Denne side blev automatisk oversat, og nøjagtigheden af ​​oversættelsen er ikke garanteret. Der henvises til engelsk version for en kildetekst.

Optisk Genomkortlægnings (OGM) bidrag til diagnostik af flere medfødte misdannelser med eller uden intellektuel handicap uden genetisk abnormitet (CARTOGEN-N)

20. januar 2026 opdateret af: Céline PEBREL-RICHARD

CARTOGEN-N_Bidrag fra optisk genomkortlægning (OGM) i diagnostikken af multiple medfødte misdannelser med eller uden intellektuel handicap uden genetisk abnormitet detekteret ved hele genoms sekventering

Medfødte misdannelser skyldes en udviklingsforstyrrelse i fosterstadiet (DD), der påvirker et eller flere systemer (hjerte, skelet, nervesystem osv.). Disse kaldes multiple medfødte anomalier (MCA). De kan være forbundet med en intellektuel funktionsnedsættelse (ID)1.

Kromosomanalyse med kromosomisk microarray-analyse (CMA) og genpaneler eller eksekvensering af eksomet er henholdsvis gulstandardmetoderne til kromosom- og molekylardiagnostik af DD2. I tilfælde hvor ingen diagnose fastslås efter disse første-linje test, kan kort-læsning hele-genom sekvensering (WGS) via Plan France Medicine Genomic 2020-2025 (AURAGEN) overvejes. Denne tilgang muliggør diagnose hos næsten 40% af patienter med DD3,4. Men mange patienter forbliver i diagnostisk dødlås, sandsynligvis på grund af de tekniske begrænsninger ved disse metoder, som potentielt kan overvindes af nye metodologier som optisk genomkortlægning (OGM)5,6,7,8,9. Undersøgerne foreslår systematisk at udføre OGM på 30 patienter med MCA+/-ID, der har ukonklusive WGS-resultater10.

Hovedformålet er at vurdere OGM's bidrag til at identificere strukturelle varianter, der ikke er detekteret eller dårligt karakteriseret af WGS i denne kliniske kontekst. Dette arbejde vil også bidrage til den igangværende implementering af OGM i rutinediagnostik og fastslå dets rolle i den samlede genetiske diagnostik af MCA+/-ID. Derudover kan det føre til identifikation af nye kandidatgener og/eller patogenetiske mekanismer. Hvis resultaterne er lovende, kan yderligere klinisk arbejde udvide dette foreløbige arbejde til et større projekt. Forbedring af den genetiske diagnostik af DD bør forbedre den medicinske behandling af patienter, der i øjeblikket er i diagnostisk dødlås, og deres familier.

Studieoversigt

Status

Rekruttering

Betingelser

Intervention / Behandling

Detaljeret beskrivelse

Studiearbejdsgang

Præ-analytisk fase

Deltagelse i studiet vil blive tilbudt til alle patienter, der opfylder inklusions- og ikke-inklusionskriterierne, af en undersøger fra Genetikafdelingen under en medicinsk konsultation, hvor det ikke-bidragende hele-genom-sekventeringsresultat (WGS) vil være blevet kommunikeret (Figur 1). Information om studieprocedurerne og målene vil blive givet på det tidspunkt. Informationsarket og samtykkeformularen vil blive givet til patienten (hvis voksen) eller til forældremyndighedshaverne (hvis patienten er mindreårig). Efter opnåelse af samtykke til både de genetiske undersøgelser og deltagelse i forskningsprojektet, kan patienten indskrives i studiet. Blodprøver, der kræves til studiet, vil blive indsamlet, overført til laboratoriet og sikret til analyse i henhold til følgende protokol:

Patient > 20 kg:

2 × 5 mL EDTA-blodrør

  1. × 5 mL hepariniseret blodrør

    Patient 12-20 kg:

  2. × 5 mL EDTA-blodrør

Patient 5-12 kg:

