- ICH GCP
- US Clinical Trials Registry
- Klinisk forsøg NCT07224841
Udvikling af et cfDNA 5mC/5hmC-baseret biomarkørpanel til at forudsige målrettet terapi-effektivitet i mCRC (EpiDRIVE)
Udvikling af et cfDNA 5mC/5hmC-baseret epigenetisk biomarkørpanel til at identificere determinanter for respons ved VEGF/EGFR-målrettet terapi for metastaserende tyktarmskræft
EpiDRIVE-studiet har til formål at identificere cfDNA-baserede epigenetiske determinanter for respons hos patienter med metastatisk kolorektal cancer (mCRC), der behandles med EGFR- eller VEGF-målrettet terapi.
Ved at integrere 5-methylcytosin (5mC) og 5-hydroxymethylcytosin (5hmC) profileringsdata sigter denne studie mod at udvikle et prædiktivt biomarkørpanel, der kan differentiere respondenter fra ikke-respondenter til målrettet terapi.
Studieoversigt
Status
Betingelser
Detaljeret beskrivelse
Metastatisk kolorektal cancer (mCRC) forbliver en af de førende årsager til kræftrelaterede dødsfald. Selvom målrettede lægemidler som anti-EGFR (cetuximab, panitumumab) og anti-VEGF (bevacizumab) terapier har forbedret overlevelsen, varierer behandlingsresponsen betydeligt selv blandt molekylært definerede undergrupper.
Traditionelle biomarkører, herunder RAS/BRAF-mutation og tumorsidedness, formår ikke præcist at forudsige terapeutisk effekt.
Nylige studier fremhæver potentialet af cell-frit DNA (cfDNA) methylering (5mC) og hydroxymethylering (5hmC) som følsomme, ikke-invasive indikatorer for tumorbiologi og behandlingsdynamik.
EpiDRIVE-studiet integrerer cfDNA 5mC/5hmC-sekventering og målrettet validering for at opdage og verificere epigenetiske determinanter for terapeutisk respons.
Opdagelsesfase: Helt-genom 5mC/5hmC-profilering for at identificere differentielt modificerede regioner mellem respondenter og ikke-respondenter.
Træningsfase: Målrettet sekventering for at etablere en prædiktiv cfDNA epigenetisk panel (EpiDRIVE-panel).
Valideringsfase: qPCR-baseret validering af udvalgte markører i en uafhængig kohorte for at bekræfte prædiktiv nøjagtighed.
Dette studie har til formål at give en ikke-invasiv biomarkørramme til at forudsige og overvåge effekten af EGFR- og VEGF-målrettede terapier i mCRC, og i sidste ende vejlede personlig behandlingsvalg.
Undersøgelsestype
Tilmelding (Anslået)
Kontakter og lokationer
Studiekontakt
- Navn: Ajay Goel, PhD
- Telefonnummer: 626-359-8111
- E-mail: ajgoel@coh.org
Studiesteder
-
-
California
-
Duarte, California, Forenede Stater, 91016
- Rekruttering
- City of Hope Medical Center
-
Kontakt:
- Ajay Goel, PhD
- Telefonnummer: 626-218-3452
- E-mail: AJGOEL@COH.ORG
-
-
Deltagelseskriterier
Berettigelseskriterier
Aldre berettiget til at studere
- Voksen
- Ældre voksen
Tager imod sunde frivillige
Prøveudtagningsmetode
Studiebefolkning
Beskrivelse
Inklusionskriterier:
- Histologisk bekræftet metastatisk kolorektal adenokarcinom (mCRC).
- Har modtaget EGFR-målrettet terapi (cetuximab/panitumumab) eller VEGF-målrettet terapi (bevacizumab).
- Tilgængelighed af præ-behandlings plasma-prøve til cfDNA-analyse.
- Dokumenteret radiologisk responsvurdering (RECIST 1.1).
- RAS/BRAF-mutationsstatus kendt.
Eksklusionskriterier:
- Utilstrækkelig cfDNA-kvalitet eller lav cfDNA-udbytte.
- Ikke-adenokarcinom histologi.
- Samtidig eller tidligere anden aktiv malignitet.
- Aktiv inflammatorisk eller autoimmun sygdom, der påvirker cfDNA-methyleringsprofiler.
Studieplan
Hvordan er undersøgelsen tilrettelagt?
