Ezt az oldalt automatikusan lefordították, és a fordítás pontossága nem garantált. Kérjük, olvassa el a angol verzió forrásszöveghez.

Az Optikai Genom Térképezés (OGM) hozzájárulása a Többfajta Veleszületett Fejlődési Rendellenesség Genetikai Rendellenesség Nélküli vagy Értelmi Fogyatékossággal Járó Diagnosztizálásához (CARTOGEN-N)

2026. január 20. frissítette: Céline PEBREL-RICHARD

CARTOGEN-N_Optikai Génkartográfia (OGM) Hozzájárulása a Többfajta Veleszületett Rendellenesség Diagnosztizálásához Intellektuális Fogyatékossággal vagy anélkül, Genetiális Rendellenesség Nélkül, amelyet Teljes Génszekvenálással Észleltek

A veleszületett rendellenességek egy vagy több rendszert (szív-, csont-, idegrendszer stb.) érintő embriónális vagy magzati fejlődési rendellenességből (DD) származnak. Ezeket többes veleszületett rendellenességeknek (MCAs) nevezik. Intellektuális fogyatékossággal (ID) társulhatnak1.

A kromoszómamikrotömb-analízis (CMA) kromoszómaelemzése és a géngarnitúrák vagy exomszekvenálás a DD kromoszómális és molekuláris diagnosztikájának arany standard módszerei2. Amennyiben ezek az elsővonalbeli tesztek után nem állapítható meg diagnózis, a rövid olvasatú teljes genomszekvenálás (WGS) megfontolható a Plan France Medicine Genomic 2020-2025 (AURAGEN) keretében. Ez a megközelítés közel 40%-ban teszi lehetővé a diagnózist a DD-ben szenvedő betegeknél3,4. Sok beteg azonban továbbra is diagnosztikus holtpontban marad, valószínűleg e módszerek technikai korlátai miatt, amelyeket esetleg leküzdhetnek az új módszerek, mint az optikai genomtérképezés (OGM)5,6,7,8,9. A kutatók javasolják az OGM szisztematikus elvégzését 30 olyan betegnél, akik MCA+/-ID-t mutatnak, és nem egyértelmű WGS-eredményük van10.

A fő cél az OGM hozzájárulásának felmérése a WGS által nem észlelt vagy rosszul jellemzett strukturális variánsok azonosításában ebben a klinikai kontextusban. Ez a munka hozzájárul az OGM folyamatos rutindiagnosztikai alkalmazásához és meghatározza szerepét az MCA+/-ID általános genetikai diagnosztikájában. Emellett új jelölt gének és/vagy patogenitási mechanizmusok azonosításához vezethet. Ha az eredmények ígéretesek, további klinikai vizsgálatok kibővíthetik ezt az előzetes munkát egy nagyobb léptékű projektté. A DD genetikai diagnosztikájának javítása javítania kell a jelenleg diagnosztikus holtpontban lévő betegek és családjaik orvosi kezelését.

A tanulmány áttekintése

Állapot

Toborzás

Körülmények

Beavatkozás / kezelés

Részletes leírás

Tanulmány Munkafolyamat

Pre-analitikai Szakasz

A tanulmányban való részvételt a Genetikai Tanszék egyik kutatója felajánlja minden olyan betegnek, aki megfelel a befogadási és nem befogadási kritériumoknak, egy olyan orvosi konzultáció során, amelyen a nem hozzájáruló teljes genom szekvenálás (WGS) eredményét közölték (1. ábra). A tanulmány eljárásairól és céljairól szóló tájékoztatást ekkor adják meg. A tájékoztatót és a beleegyező nyilatkozatot a betegnek (ha felnőtt) vagy a szülői felhatalmazás birtokosainak (ha a beteg kiskorú) adják át. A genetikai vizsgálatokra és a kutatási projektben való részvételre vonatkozó beleegyezés megszerzése után a beteg felvételre kerülhet a tanulmányba. A tanulmányhoz szükséges vér mintákat gyűjtik, átviszik a laboratóriumba, és a következő protokoll szerint biztosítják az elemzéshez:

Beteg > 20 kg:

