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Trapianto microbico fecale per colite C. difficile e/o ulcerosa o colite indeterminata (FMT)

21 febbraio 2022 aggiornato da: Anupama Chawla, Stony Brook University

Trapianto microbico fecale in pazienti con colite da Clostridium difficile e/o colite ulcerosa refrattaria ai farmaci o colite indeterminata

Il trapianto di microbiota fecale sarà offerto ai pazienti idonei per C. difficile (non richiede la designazione di nuovo farmaco sperimentale) e ai pazienti idonei con colite ulcerosa o colite indeterminata come trattamento sperimentale con nuovo farmaco

Panoramica dello studio

Stato

Completato

Condizioni

Intervento / Trattamento

Descrizione dettagliata

In questo studio verranno testate le seguenti ipotesi:

  1. Il trapianto di microbiota fecale è una procedura sicura, tollerabile ed efficace per i pazienti con C. difficile ed è una procedura sicura e tollerabile per i pazienti con colite ulcerosa e colite indeterminata.
  2. La diversità microbica fecale, la composizione e la funzione nei destinatari delle feci dopo il trapianto fecale cambieranno in una diversità microbica, composizione e funzionalità simili a quelle che si trovano nelle feci del donatore.

Obiettivi primari:

1. Determinare la sicurezza e la tollerabilità a breve termine del trapianto di microbiota fecale in pazienti con Clostridium difficile ricorrente o refrattario e colite ulcerosa refrattaria ai farmaci o colite indeterminata fino a 12 settimane dopo il trapianto.

Obiettivi secondari:

1a. Determinare la sicurezza e la tollerabilità a lungo termine del trapianto di microbiota fecale fino a 1 anno dopo il trapianto in pazienti con Clostridium difficile ricorrente o refrattario e colite ulcerosa refrattaria ai farmaci o colite indeterminata.

1b. Per determinare l'efficacia del trapianto di microbiota fecale in pazienti con Clostridium difficile ricorrente o refrattario definito come nessuna recidiva di C. difficile entro un anno.

2. Confrontare la diversità microbica nelle feci sane del donatore rispetto alle feci del ricevente pre-FMT raccolte da pazienti (riceventi) con Clostridium difficile ricorrente o refrattario e colite ulcerosa refrattaria ai farmaci o colite indeterminata.

3. Confrontare la composizione microbica nelle feci sane del donatore rispetto alle feci del ricevente pre-FMT da pazienti (riceventi) con Clostridium difficile ricorrente o refrattario e colite ulcerosa refrattaria ai farmaci o colite indeterminata.

4. Confrontare la funzione microbica nelle feci sane del donatore rispetto alle feci del ricevente pre-FMT da pazienti (riceventi) con Clostridium difficile ricorrente o refrattario e colite ulcerosa refrattaria ai farmaci o colite indeterminata.

5. Confrontare la diversità microbica nelle feci sane del donatore e nelle feci del ricevente pre-FMT con campioni di feci del ricevente post-trapianto di 1 settimana raccolti da pazienti (riceventi) con Clostridium difficile ricorrente o refrattario e colite ulcerosa refrattaria ai farmaci o colite indeterminata.

6. Confrontare la composizione microbica nelle feci sane del donatore e nelle feci del ricevente pre-FMT con campioni di feci del ricevente post-trapianto di 1 settimana raccolti da pazienti (riceventi) con Clostridium difficile ricorrente o refrattario e colite ulcerosa refrattaria ai farmaci o colite indeterminata.

7. Confrontare la funzione microbica nelle feci sane del donatore e nelle feci del ricevente pre-FMT con campioni di feci del ricevente post-trapianto di 1 settimana raccolti da pazienti (riceventi) con Clostridium difficile ricorrente o refrattario e colite ulcerosa refrattaria ai farmaci o colite indeterminata.

8. Confrontare la diversità microbica nelle feci sane del donatore e nelle feci del ricevente pre-FMT con i campioni di feci del ricevente post-trapianto di 12 settimane raccolti da pazienti (riceventi) con Clostridium difficile ricorrente o refrattario e colite ulcerosa refrattaria ai farmaci o colite indeterminata.

9. Confrontare la composizione microbica nelle feci sane del donatore e nelle feci del ricevente pre-FMT con campioni di feci del ricevente post-trapianto di 12 settimane raccolti da pazienti (riceventi) con Clostridium difficile ricorrente o refrattario e colite ulcerosa refrattaria ai farmaci o colite indeterminata.

10. Per confrontare la funzione microbica nelle feci sane del donatore e nelle feci del ricevente pre-FMT con i campioni di feci del ricevente post-trapianto di 12 settimane raccolti da pazienti (riceventi) con Clostridium difficile ricorrente o refrattario e colite ulcerosa refrattaria ai farmaci o colite indeterminata.