Design detaljer
Kohorter og interventioner
Gruppe / kohorte |
Intervention / Behandling |
|---|---|
|
Discovery-kohorte - Lang PFS-gruppe (Responder)
Patienter med metastatisk kolorektalkræft (mCRC), som modtog EGFR- eller VEGF-målrettet terapi og opnåede en progressionsfri overlevelse (PFS) ≥ 12 måneder, klassificeret som kliniske respondere. Præ-behandlings plasma cfDNA-prøver blev analyseret ved hjælp af genome-wide 5mC/5hmC-sekventering for at identificere epigenetiske determinanter associeret med vedvarende behandlingsrespons. |
Højtydende genomvidst sekventering af cfDNA-methylering (5mC) og hydroxymethylering (5hmC) profiler fra præbehandlings plasmaprøver i opdagelseskohorten for at identificere epigenetiske determinanter af målrettet terapi-respons (PFS ≥ 12 måneder vs < 12 måneder).
|
|
Opdagelseskohorte - Kort PFS-gruppe (Ikke-svarer)
Patienter med mCRC, som modtog EGFR- eller VEGF-målrettet terapi og viste progressionsfri overlevelse (PFS) < 12 måneder, klassificeret som non-respondere. Præ-behandlings cfDNA-prøver blev analyseret ved hjælp af genome-wide 5mC/5hmC-sekventering og sammenlignet med lang-PFS-respondenter for at identificere differentielle metylerings- og hydroxymyleringsmønstre associeret med resistens. |
Højtydende genomvidst sekventering af cfDNA-methylering (5mC) og hydroxymethylering (5hmC) profiler fra præbehandlings plasmaprøver i opdagelseskohorten for at identificere epigenetiske determinanter af målrettet terapi-respons (PFS ≥ 12 måneder vs < 12 måneder).
|
|
Træningskohorte - Lang PFS-gruppe (Responder)
Uafhængig mCRC-kohorte med PFS ≥ 12 måneder efter EGFR- eller VEGF-målrettet terapi. Kandidat-cfDNA 5mC/5hmC-markører identificeret i opdagelsesfasen blev valideret ved hjælp af målrettet sekventering (EpiDRIVE-test) til at konstruere den prædiktive epigenetiske biomarkørpanel. |
Målrettet sekventering eller qPCR-baseret validering af cfDNA 5mC/5hmC-markører identificeret fra opdagelsesfasen for at udvikle og validere en prædiktiv biomarkørmodel, der kan skelne mellem patienter med lang vs. kort progressionsfri overlevelse efter EGFR-/VEGF-målrettet terapi.
|
|
Træningskohorte - Kort PFS-gruppe (Ikke-svarer)
Uafhængige mCRC-patienter med PFS < 12 måneder efter målrettet terapi.
Målrettet sekventering ved hjælp af EpiDRIVE-testen blev udført for at forfine og optimere den prædiktive model ved at sammenligne kort- versus lang-PFS-tilfælde.
|
Målrettet sekventering eller qPCR-baseret validering af cfDNA 5mC/5hmC-markører identificeret fra opdagelsesfasen for at udvikle og validere en prædiktiv biomarkørmodel, der kan skelne mellem patienter med lang vs. kort progressionsfri overlevelse efter EGFR-/VEGF-målrettet terapi.
|
|
Valideringskohort - Lang PFS-gruppe (Responder)
Separat valideringskohorte af mCRC-patienter, der opnår PFS ≥ 12 måneder under EGFR- eller VEGF-målrettet terapi. qPCR-baseret EpiDRIVE-test blev anvendt til at bekræfte den prædiktive nøjagtighed af cfDNA 5mC/5hmC-biomarkerpanelet i identifikation af vedvarende respondenter. |
Målrettet sekventering eller qPCR-baseret validering af cfDNA 5mC/5hmC-markører identificeret fra opdagelsesfasen for at udvikle og validere en prædiktiv biomarkørmodel, der kan skelne mellem patienter med lang vs. kort progressionsfri overlevelse efter EGFR-/VEGF-målrettet terapi.
|
|
Valideringskohorte - Kort PFS-gruppe (Ikke-responder)
Uafhængig valideringskohorte af mCRC-patienter med PFS < 12 måneder efter målrettet terapi. cfDNA blev analyseret ved hjælp af qPCR-baserede EpiDRIVE-test til vurdering af models specifikitet og adskillelse af ikke-respondenter fra langtidsrespondenter. |
Målrettet sekventering eller qPCR-baseret validering af cfDNA 5mC/5hmC-markører identificeret fra opdagelsesfasen for at udvikle og validere en prædiktiv biomarkørmodel, der kan skelne mellem patienter med lang vs. kort progressionsfri overlevelse efter EGFR-/VEGF-målrettet terapi.
|
Hvad måler undersøgelsen?
Primære resultatmål
Resultatmål |
Foranstaltningsbeskrivelse |
Tidsramme |
|---|---|---|
|
Progressionsfri Overlevelse (PFS) ifølge cfDNA 5mC/5hmC biomarkørprofil
Tidsramme: Op til 36 måneder fra terapiens start
|
Progressionsfri overlevelse (PFS) blandt patienter med metastatisk kolorektal cancer (mCRC), der modtager EGFR- eller VEGF-målrettet terapi, stratificeret efter cfDNA 5mC/5hmC-baseret biomarkørstatus.
|
Op til 36 måneder fra terapiens start
|
Sekundære resultatmål
Resultatmål |
Foranstaltningsbeskrivelse |
Tidsramme |
|---|---|---|
|
Overlevelse i alt (OS)
Tidsramme: Op til 60 måneder fra behandlingsstart
|
Tid fra indledning af EGFR- eller VEGF-målrettet terapi til død af enhver årsag.
