Global syfilissekvensering
Helgenomsekvensering av syfilis med rutinmässiga kliniska prov
Syfilis är en viktig sexuellt överförbar infektion. Det har förekommit en epidemi av syfilis bland män som har sex med män i Storbritannien under det senaste decenniet. Tidig infektion med syfilis orsakar ett sår i könsorganen följt, i avsaknad av behandling, av en generaliserad sjukdom ofta åtföljd av utslag. Studier på syfilis har varit begränsade eftersom det inte är möjligt att odla syfilis utanför kroppen. Nya metoder gör att hela den genetiska sekvensen av Treponema pallidum kan erhållas från en pinne.
I denna studie kommer rest-DNA som samlats in som en del av rutinmässig patientvård av patienter som ses på sexuella hälsokliniker i Storbritannien att användas för sekvensering. Ingen patientkontakt är involverad i studien som är begränsad till helgenomsekvensering med hjälp av restmaterial från prover. Genom att bättre förstå genomet av T. pallidum kommer insikter att fås i patogenesen av denna viktiga sexuellt överförbara sjukdom.
Studieöversikt
Status
Betingelser
Intervention / Behandling
Studietyp
Inskrivning (Faktisk)
Kontakter och platser
Studieorter
-
-
-
Birmingham, Storbritannien
- University Hospitals Birmingham
-
Brighton, Storbritannien
- Brighton and Sussex NHS Trust
-
Leeds, Storbritannien
- Leeds University Teaching Hospital
-
London, Storbritannien
- Mortimer Market Centre
-
Manchester, Storbritannien
- Penine Acute Hospitals Trust
-
-
Deltagandekriterier
Urvalskriterier
Åldrar som är berättigade till studier
Tar emot friska volontärer
Kön som är behöriga för studier
Testmetod
Studera befolkning
Patienter som presenterar sig för sexuella hälsovårdstjänster i Storbritannien med diagnosen syfilis.
Vi kommer att identifiera kvarvarande T.pallidum-DNA från rutinmässigt insamlade kliniska prover som hålls på deltagande kliniker/sjukhus. Data som medföljer dessa prover kommer att anonymiseras och kommer inte att innehålla patientidentifierbar information. Medföljande data kommer att inkludera: ursprungsstad, ålder, kön, hiv-status och sexuell läggning.
Beskrivning
Inklusionskriterier:
- Diagnos av syfilis
Exklusions kriterier:
- Inget PCR-positivt kliniskt prov
Studieplan
Hur är studien utformad?
Designdetaljer
Kohorter och interventioner
Grupp / Kohort |
Intervention / Behandling |
|---|---|
|
Syfilis
Patienter med syfilis och detekterbart DNA från Treponema pallidum i ett rutinmässigt insamlat kliniskt prov
|
Resterande DNA från kliniska prover kommer att användas för helgenomsekvensering av Treponema pallidum, det orsakande medlet för syfilis
|
Vad mäter studien?
Primära resultatmått
Resultatmått |
Åtgärdsbeskrivning |
Tidsram |
|---|---|---|
|
Genomisk mångfald av Treponema Pallidum bedömd av nukleotiddiversitet och fylogenetisk härstamning
Tidsram: Mätt vid baslinjen - tidpunkt för registrering. Det finns inga ytterligare prover eller besök i studien.
|
Helgenomsekvensering av brittiska och globala syfilisprover kombinerat med fylogenomiska och populationsgenomiska analyser för att bestämma populationsstrukturen och mångfalden av Treponema både regionalt och i globala sammanhang.
Mångfald kommer att bedömas genom att mäta nukleotiddiversitet mellan prover och referensgenom.
|
Mätt vid baslinjen - tidpunkt för registrering. Det finns inga ytterligare prover eller besök i studien.
|
Samarbetspartners och utredare
Samarbetspartners
Studieavstämningsdatum
Studera stora datum
Studiestart (FAKTISK)
Primärt slutförande (FAKTISK)
Avslutad studie (FAKTISK)
Studieregistreringsdatum
Först inskickad
Först inskickad som uppfyllde QC-kriterierna
Första postat (FAKTISK)
Uppdateringar av studier
Senaste uppdatering publicerad (FAKTISK)
Senaste inskickade uppdateringen som uppfyllde QC-kriterierna
Senast verifierad
Mer information
Termer relaterade till denna studie
Ytterligare relevanta MeSH-villkor
Andra studie-ID-nummer
- 16014
Plan för individuella deltagardata (IPD)
Planerar du att dela individuella deltagardata (IPD)?
Läkemedels- och apparatinformation, studiedokument
Studerar en amerikansk FDA-reglerad läkemedelsprodukt
Studerar en amerikansk FDA-reglerad produktprodukt
Denna information hämtades direkt från webbplatsen clinicaltrials.gov utan några ändringar. Om du har några önskemål om att ändra, ta bort eller uppdatera dina studieuppgifter, vänligen kontakta register@clinicaltrials.gov. Så snart en ändring har implementerats på clinicaltrials.gov, kommer denna att uppdateras automatiskt även på vår webbplats .
Kliniska prövningar på Sekvensering av hela genomet
-
Stanford UniversityAvslutadSteg IV lungcancer | Metastatisk malign neoplasm i lungan | Icke-småcelligt lungkarcinom | Malign lungneoplasmaFörenta staterna
-
Jagiellonian UniversityRekrytering
-
University Hospital TuebingenAvslutadSällsynta sjukdomar | Genetisk predispositionTyskland
-
Addario Lung Cancer Medical InstituteNational Cancer Institute (NCI); Dana-Farber Cancer InstituteAvslutadIcke-småcellig lungcancerFörenta staterna
-
University of Illinois College of Medicine at PeoriaRady Children's Institute of Genomic MedicineAktiv, inte rekryterandeGenetisk sjukdom | Genetiskt syndromFörenta staterna
-
Samsung Medical CenterRekryteringTrippel negativ bröstcancer | Pembrolizumab | Neoadjuvant kemoterapi | TumörmikromiljöKorea, Republiken av
-
Ambry GeneticsBeth Israel Deaconess Medical Center; HonorHealth Research Institute; University...AvslutadDuktalt adenokarcinom i bukspottkörtelnFörenta staterna
-
University Hospital, Strasbourg, FranceIGBMC; Laboratoire de diagnostic génétique - NHC; Groupe Méthode en Recherche... och andra samarbetspartnersHar inte rekryterat ännuUtvecklings- och epileptisk encefalopati | Epilepsi hos barnFrankrike
-
Imperial College London Diabetes CentreOkändMendelska sjukdomar | Genetisk störning | Ny mutation | Ärftlig sjukdom | De Novo Mutation | Ärftlig sjukdom | Singelgen defekterFörenade arabemiraten
-
University of California, San FranciscoAvslutadSkelettanomalier | Flera anomalier | Strukturella anomalier | Hjärtavvikelser | Anomalier i centrala nervsystemet | Thorax anomalier | Genito-urinära anomalier | Gastrointestinala anomalierFörenta staterna