11. I livelli di calprotectina fecale saranno misurati nel ricevente al basale prima dell'FMT, 1 settimana e 12 settimane dopo l'FMT per determinare se l'FMT causa un cambiamento statisticamente significativo.

Tipo di studio

Interventistico

Iscrizione (Effettivo)

12

Fase

  • Prima fase 1

Contatti e Sedi

Questa sezione fornisce i recapiti di coloro che conducono lo studio e informazioni su dove viene condotto lo studio.

Luoghi di studio

    • New York
      • Stony Brook, New York, Stati Uniti, 11794
        • Stony Brook University Hospital

Criteri di partecipazione

I ricercatori cercano persone che corrispondano a una certa descrizione, chiamata criteri di ammissibilità. Alcuni esempi di questi criteri sono le condizioni generali di salute di una persona o trattamenti precedenti.

Criteri di ammissibilità

Età idonea allo studio

7 anni e precedenti (Bambino, Adulto, Adulto più anziano)

Accetta volontari sani

No

Sessi ammissibili allo studio

Tutto

Descrizione

Solo per pazienti/riceventi C. difficile:

Inclusione:

1. Il paziente ha almeno 7 anni di età. 2. Uno dei seguenti: 2a. Almeno due recidive (in totale tre infezioni da CDI) di C. difficile da lieve a moderato (<6 feci diarroiche/giorno) diagnosticate mediante PCR o EIA con tossina positiva dopo aver completato la terapia medica standard con metronidazolo, vancomicina o fidaxomicina.

2b. Almeno due episodi di grave infezione da C. difficile (>6 scariche diarroiche/die che richiedono il ricovero in ospedale e sono associate a significativa morbilità).

2c. Moderata infezione da C. difficile (3-6 feci diarroiche/giorno che non rispondono alla successiva terapia standard, ad es. metronidazolo, vancomicina e/o fidaxomicina) della durata di almeno 28 giorni.

2d. Colite da C. difficile grave e/o fulminante (> 6 scariche diarroiche/die) senza risposta alla terapia standard dopo 48 ore.

Esclusione:

  1. meno di 7 anni
  2. programmato per un intervento chirurgico addominale entro le prossime 12 settimane
  3. ha subito un intervento chirurgico addominale maggiore negli ultimi 3 mesi
  4. gravidanza
  5. Emoglobina < 6 g/dL
  6. conta assoluta dei neutrofili inferiore a 1500/mm3
  7. diagnosi nota di malattia del trapianto contro l'ospite
  8. ha utilizzato un farmaco sperimentale negli ultimi 2 mesi
  9. utilizzato un agonista del TNFa nelle ultime 2 settimane
  10. diagnosi di batteriemia nelle ultime 4 settimane

Solo per i pazienti con colite ulcerosa e indeterminata:

Inclusione:

  1. Il paziente ha 7 anni o più.
  2. Uno dei seguenti:

2a. trattati con terapia steroidea per almeno un mese. 2b. trattati con terapia immunomodulante per almeno un mese 2c. trattati con terapia biologica per almeno un mese.

Esclusione:

  1. meno di 7 anni
  2. programmato per un intervento chirurgico addominale entro le prossime 12 settimane
  3. ha subito un intervento chirurgico addominale maggiore negli ultimi 3 mesi
  4. gravidanza
  5. Emoglobina < 6 g/dL
  6. conta assoluta dei neutrofili inferiore a 1500/mm3
  7. diagnosi nota di malattia del trapianto contro l'ospite
  8. ha utilizzato un farmaco sperimentale negli ultimi 2 mesi
  9. utilizzato un agonista del TNFa nelle ultime 2 settimane
  10. diagnosi di batteriemia nelle ultime 4 settimane
  11. FMT precedente

Piano di studio

Questa sezione fornisce i dettagli del piano di studio, compreso il modo in cui lo studio è progettato e ciò che lo studio sta misurando.

Come è strutturato lo studio?

Dettagli di progettazione

  • Scopo principale: Trattamento
  • Assegnazione: N / A
  • Modello interventistico: Assegnazione di gruppo singolo
  • Mascheramento: Nessuno (etichetta aperta)

Armi e interventi

Gruppo di partecipanti / Arm
Intervento / Trattamento
Sperimentale: Trapianto microbico fecale
Trattata con trapianto microbico fecale

Il trapianto microbico fecale è offerto come opzione terapeutica ai pazienti idonei. I donatori selezionati dai pazienti saranno selezionati mediante questionario e mediante esami del sangue e delle feci per potenziali patogeni trasmissibili.

Il filtrato delle feci verrà somministrato nell'ileo e/o nel cieco tramite colonscopia

Altri nomi:
  • FMT

Cosa sta misurando lo studio?