Overlevelse vil blive analyseret i forhold til cfDNA 5mC/5hmC biomarkør-definerede grupper (høj vs. lav EpiDRIVE-score) for at vurdere, om epigenetiske cfDNA-profiler er forbundet med forskelle i overlevelsesresultater.
|
Op til 60 måneder fra behandlingsstart
|
Samarbejdspartnere og efterforskere
Sponsor
Efterforskere
- Ledende efterforsker: Ajay Goel, PhD, City of Hope Medical Center
Publikationer og nyttige links
Generelle publikationer
- Xie YH, Chen YX, Fang JY. Comprehensive review of targeted therapy for colorectal cancer. Signal Transduct Target Ther. 2020 Mar 20;5(1):22. doi: 10.1038/s41392-020-0116-z.
- Siegel RL, Kratzer TB, Giaquinto AN, Sung H, Jemal A. Cancer statistics, 2025. CA Cancer J Clin. 2025 Jan-Feb;75(1):10-45. doi: 10.3322/caac.21871. Epub 2025 Jan 16.
- Zeng C, Stroup EK, Zhang Z, Chiu BC, Zhang W. Towards precision medicine: advances in 5-hydroxymethylcytosine cancer biomarker discovery in liquid biopsy. Cancer Commun (Lond). 2019 Mar 29;39(1):12. doi: 10.1186/s40880-019-0356-x.
- Xu C, Mannucci A, Esposito F, Oliveres H, Alonso-Orduna V, Yubero A, Fernandez-Martos C, Salud A, Gallego J, Martin-Richard M, Fernandez-Plana J, Guillot M, Aparicio J, Fakih M, Kopetz S, Feliu J, Maurel J, Goel A. An Exosome-Based Liquid Biopsy Predicts Depth of Response and Survival Outcomes to Cetuximab and Panitumumab in Metastatic Colorectal Cancer: The EXONERATE Study. Clin Cancer Res. 2025 Mar 17;31(6):1002-1015. doi: 10.1158/1078-0432.CCR-24-1934.
- Koroukian SM, Booker BD, Vu L, Schumacher FR, Rose J, Cooper GS, Selfridge JE, Markt SC. Receipt of Targeted Therapy and Survival Outcomes in Patients With Metastatic Colorectal Cancer. JAMA Netw Open. 2023 Jan 3;6(1):e2250030. doi: 10.1001/jamanetworkopen.2022.50030.
- Tirendi S, Marengo B, Domenicotti C, Bassi AM, Almonti V, Vernazza S. Colorectal cancer and therapy response: a focus on the main mechanisms involved. Front Oncol. 2023 Jul 19;13:1208140. doi: 10.3389/fonc.2023.1208140. eCollection 2023.
- Cai Z, Zhang J, He Y, Xia L, Dong X, Chen G, Zhou Y, Hu X, Zhong S, Wang Y, Chen H, Xie D, Liu X, Liu J. Liquid biopsy by combining 5-hydroxymethylcytosine signatures of plasma cell-free DNA and protein biomarkers for diagnosis and prognosis of hepatocellular carcinoma. ESMO Open. 2021 Feb;6(1):100021. doi: 10.1016/j.esmoop.2020.100021. Epub 2021 Jan 25.
- West-Szymanski DC, Zhang Z, Cui XL, Kowitwanich K, Gao L, Deng Z, Dougherty U, Williams C, Merkle S, He C, Zhang W, Bissonnette M. 5-Hydroxymethylated Biomarkers in Cell-Free DNA Predict Occult Colorectal Cancer up to 36 Months Before Diagnosis in the Prostate, Lung, Colorectal, and Ovarian Cancer Screening Trial. JCO Precis Oncol. 2024 Oct;8:e2400277. doi: 10.1200/PO.24.00277. Epub 2024 Oct 11.
- West-Szymanski DC, Zhang Z, Cui XL, Kowitwanich K, Gao L, Deng Z, Dougherty U, Williams C, Merkle S, Moore M, He C, Bissonnette M, Zhang W. Machine learning identifies cell-free DNA 5-hydroxymethylation biomarkers that detect occult colorectal cancer in PLCO Screening Trial subjects. bioRxiv [Preprint]. 2024 Feb 26:2024.02.25.581955. doi: 10.1101/2024.02.25.581955.
