Medicínsko-ekonomické hodnocení různých vysoce výkonných sekvenačních strategií v diagnostice pacientů s intelektuální nedostatečností (DISSEQ)

Intelektuální deficit (ID) je skutečným problémem veřejného zdraví, protože postihuje 1 až 3 % populace. V současné době je ve Francii diagnóza založena na klinické expertíze, použití analýzy DNA microarray, screeningu na syndrom fragile-X a v případě potřeby na studii cílových genů v závislosti na klinických datech. Přestože klinická odbornost nestačí k tomu, aby se zaměřila zejména na jeden gen, tyto různé nástroje vedou v současné době k diagnóze v průměru jen u 20 % pacientů (vyšší procento v případech syndromové intelektuální nedostatečnosti), někdy po četných nákladných biologických vyšetřeních.

Díky vysokokapacitnímu sekvenování (HTS) zažívá lékařská genetika velký technologický převrat, který má původ ve vývoji sekvenačních panelů cílových genů, jako je například panel DI459, složený ze 459 genů, které se účastní nebo pravděpodobně budou zapojený do ID, vyvinutý týmem ve Štrasburku a sekvenování celého exomu (WES). Nasazení HTS v diagnostice probíhalo různou rychlostí v závislosti na zemi, z nichž některé jej používají v rutinní diagnostice již několik let. Typ strategie, kterou je třeba přijmout v případě vývojových anomálií, je stále předmětem debaty ve Francii, protože chybí výsledky analýz efektivnosti nákladů; tato absence bránila implementaci těchto technologií.

V diagnostice ID má panel DI459 diagnostickou výtěžnost 25 %. Údaje v literatuře také ukazují vysokou účinnost WES u pacientů s ID: přibližně 32 % genetických diagnóz (progresivně se zvyšuje díky možné reanalýze s pokrokem znalostí genomiky) a 10 % dalších diagnóz prostřednictvím identifikace chromozomálních mikropřestaveb, což představuje očekávaný celkový počet 42 % diagnóz. WES by tak mohl nahradit array-CGH. Cena je vyšší než u panelů DI44 a DI459, ale to znamená, že vyšetření se nemusí v průběhu času opakovat postupně, pokud jsou vyšetření negativní.

Otázka lékařsko-ekonomické hodnoty je tedy ústřední, aby bylo možné určit, která strategie je nejúčinnější. Několik lékařsko-ekonomických studií, srovnávajících klasická vyšetření s WES, již bylo provedeno ohledně použití HTS pro diagnostické účely, ale žádná se netýkala ID nebo porovnávala panelové sekvenování s WES. V této souvislosti je ve Francii nezbytná lékařsko-ekonomická studie, protože v konečném důsledku bude mít výběr nejvhodnější strategie HTS v diagnostice ID velké dopady nejen klinické a ekonomické, ale na jedné straně také pro společnost jako celek. kvůli výhodám 1) pro management a prognózu pacientů a 2) pro rodiny, protože budou mít lepší přístup ke genetickému poradenství. Je důležité poznamenat, že genetická komunita nikdy nezažila tak obrovskou technologickou inovaci, která povede k masivnímu nárůstu diagnostické výtěžnosti, což ospravedlňuje zájem, který musí komunita této inovaci věnovat.