1 × 5 mL EDTA-blodrør

Prøver vil blive sendt til Cytogenetikaflingen, hvor de vil blive pseudonymiseret og sikret. Mindst tre aliquotter på 1,5 mL EDTA-blod og det resterende volumen vil blive frosset ned ved -80 °C til DNA-ekstraktion og langfragment-DNA-ekstraktion. En cellekultur (perifere blodlymfocytter) vil også blive udført for at opnå en fastsat kromosompellet fra det hepariniserede rør, når tilgængeligt. Hvis den hepariniserede prøve ikke er tilgængelig, og resultaterne af optisk genomkortlægning kræver bekræftelse af en kromosomabnormalitet ved karyotype eller FISH (dvs. bidragende resultat), vil en anden blodprøvetagning blive foreslået under klinisk resultatreturkonsultationen.

Analyse Frosne prøver fra Cytogenetikaflingen på Clermont-Ferrand Universitetshospital (en pr. patient) vil blive overført via TSE til Genetikafdelingen på Reims Universitetshospital, udpeget til at udføre optisk genomkortlægning, mens installationen af Saphyr-scanneren på Clermont-Ferrand Universitetshospital afventes (DAN 2025-ansøgning).

Ekstraktion, mærkning og billeddannelse af lange DNA-molekyler vil blive udført ved hjælp af producentens kits i henhold til de leverede instruktioner.

Resultater og fortolkning

Rådata vil blive analyseret og valideret af cytogenetikere på Reims Universitetshospital ved hjælp af Bionano Access og Solve®-software. Data vil også blive sikkert delt med projektlederen, ansvarlig for:

Udførelse af en anden uafhængig analyse (med Bionano Access og Solve, tilgængelig i Cytogenetikaflingen), udnyttelse af ekspertise opnået gennem deltagelse i tidligere projekter.

Givelse af endelig fortolkning af resultater og spredning af klinisk relevante resultater til patienthåndtering.

Hver prøve vil derfor drage fordel af dobbelt gennemgang og dobbelt ekspertise, hvilket sikrer resultaternes pålidelighed.

Forældresegregationsundersøgelser kan blive foreslået for at lette den biologiske fortolkning. Hvis nødvendigt, vil indsamling af forældreprøver og samtykkeprocedurer blive koordineret af Afdelingen for Medicinsk Genetik på Clermont-Ferrand Universitetshospital. Konkluderende resultater vil blive kommunikeret til klinikeren, der ordinerede WGS til patienthåndtering og genetisk rådgivning.

Undersøgelsestype

Interventionel

Tilmelding (Anslået)

55

Fase

  • Ikke anvendelig

Kontakter og lokationer

Dette afsnit indeholder kontaktoplysninger for dem, der udfører undersøgelsen, og oplysninger om, hvor denne undersøgelse udføres.

Studiekontakt

Studiesteder

Deltagelseskriterier

Forskere leder efter personer, der passer til en bestemt beskrivelse, kaldet berettigelseskriterier. Nogle eksempler på disse kriterier er en persons generelle helbredstilstand eller tidligere behandlinger.

Berettigelseskriterier

Aldre berettiget til at studere

  • Barn
  • Voksen
  • Ældre voksen

Tager imod sunde frivillige

Ingen

Beskrivelse

Inklusionskriterier

  • Patienter med mindst to medfødte anomali, med eller uden intellektuel funktionsnedsættelse, og med en vægt på over 5 kg.
  • Hele-genom-sekventering udført af AURAGEN-laboratoriet vurderet som ikke-bidragende (fravær af klasse 4- eller 5-variationer, eller identifikation af en VUS, eller identifikation af kun én variation i forbindelse med en recessiv sygdom).
  • Patient dækket af et socialt sikringssystem.
  • Patient i stand til at forstå og modsætte sig deltagelse i studiet.
  • Skriftligt informeret samtykke til genetiske analyser, underskrevet enten af patienten eller deres juridiske repræsentanter (for mindreårige), efter at klar og retfærdig information om studiet er blevet givet.

