Séquençage mondial de la syphilis
Séquençage du génome entier de la syphilis à l'aide d'échantillons cliniques de routine
La syphilis est une importante infection sexuellement transmissible. Il y a eu une épidémie de syphilis parmi les hommes ayant des rapports sexuels avec des hommes au Royaume-Uni au cours de la dernière décennie. L'infection précoce par la syphilis provoque un ulcère génital suivi, en l'absence de traitement, d'une maladie généralisée souvent accompagnée d'éruptions cutanées. Les études sur la syphilis ont été limitées car il n'est pas possible de développer la syphilis en dehors du corps. De nouvelles approches permettent d'obtenir la séquence génétique complète de Treponema pallidum à partir d'un écouvillon.
Dans cette étude, l'ADN résiduel collecté dans le cadre des soins de routine aux patients vus dans des cliniques de santé sexuelle au Royaume-Uni sera utilisé pour le séquençage. Aucun contact avec le patient n'est impliqué dans l'étude qui se limite au séquençage du génome entier à l'aide de matériel résiduel d'échantillons. En comprenant mieux le génome de T. pallidum, nous pourrons mieux comprendre la pathogenèse de cette importante maladie sexuellement transmissible.
Aperçu de l'étude
Statut
Les conditions
Intervention / Traitement
Type d'étude
Inscription (Réel)
Contacts et emplacements
Lieux d'étude
-
-
-
Birmingham, Royaume-Uni
- University Hospitals Birmingham
-
Brighton, Royaume-Uni
- Brighton and Sussex NHS Trust
-
Leeds, Royaume-Uni
- Leeds University Teaching Hospital
-
London, Royaume-Uni
- Mortimer Market Centre
-
Manchester, Royaume-Uni
- Penine Acute Hospitals Trust
-
-
Critères de participation
Critère d'éligibilité
Âges éligibles pour étudier
Accepte les volontaires sains
Sexes éligibles pour l'étude
Méthode d'échantillonnage
Population étudiée
Patients se présentant aux services de santé sexuelle au Royaume-Uni avec un diagnostic de syphilis.
Nous identifierons l'ADN résiduel de T.pallidum à partir d'échantillons cliniques collectés en routine et conservés dans les cliniques/hôpitaux participants. Les données accompagnant ces échantillons seront anonymisées et n'incluront pas d'informations permettant d'identifier le patient. Les données d'accompagnement comprendront : la ville d'origine, l'âge, le sexe, le statut VIH et l'orientation sexuelle.
La description
Critère d'intégration:
- Diagnostic de la syphilis
Critère d'exclusion:
- Pas d'échantillon clinique positif à la PCR
Plan d'étude
Comment l'étude est-elle conçue ?
Détails de conception
Cohortes et interventions
Groupe / Cohorte |
Intervention / Traitement |
|---|---|
|
Syphilis
Patients atteints de syphilis et ADN de Treponema pallidum détectable dans un échantillon clinique prélevé en routine
|
L'ADN résiduel des échantillons cliniques sera utilisé pour le séquençage du génome entier de Treponema pallidum, l'agent causal de la syphilis
|
Que mesure l'étude ?
Principaux critères de jugement
Mesure des résultats |
Description de la mesure |
Délai |
|---|---|---|
|
Diversité génomique de Treponema Pallidum évaluée par la diversité des nucléotides et la lignée phylogénétique
Délai: Mesuré au départ - moment de l'inscription. Il n'y a pas d'autres échantillons ou visites dans l'étude.
|
Séquençage du génome entier d'échantillons de syphilis au Royaume-Uni et dans le monde combiné à des analyses phylogénomiques et génomiques de la population pour déterminer la structure et la diversité de la population de Treponema à la fois au niveau régional et dans le contexte mondial.
La diversité sera évaluée en mesurant la diversité des nucléotides entre les échantillons et les génomes de référence.
|
Mesuré au départ - moment de l'inscription. Il n'y a pas d'autres échantillons ou visites dans l'étude.
|
Collaborateurs et enquêteurs
Collaborateurs
Dates d'enregistrement des études
Dates principales de l'étude
Début de l'étude (RÉEL)
Achèvement primaire (RÉEL)
Achèvement de l'étude (RÉEL)
Dates d'inscription aux études
Première soumission
Première soumission répondant aux critères de contrôle qualité
Première publication (RÉEL)
Mises à jour des dossiers d'étude
Dernière mise à jour publiée (RÉEL)
Dernière mise à jour soumise répondant aux critères de contrôle qualité
Dernière vérification
Plus d'information
Termes liés à cette étude
Termes MeSH pertinents supplémentaires
Autres numéros d'identification d'étude
- 16014
Plan pour les données individuelles des participants (IPD)
Prévoyez-vous de partager les données individuelles des participants (DPI) ?
Informations sur les médicaments et les dispositifs, documents d'étude
Étudie un produit pharmaceutique réglementé par la FDA américaine
Étudie un produit d'appareil réglementé par la FDA américaine
Ces informations ont été extraites directement du site Web clinicaltrials.gov sans aucune modification. Si vous avez des demandes de modification, de suppression ou de mise à jour des détails de votre étude, veuillez contacter register@clinicaltrials.gov. Dès qu'un changement est mis en œuvre sur clinicaltrials.gov, il sera également mis à jour automatiquement sur notre site Web .
Essais cliniques sur Séquençage du génome entier
-
Hospices Civils de LyonInconnue
-
Tianjin Medical University Second HospitalInconnue
-
Rady Pediatric Genomics & Systems Medicine InstituteBrain & Behavior Research FoundationPas encore de recrutement
-
Rady Pediatric Genomics & Systems Medicine InstituteRecrutement
-
National Cancer Institute (NCI)SuspenduCancer du sein | Carcinome du sein | Tumeur maligne du sein | Cancer du seinÉtats-Unis