2 × 5 mL EDTA vér cső

  1. × 5 mL heparinizált vér cső

    Beteg 12-20 kg:

  2. × 5 mL EDTA vér cső

Beteg 5-12 kg:

1 × 5 mL EDTA vér cső

A mintákat a Citogenetikai Tanszékre küldik, ahol álnevesítik és biztosítják. Legalább három, 1,5 mL EDTA vérből származó alikvótot és a maradék térfogatot -80 °C-on lefagyasztják a DNS kinyerés és a hosszú fragmentumú DNS kinyerés céljából. Perifériás vér limfocitákból álló sejttenyésztést is végeznek a heparinizált csőből származó fix kromoszóma pellet előállításához, ha az elérhető. Ha a heparinizált minta nem áll rendelkezésre, és az optikai genom térképezés eredményei kromoszóma rendellenesség kariotípussal vagy FISH-sel történő megerősítését igénylik (azaz hozzájáruló eredmény), akkor a klinikai eredmény-visszajelző konzultáció során egy második vérvételt javasolnak.

Elemzés A Clermont-Ferrand Egyetemi Kórház Citogenetikai Tanszékéről származó fagyasztott mintákat (betegenként egyet) TSE-n keresztül továbbítják a Reims Egyetemi Kórház Genetikai Tanszékére, amelyet az optikai genom térképezés végrehajtására jelöltek ki, amíg a Saphyr szkennert a Clermont-Ferrand Egyetemi Kórházban telepítik (DAN 2025 pályázat).

A hosszú DNS molekulák kinyerését, jelölését és képezését a gyártói készletekkel, a mellékelt utasítások szerint végzik.

Eredmények és Értelmezés

A nyers adatokat a Reims Egyetemi Kórház citogenetikusai elemezik és érvényesítik a Bionano Access és Solve® szoftverek segítségével. Az adatokat biztonságosan megosztják a projekt vezetőjével is, aki felelős:

Egy második független elemzés (a Citogenetikai Tanszékben elérhető Bionano Access és Solve segítségével) végrehajtásáért, kihasználva a korábbi projektekben való részvétel során szerzett szakértelmet.

Az eredmények végső értelmezéséért és a klinikailag releváns megállapítások terjesztéséért a betegellátás érdekében.

Így minden minta dupla felülvizsgálatból és dupla szakértelemből részesül, biztosítva az eredmények megbízhatóságát.

Szülői szegregációs vizsgálatokat javasolhatnak a biológiai értelmezés megkönnyítése érdekében. Ha szükséges, a szülői minták gyűjtését és a beleegyezési eljárásokat a Clermont-Ferrand Egyetemi Kórház Orvosi Genetikai Tanszéke koordinálja. A meggyőző eredményeket a WGS-t felíró klinikusnak közlik a betegellátás és a genetikai tanácsadás céljából.

Tanulmány típusa

Beavatkozó

Beiratkozás (Becsült)

55

Fázis

  • Nem alkalmazható

Kapcsolatok és helyek

Ez a rész a vizsgálatot végzők elérhetőségeit, valamint a vizsgálat lefolytatásának helyére vonatkozó információkat tartalmazza.

Tanulmányi kapcsolat

Tanulmányi helyek

Részvételi kritériumok

A kutatók olyan embereket keresnek, akik megfelelnek egy bizonyos leírásnak, az úgynevezett jogosultsági kritériumoknak. Néhány példa ezekre a kritériumokra a személy általános egészségi állapota vagy a korábbi kezelések.

Jogosultsági kritériumok

Tanulmányozható életkorok

  • Gyermek
  • Felnőtt
  • Idősebb felnőtt

Egészséges önkénteseket fogad

Nem

Leírás

Bevonási kritériumok

  • Legalább két veleszületett rendellenességgel rendelkező betegek, intellektuális fogyatékossággal vagy anélkül, és akik súlya meghaladja az 5 kg-ot.
  • AURAGEN laboratórium által végzett teljes genom szekvenálás nem tartozónak minősített (nincsenek 4. vagy 5. osztályú variánsok, vagy VUS azonosításra került, vagy recesszív rendellenesség esetén csak egy variáns azonosításra került).
  • A beteg társadalombiztosítási rendszerrel rendelkezik.
  • A beteg képes megérteni és ellenezni a vizsgálatban való részvételt.
  • A genetikai vizsgálatokhoz szükséges írásos tájékoztatott beleegyezés, amelyet a beteg vagy törvényes képviselői (kiskorúak esetén) írtak alá, miután világos és tisztességes tájékoztatást kaptak a vizsgálatról.

