Globale Syphilis-Sequenzierung
Gesamtgenomsequenzierung von Syphilis unter Verwendung klinischer Routineproben
Syphilis ist eine wichtige sexuell übertragbare Infektion. Im Vereinigten Königreich hat es im letzten Jahrzehnt eine Syphilis-Epidemie unter Männern gegeben, die Sex mit Männern haben. Eine frühe Infektion mit Syphilis verursacht ein Geschwür im Genitalbereich, gefolgt von einer generalisierten Erkrankung, die oft von Hautausschlag begleitet wird, wenn keine Behandlung erfolgt. Studien über Syphilis waren begrenzt, da es nicht möglich ist, Syphilis außerhalb des Körpers zu züchten. Neue Ansätze erlauben es, die gesamte genetische Sequenz von Treponema pallidum aus einem Abstrich zu gewinnen.
In dieser Studie wird Rest-DNA, die im Rahmen der routinemäßigen Patientenversorgung von Patienten gesammelt wurde, die in Kliniken für sexuelle Gesundheit in Großbritannien behandelt wurden, für die Sequenzierung verwendet. An der Studie, die sich auf die Sequenzierung des gesamten Genoms unter Verwendung von Restmaterial aus Proben beschränkt, ist kein Patientenkontakt beteiligt. Durch ein besseres Verständnis des Genoms von T.pallidum sollen Erkenntnisse zur Pathogenese dieser wichtigen sexuell übertragbaren Krankheit gewonnen werden.
Studienübersicht
Status
Status
Bedingungen
Bedingungen
Intervention / Behandlung
Intervention / Behandlung
Studientyp
Studientyp
Einschreibung (Tatsächlich)
Einschreibung
Kontakte und Standorte
Studienorte
-
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Birmingham, Vereinigtes Königreich
- University Hospitals Birmingham
-
Brighton, Vereinigtes Königreich
- Brighton and Sussex NHS Trust
-
Leeds, Vereinigtes Königreich
- Leeds University Teaching Hospital
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London, Vereinigtes Königreich
- Mortimer Market Centre
-
Manchester, Vereinigtes Königreich
- Penine Acute Hospitals Trust
-
-
Teilnahmekriterien
Zulassungskriterien
Zulassungskriterien
Studienberechtigtes Alter
Akzeptiert gesunde Freiwillige
Studienberechtigte Geschlechter
Probenahmeverfahren
Studienpopulation
Patienten, die sich mit einer Syphilis-Diagnose bei Diensten für sexuelle Gesundheit in Großbritannien vorstellen.
Wir identifizieren restliche T.pallidum-DNA aus routinemäßig gesammelten klinischen Proben, die in teilnehmenden Kliniken/Krankenhäusern aufbewahrt werden. Die diesen Proben beigefügten Daten werden anonymisiert und enthalten keine identifizierbaren Patienteninformationen. Begleitende Daten umfassen: Herkunftsort, Alter, Geschlecht, HIV-Status und sexuelle Orientierung.
Beschreibung
Einschlusskriterien:
- Diagnose Syphilis
Ausschlusskriterien:
- Keine PCR-positive klinische Probe
Studienplan
Wie ist die Studie aufgebaut?
Designdetails
Anzahl der Gruppen / Kohorten
Kohorten und Interventionen
Gruppe / KohorteGruppe / Kohorte |
Intervention / BehandlungIntervention / Behandlung |
|---|---|
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Syphilis
Patienten mit Syphilis und nachweisbarer Treponema pallidum-DNA in einer routinemäßig entnommenen klinischen Probe
|
Rest-DNA aus klinischen Proben wird für die Sequenzierung des gesamten Genoms von Treponema pallidum, dem Erreger der Syphilis, verwendet
|
Was misst die Studie?
Primäre Ergebnismessungen
Primäre Ergebnismessungen
Ergebnis Maßnahme |
Maßnahmenbeschreibung |
Zeitfenster |
|---|---|---|
|
Genomische Diversität von Treponema pallidum, bewertet durch Nukleotiddiversität und phylogenetische Abstammung
Zeitfenster: Gemessen zu Studienbeginn – Zeitpunkt der Einschreibung. Es gibt keine weiteren Proben oder Besuche in der Studie.
|
Gesamtgenomsequenzierung von britischen und globalen Syphilis-Proben in Kombination mit phylogenomischen und populationsgenomischen Analysen zur Bestimmung der Populationsstruktur und Diversität von Treponema sowohl regional als auch im globalen Kontext.
Die Diversität wird durch Messung der Nukleotiddiversität zwischen Proben und Referenzgenomen bewertet.
|
Gemessen zu Studienbeginn – Zeitpunkt der Einschreibung. Es gibt keine weiteren Proben oder Besuche in der Studie.
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Mitarbeiter und Ermittler
Sponsor
Sponsor
Mitarbeiter
Mitarbeiter
Studienaufzeichnungsdaten
Haupttermine studieren
Studienbeginn (TATSÄCHLICH)
Studienbeginn
Primärer Abschluss (TATSÄCHLICH)
Primärer Abschluss
Studienabschluss (TATSÄCHLICH)
Studienabschluss
Studienanmeldedaten
Zuerst eingereicht
Zuerst eingereicht
Zuerst eingereicht, das die QC-Kriterien erfüllt hat
Zuerst eingereicht, das die QC-Kriterien erfüllt hat
Zuerst gepostet (TATSÄCHLICH)
Zuerst gepostet
Studienaufzeichnungsaktualisierungen
Letztes Update gepostet (TATSÄCHLICH)
Letztes Update gepostet
Letztes eingereichtes Update, das die QC-Kriterien erfüllt
Letztes eingereichtes Update, das die QC-Kriterien erfüllt
Zuletzt verifiziert
Zuletzt verifiziert
Mehr Informationen
Begriffe im Zusammenhang mit dieser Studie
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Andere Studien-ID-Nummern
Andere Studien-ID-Nummern
- 16014
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Arzneimittel- und Geräteinformationen, Studienunterlagen
Studiert ein von der US-amerikanischen FDA reguliertes Arzneimittelprodukt
Studiert ein von der US-amerikanischen FDA reguliertes Geräteprodukt
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