Mediko-økonomisk evaluering af forskellige high-throughput sekvenseringsstrategier i diagnosticering af patienter med intellektuelle defekter (DISSEQ)

Intellektuel mangel (ID) er et sandt folkesundhedsproblem, fordi det påvirker 1 til 3 % af befolkningen som helhed. I øjeblikket er diagnosen i Frankrig baseret på klinisk ekspertise, brug af DNA-mikroarray-analyse, screening for fragilt-X syndrom og om nødvendigt en undersøgelse af målgener afhængigt af de kliniske data. Selvom klinisk ekspertise ikke er nok til at målrette mod ét gen i særdeleshed, fører disse forskellige værktøjer i øjeblikket kun til diagnose hos kun 20 % af patienterne i gennemsnit (højere procentdel i tilfælde af syndromisk intellektuel mangel), nogle gange efter adskillige dyre biologiske undersøgelser.

Takket være high-throughput sekventering (HTS) oplever medicinsk genetik en stor teknologisk omvæltning, der stammer fra udviklingen af ​​sekventeringspaneler af målgener, såsom for eksempel DI459 panelet, der består af 459 gener, der er impliceret i eller sandsynligvis vil være impliceret i ID, udviklet af teamet i Strasbourg og hel-eksome-sekventering (WES). Indsættelsen af ​​HTS til diagnosticering er sket med forskellige hastigheder afhængigt af landet, hvoraf nogle har brugt det til rutinediagnostik i flere år. Den type strategi, der skal vedtages i forbindelse med udviklingsanomalier, er stadig et spørgsmål om debat i Frankrig, i mangel af resultater fra omkostningseffektivitetsanalyser; dette fravær har hæmmet implementeringen af ​​disse teknologier.

Ved diagnosticering af ID har DI459-panelet et diagnostisk udbytte på 25 %. Data i litteraturen viser også en høj effektivitet af WES hos patienter med ID: ca. 32 % af genetiske diagnoser (progressivt stigende takket være mulig reanalyse som viden om genomiske fremskridt) og 10 % af yderligere diagnoser gennem identifikation af kromosomale mikro-omlejringer, med en forventet total på 42% af diagnoserne. WES kunne således erstatte array-CGH. Omkostningerne er højere end for panelerne DI44 og DI459, men det betyder, at undersøgelserne ikke skal gentages sekventielt over tid, hvis undersøgelserne er negative.

Spørgsmålet om medico-økonomisk værdi er således centralt for at afgøre, hvilken strategi der er den mest effektive. Nogle få medico-økonomiske undersøgelser, der sammenligner klassiske undersøgelser med WES, er allerede blevet udført vedrørende brugen af ​​HTS til diagnostiske formål, men ingen har vedrørt ID eller sammenlignet panelsekventering med WES. I denne sammenhæng er en medico-økonomisk undersøgelse essentiel i Frankrig, fordi valget af den mest passende HTS-strategi til diagnosticering af ID i sidste ende vil have store konsekvenser ikke kun kliniske og økonomiske, men også for samfundet som helhed, på den ene side på grund af fordelene 1) for håndtering og prognose for patienter og 2) for familier, da de vil få forbedret adgang til genetisk rådgivning. Det er vigtigt at bemærke, at det genetiske samfund aldrig har oplevet så stor en teknologisk innovation, som vil føre til en massiv stigning i diagnostisk udbytte, og dermed retfærdiggøre den interesse, som samfundet skal give denne innovation.