Valutazione medico-economica di diverse strategie di sequenziamento ad alto rendimento nella diagnosi di pazienti con deficit intellettivo (DISSEQ)

La deficienza intellettiva (ID) è un vero e proprio problema di salute pubblica perché colpisce dall'1 al 3% della popolazione in generale. Attualmente, in Francia, la diagnosi si basa sull'esperienza clinica, sull'uso dell'analisi del DNA microarray, sullo screening per la sindrome dell'X fragile e, se necessario, su uno studio dei geni bersaglio in base ai dati clinici. Sebbene l'esperienza clinica non sia sufficiente per individuare un gene in particolare, questi diversi strumenti attualmente portano alla diagnosi in media solo nel 20% dei pazienti (percentuale più alta nei casi di deficit cognitivo sindromico), a volte dopo numerosi e costosi esami biologici.

Grazie all'high-throughput sequencing (HTS), la genetica medica sta vivendo un grande sconvolgimento tecnologico, originato dallo sviluppo di pannelli di sequenziamento di geni bersaglio, come, ad esempio, il pannello DI459, composto da 459 geni implicati o suscettibili di essere implicato nell'ID, sviluppato dal team di Strasburgo e nel sequenziamento dell'intero esoma (WES). L'implementazione di HTS nella diagnosi è avvenuta a velocità diverse a seconda del paese, alcuni dei quali lo utilizzano nella diagnosi di routine da diversi anni. Il tipo di strategia da adottare nelle anomalie di sviluppo è ancora oggetto di dibattito in Francia, in assenza di risultati di analisi costo-efficacia; questa assenza ha ostacolato l'implementazione di queste tecnologie.

Nella diagnosi di ID il pannello DI459 ha una resa diagnostica del 25%. I dati in letteratura mostrano anche un'elevata efficacia della WES nei pazienti con ID: circa il 32% delle diagnosi genetiche (in progressivo aumento grazie a possibili rianalisi con l'avanzare della conoscenza della genomica) e il 10% delle diagnosi aggiuntive attraverso l'identificazione di microarrangiamenti cromosomici, facendo un totale previsto del 42% delle diagnosi. WES potrebbe quindi sostituire l'array-CGH. Il costo è superiore a quello dei pannelli DI44 e DI459, ma significa che gli esami non devono essere ripetuti sequenzialmente nel tempo se gli accertamenti sono negativi.

La questione del valore medico-economico è quindi centrale per determinare quale sia la strategia più efficace. Sono già stati effettuati alcuni studi medico-economici, di confronto tra indagini classiche e WES, sull'uso dell'HTS a fini diagnostici, ma nessuno ha riguardato l'ID, o il sequenziamento del panel rispetto al WES. In questo contesto, uno studio medico-economico è essenziale in Francia, perché in definitiva la scelta della strategia HTS più appropriata nella diagnosi di DI avrà importanti ripercussioni non solo cliniche ed economiche, ma anche per la società in generale, da un lato a causa dei vantaggi 1) per la gestione e la prognosi dei pazienti e 2) per le famiglie in quanto avranno un migliore accesso alla consulenza genetica. È importante notare che la comunità genetica non ha mai sperimentato una così grande innovazione tecnologica, che porterà ad un massiccio aumento della resa diagnostica, giustificando così l'interesse che la comunità deve dare a questa innovazione.