Trapianto microbico fecale per colite C. difficile e/o ulcerosa o colite indeterminata (FMT)
Trapianto microbico fecale in pazienti con colite da Clostridium difficile e/o colite ulcerosa refrattaria ai farmaci o colite indeterminata
Panoramica dello studio
Stato
Stato
Condizioni
Condizioni
Intervento / Trattamento
Intervento / Trattamento
Descrizione dettagliata
In questo studio verranno testate le seguenti ipotesi:
- Il trapianto di microbiota fecale è una procedura sicura, tollerabile ed efficace per i pazienti con C. difficile ed è una procedura sicura e tollerabile per i pazienti con colite ulcerosa e colite indeterminata.
- La diversità microbica fecale, la composizione e la funzione nei destinatari delle feci dopo il trapianto fecale cambieranno in una diversità microbica, composizione e funzionalità simili a quelle che si trovano nelle feci del donatore.
Obiettivi primari:
1. Determinare la sicurezza e la tollerabilità a breve termine del trapianto di microbiota fecale in pazienti con Clostridium difficile ricorrente o refrattario e colite ulcerosa refrattaria ai farmaci o colite indeterminata fino a 12 settimane dopo il trapianto.
Obiettivi secondari:
1a. Determinare la sicurezza e la tollerabilità a lungo termine del trapianto di microbiota fecale fino a 1 anno dopo il trapianto in pazienti con Clostridium difficile ricorrente o refrattario e colite ulcerosa refrattaria ai farmaci o colite indeterminata.
1b. Per determinare l'efficacia del trapianto di microbiota fecale in pazienti con Clostridium difficile ricorrente o refrattario definito come nessuna recidiva di C. difficile entro un anno.
2. Confrontare la diversità microbica nelle feci sane del donatore rispetto alle feci del ricevente pre-FMT raccolte da pazienti (riceventi) con Clostridium difficile ricorrente o refrattario e colite ulcerosa refrattaria ai farmaci o colite indeterminata.
3. Confrontare la composizione microbica nelle feci sane del donatore rispetto alle feci del ricevente pre-FMT da pazienti (riceventi) con Clostridium difficile ricorrente o refrattario e colite ulcerosa refrattaria ai farmaci o colite indeterminata.
4. Confrontare la funzione microbica nelle feci sane del donatore rispetto alle feci del ricevente pre-FMT da pazienti (riceventi) con Clostridium difficile ricorrente o refrattario e colite ulcerosa refrattaria ai farmaci o colite indeterminata.
5. Confrontare la diversità microbica nelle feci sane del donatore e nelle feci del ricevente pre-FMT con campioni di feci del ricevente post-trapianto di 1 settimana raccolti da pazienti (riceventi) con Clostridium difficile ricorrente o refrattario e colite ulcerosa refrattaria ai farmaci o colite indeterminata.
6. Confrontare la composizione microbica nelle feci sane del donatore e nelle feci del ricevente pre-FMT con campioni di feci del ricevente post-trapianto di 1 settimana raccolti da pazienti (riceventi) con Clostridium difficile ricorrente o refrattario e colite ulcerosa refrattaria ai farmaci o colite indeterminata.
7. Confrontare la funzione microbica nelle feci sane del donatore e nelle feci del ricevente pre-FMT con campioni di feci del ricevente post-trapianto di 1 settimana raccolti da pazienti (riceventi) con Clostridium difficile ricorrente o refrattario e colite ulcerosa refrattaria ai farmaci o colite indeterminata.
8. Confrontare la diversità microbica nelle feci sane del donatore e nelle feci del ricevente pre-FMT con i campioni di feci del ricevente post-trapianto di 12 settimane raccolti da pazienti (riceventi) con Clostridium difficile ricorrente o refrattario e colite ulcerosa refrattaria ai farmaci o colite indeterminata.
9. Confrontare la composizione microbica nelle feci sane del donatore e nelle feci del ricevente pre-FMT con campioni di feci del ricevente post-trapianto di 12 settimane raccolti da pazienti (riceventi) con Clostridium difficile ricorrente o refrattario e colite ulcerosa refrattaria ai farmaci o colite indeterminata.
10. Per confrontare la funzione microbica nelle feci sane del donatore e nelle feci del ricevente pre-FMT con i campioni di feci del ricevente post-trapianto di 12 settimane raccolti da pazienti (riceventi) con Clostridium difficile ricorrente o refrattario e colite ulcerosa refrattaria ai farmaci o colite indeterminata.
11. I livelli di calprotectina fecale saranno misurati nel ricevente al basale prima dell'FMT, 1 settimana e 12 settimane dopo l'FMT per determinare se l'FMT causa un cambiamento statisticamente significativo.
