Medisinsk-økonomisk evaluering av ulike sekvenseringsstrategier med høy ytelse ved diagnostisering av pasienter med intellektuell mangel (DISSEQ)

Intellektuell mangel (ID) er et veritabelt folkehelseproblem fordi det påvirker 1 til 3 % av befolkningen for øvrig. For tiden, i Frankrike, er diagnosen basert på klinisk ekspertise, bruk av DNA-mikroarray-analyse, screening for fragilt-X-syndrom og, om nødvendig, en studie av målgener avhengig av kliniske data. Selv om klinisk ekspertise ikke er nok til å målrette mot ett gen spesielt, fører disse forskjellige verktøyene i dag til diagnose hos bare 20 % av pasientene i gjennomsnitt (høyere prosentandel i tilfeller av syndromisk intellektuell mangel), noen ganger etter mange dyre biologiske undersøkelser.

Takket være high-throughput sekvensering (HTS) opplever medisinsk genetikk en stor teknologisk omveltning, som stammer fra utviklingen av sekvenseringspaneler av målgener, slik som for eksempel DI459-panelet, som består av 459 gener som er involvert i eller sannsynligvis vil være implisert i ID, utviklet av teamet i Strasbourg og hel-eksome-sekvensering (WES). Utplasseringen av HTS i diagnose har skjedd med forskjellige hastigheter avhengig av land, noen av dem har brukt det i rutinediagnostikk i flere år. Hvilken strategi som skal brukes i utviklingsavvik er fortsatt et spørsmål om debatt i Frankrike, i mangel av resultater fra kostnadseffektivitetsanalyser; dette fraværet har hindret implementeringen av disse teknologiene.

Ved diagnostisering av ID har DI459-panelet et diagnostisk utbytte på 25 %. Data i litteraturen viser også en høy effekt av WES hos pasienter med ID: omtrent 32 % av genetiske diagnoser (progressivt økende takket være mulig reanalyse som kunnskap om genomiske fremskritt) og 10 % av tilleggsdiagnoser gjennom identifisering av kromosomale mikroomorganiseringer, utgjør en forventet total på 42 % av diagnosene. WES kan dermed erstatte array-CGH. Kostnaden er høyere enn for DI44- og DI459-panelene, men det betyr at undersøkelser ikke trenger å gjentas sekvensielt over tid hvis undersøkelsene er negative.

Spørsmålet om medisk-økonomisk verdi er dermed sentralt for å avgjøre hvilken strategi som er mest effektiv. Noen få medisinsk-økonomiske studier, som sammenligner klassiske undersøkelser med WES, er allerede utført vedrørende bruk av HTS til diagnostiske formål, men ingen har omhandlet ID, eller sammenlignet panelsekvensering med WES. I denne sammenhengen er en medisinsk-økonomisk studie viktig i Frankrike, fordi til syvende og sist vil valget av den mest hensiktsmessige HTS-strategien for diagnostisering av ID ha store konsekvenser ikke bare kliniske og økonomiske, men også for samfunnet for øvrig, på den ene siden. på grunn av fordelene 1) for håndtering og prognose for pasienter, og 2) for familier ettersom de vil få forbedret tilgang til genetisk veiledning. Det er viktig å merke seg at det genetiske samfunnet aldri har opplevd en så stor teknologisk innovasjon, som vil føre til en massiv økning i diagnostisk utbytte, og dermed rettferdiggjøre interessen som samfunnet må gi denne innovasjonen.