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글로벌 매독 시퀀싱

2022년 4월 11일 업데이트: London School of Hygiene and Tropical Medicine

일상적인 임상 샘플을 사용한 매독의 전체 게놈 시퀀싱

매독은 중요한 성병입니다. 지난 10년 동안 영국에서 남성과 성관계를 가진 남성 사이에 매독이 유행했습니다. 매독에 의한 초기 감염은 생식기 궤양을 일으키고, 치료하지 않으면 종종 발진을 동반하는 전신 질환이 뒤따릅니다. 매독에 대한 연구는 매독이 몸 밖에서 자라는 것이 불가능하기 때문에 제한적이었습니다. 새로운 접근 방식을 통해 면봉에서 Treponema pallidum의 전체 유전자 서열을 얻을 수 있습니다.

이 연구에서 영국의 성 건강 클리닉에서 환자의 일상적인 환자 관리의 일부로 수집된 잔여 DNA는 시퀀싱에 사용됩니다. 샘플의 잔류 물질을 사용하여 전체 게놈 시퀀싱으로 제한되는 연구에 환자 접촉은 없습니다. T.pallidum의 게놈을 더 잘 이해함으로써 이 중요한 성병의 병인에 대한 통찰력을 얻을 수 있습니다.

연구 개요

상태

완전한

정황

연구 유형

관찰

등록 (실제)

726

연락처 및 위치

이 섹션에서는 연구를 수행하는 사람들의 연락처 정보와 이 연구가 수행되는 장소에 대한 정보를 제공합니다.

연구 장소

      • Birmingham, 영국
        • University Hospitals Birmingham
      • Brighton, 영국
        • Brighton and Sussex NHS Trust
      • Leeds, 영국
        • Leeds University Teaching Hospital
      • London, 영국
        • Mortimer Market Centre
      • Manchester, 영국
        • Penine Acute Hospitals Trust

참여기준

연구원은 적격성 기준이라는 특정 설명에 맞는 사람을 찾습니다. 이러한 기준의 몇 가지 예는 개인의 일반적인 건강 상태 또는 이전 치료입니다.

자격 기준

공부할 수 있는 나이

18년 이상 (성인, OLDER_ADULT)

건강한 자원 봉사자를 받아들입니다

아니

연구 대상 성별

모두

샘플링 방법

비확률 샘플

연구 인구

매독 진단을 받고 영국에서 성 건강 서비스를 제공하는 환자.

우리는 참여 클리닉/병원에서 일상적으로 수집된 임상 샘플에서 잔류 T.pallidum DNA를 식별할 것입니다. 이러한 샘플과 함께 제공되는 데이터는 익명으로 처리되며 환자 식별 정보는 포함되지 않습니다. 수반되는 데이터에는 출신 도시, 연령, 성별, HIV 상태 및 성적 취향이 포함됩니다.

설명

포함 기준:

  • 매독 진단

제외 기준:

  • PCR 양성 임상 샘플 없음

공부 계획

이 섹션에서는 연구 설계 방법과 연구가 측정하는 내용을 포함하여 연구 계획에 대한 세부 정보를 제공합니다.

연구는 어떻게 설계됩니까?

디자인 세부사항

코호트 및 개입

그룹/코호트
개입 / 치료
매독
일상적으로 수집된 임상 샘플에서 매독 및 검출 가능한 Treponema pallidum DNA가 있는 환자
임상 시료의 잔여 DNA는 매독의 원인균인 트레포네마 팔리듐(Treponema pallidum)의 전체 게놈 시퀀싱에 활용될 예정입니다.

연구는 무엇을 측정합니까?

주요 결과 측정

결과 측정
측정값 설명
기간
뉴클레오타이드 다양성과 계통 발생적 계통으로 평가한 Treponema Pallidum의 게놈 다양성
기간: 기준선 - 등록 시점에 측정됩니다. 연구에서 더 이상의 샘플이나 방문은 없습니다.
영국 및 글로벌 매독 샘플의 전체 게놈 시퀀싱과 계통유전체 및 인구 게놈 분석을 결합하여 지역 및 글로벌 맥락에서 Treponema의 인구 구조 및 다양성을 결정합니다. 다양성은 샘플과 참조 게놈 간의 뉴클레오티드 다양성을 측정하여 평가됩니다.
기준선 - 등록 시점에 측정됩니다. 연구에서 더 이상의 샘플이나 방문은 없습니다.

공동 작업자 및 조사자

여기에서 이 연구와 관련된 사람과 조직을 찾을 수 있습니다.

연구 기록 날짜

이 날짜는 ClinicalTrials.gov에 대한 연구 기록 및 요약 결과 제출의 진행 상황을 추적합니다. 연구 기록 및 보고된 결과는 공개 웹사이트에 게시되기 전에 특정 품질 관리 기준을 충족하는지 확인하기 위해 국립 의학 도서관(NLM)에서 검토합니다.

연구 주요 날짜

연구 시작 (실제)

2018년 10월 8일

기본 완료 (실제)

2020년 12월 31일

연구 완료 (실제)

2022년 2월 28일

연구 등록 날짜

최초 제출

2018년 10월 8일

QC 기준을 충족하는 최초 제출

2018년 10월 16일

처음 게시됨 (실제)

2018년 10월 17일

연구 기록 업데이트

마지막 업데이트 게시됨 (실제)

2022년 4월 12일

QC 기준을 충족하는 마지막 업데이트 제출

2022년 4월 11일

마지막으로 확인됨

2022년 4월 1일

추가 정보

이 연구와 관련된 용어

개별 참가자 데이터(IPD) 계획

개별 참가자 데이터(IPD)를 공유할 계획입니까?

미정

약물 및 장치 정보, 연구 문서

미국 FDA 규제 의약품 연구

아니

미국 FDA 규제 기기 제품 연구

아니

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전체 게놈 시퀀싱에 대한 임상 시험

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