Nem-bevonási kritériumok

  • Azok a betegek, akiknél korábban nem genetikai okot (fertőző, környezeti vagy toxikus) azonosítottak.
  • Megfelelő mintavétel elérésének lehetetlensége.
  • A beteg vagy a szülői felhatalmazás birtokosa gyámság vagy jogi védelem alatt áll, szabadságától megfosztott, vagy bírósági védelem alatt áll.

Tanulási terv

Ez a rész a vizsgálati terv részleteit tartalmazza, beleértve a vizsgálat megtervezését és a vizsgálat mérését.

Hogyan készül a tanulmány?

Tervezési részletek

  • Elsődleges cél: Diagnosztikai
  • Kiosztás: N/A
  • Beavatkozó modell: Egyetlen csoportos hozzárendelés
  • Maszkolás: Nincs (Open Label)

Fegyverek és beavatkozások

Résztvevő csoport / kar
Beavatkozás / kezelés
Kísérleti: egyetlen csoport a veleszületett rendellenességekkel rendelkező betegek számára
Genetikai: vérvétel
A beteg és/vagy törvényes képviselői hozzájárulásának megszerzése után vérvétel történik. A szükséges csövek száma (1-3) a beteg súlya alapján kerül meghatározásra, az optikai genom térképezés és a szükséges megerősítő vizsgálatok elvégzése érdekében abban az esetben, ha strukturális variánst azonosítanak.

Mit mér a tanulmány?

Elsődleges eredményintézkedések

Eredménymérő
Intézkedés leírása
Időkeret
az optikai genom térképezés (OGM) diagnosztikai hozama többfajta veleszületett rendellenességnél, intellektuális képességzavarral vagy anélkül, amikor a teljes genom szekvenálás (WGS) nem hoz eredményt
Időkeret: 1. nap (beválasztás és vérmintavétel)
Az optikai genomtérképezés (OGM) diagnosztikus hozamának értékelése több veleszületett rendellenességnél, intellektuális fogyatékossággal vagy anélkül, amikor a teljes genom szekvenálás (WGS) nem járul hozzá (nincs oksági genetikai variáció vagy bizonytalan jelentőségű variáns (VUS) vagy egyetlen variáns egy recesszív rendellenességben észlelhető).
1. nap (beválasztás és vérmintavétel)

