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HIV-1 耐性解析のターゲットとしてのプロウイルス DNA (HIV)

2019年9月12日 更新者：PABLO ANDRES FERRER CAMPOS、University of Chile

要約すると、このプロジェクトでは、研究者は、抗レトロウイルス薬の治療標的であるすべての HIV 遺伝子を分析するために、現在使用されている商用システムよりも低コストで幅広いプロウイルス DNA ジェノタイピングを研究することを提案しています。 HIV プロウイルス DNA を使用して、HIV-1 ウイルス向性、インテグラーゼ阻害剤に関連する変異、転写酵素逆阻害剤に関連する変異、プロテアーゼ阻害剤に関連する変異、および GP41 阻害剤に関連する変異に関する情報を取得できます。

これに加えて、研究者は、患者のウイルス量とは無関係なジェノタイピングの開始材料としてプロウイルス DNA を検証し、HIV 感染を監視する上で不可欠なこの重要な検査にアクセスできる HIV と共に生きるより多くの患者を達成することを提案しています。

3.2 研究に関する質問 プロウイルス DNA は、ウイルス量が少ないか検出できない患者の遺伝子型耐性検査を行うのに適した遺伝子コンパートメントですか? プロウイルス DNA は RNA と同じ臨床的妥当性を持っていますか? 3.3.- 仮説 Proviral DNA によって実施される耐性ジェノタイピング テストは、ウイルス RNA の耐性に関連する同じ変異を検出します。

3.4.- 目的: 一般/特定 一般目的 TR 逆転写酵素およびプロテアーゼ (PRO)、インテグラーゼまたは GP41 阻害剤およびHIV向性。 特定の目的

1. プロウイルス DNA によるジェノタイピングを実行し、ウイルス RNA で行われた同じ遺伝子ジェノタイピングと比較します。 2. プロウイルス DNA と RNA の間の相関関係が示されたら、各患者のニーズに応じて HIV 患者を監視する際に臨床使用のための技術を使用する方法を標準化します。 ウイルス量が 1,000 コピー/mL を超える患者の RNA。 ウイルス量が少ない、または検出できない患者のためのプロウイルス DNA。

調査の概要

状態

わからない

条件

詳細な説明

前向き縦断観察研究の目的は、ウイルス学的失敗および低レベルのウイルス血症の患者において、プロウイルス DNA によって検出される INRT、INNRT、プロテアーゼ、および INIS 変異の有病率を観察し、説明することです。

包含/除外: 私たちの研究には、"Instituto de Salud Pública de Chile" (ISP-チリ) によって確認された HIV 患者のみが含まれます。 18歳未満のお子様は対象外です。

患者数: 合計 1,200 人の患者が 3 年間に含まれます (適切な場合、統計的正当性を含む)。

  1. -インフォームドコンセントに署名した患者のみが私たちの研究に認められます。
  2. -入院した患者は、HIV遺伝子型耐性検査のために血液サンプルを採取します。
  3. - 入院した各患者の臨床記録から、CD4 T リンパ球数、ウイルス負荷、HIV 診断日、治療開始日、治療の数と種類などの結果を解釈するために、いくつかの関連する臨床データが取得されます。
  4. - 遺伝子型管理のため、毎年 2 回目の血液サンプルを採取します。

詳細な説明

HIV-1 感染症におけるプロウイルス DNA の耐性変異の検出

背景 抗レトロウイルス薬に対する耐性の遺伝子検査 HIV プロウイルス DNA (HPD) は、抗レトロウイルス療法を受けている患者で、ウイルス負荷レベルが検出できないレベルに達していないか、低レベルのウイルス血症 (LLV) の患者の突然変異を検出するのに非常に役立ちます。

HPD は、血漿中で検出できなかった循環耐性バリアントの検出とアーカイブを可能にします。

HPD は、患者のウイルス量とは無関係です。 これは、ベースラインのウイルス量が少ない (<1,000 コピー/mL) 最近診断された患者の耐性変異を検出できるため、一次耐性の研究に非常に役立ちます。

HPD は、分析用の HIV RNA がない場合に、European AIDS Clinical Society EACS によって推奨されています (Barcelona、2015 年 10 月)。

HPD は、現在市場で入手可能なすべての抗レトロウイルス薬に対する耐性を分析できます。 したがって、HPD イノベーションにより、次の遺伝的耐性検査を実施できます。

サイズ サンプルと方法論

2 年間で、1,200 人の患者集団を調査します。 これらには、2012 年 12 月までに HIV センターで分析したすべての患者が含まれます。 この方法論には、核酸抽出、治療上の標的である HIV-1 遺伝子の増幅、および従来および新世代の配列決定法による配列決定が含まれます。

患者募集: 合計 1.200 (年ごとに 400)

血液サンプルの取得: 2 つのサンプル: 開始までのサンプルと 1 年後の終了までの 1 つのサンプル

DNA およびウイルス RNA の抽出:

RT-PCR 増幅:

