Global syfilis-sekventering
Helgenomsekventering af syfilis ved hjælp af rutinemæssige kliniske prøver
Syfilis er en vigtig seksuelt overført infektion. Der har været en epidemi af syfilis blandt mænd, der har sex med mænd i Det Forenede Kongerige i det sidste årti. Tidlig infektion med syfilis forårsager et sår på kønsorganerne efterfulgt, i mangel af behandling, af en generaliseret sygdom ofte ledsaget af udslæt. Undersøgelser af syfilis har været begrænsede, fordi det ikke er muligt at dyrke syfilis uden for kroppen. Nye tilgange gør det muligt at få hele den genetiske sekvens af Treponema pallidum fra en podning.
I denne undersøgelse vil resterende DNA indsamlet som en del af rutinemæssig patientbehandling af patienter set på seksuelle sundhedsklinikker i Storbritannien blive brugt til sekventering. Ingen patientkontakt er involveret i undersøgelsen, som er begrænset til helgenomsekventering ved brug af restmateriale fra prøver. Ved bedre at forstå genomet af T. pallidum vil man opnå indsigt i patogenesen af denne vigtige seksuelt overførte sygdom.
Studieoversigt
Status
Betingelser
Intervention / Behandling
Undersøgelsestype
Tilmelding (Faktiske)
Kontakter og lokationer
Studiesteder
-
-
-
Birmingham, Det Forenede Kongerige
- University Hospitals Birmingham
-
Brighton, Det Forenede Kongerige
- Brighton and Sussex NHS Trust
-
Leeds, Det Forenede Kongerige
- Leeds University Teaching Hospital
-
London, Det Forenede Kongerige
- Mortimer Market Centre
-
Manchester, Det Forenede Kongerige
- Penine Acute Hospitals Trust
-
-
Deltagelseskriterier
Berettigelseskriterier
Aldre berettiget til at studere
Tager imod sunde frivillige
Køn, der er berettiget til at studere
Prøveudtagningsmetode
Studiebefolkning
Patienter, der præsenterer for seksuelle sundhedstjenester i Storbritannien med en diagnose af syfilis.
Vi vil identificere resterende T.pallidum DNA fra rutinemæssigt indsamlede kliniske prøver holdt på deltagende klinikker/hospitaler. Data, der ledsager disse prøver, vil blive anonymiseret og vil ikke omfatte patientidentificerbare oplysninger. Medfølgende data vil omfatte: oprindelsesby, alder, køn, hiv-status og seksuel orientering.
Beskrivelse
Inklusionskriterier:
- Diagnose af syfilis
Ekskluderingskriterier:
- Ingen PCR-positiv klinisk prøve
Studieplan
Hvordan er undersøgelsen tilrettelagt?
Design detaljer
Kohorter og interventioner
Gruppe / kohorte |
Intervention / Behandling |
|---|---|
|
Syfilis
Patienter med syfilis og påviselig Treponema pallidum DNA i en rutinemæssigt indsamlet klinisk prøve
|
Resterende DNA fra kliniske prøver vil blive brugt til helgenomsekventering af Treponema pallidum, det forårsagende middel til syfilis
|
Hvad måler undersøgelsen?
Primære resultatmål
Resultatmål |
Foranstaltningsbeskrivelse |
Tidsramme |
|---|---|---|
|
Genomisk mangfoldighed af Treponema Pallidum vurderet ved nukleotiddiversitet og fylogenetisk afstamning
Tidsramme: Målt ved baseline - tidspunkt for tilmelding. Der er ingen yderligere prøver eller besøg i undersøgelsen.
|
Helgenomsekventering af britiske og globale syfilisprøver kombineret med fylogenomiske og populationsgenomiske analyser for at bestemme befolkningsstrukturen og diversiteten af Treponema både regionalt og i global sammenhæng.
Diversitet vil blive vurderet ved at måle nukleotiddiversitet mellem prøver og referencegenomer.
|
Målt ved baseline - tidspunkt for tilmelding. Der er ingen yderligere prøver eller besøg i undersøgelsen.
|
Samarbejdspartnere og efterforskere
Samarbejdspartnere
Datoer for undersøgelser
Studer store datoer
Studiestart (FAKTISKE)
Primær færdiggørelse (FAKTISKE)
Studieafslutning (FAKTISKE)
Datoer for studieregistrering
Først indsendt
Først indsendt, der opfyldte QC-kriterier
Først opslået (FAKTISKE)
Opdateringer af undersøgelsesjournaler
Sidste opdatering sendt (FAKTISKE)
Sidste opdatering indsendt, der opfyldte kvalitetskontrolkriterier
Sidst verificeret
Mere information
Begreber relateret til denne undersøgelse
Yderligere relevante MeSH-vilkår
Andre undersøgelses-id-numre
- 16014
Plan for individuelle deltagerdata (IPD)
Planlægger du at dele individuelle deltagerdata (IPD)?
Lægemiddel- og udstyrsoplysninger, undersøgelsesdokumenter
Studerer et amerikansk FDA-reguleret lægemiddelprodukt
Studerer et amerikansk FDA-reguleret enhedsprodukt
Disse oplysninger blev hentet direkte fra webstedet clinicaltrials.gov uden ændringer. Hvis du har nogen anmodninger om at ændre, fjerne eller opdatere dine undersøgelsesoplysninger, bedes du kontakte register@clinicaltrials.gov. Så snart en ændring er implementeret på clinicaltrials.gov, vil denne også blive opdateret automatisk på vores hjemmeside .
Kliniske forsøg med Helgenomsekventering
-
Magdi Yacoub Heart FoundationRekruttering
-
Jagiellonian UniversityRekruttering
-
University Hospital TuebingenAfsluttetSjældne sygdomme | Genetisk dispositionTyskland
-
Blood Donation Service Zurich, SRCUkendtGenetisk blodgruppe (bg) Polymorfi i U-negativitet og St(a) af MNS'erSchweiz
-
First Affiliated Hospital Xi'an Jiaotong UniversityRekruttering
-
Brigham and Women's HospitalEunice Kennedy Shriver National Institute of Child Health and Human Development... og andre samarbejdspartnereAfsluttetImplementering af sekventering af hele genom som screening i en mangfoldig kohorte af raske spædbørnGenetisk disposition for sygdom | Arvelige sygdommeForenede Stater
-
Baylor College of MedicineRekrutteringHypoksisk iskæmisk encefalopati | Hypoksisk iskæmisk encefalopati hos nyfødte | Hypoksisk iskæmisk encefalopati (HIE)Forenede Stater
-
Sequenom, Inc.Columbia UniversityAfsluttetKopinummervariationerForenede Stater
-
Addario Lung Cancer Medical InstituteNational Cancer Institute (NCI); Dana-Farber Cancer InstituteAfsluttetIkke-småcellet lungekræftForenede Stater
-
University of Illinois College of Medicine at PeoriaRady Children's Institute of Genomic MedicineAktiv, ikke rekrutterendeGenetisk sygdom | Genetisk syndromForenede Stater