Tipo di studio
Tipo di studio
Iscrizione (Effettivo)
Iscrizione
Fase
Fase
- Prima fase 1
Contatti e Sedi
Luoghi di studio
-
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New York
-
Stony Brook, New York, Stati Uniti, 11794
- Stony Brook University Hospital
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Criteri di partecipazione
Criteri di ammissibilità
Criteri di ammissibilità
Età idonea allo studio
Accetta volontari sani
Sessi ammissibili allo studio
Descrizione
Solo per pazienti/riceventi C. difficile:
Inclusione:
1. Il paziente ha almeno 7 anni di età. 2. Uno dei seguenti: 2a. Almeno due recidive (in totale tre infezioni da CDI) di C. difficile da lieve a moderato (<6 feci diarroiche/giorno) diagnosticate mediante PCR o EIA con tossina positiva dopo aver completato la terapia medica standard con metronidazolo, vancomicina o fidaxomicina.
2b. Almeno due episodi di grave infezione da C. difficile (>6 scariche diarroiche/die che richiedono il ricovero in ospedale e sono associate a significativa morbilità).
2c. Moderata infezione da C. difficile (3-6 feci diarroiche/giorno che non rispondono alla successiva terapia standard, ad es. metronidazolo, vancomicina e/o fidaxomicina) della durata di almeno 28 giorni.
2d. Colite da C. difficile grave e/o fulminante (> 6 scariche diarroiche/die) senza risposta alla terapia standard dopo 48 ore.
Esclusione:
- meno di 7 anni
- programmato per un intervento chirurgico addominale entro le prossime 12 settimane
- ha subito un intervento chirurgico addominale maggiore negli ultimi 3 mesi
- gravidanza
- Emoglobina < 6 g/dL
- conta assoluta dei neutrofili inferiore a 1500/mm3
- diagnosi nota di malattia del trapianto contro l'ospite
- ha utilizzato un farmaco sperimentale negli ultimi 2 mesi
- utilizzato un agonista del TNFa nelle ultime 2 settimane
- diagnosi di batteriemia nelle ultime 4 settimane
Solo per i pazienti con colite ulcerosa e indeterminata:
Inclusione:
- Il paziente ha 7 anni o più.
- Uno dei seguenti:
2a. trattati con terapia steroidea per almeno un mese. 2b. trattati con terapia immunomodulante per almeno un mese 2c. trattati con terapia biologica per almeno un mese.
Esclusione:
- meno di 7 anni
- programmato per un intervento chirurgico addominale entro le prossime 12 settimane
- ha subito un intervento chirurgico addominale maggiore negli ultimi 3 mesi
- gravidanza
- Emoglobina < 6 g/dL
- conta assoluta dei neutrofili inferiore a 1500/mm3
- diagnosi nota di malattia del trapianto contro l'ospite
- ha utilizzato un farmaco sperimentale negli ultimi 2 mesi
- utilizzato un agonista del TNFa nelle ultime 2 settimane
- diagnosi di batteriemia nelle ultime 4 settimane
- FMT precedente
Piano di studio
Come è strutturato lo studio?
Dettagli di progettazione
- Scopo principale: Trattamento
- Assegnazione: N / A
- Modello interventistico: Assegnazione di gruppo singolo
- Mascheramento: Nessuno (etichetta aperta)
Numero di armi
Armi e interventi
Gruppo di partecipanti / ArmGruppo di partecipanti / Arm |
Intervento / TrattamentoIntervento / Trattamento |
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Sperimentale: Trapianto microbico fecale
Trattata con trapianto microbico fecale
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Il trapianto microbico fecale è offerto come opzione terapeutica ai pazienti idonei. I donatori selezionati dai pazienti saranno selezionati mediante questionario e mediante esami del sangue e delle feci per potenziali patogeni trasmissibili. Il filtrato delle feci verrà somministrato nell'ileo e/o nel cieco tramite colonscopia
Altri nomi:
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Cosa sta misurando lo studio?