Ikke-inklusionskriterier

  • Patienter, for hvem en ikke-genetisk årsag (infektiøs, miljømæssig eller toksisk) tidligere er blevet identificeret.
  • Umulighed for at opnå en kompatibel prøve.
  • Patient eller indehaver af forældremyndighed under værge eller juridisk beskyttelse, frataget frihed, eller placeret under domstolsbeskyttelse.

Studieplan

Dette afsnit indeholder detaljer om studieplanen, herunder hvordan undersøgelsen er designet, og hvad undersøgelsen måler.

Hvordan er undersøgelsen tilrettelagt?

Design detaljer

  • Primært formål: Diagnostisk
  • Tildeling: N/A
  • Interventionel model: Enkelt gruppeopgave
  • Maskning: Ingen (Åben etiket)

Våben og indgreb

Deltagergruppe / Arm
Intervention / Behandling
Eksperimentel: en enkelt arm af patienter med medfødte misdannelser
Genetisk: blodprøve
En blodprøve vil blive taget efter at have indhentet samtykke fra patienten og/eller deres værge. Antallet af rør, der kræves (1 til 3), vil blive bestemt i henhold til patientens vægt, med henblik på at udføre optisk genommapping og eventuelle nødvendige bekræftelsesanalyser i tilfælde af, at en strukturel variant identificeres.

Hvad måler undersøgelsen?

Primære resultatmål

Resultatmål
Foranstaltningsbeskrivelse
Tidsramme
diagnostisk udbytte af optisk genommapping (OGM) i tilfælde af multiple medfødte anomali med eller uden intellektuel funktionsnedsættelse, når whole-genome sequencing (WGS) ikke bidrager
Tidsramme: dag 1 (inklusion og blodprøvetagning)
Vurdering af den diagnostiske udbytte af optisk genomkortlægning (OGM) ved multiple medfødte anomali med eller uden intellektuel handicap, når hele-genomsekventering (WGS) er ikke-bidragende (fravær af årsagssammenhængende genetisk variation eller påvisning af en variant af usikker signifikans (VUS) eller en enkelt variant i en recessiv lidelse).
dag 1 (inklusion og blodprøvetagning)

Sekundære resultatmål

Resultatmål
Foranstaltningsbeskrivelse
Tidsramme
Antal reklassificerede varianter, der oprindeligt blev betragtet som VUS (Varianter af usikker/ukendt betydning)
Tidsramme: dag 1 (inklusion og blodprøvetagning)
Vurdering af antallet af varianter, der oprindeligt blev klassificeret som VUS (varianter af usikker/ukendt betydning), som blev omklassificeret som benigne eller patogene varianter
dag 1 (inklusion og blodprøvetagning)
Antal patienter, hvor en ny kandidatgen/sygdomsmekanisme identificeres
Tidsramme: dag 1 (inklusion og blodprøveudtagning)
dag 1 (inklusion og blodprøveudtagning)
Evaluering af teknikkens gennemførlighed (varighed) i nuværende praksis i 1. linje, 2. linje (efter rutinemæssige tests såsom kromosom microarray, exomsekventering…) eller 3. linje i tilfælde af ikke-bidragende helgenomsekventering baseret på flere kriterier
Tidsramme: dag 1 (inklusion og blodprøveudtagning)
Evaluering af teknisk varighed (timer)
dag 1 (inklusion og blodprøveudtagning)
Vurdering af teknikkens gennemførlighed (fiasko) i nuværende praksis i 1. linje, 2. linje (efter rutinemæssige tests som kromosomisk microarray, exom-sekventering...), eller 3. linje i tilfælde af ikke-bidragende helgenom-sekventering baseret på flere kriterier
Tidsramme: dag 1 (inklusion og blodprøvetagning)
fejlprocentnummer
dag 1 (inklusion og blodprøvetagning)
Evaluering af teknikkens (reprocessering) anvendelighed i nuværende praksis i 1. linje, 2. linje (efter rutinemæssige tests som kromosomal microarray, exomsekventering…) eller 3. linje i tilfælde af ikke-bidragende WGS baseret på flere kriterier
Tidsramme: dag 1 (inklusion og blodprøvetagning)
genbehandlingshastighedsnummer
dag 1 (inklusion og blodprøvetagning)
Evaluering af teknikkens gennemførlighed (fortolkning) i nuværende praksis i 1. linje, 2. linje (efter rutinemæssige tests såsom kromosomal microarray, exomsekventering…), eller 3. linje i tilfælde af ikke-bidragende WGS baseret på flere kriterier
Tidsramme: dag 1 (inklusion og blodprøvetagning)
Evaluering af biologisk fortolkningstid (timer)
dag 1 (inklusion og blodprøvetagning)
Vurder effekten af at bruge disse nye teknologier på patienthåndteringen.
Tidsramme: dag 1 (inklusion og blodprøvetagning)
Procentdel af patienter, for hvem OGM-resultaterne førte til en ændring i den kliniske håndtering.
dag 1 (inklusion og blodprøvetagning)