Misure di risultato primarie

Misura del risultato
Misura Descrizione
Lasso di tempo
Numero di partecipanti con eventi avversi correlati al trattamento come valutato da CTCAE v4.0
Lasso di tempo: 9 anni

Verrà riportato il numero di partecipanti con eventi avversi correlati al trattamento con grado superiore a 2 entro un anno dall'FMT.

La sicurezza sarà valutata come segnalazione di nessuna nuova condizione medica dopo il trapianto, la tollerabilità, come registrata dalla segnalazione di assenza di eventi avversi gravi dopo il trapianto e l'efficacia della procedura sarà registrata come miglioramento dei sintomi clinici durante qualsiasi colonscopia clinicamente indicata dopo il trapianto trapianto rispetto a prima del trapianto

I pazienti con C. Diff avranno un rapporto di test C. diff negativo dopo il trapianto come misura di esito.

9 anni

Misure di risultato secondarie

Misura del risultato
Misura Descrizione
Lasso di tempo
Misurare l'effetto del trapianto microbico fecale sulla diversità microbica nelle feci sane del donatore rispetto alle feci del ricevente pre-FMT, 1 settimana dopo l'FMT e 12 settimane dopo l'FMT.
Lasso di tempo: 10 anni
I campioni di DNA fecale saranno sottoposti a sequenziamento dell'rRNA V3-V4 16S. Unità tassonomiche operative (OTU) saranno prodotte raggruppando sequenze con assegnazioni tassonomiche identiche. Indici di diversità alfa (ad es. Chao1, complessità Shannon H, Shannon Evenness H/Hmax) saranno calcolati inferiti attraverso 1000 ricampionamenti replicati usando Explicet. La diversità beta (distanze Bray-Curtis e Jaccard) sarà calcolata per il ricevente Pre-FMT, 1 settimana post-FMT e 12 settimane post-FMT rispetto al loro donatore pared utilizzando la funzione adonis nel pacchetto R vegan presso il phyla, livello di famiglia e di genere. Verrà utilizzato un modello misto lineare per confrontare la diversità alfa (ShannonH) e la diversità beta (distanza di Bray-Curtis e Jaccard) tra ciascun punto temporale (FMT) e ciascun gruppo di malattia (Gruppo). I valori P inferiori a 0,05 sono stati considerati statisticamente significativi.
10 anni
Per misurare l'effetto del trapianto microbico fecale sulla composizione microbica nelle feci sane del donatore rispetto alle feci del ricevente pre-FMT, 1 settimana dopo l'FMT e 12 settimane dopo l'FMT.
Lasso di tempo: 10 anni
I campioni di DNA fecale saranno sottoposti a sequenziamento dell'rRNA V3-V4 16S. Unità tassonomiche operative (OTU) saranno prodotte raggruppando sequenze con assegnazioni tassonomiche identiche. Le analisi di modelli misti lineari su singole OTU a livello di genere saranno condotte su 105 OTU dopo aver eliminato le OTU con un'abbondanza relativa media <0,001% nei campioni pre-FMT del donatore e del ricevente e dopo aver scartato le OTU in cui oltre il 75% delle i campioni avevano un conteggio zero. Per confrontare l'abbondanza relativa di ciascuna OTU tra i punti temporali prima e dopo FMT [destinatario pre-trapianto, 1 settimana. destinatario post-FMT, 3 mesi. destinatario post-FMT] e ciascun gruppo di malattia, verrà utilizzato un modello misto lineare generalizzato (GLMM) o un'equazione di stima generalizzata (GEE) prendendo i conteggi effettivi di ciascuna OTU come risultati che si presume seguano una distribuzione binomiale negativa. I p-value saranno aggiustati per confronti multipli con la correzione di Bonferroni o con il metodo Benjamin-Hochberg (FDR < 0.05).
10 anni
Per misurare l'effetto del trapianto microbico fecale sulla funzione microbica utilizzando la metagenomica del DNA del fucile da caccia nelle feci del donatore sano rispetto alle feci del ricevente pre-FMT, 1 settimana dopo l'FMT e 12 settimane dopo l'FMT.
Lasso di tempo: 10 anni
I campioni di DNA fecale saranno sottoposti a sequenziamento metagenomico del DNA del fucile. Dopo aver rimosso le sequenze umane, le letture per kilobase gene length (RKP) saranno calcolate utilizzando il software HUMANN2 per le singole proteine/enzimi e percorsi batterici. . Verrà utilizzato un modello misto lineare per confrontare RPK associato a percorsi e singole proteine ​​tra ciascun punto temporale (FMT) e ciascun gruppo di malattia (gruppo). I valori P inferiori a 0,05 sono stati considerati statisticamente significativi. Le analisi di modelli misti lineari sull'RPK associato a singoli geni e percorsi saranno analizzate utilizzando modelli misti lineari tra punti temporali prima e dopo FMT [destinatario pre-trapianto, 1 settimana. destinatario post-FMT, 3 mesi. post-FMT destinatario] e ciascun gruppo di malattia, un modello misto lineare generalizzato (GLMM) o un'equazione di stima generalizzata (GEE) sono stati utilizzati prendendo l'RPK effettivo come i risultati che si presume seguano una distribuzione binomiale negativa.
10 anni
Per misurare l'effetto del trapianto microbico fecale sulla funzione microbica utilizzando il sequenziamento metatrascrittomico batterico
Lasso di tempo: 10 anni
I campioni di RNA fecale saranno sottoposti a sequenziamento metatrascrittomico dell'RNA batterico. Dopo aver rimosso le sequenze umane, verranno calcolate le letture per trascrizione di kilobase (RKP) per le singole proteine/enzimi e vie batteriche. Verrà utilizzato un modello misto lineare per confrontare RPK associato a percorsi e singole proteine ​​tra ciascun punto temporale (FMT) e ciascun gruppo di malattia (gruppo). I valori P inferiori a 0,05 sono stati considerati statisticamente significativi.
10 anni
Per misurare l'effetto del trapianto microbico fecale sulla funzione microbica utilizzando saggi metabolomici mirati.
Lasso di tempo: 10 anni
I campioni fecali saranno sottoposti a estrazione per l'analisi metabolomica mirata degli acidi grassi a catena corta (microgrammi/grammo feci) mediante gascromatografia-spettrometria di massa, e degli acidi biliari (microgrammi/grammo feci) mediante cromatografia liquida-spettrometria di massa. Verrà utilizzato un modello misto lineare per confrontare rispettivamente i metaboliti degli acidi grassi a catena corta e degli acidi biliari tra ciascun punto temporale (FMT) e ciascun gruppo di malattia (Gruppo). I valori P inferiori a 0,05 sono stati considerati statisticamente significativi.
10 anni
Determinare se l'FMT causa un cambiamento statisticamente significativo nei livelli di calprotectina fecale del ricevente
Lasso di tempo: 10 anni
I livelli di calprotectina fecale (microgrammi/grammo di feci) saranno misurati come nel ricevente al basale pre-FMT, 1 settimana e 12 settimane dopo FMT. Verrà utilizzato un modello misto lineare per confrontare i livelli di calprotectina fecale tra ciascun punto temporale (FMT) e ciascun gruppo di malattia (gruppo). I valori P inferiori a 0,05 sono stati considerati statisticamente significativi.
10 anni
Determinare il numero di destinatari di C. difficile che hanno C. difficile ricorrente entro un anno dal trapianto microbico fecale
Lasso di tempo: 10 anni
Attualmente l'efficacia dell'FMT colonscopico è di circa il 90% dopo 12 settimane. Tuttavia può essere inferiore con i pazienti che hanno anche una malattia infiammatoria intestinale. Quantificheremo l'efficacia del trapianto microbico fecale sulla recidiva di C. difficile entro un anno in pazienti con C. difficile senza malattie infiammatorie intestinali, C. difficile con malattia di Crohn e C. difficile con colite ulcerosa o indeterminata.
10 anni

