Medikoekonomisk utvärdering av olika sekvenseringsstrategier med hög genomströmning vid diagnos av patienter med intellektuell brist (DISSEQ)

Intellektuell brist (ID) är en veritabel folkhälsofråga eftersom den drabbar 1 till 3 % av befolkningen i stort. För närvarande, i Frankrike, baseras diagnosen på klinisk expertis, användning av DNA-mikroarrayanalys, screening för fragilt-X-syndrom och, om nödvändigt, en studie av målgener beroende på kliniska data. Även om klinisk expertis inte är tillräcklig för att rikta in sig på en gen i synnerhet, leder dessa olika verktyg för närvarande till diagnos hos endast 20 % av patienterna i genomsnitt (högre procentandel vid syndromisk intellektuell brist), ibland efter många dyra biologiska undersökningar.

Tack vare high-throughput sekvensering (HTS) upplever medicinsk genetik en stor teknisk omvälvning, som härrör från utvecklingen av sekvenseringspaneler av målgener, som till exempel DI459-panelen, som består av 459 gener som är inblandade i eller sannolikt kommer att vara inblandad i ID, utvecklat av teamet i Strasbourg och helexomsekvensering (WES). Utbyggnaden av HTS i diagnostik har skett i olika hastigheter beroende på land, av vilka några har använt det i rutindiagnostik i flera år. Vilken typ av strategi som ska tillämpas i utvecklingsavvikelser är fortfarande en fråga om debatt i Frankrike, i avsaknad av resultat från kostnadseffektivitetsanalyser; denna frånvaro har hämmat implementeringen av dessa tekniker.

Vid diagnos av ID har DI459-panelen ett diagnostiskt utbyte på 25 %. Data i litteraturen visar också en hög effektivitet av WES hos patienter med ID: cirka 32 % av genetiska diagnoser (progressivt ökande tack vare möjlig omanalys som kunskap om genomiska framsteg) och 10 % av ytterligare diagnoser genom identifiering av kromosomala mikroomarrangemang, vilket gör en förväntad total på 42 % av diagnoserna. WES skulle alltså kunna ersätta array-CGH. Kostnaden är högre än för panelerna DI44 och DI459, men det innebär att undersökningarna inte behöver upprepas sekventiellt över tid om undersökningarna är negativa.

Frågan om medicinskt ekonomiskt värde är alltså central för att avgöra vilken strategi som är mest effektiv. Ett fåtal medikoekonomiska studier, som jämför klassiska undersökningar med WES, har redan genomförts rörande användningen av HTS för diagnostiska ändamål, men ingen har rört ID eller jämfört panelsekvensering med WES. I detta sammanhang är en medicinsk-ekonomisk studie väsentlig i Frankrike, eftersom valet av den mest lämpliga HTS-strategin för diagnos av ID i slutändan kommer att få stora återverkningar, inte bara kliniska och ekonomiska, utan också för samhället i stort, å ena sidan på grund av fördelarna 1) för hantering och prognos för patienter, och 2) för familjer eftersom de kommer att få förbättrad tillgång till genetisk rådgivning. Det är viktigt att notera att det genetiska samhället aldrig har upplevt en sådan enorm teknisk innovation, vilket kommer att leda till en massiv ökning av diagnostiskt utbyte, vilket motiverar det intresse som samhället måste ge denna innovation.