Samarbejdspartnere og efterforskere

Det er her, du vil finde personer og organisationer, der er involveret i denne undersøgelse.

Sponsor

Céline PEBREL-RICHARD

Efterforskere

  • Studiestol: Lise Laclautre, University Hospital, Clermont-Ferrand

Datoer for undersøgelser

Disse datoer sporer fremskridtene for indsendelser af undersøgelsesrekord og resumeresultater til ClinicalTrials.gov. Studieregistreringer og rapporterede resultater gennemgås af National Library of Medicine (NLM) for at sikre, at de opfylder specifikke kvalitetskontrolstandarder, før de offentliggøres på den offentlige hjemmeside.

Studer store datoer

Studiestart (Faktiske)

18. november 2025

Primær færdiggørelse (Anslået)

1. november 2028

Studieafslutning (Anslået)

1. november 2028

Datoer for studieregistrering

Først indsendt

9. december 2025

Først indsendt, der opfyldte QC-kriterier

20. januar 2026

Først opslået (Faktiske)

27. januar 2026

Opdateringer af undersøgelsesjournaler

Sidste opdatering sendt (Faktiske)

27. januar 2026

Sidste opdatering indsendt, der opfyldte kvalitetskontrolkriterier

20. januar 2026

Sidst verificeret

1. januar 2026

Mere information

Begreber relateret til denne undersøgelse

Nøgleord

Yderligere relevante MeSH-vilkår

Andre undersøgelses-id-numre

  • AOI 2024 PEBREL-RICHARD

Plan for individuelle deltagerdata (IPD)

Planlægger du at dele individuelle deltagerdata (IPD)?

INGEN

Lægemiddel- og udstyrsoplysninger, undersøgelsesdokumenter

Studerer et amerikansk FDA-reguleret lægemiddelprodukt

Ingen

Studerer et amerikansk FDA-reguleret enhedsprodukt

Ingen

Disse oplysninger blev hentet direkte fra webstedet clinicaltrials.gov uden ændringer. Hvis du har nogen anmodninger om at ændre, fjerne eller opdatere dine undersøgelsesoplysninger, bedes du kontakte register@clinicaltrials.gov. Så snart en ændring er implementeret på clinicaltrials.gov, vil denne også blive opdateret automatisk på vores hjemmeside .

Kliniske forsøg med Medfødte misdannelser

Kliniske forsøg med blodprøve

Søg i lignende forsøg

Sponsorer og samarbejdspartnere

Medicinske tilstande

Narkotikainterventioner

CROs by country

CROs in Cote d'Ivoire

Betingelser

Sjældne sygdomme

Narkotikainterventioner

Kosttilskud

Sponsor / samarbejdspartnere

Placeringer

Abonner