Misure di risultato primarie
Misure di risultato primarie
Misura del risultato |
Misura Descrizione |
Lasso di tempo |
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Numero di partecipanti con eventi avversi correlati al trattamento come valutato da CTCAE v4.0
Lasso di tempo: 9 anni
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Verrà riportato il numero di partecipanti con eventi avversi correlati al trattamento con grado superiore a 2 entro un anno dall'FMT. La sicurezza sarà valutata come segnalazione di nessuna nuova condizione medica dopo il trapianto, la tollerabilità, come registrata dalla segnalazione di assenza di eventi avversi gravi dopo il trapianto e l'efficacia della procedura sarà registrata come miglioramento dei sintomi clinici durante qualsiasi colonscopia clinicamente indicata dopo il trapianto trapianto rispetto a prima del trapianto I pazienti con C. Diff avranno un rapporto di test C. diff negativo dopo il trapianto come misura di esito. |
9 anni
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Misure di risultato secondarie
Misure di risultato secondarie
Misura del risultato |
Misura Descrizione |
Lasso di tempo |
|---|---|---|
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Misurare l'effetto del trapianto microbico fecale sulla diversità microbica nelle feci sane del donatore rispetto alle feci del ricevente pre-FMT, 1 settimana dopo l'FMT e 12 settimane dopo l'FMT.
Lasso di tempo: 10 anni
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I campioni di DNA fecale saranno sottoposti a sequenziamento dell'rRNA V3-V4 16S.
Unità tassonomiche operative (OTU) saranno prodotte raggruppando sequenze con assegnazioni tassonomiche identiche.
Indici di diversità alfa (ad es.
Chao1, complessità Shannon H, Shannon Evenness H/Hmax) saranno calcolati inferiti attraverso 1000 ricampionamenti replicati usando Explicet.
La diversità beta (distanze Bray-Curtis e Jaccard) sarà calcolata per il ricevente Pre-FMT, 1 settimana post-FMT e 12 settimane post-FMT rispetto al loro donatore pared utilizzando la funzione adonis nel pacchetto R vegan presso il phyla, livello di famiglia e di genere.
Verrà utilizzato un modello misto lineare per confrontare la diversità alfa (ShannonH) e la diversità beta (distanza di Bray-Curtis e Jaccard) tra ciascun punto temporale (FMT) e ciascun gruppo di malattia (Gruppo).
I valori P inferiori a 0,05 sono stati considerati statisticamente significativi.
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10 anni
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Per misurare l'effetto del trapianto microbico fecale sulla composizione microbica nelle feci sane del donatore rispetto alle feci del ricevente pre-FMT, 1 settimana dopo l'FMT e 12 settimane dopo l'FMT.
Lasso di tempo: 10 anni
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I campioni di DNA fecale saranno sottoposti a sequenziamento dell'rRNA V3-V4 16S.
Unità tassonomiche operative (OTU) saranno prodotte raggruppando sequenze con assegnazioni tassonomiche identiche.
Le analisi di modelli misti lineari su singole OTU a livello di genere saranno condotte su 105 OTU dopo aver eliminato le OTU con un'abbondanza relativa media <0,001% nei campioni pre-FMT del donatore e del ricevente e dopo aver scartato le OTU in cui oltre il 75% delle i campioni avevano un conteggio zero.
Per confrontare l'abbondanza relativa di ciascuna OTU tra i punti temporali prima e dopo FMT [destinatario pre-trapianto, 1 settimana.
destinatario post-FMT, 3 mesi.
destinatario post-FMT] e ciascun gruppo di malattia, verrà utilizzato un modello misto lineare generalizzato (GLMM) o un'equazione di stima generalizzata (GEE) prendendo i conteggi effettivi di ciascuna OTU come risultati che si presume seguano una distribuzione binomiale negativa.
I p-value saranno aggiustati per confronti multipli con la correzione di Bonferroni o con il metodo Benjamin-Hochberg (FDR < 0.05).
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10 anni
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Per misurare l'effetto del trapianto microbico fecale sulla funzione microbica utilizzando la metagenomica del DNA del fucile da caccia nelle feci del donatore sano rispetto alle feci del ricevente pre-FMT, 1 settimana dopo l'FMT e 12 settimane dopo l'FMT.
Lasso di tempo: 10 anni
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I campioni di DNA fecale saranno sottoposti a sequenziamento metagenomico del DNA del fucile.
Dopo aver rimosso le sequenze umane, le letture per kilobase gene length (RKP) saranno calcolate utilizzando il software HUMANN2 per le singole proteine/enzimi e percorsi batterici. .
Verrà utilizzato un modello misto lineare per confrontare RPK associato a percorsi e singole proteine tra ciascun punto temporale (FMT) e ciascun gruppo di malattia (gruppo).
I valori P inferiori a 0,05 sono stati considerati statisticamente significativi. Le analisi di modelli misti lineari sull'RPK associato a singoli geni e percorsi saranno analizzate utilizzando modelli misti lineari tra punti temporali prima e dopo FMT [destinatario pre-trapianto, 1 settimana.
destinatario post-FMT, 3 mesi.
post-FMT destinatario] e ciascun gruppo di malattia, un modello misto lineare generalizzato (GLMM) o un'equazione di stima generalizzata (GEE) sono stati utilizzati prendendo l'RPK effettivo come i risultati che si presume seguano una distribuzione binomiale negativa.
