10-45. doi: 10.3322/caac.21871. Epub 2025 Jan 16.
- Zeng C, Stroup EK, Zhang Z, Chiu BC, Zhang W. Towards precision medicine: advances in 5-hydroxymethylcytosine cancer biomarker discovery in liquid biopsy. Cancer Commun (Lond). 2019 Mar 29;39(1):12. doi: 10.1186/s40880-019-0356-x.
- Xu C, Mannucci A, Esposito F, Oliveres H, Alonso-Orduna V, Yubero A, Fernandez-Martos C, Salud A, Gallego J, Martin-Richard M, Fernandez-Plana J, Guillot M, Aparicio J, Fakih M, Kopetz S, Feliu J, Maurel J, Goel A. An Exosome-Based Liquid Biopsy Predicts Depth of Response and Survival Outcomes to Cetuximab and Panitumumab in Metastatic Colorectal Cancer: The EXONERATE Study. Clin Cancer Res. 2025 Mar 17;31(6):1002-1015. doi: 10.1158/1078-0432.CCR-24-1934.
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- West-Szymanski DC, Zhang Z, Cui XL, Kowitwanich K, Gao L, Deng Z, Dougherty U, Williams C, Merkle S, Moore M, He C, Bissonnette M, Zhang W. Machine learning identifies cell-free DNA 5-hydroxymethylation biomarkers that detect occult colorectal cancer in PLCO Screening Trial subjects. bioRxiv [Preprint]. 2024 Feb 26:2024.02.25.581955. doi: 10.1101/2024.02.25.581955.
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- Li Q, Huang CC, Huang S, Tian Y, Huang J, Bitaraf A, Dong X, Nevalanen MT, Patel M, Wong J, Zhang J, Manley BJ, Park JY, Kohli M, Gore EM, Kilari D, Wang L. 5-hydroxymethylcytosine sequencing in plasma cell-free DNA identifies unique epigenomic features in prostate cancer patients resistant to androgen deprivation therapies. medRxiv [Preprint]. 2024 Oct 17:2023.10.13.23296758. doi: 10.1101/2023.10.13.23296758.
Studienaufzeichnungsdaten
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Zuerst gepostet (Geschätzt)
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- 23228/EpiDRIVE
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Klinische Studien zur cfDNA 5mC/5hmC-Sequenzierung (EpiDRIVE-Entdeckungsphase)
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