Másodlagos eredményintézkedések

Eredménymérő
Intézkedés leírása
Időkeret
A kezdetben VUS-nak (bizonytalan/ismeretlen jelentőségű variánsoknak) tekintett átsorolt variánsok száma
Időkeret: 1. nap (beválasztás és vérgyűjtés)
A kezdetben VUS-nak (bizonytalan/ismeretlen jelentőségű variánsoknak) minősített variánsok számának felmérése, amelyeket később ártalmatlan vagy kóros variánsokként újraosztályoztak
1. nap (beválasztás és vérgyűjtés)
A betegek száma, akiknél új jelölt gént/patogén mechanizmust azonosítottak
Időkeret: 1. nap (beválasztás és vérvétel)
1. nap (beválasztás és vérvétel)
A technika alkalmazhatóságának (időtartamának) értékelése a jelenlegi gyakorlatban első vonalban, második vonalban (rutin tesztek, például kromoszómális mikrotömb, exom szekvenálás stb. után), vagy harmadik vonalban nem hozzájáruló WGS esetén több kritérium alapján
Időkeret: 1. nap (beválasztás és vérgyűjtés)
A technikai időtartam (óra) értékelése
1. nap (beválasztás és vérgyűjtés)
A technika alkalmazhatóságának (kudarc) értékelése a jelenlegi gyakorlatban 1. vonalban, 2. vonalban (rutin tesztek, mint a kromoszómális mikrotömb, exom szekvenálás... után), vagy 3. vonalban nem hozzájáruló teljes genom szekvenálás esetén több kritérium alapján
Időkeret: 1. nap (beválasztás és vérgyűjtés)
hibarátaszám
1. nap (beválasztás és vérgyűjtés)
A technika (újrafeldolgozás) alkalmazhatóságának értékelése a jelenlegi gyakorlatban első vonalban, második vonalban (rutin tesztek, mint a kromoszómális mikrotömb, exom szekvenálás stb. után) vagy harmadik vonalban, nem hozzájáruló teljes genom szekvenálás esetén, több kritérium alapján
Időkeret: 1. nap (bevonás és vérgyűjtés)
újrafeldolgozási arány szám
1. nap (bevonás és vérgyűjtés)
A technika alkalmazhatóságának (értelmezés) értékelése a jelenlegi gyakorlatban első vonalban, második vonalban (rutin tesztek után, mint a kromoszómális mikrotömb, exom szekvenálás…), vagy harmadik vonalban nem hozzájáruló teljes genom szekvenálás esetén több kritérium alapján
Időkeret: 1. nap (beválasztás és vérvétel)
Biológiai értelmezési idő (óra) értékelése
1. nap (beválasztás és vérvétel)
Értékelje az új technológiák alkalmazásának hatását a betegellátásra.
Időkeret: 1. nap (beválasztás és vérgyűjtés)
A betegek százalékos aránya, akiknél az OGM-eredmények klinikai kezelési módosítást eredményeztek.
1. nap (beválasztás és vérgyűjtés)

Együttműködők és nyomozók

Itt találhatja meg a tanulmányban érintett személyeket és szervezeteket.

Szponzor

Céline PEBREL-RICHARD

Nyomozók

  • Tanulmányi szék: Lise Laclautre, University Hospital, Clermont-Ferrand

Tanulmányi rekorddátumok

Ezek a dátumok nyomon követik a ClinicalTrials.gov webhelyre benyújtott vizsgálati rekordok és összefoglaló eredmények benyújtásának folyamatát. A vizsgálati feljegyzéseket és a jelentett eredményeket a Nemzeti Orvostudományi Könyvtár (NLM) felülvizsgálja, hogy megbizonyosodjon arról, hogy megfelelnek-e az adott minőség-ellenőrzési szabványoknak, mielőtt közzéteszik őket a nyilvános weboldalon.

Tanulmány főbb dátumok

Tanulmány kezdete (Tényleges)

2025. november 18.

Elsődleges befejezés (Becsült)

2028. november 1.

A tanulmány befejezése (Becsült)

2028. november 1.

Tanulmányi regisztráció dátumai

Először benyújtva

2025. december 9.

Először nyújtották be, amely megfelel a minőségbiztosítási kritériumoknak

2026. január 20.

Első közzététel (Tényleges)

2026. január 27.

Tanulmányi rekordok frissítései

Utolsó frissítés közzétéve (Tényleges)

2026. január 27.

Az utolsó frissítés elküldve, amely megfelel a minőségbiztosítási kritériumoknak

2026. január 20.

Utolsó ellenőrzés

2026. január 1.

Több információ

A tanulmányhoz kapcsolódó kifejezések

Kulcsszavak

További vonatkozó MeSH feltételek

Egyéb vizsgálati azonosító számok

  • AOI 2024 PEBREL-RICHARD

Terv az egyéni résztvevői adatokhoz (IPD)

Tervezi megosztani az egyéni résztvevői adatokat (IPD)?

NEM

Gyógyszer- és eszközinformációk, tanulmányi dokumentumok

Egy amerikai FDA által szabályozott gyógyszerkészítményt tanulmányoz

Nem

Egy amerikai FDA által szabályozott eszközterméket tanulmányoz

Nem

Ezt az információt közvetlenül a clinicaltrials.gov webhelyről szereztük be, változtatás nélkül. Ha bármilyen kérése van vizsgálati adatainak módosítására, eltávolítására vagy frissítésére, kérjük, írjon a következő címre: register@clinicaltrials.gov. Amint a változás bevezetésre kerül a clinicaltrials.gov oldalon, ez a webhelyünkön is automatikusan frissül. .

Iratkozz fel