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10 anni
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Per misurare l'effetto del trapianto microbico fecale sulla funzione microbica utilizzando il sequenziamento metatrascrittomico batterico
Lasso di tempo: 10 anni
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I campioni di RNA fecale saranno sottoposti a sequenziamento metatrascrittomico dell'RNA batterico.
Dopo aver rimosso le sequenze umane, verranno calcolate le letture per trascrizione di kilobase (RKP) per le singole proteine/enzimi e vie batteriche.
Verrà utilizzato un modello misto lineare per confrontare RPK associato a percorsi e singole proteine tra ciascun punto temporale (FMT) e ciascun gruppo di malattia (gruppo).
I valori P inferiori a 0,05 sono stati considerati statisticamente significativi.
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10 anni
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Per misurare l'effetto del trapianto microbico fecale sulla funzione microbica utilizzando saggi metabolomici mirati.
Lasso di tempo: 10 anni
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I campioni fecali saranno sottoposti a estrazione per l'analisi metabolomica mirata degli acidi grassi a catena corta (microgrammi/grammo feci) mediante gascromatografia-spettrometria di massa, e degli acidi biliari (microgrammi/grammo feci) mediante cromatografia liquida-spettrometria di massa.
Verrà utilizzato un modello misto lineare per confrontare rispettivamente i metaboliti degli acidi grassi a catena corta e degli acidi biliari tra ciascun punto temporale (FMT) e ciascun gruppo di malattia (Gruppo).
I valori P inferiori a 0,05 sono stati considerati statisticamente significativi.
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10 anni
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Determinare se l'FMT causa un cambiamento statisticamente significativo nei livelli di calprotectina fecale del ricevente
Lasso di tempo: 10 anni
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I livelli di calprotectina fecale (microgrammi/grammo di feci) saranno misurati come nel ricevente al basale pre-FMT, 1 settimana e 12 settimane dopo FMT.
Verrà utilizzato un modello misto lineare per confrontare i livelli di calprotectina fecale tra ciascun punto temporale (FMT) e ciascun gruppo di malattia (gruppo).
I valori P inferiori a 0,05 sono stati considerati statisticamente significativi.
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10 anni
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Determinare il numero di destinatari di C. difficile che hanno C. difficile ricorrente entro un anno dal trapianto microbico fecale
Lasso di tempo: 10 anni
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Attualmente l'efficacia dell'FMT colonscopico è di circa il 90% dopo 12 settimane.
Tuttavia può essere inferiore con i pazienti che hanno anche una malattia infiammatoria intestinale.
Quantificheremo l'efficacia del trapianto microbico fecale sulla recidiva di C. difficile entro un anno in pazienti con C. difficile senza malattie infiammatorie intestinali, C. difficile con malattia di Crohn e C. difficile con colite ulcerosa o indeterminata.
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10 anni
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Collaboratori e investigatori
Sponsor
Sponsor
Investigatori
Investigatori
- Investigatore principale: Anupama Chawla, MD, Stony Brook Medicine
Pubblicazioni e link utili
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Inizio studio
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Completamento primario (Effettivo)
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Completamento dello studio (Effettivo)
Completamento dello studio
Date di iscrizione allo studio
Primo inviato
Primo inviato
Primo inviato che soddisfa i criteri di controllo qualità
Primo inviato che soddisfa i criteri di controllo qualità
Primo Inserito (Effettivo)
Primo Inserito
Aggiornamenti dei record di studio
Ultimo aggiornamento pubblicato (Effettivo)
Ultimo aggiornamento pubblicato
Ultimo aggiornamento inviato che soddisfa i criteri QC
Ultimo aggiornamento inviato che soddisfa i criteri QC
Ultimo verificato
Ultimo verificato
Maggiori informazioni
Termini relativi a questo studio
Termini MeSH pertinenti aggiuntivi
- Malattie dell'apparato digerente
- Processi patologici
- Infezioni
- Malattie gastrointestinali
- Gastroenterite
- Malattie del colon
- Malattie intestinali
- Infezioni batteriche
- Infezioni batteriche e micosi
- Infezioni batteriche Gram-positive
- Malattie infiammatorie intestinali
- Ulcera
- Colite
- Colite, ulcerosa
- Infezioni da Clostridium
Altri numeri di identificazione dello studio
Altri numeri di identificazione dello studio
- 479696
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