グローバル梅毒シーケンス
ルーチンの臨床サンプルを使用した梅毒の全ゲノム配列決定
梅毒は重要な性感染症です。 過去 10 年間に英国で男性とセックスをする男性の間で梅毒の流行がありました。 梅毒の早期感染は性器潰瘍を引き起こし、その後、治療を行わないと発疹を伴うことが多い全身疾患を引き起こします。 体外で梅毒を増殖させることはできないため、梅毒に関する研究は限られています。 新しいアプローチにより、スワブからトレポネマ・パリダムの全遺伝子配列を取得できます。
この研究では、英国のセクシュアル ヘルス クリニックで受診する患者の定期的な患者ケアの一環として収集された残留 DNA が配列決定に使用されます。 サンプルからの残留物質を使用した全ゲノム配列決定に限定された研究には、患者との接触は含まれていません。 T.pallidum のゲノムをよりよく理解することにより、この重要な性感染症の病因についての洞察が得られます。
調査の概要
状態
状態
条件
条件
介入・治療
介入・治療
研究の種類
研究の種類
入学 (実際)
入学
連絡先と場所
研究場所
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Birmingham、イギリス
- University Hospitals Birmingham
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Brighton、イギリス
- Brighton and Sussex NHS Trust
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Leeds、イギリス
- Leeds University Teaching Hospital
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London、イギリス
- Mortimer Market Centre
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Manchester、イギリス
- Penine Acute Hospitals Trust
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参加基準
適格基準
適格基準
就学可能な年齢
健康ボランティアの受け入れ
受講資格のある性別
サンプリング方法
調査対象母集団
梅毒と診断されて英国の性的健康サービスを受診した患者。
参加している診療所/病院で定期的に収集された臨床サンプルから残留 T.pallidum DNA を特定します。 これらのサンプルに付随するデータは匿名化され、患者を特定できる情報は含まれません。 付随するデータには、出身地、年齢、性別、HIV 感染状況、性的指向が含まれます。
説明
包含基準:
- 梅毒の診断
除外基準:
- PCR陽性臨床検体なし
研究計画
研究はどのように設計されていますか?
デザインの詳細
グループ/コホートの数
コホートと介入
グループ/コホートグループ/コホート |
介入・治療介入・治療 |
|---|---|
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梅毒
定期的に採取された臨床検体から検出可能な梅毒トレポネマ DNA を有する梅毒患者
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臨床サンプルからの残留DNAは、梅毒の原因物質である梅毒トレポネーマの全ゲノム配列決定に利用されます
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この研究は何を測定していますか?
主要な結果の測定
主要な結果の測定
結果測定 |
メジャーの説明 |
時間枠 |
|---|---|---|
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ヌクレオチド多様性と系統発生によって評価される梅毒トレポネーマのゲノム多様性
時間枠:ベースラインで測定 - 登録時。この研究では、それ以上のサンプルや訪問はありません。
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英国および世界の梅毒サンプルの全ゲノム配列決定と系統ゲノム解析および集団ゲノム解析を組み合わせて、地域的および世界的な文脈でトレポネマの集団構造と多様性を決定します。
多様性は、サンプルと参照ゲノム間のヌクレオチド多様性を測定することによって評価されます。
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ベースラインで測定 - 登録時。この研究では、それ以上のサンプルや訪問はありません。
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協力者と研究者
協力者
協力者
研究記録日
主要日程の研究
研究開始 (実際)
研究開始
一次修了 (実際)
一次修了
研究の完了 (実際)
研究の完了
試験登録日
最初に提出
最初に提出
QC基準を満たした最初の提出物
QC基準を満たした最初の提出物
最初の投稿 (実際)
最初の投稿
学習記録の更新
投稿された最後の更新 (実際)
投稿された最後の更新
QC基準を満たした最後の更新が送信されました
QC基準を満たした最後の更新が送信されました
最終確認日
最終確認日
詳しくは
本研究に関する用語
追加の関連 MeSH 用語
その他の研究ID番号
その他の研究ID番号
- 16014
個々の参加者データ (IPD) の計画
個々の参加者データ (IPD) を共有する予定はありますか?
医薬品およびデバイス情報、研究文書
米国FDA規制医薬品の研究
米国FDA規制機器製品の研究
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