アガロースゲルでの電気泳動の可視化

配列決定サービスのためにサンプルを Macrogen に送信する

Macrogen USA のサンガー法による自動シーケンシング

チリまたは Macrogen USA でのディープ シーケンス (NGS) によるシーケンス

配列分析

ソフトウェア ReCall での生配列の品質分析と組み立て

臨床的に関心のある変異の登録

抗レトロウイルス薬耐性報告

生物統計分析

結果報告と出版物

予備的結果 ウイルス量が 1,000 コピー/mL 未満の 100 人の患者の予備的分析では、逆転写酵素とウイルス プロテアーゼを阻害する薬剤に対する耐性の変異を持つ患者が 10% 検出されました。 この貴重な情報により、より高いレベルのウイルス負荷に達する前に薬物スキームを変更することで、早期の治療介入が可能になり、結果として臨床管理が改善されました。

予測プロジェクト この予備研究の成功と即時の適用により、公衆衛生システムにおける HIV クリニック患者の日常的な遺伝子検査としてこの技術を検証することが非常に重要になると考えています。 この HIV プロウイルス DNA の遺伝的 HIV 検査のための恒久的な資金提供は、チリ政府の保健省によって行われるべきです。

結論として、現在 HPD は抗レトロ ウイルス療法の早期変更のためにウイルス学的失敗と LLV を研究するための非常に有用なツールです。

研究の種類

観察的

入学 (予想される)

1200

連絡先と場所

このセクションには、調査を実施する担当者の連絡先の詳細と、この調査が実施されている場所に関する情報が記載されています。

研究場所

  • チリ
    • Metropolitana
      • Santiago、Metropolitana、チリ
        • 募集
        • Immunology, HIV and Allergy Section
        • コンタクト：
      • Santiago、Metropolitana、チリ
        • 募集
        • Molecular Medicine Laboratory
        • コンタクト：

参加基準

研究者は、適格基準と呼ばれる特定の説明に適合する人を探します。これらの基準のいくつかの例は、人の一般的な健康状態または以前の治療です。

適格基準

就学可能な年齢

18年～99年 (アダルト、OLDER_ADULT)

健康ボランティアの受け入れ

はい

受講資格のある性別

全て

サンプリング方法

確率サンプル

調査対象母集団

包含/除外: 私たちの研究には、"Instituto de Salud Pública de Chile" (ISP-チリ) によって確認された HIV 患者のみが含まれます。 18歳未満のお子様は対象外です。

患者数: 3 年間で合計 1,200 人の患者が含まれます (必要に応じて、統計的根拠を含めて)

説明

包含基準:

HIVの臨床診断

ウイルス量 <1.000 コピー/mL

抗レトロウイルス治療中

除外基準:

HIV陰性

ウイルス量 >1.000 コピー/mL

研究計画

このセクションでは、研究がどのように設計され、研究が何を測定しているかなど、研究計画の詳細を提供します。

研究はどのように設計されていますか？

デザインの詳細

この研究は何を測定していますか？

主要な結果の測定

結果測定
メジャーの説明
時間枠
HIV-1 耐性解析のターゲットとしてのプロウイルス DNA
時間枠：3年
TR 逆転写酵素およびプロテアーゼ (PRO)、インテグラーゼまたは GP41 阻害剤、および HIV 向性として薬理学的に関心のある遺伝子のジェノタイピング アッセイの遺伝物質として、プロウイルス HIV-1 DNA または RNA を評価する方法論を開発する
3年

協力者と研究者

ここでは、この調査に関係する人々や組織を見つけることができます。

スポンサー

University of Chile

協力者

ViiV Healthcare

捜査官

  • 主任研究者：Pablo Ferrer, Dr、University of Chile

研究記録日

これらの日付は、ClinicalTrials.gov への研究記録と要約結果の提出の進捗状況を追跡します。研究記録と報告された結果は、国立医学図書館 (NLM) によって審査され、公開 Web サイトに掲載される前に、特定の品質管理基準を満たしていることが確認されます。

主要日程の研究

研究開始 (実際)

2018年10月15日

一次修了 (実際)

2019年9月8日

研究の完了 (予期された)

2022年12月31日

試験登録日

最初に提出

2019年9月11日

QC基準を満たした最初の提出物

2019年9月11日

最初の投稿 (実際)

2019年9月13日

学習記録の更新

投稿された最後の更新 (実際)

2019年9月17日

QC基準を満たした最後の更新が送信されました

2019年9月12日

最終確認日

2019年9月1日

詳しくは

本研究に関する用語

キーワード

追加の関連 MeSH 用語

その他の研究ID番号

  • Nº OAIC 986/18

医薬品およびデバイス情報、研究文書

米国FDA規制医薬品の研究

いいえ

米国FDA規制機器製品の研究

いいえ

この情報は、Web サイト clinicaltrials.gov から変更なしで直接取得したものです。研究の詳細を変更、削除、または更新するリクエストがある場合は、register@clinicaltrials.gov。 までご連絡ください。 clinicaltrials.gov に変更が加えられるとすぐに、ウェブサイトでも自動的に更新されます。

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