Wereldwijde syfilis-sequencing
Volledige genoomsequencing van syfilis met behulp van routinematige klinische monsters
Syfilis is een belangrijke seksueel overdraagbare aandoening. Er is de afgelopen tien jaar een syfilisepidemie geweest onder mannen die seks hebben met mannen in het Verenigd Koninkrijk. Een vroege infectie met syfilis veroorzaakt een zweer aan de geslachtsorganen, gevolgd door het uitblijven van behandeling door een gegeneraliseerde ziekte die vaak gepaard gaat met huiduitslag. Studies over syfilis zijn beperkt omdat het niet mogelijk is om syfilis buiten het lichaam te laten groeien. Dankzij nieuwe benaderingen kan de volledige genetische sequentie van Treponema pallidum worden verkregen uit een uitstrijkje.
In deze studie zal rest-DNA dat is verzameld als onderdeel van de routinematige patiëntenzorg van patiënten die worden gezien in seksuele gezondheidsklinieken in het VK, worden gebruikt voor sequentiebepaling. Er is geen patiëntencontact bij de studie betrokken, die zich beperkt tot de sequentiebepaling van het hele genoom met behulp van restmateriaal van monsters. Door een beter begrip van het genoom van de T.pallidum zal inzicht worden verkregen in de pathogenese van deze belangrijke seksueel overdraagbare aandoening.
Studie Overzicht
Toestand
Conditie
Interventie / Behandeling
Studietype
Inschrijving (Werkelijk)
Contacten en locaties
Studie Locaties
-
-
-
Birmingham, Verenigd Koninkrijk
- University Hospitals Birmingham
-
Brighton, Verenigd Koninkrijk
- Brighton and Sussex NHS Trust
-
Leeds, Verenigd Koninkrijk
- Leeds University Teaching Hospital
-
London, Verenigd Koninkrijk
- Mortimer Market Centre
-
Manchester, Verenigd Koninkrijk
- Penine Acute Hospitals Trust
-
-
Deelname Criteria
Geschiktheidscriteria
Leeftijden die in aanmerking komen voor studie
Accepteert gezonde vrijwilligers
Geslachten die in aanmerking komen voor studie
Bemonsteringsmethode
Studie Bevolking
Patiënten die zich bij seksuele gezondheidsdiensten in het VK aanmelden met de diagnose syfilis.
We zullen achtergebleven T.pallidum-DNA identificeren van routinematig verzamelde klinische monsters die worden bewaard in deelnemende klinieken/ziekenhuizen. De gegevens die deze monsters vergezellen, worden geanonimiseerd en bevatten geen informatie over de identificatie van de patiënt. Begeleidende gegevens zijn onder meer: stad van herkomst, leeftijd, geslacht, hiv-status en seksuele geaardheid.
Beschrijving
Inclusiecriteria:
- Diagnose van syfilis
Uitsluitingscriteria:
- Geen PCR-positief klinisch monster
Studie plan
Hoe is de studie opgezet?
Ontwerpdetails
Cohorten en interventies
Groep / Cohort |
Interventie / Behandeling |
|---|---|
|
Syfilis
Patiënten met syfilis en detecteerbaar DNA van Treponema pallidum in een routinematig verzameld klinisch monster
|
Rest-DNA van klinische monsters zal worden gebruikt voor sequentiebepaling van het volledige genoom van Treponema pallidum, de veroorzaker van syfilis
|
Wat meet het onderzoek?
Primaire uitkomstmaten
Uitkomstmaat |
Maatregel Beschrijving |
Tijdsspanne |
|---|---|---|
|
Genomische diversiteit van Treponema Pallidum zoals beoordeeld door nucleotide-diversiteit en fylogenetische afstamming
Tijdsspanne: Gemeten bij baseline - tijdstip van inschrijving. Er zijn geen verdere monsters of bezoeken in het onderzoek.
|
Gehele genoomsequencing van Britse en wereldwijde syfilismonsters gecombineerd met fylogenomische en populatie-genomische analyses om de populatiestructuur en diversiteit van Treponema zowel regionaal als in mondiale context te bepalen.
Diversiteit zal worden beoordeeld door de nucleotide-diversiteit tussen monsters en referentiegenomen te meten.
|
Gemeten bij baseline - tijdstip van inschrijving. Er zijn geen verdere monsters of bezoeken in het onderzoek.
|
Medewerkers en onderzoekers
Medewerkers
Studie record data
Bestudeer belangrijke data
Studie start (WERKELIJK)
Primaire voltooiing (WERKELIJK)
Studie voltooiing (WERKELIJK)
Studieregistratiedata
Eerst ingediend
Eerst ingediend dat voldeed aan de QC-criteria
Eerst geplaatst (WERKELIJK)
Updates van studierecords
Laatste update geplaatst (WERKELIJK)
Laatste update ingediend die voldeed aan QC-criteria
Laatst geverifieerd
Meer informatie
Termen gerelateerd aan deze studie
Aanvullende relevante MeSH-voorwaarden
Andere studie-ID-nummers
- 16014
Plan Individuele Deelnemersgegevens (IPD)
Bent u van plan om gegevens van individuele deelnemers (IPD) te delen?
Informatie over medicijnen en apparaten, studiedocumenten
Bestudeert een door de Amerikaanse FDA gereguleerd geneesmiddel
Bestudeert een door de Amerikaanse FDA gereguleerd apparaatproduct
Deze informatie is zonder wijzigingen rechtstreeks van de website clinicaltrials.gov gehaald. Als u verzoeken heeft om uw onderzoeksgegevens te wijzigen, te verwijderen of bij te werken, neem dan contact op met register@clinicaltrials.gov. Zodra er een wijziging wordt doorgevoerd op clinicaltrials.gov, wordt deze ook automatisch bijgewerkt op onze website .