Különböző nagy áteresztőképességű szekvenálási stratégiák orvosi-gazdasági értékelése az értelmi fogyatékos betegek diagnosztizálásában (DISSEQ)

Az intellektuális hiányosság (ID) valódi közegészségügyi probléma, mivel a lakosság 1-3%-át érinti. Jelenleg Franciaországban a diagnózis alapja a klinikai szakértelem, a DNS microarray elemzés alkalmazása, a fragile-X szindróma szűrése és szükség esetén a célgének vizsgálata a klinikai adatoktól függően. Bár a klinikai szakértelem nem elegendő egy konkrét gén megcélzásához, ezek a különböző eszközök jelenleg a betegek átlagosan csak 20%-ánál vezetnek diagnózishoz (szindrómás intellektuális hiány esetén magasabb százalék), néha számos költséges biológiai vizsgálat után.

A nagy áteresztőképességű szekvenálásnak (HTS) köszönhetően az orvosi genetika jelentős technológiai felforduláson megy keresztül, ami a célgének szekvenáló paneleinek kifejlesztéséből ered, mint például a DI459 panel, amely 459 génből áll, amelyek érintettek vagy valószínűleg érintett az ID-ben, amelyet a strasbourgi csapat fejlesztett ki és a teljes exome szekvenálást (WES). A HTS bevezetése a diagnosztikában országonként eltérő sebességgel ment végbe, amelyek közül néhányan már évek óta használják a rutin diagnosztikában. A fejlesztési anomáliák esetén alkalmazandó stratégia típusa még mindig vita tárgya Franciaországban, a költséghatékonysági elemzések eredményei hiányában; ez a hiány akadályozta e technológiák megvalósítását.

Az ID diagnosztizálásában a DI459 panel diagnosztikai hozama 25%. A szakirodalmi adatok a WES magas hatékonyságát is mutatják ID-s betegeknél: a genetikai diagnózisok körülbelül 32%-a (a genomika ismereteinek előrehaladtával fokozatosan növekszik az esetleges újraelemzésnek köszönhetően), és a további diagnózisok 10%-a a kromoszómális mikro-átrendeződések azonosítása révén. így a diagnózisok várhatóan összesen 42%-a. A WES így helyettesítheti az array-CGH-t. A költség magasabb, mint a DI44 és DI459 paneleknél, de ez azt jelenti, hogy a vizsgálatokat nem kell egymás után megismételni, ha a vizsgálatok negatívak.

Az orvosi-gazdasági érték kérdése tehát központi szerepet játszik annak meghatározásában, hogy melyik stratégia a leghatékonyabb. Néhány, a klasszikus vizsgálatokat WES-sel összehasonlító orvos-ökonómiai tanulmány készült már a HTS diagnosztikai célú felhasználásával kapcsolatban, de egyik sem érintette az ID-t, illetve nem hasonlította össze a panelszekvenálást a WES-sel. Ebben az összefüggésben egy orvosi-gazdasági tanulmány elengedhetetlen Franciaországban, mert végső soron az ID diagnózisában a legmegfelelőbb HTS-stratégia kiválasztása nemcsak klinikai és gazdasági, hanem egyrészt a társadalom egészében is jelentős következményekkel jár. az előnyök miatt 1) ​​a betegek kezelése és prognózisa, valamint 2) a családok számára, mivel jobb hozzáférést biztosítanak a genetikai tanácsadáshoz. Fontos megjegyezni, hogy a genetikai közösség még soha nem tapasztalt ilyen hatalmas technológiai innovációt, amely a diagnosztikai hozam masszív növekedéséhez vezet, így indokolt a közösség érdeklődése ezen innováció iránt.