Collaboratori e investigatori

Qui è dove troverai le persone e le organizzazioni coinvolte in questo studio.

Sponsor

Investigatori

  • Investigatore principale: Anupama Chawla, MD, Stony Brook Medicine

Pubblicazioni e link utili

La persona responsabile dell'inserimento delle informazioni sullo studio fornisce volontariamente queste pubblicazioni. Questi possono riguardare qualsiasi cosa relativa allo studio.

Studiare le date dei record

Queste date tengono traccia dell'avanzamento della registrazione dello studio e dell'invio dei risultati di sintesi a ClinicalTrials.gov. I record degli studi e i risultati riportati vengono esaminati dalla National Library of Medicine (NLM) per assicurarsi che soddisfino specifici standard di controllo della qualità prima di essere pubblicati sul sito Web pubblico.

Studia le date principali

Inizio studio

1 novembre 2013

Completamento primario (Effettivo)

15 febbraio 2022

Completamento dello studio (Effettivo)

15 febbraio 2022

Date di iscrizione allo studio

Primo inviato

22 marzo 2016

Primo inviato che soddisfa i criteri di controllo qualità

28 agosto 2017

Primo Inserito (Effettivo)

31 agosto 2017

Aggiornamenti dei record di studio

Ultimo aggiornamento pubblicato (Effettivo)

22 febbraio 2022

Ultimo aggiornamento inviato che soddisfa i criteri QC

21 febbraio 2022

Ultimo verificato

1 febbraio 2022

Maggiori informazioni

Termini relativi a questo studio

Altri numeri di identificazione dello studio

  • 479696

Piano per i dati dei singoli partecipanti (IPD)

Hai intenzione di condividere i dati dei singoli partecipanti (IPD)?

No

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