Medico-economische evaluatie van verschillende high-throughput sequencing-strategieën bij de diagnose van patiënten met een verstandelijke beperking (DISSEQ)

Intellectuele deficiëntie (ID) is een echt probleem voor de volksgezondheid omdat het 1 tot 3% van de bevolking treft. Momenteel is de diagnose in Frankrijk gebaseerd op klinische expertise, het gebruik van DNA-microarray-analyse, screening op het fragiele-X-syndroom en, indien nodig, een studie van doelgenen, afhankelijk van de klinische gegevens. Hoewel klinische expertise niet voldoende is om zich op één gen in het bijzonder te richten, leiden deze verschillende hulpmiddelen momenteel tot een diagnose bij gemiddeld slechts 20% van de patiënten (hoger percentage in gevallen van syndromale intellectuele achterstand), soms na tal van dure biologische onderzoeken.

Dankzij high-throughput sequencing (HTS) ondergaat de medische genetica een grote technologische omwenteling, voortkomend uit de ontwikkeling van sequencing-panels van doelgenen, zoals bijvoorbeeld het DI459-panel, samengesteld uit 459 genen die betrokken zijn bij of waarschijnlijk worden betrokken bij ID, ontwikkeld door het team in Straatsburg en whole-exome sequencing (WES). De inzet van HTS bij diagnose is met verschillende snelheden verlopen, afhankelijk van het land, waarvan sommige het al meerdere jaren gebruiken bij routinematige diagnose. Het type strategie dat moet worden gevolgd bij ontwikkelingsafwijkingen is nog steeds een punt van discussie in Frankrijk, bij gebrek aan resultaten van kosteneffectiviteitsanalyses; deze afwezigheid heeft de implementatie van deze technologieën belemmerd.

Bij de diagnose van ID heeft het DI459 paneel een diagnostisch rendement van 25%. Gegevens in de literatuur laten ook een hoge werkzaamheid van WES zien bij patiënten met VB: ongeveer 32% van de genetische diagnoses (progressief toenemend dankzij mogelijke heranalyse naarmate de kennis van genomics vordert) en 10% van de aanvullende diagnoses door de identificatie van chromosomale micro-herschikkingen, het maken van een verwacht totaal van 42% van de diagnoses. WES zou dus array-CGH kunnen vervangen. De kosten zijn hoger dan die voor de DI44- en DI459-panelen, maar het betekent dat onderzoeken niet opeenvolgend in de loop van de tijd hoeven te worden herhaald als de onderzoeken negatief zijn.

De vraag naar de medisch-economische waarde staat dus centraal om te bepalen welke strategie het meest effectief is. Er zijn al enkele medisch-economische studies uitgevoerd waarin klassiek onderzoek met WES is vergeleken, maar geen enkele heeft betrekking op ID of op panel sequencing met WES. In deze context is een medisch-economische studie essentieel in Frankrijk, omdat uiteindelijk de keuze van de meest geschikte HTS-strategie bij de diagnose van VB grote gevolgen zal hebben, niet alleen klinisch en economisch, maar ook voor de samenleving als geheel. vanwege de voordelen 1) voor het beheer en de prognose van patiënten, en 2) voor gezinnen, aangezien zij een betere toegang tot erfelijkheidsadvisering zullen hebben. Het is belangrijk op te merken dat de genetische gemeenschap nog nooit zo'n enorme technologische innovatie heeft meegemaakt, die zal leiden tot een enorme toename van de diagnostische opbrengst, wat de interesse rechtvaardigt die de gemeenschap aan deze innovatie moet geven.