- Song D, Zhang Z, Zheng J, Zhang W, Cai J. 5-Hydroxymethylcytosine modifications in circulating cell-free DNA: frontiers of cancer detection, monitoring, and prognostic evaluation. Biomark Res. 2025 Mar 7;13(1):39. doi: 10.1186/s40364-025-00751-9.
- Baldassarre G, L de la Serna I, Vallette FM. Death-ision: the link between cellular resilience and cancer resistance to treatments. Mol Cancer. 2025 May 15;24(1):144. doi: 10.1186/s12943-025-02339-1.
- Ferrara R, Imbimbo M, Malouf R, Paget-Bailly S, Calais F, Marchal C, Westeel V. Single or combined immune checkpoint inhibitors compared to first-line platinum-based chemotherapy with or without bevacizumab for people with advanced non-small cell lung cancer. Cochrane Database Syst Rev. 2021 Apr 30;4(4):CD013257. doi: 10.1002/14651858.CD013257.pub3.
- Guler GD, Ning Y, Coruh C, Mognol GP, Phillips T, Nabiyouni M, Hazen K, Scott A, Volkmuth W, Levy S. Plasma cell-free DNA hydroxymethylation profiling reveals anti-PD-1 treatment response and resistance biology in non-small cell lung cancer. J Immunother Cancer. 2024 Jan 11;12(1):e008028. doi: 10.1136/jitc-2023-008028.
- Shao J, Xu Y, Olsen RJ, Kasparian S, Sun K, Mathur S, Zhang J, He C, Chen SH, Bernicker EH, Li Z. 5-Hydroxymethylcytosine in Cell-Free DNA Predicts Immunotherapy Response in Lung Cancer. Cells. 2024 Apr 19;13(8):715. doi: 10.3390/cells13080715.
- Li Q, Huang CC, Huang S, Tian Y, Huang J, Bitaraf A, Dong X, Nevalanen MT, Patel M, Wong J, Zhang J, Manley BJ, Park JY, Kohli M, Gore EM, Kilari D, Wang L. 5-hydroxymethylcytosine sequencing in plasma cell-free DNA identifies unique epigenomic features in prostate cancer patients resistant to androgen deprivation therapies. medRxiv [Preprint]. 2024 Oct 17:2023.10.13.23296758. doi: 10.1101/2023.10.13.23296758.
Datoer for undersøgelser
Studer store datoer
Studiestart (Faktiske)
Primær færdiggørelse (Anslået)
Studieafslutning (Anslået)
Datoer for studieregistrering
Først indsendt
Først indsendt, der opfyldte QC-kriterier
Først opslået (Anslået)
Opdateringer af undersøgelsesjournaler
Sidste opdatering sendt (Anslået)
Sidste opdatering indsendt, der opfyldte kvalitetskontrolkriterier
Sidst verificeret
Mere information
Begreber relateret til denne undersøgelse
Nøgleord
Yderligere relevante MeSH-vilkår
Andre undersøgelses-id-numre
- 23228/EpiDRIVE
Plan for individuelle deltagerdata (IPD)
Planlægger du at dele individuelle deltagerdata (IPD)?
IPD-planbeskrivelse
Lægemiddel- og udstyrsoplysninger, undersøgelsesdokumenter
Studerer et amerikansk FDA-reguleret lægemiddelprodukt
Studerer et amerikansk FDA-reguleret enhedsprodukt
Disse oplysninger blev hentet direkte fra webstedet clinicaltrials.gov uden ændringer. Hvis du har nogen anmodninger om at ændre, fjerne eller opdatere dine undersøgelsesoplysninger, bedes du kontakte register@clinicaltrials.gov. Så snart en ændring er implementeret på clinicaltrials.gov, vil denne også blive opdateret automatisk på vores hjemmeside .
Kliniske forsøg med CRC (kolorektal cancer)
-
Stingray TherapeuticsRekrutteringRefractory Metastatic Microsatellite Stabil Colorectal Cancer (MSS-CRC)Forenede Stater
-
Hansoh BioMedical R&D CompanyRekruttering
-
Shanghai Henlius BiotechIkke rekrutterer endnu
-
Motus GI Medical Technologies LtdAfsluttet
-
Motus GI Medical Technologies LtdAfsluttet
-
NGM Biopharmaceuticals, IncTrukket tilbage
-
Motus GI Medical Technologies LtdAfsluttet
-
Jun HuangIkke rekrutterer endnuCRC | Levermetastaser tyktarmskræftKina
-
University of ArkansasRekrutteringColorectal cancer og inflammatorisk tarmsygdomForenede Stater
-
Chinese University of Hong KongAfsluttet
Kliniske forsøg med cfDNA 5mC/5hmC-sekventering (EpiDRIVE-opdagelsesfase)
-
City of Hope Medical CenterRekrutteringCRC (kolorektal cancer)Forenede Stater